More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0394 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_0398  PfkB family kinase  95.87 
 
 
339 aa  667    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0394  ribokinase family sugar kinase  100 
 
 
339 aa  694    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1598  PfkB domain protein  38.79 
 
 
341 aa  229  5e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2739  ribokinase-like domain-containing protein  36.39 
 
 
343 aa  215  9.999999999999999e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000138473  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0697  2-keto-3-deoxygluconate kinase  34.91 
 
 
341 aa  211  1e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1160  PfkB domain protein  36.31 
 
 
342 aa  211  2e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2275  PfkB domain protein  36.02 
 
 
342 aa  210  3e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1329  2-keto-3-deoxygluconate kinase  34.31 
 
 
342 aa  208  1e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0419  PfkB  34.39 
 
 
340 aa  206  4e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2044  PfkB domain protein  33.04 
 
 
340 aa  205  8e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0945186  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1380  PfkB domain protein  36.67 
 
 
331 aa  205  8e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000087223  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2713  PfkB domain protein  33.04 
 
 
340 aa  202  7e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4058  PfkB domain protein  35.44 
 
 
338 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0157  KHG/KDPG family aldolase/carbohydrate kinase  34.39 
 
 
590 aa  195  9e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00034655  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1057  PfkB domain protein  32.25 
 
 
330 aa  192  6e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.443238  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0857  ribokinase-like domain-containing protein  34.39 
 
 
339 aa  192  8e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0880  ribokinase-like domain-containing protein  33.91 
 
 
339 aa  191  2e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1906  carbohydrate kinase  37.27 
 
 
335 aa  190  2.9999999999999997e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0342  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  33.04 
 
 
334 aa  187  3e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.70493  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4261  ribokinase-like domain-containing protein  32.57 
 
 
348 aa  185  1.0000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0227  ribokinase-like domain-containing protein  32.84 
 
 
344 aa  178  1e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.068215  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11458  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  32.01 
 
 
341 aa  176  4e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.216935  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4125  PfkB domain protein  30.21 
 
 
331 aa  170  3e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.197329 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0669  ribokinase-like domain-containing protein  32.27 
 
 
343 aa  165  9e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0674  PfkB domain protein  30.63 
 
 
337 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1379  PfkB domain protein  29.89 
 
 
340 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1671  PfkB domain protein  31.02 
 
 
338 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2385  PfkB domain protein  31.01 
 
 
342 aa  163  4.0000000000000004e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2644  PfkB  29.59 
 
 
334 aa  157  3e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6831  PfkB domain protein  30.15 
 
 
332 aa  150  4e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.743211 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1246  PfkB domain protein  29.41 
 
 
342 aa  148  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.463266  normal  0.070655 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4577  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  29.26 
 
 
338 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1699  ribokinase-like domain-containing protein  30.03 
 
 
329 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4737  carbohydrate kinase  29.26 
 
 
338 aa  147  3e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4596  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  29.26 
 
 
338 aa  147  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5097  carbohydrate kinase  29.26 
 
 
338 aa  147  3e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4686  ribokinase-like domain-containing protein  29.83 
 
 
338 aa  146  5e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5000  carbohydrate kinase  29.26 
 
 
338 aa  146  6e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2071  PfkB domain protein  28.49 
 
 
339 aa  145  1e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.139149  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4972  carbohydrate kinase, PfkB family  28.69 
 
 
338 aa  145  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0263  carbohydrate kinase, PfkB family  28.86 
 
 
338 aa  144  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.957258  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4985  carbohydrate kinase, PfkB family  28.69 
 
 
338 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4957  carbohydrate kinase, PfkB family  28.98 
 
 
338 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3036  PfkB  28.62 
 
 
342 aa  140  3e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.835222 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2870  PfkB domain protein  30.57 
 
 
318 aa  140  3e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3010  PfkB domain protein  30.62 
 
 
365 aa  139  7e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.489686  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3346  PfkB domain protein  28.69 
 
 
351 aa  135  9.999999999999999e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2277  PfkB domain protein  28.53 
 
 
332 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.262567  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3516  ribokinase-like domain-containing protein  31.21 
 
 
336 aa  132  6.999999999999999e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.300255  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03455  2-keto-3-deoxygluconate kinase  28.19 
 
 
340 aa  132  6.999999999999999e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27180  sugar kinase, ribokinase  29.51 
 
 
372 aa  132  7.999999999999999e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.771219  normal  0.49339 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0227  ribokinase-like domain-containing protein  27.35 
 
 
353 aa  131  1.0000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2208  PfkB domain protein  30.12 
 
 
366 aa  128  1.0000000000000001e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235888  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2509  PfkB domain protein  27.33 
 
 
317 aa  125  8.000000000000001e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.893739 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2283  PfkB domain protein  28.61 
 
 
321 aa  125  9e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.196107  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3191  PfkB domain protein  28.12 
 
 
366 aa  125  1e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000772988  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2264  PfkB domain protein  27.19 
 
 
331 aa  124  3e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.123147 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1761  ribokinase-like domain-containing protein  27.12 
 
 
368 aa  123  5e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.550108  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0463  PfkB domain protein  30.29 
 
 
318 aa  122  6e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.949852 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0442  PfkB domain protein  30.03 
 
 
326 aa  122  7e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3215  PfkB domain protein  24.63 
 
 
317 aa  120  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0908  PfkB domain protein  30.06 
 
 
367 aa  119  7e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.288989  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4259  ribokinase-like domain-containing protein  28.82 
 
 
365 aa  118  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1292  PfkB domain protein  32.61 
 
 
317 aa  114  3e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.282801  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0202  PfkB domain protein  29.18 
 
 
359 aa  110  5e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0709042  normal  0.0337983 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2132  PfkB domain protein  24.43 
 
 
344 aa  98.6  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0115  PfkB domain protein  25 
 
 
313 aa  98.2  2e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2438  PfkB domain protein  26.71 
 
 
323 aa  94.7  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3911  PfkB domain protein  27.19 
 
 
321 aa  94  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.27465  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2815  PfkB  27.43 
 
 
314 aa  91.3  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3414  PfkB domain protein  26.46 
 
 
317 aa  89.4  9e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  25.81 
 
 
317 aa  88.6  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2098  PfkB domain protein  27.16 
 
 
360 aa  88.2  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0078  PfkB  26.2 
 
 
318 aa  87.4  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0082  myo-inositol catabolism protein IolC  24.84 
 
 
338 aa  85.1  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1737  PfkB  23.71 
 
 
314 aa  83.2  0.000000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.482727  normal  0.803501 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0949  ribokinase-like domain-containing protein  25.99 
 
 
301 aa  82  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.206012 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0369  ribokinase-like domain-containing protein  25.35 
 
 
322 aa  80.5  0.00000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7727  ribokinase-like domain-containing protein  26.12 
 
 
314 aa  80.5  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4018  PfkB domain protein  23.95 
 
 
338 aa  79.3  0.00000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00301504  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3707  ribokinase-like domain-containing protein  24.66 
 
 
319 aa  78.6  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.973516 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3696  ribokinase-like domain-containing protein  25.99 
 
 
301 aa  78.6  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.657474  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5479  PfkB domain protein  26.27 
 
 
321 aa  79  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1486  ribokinase-like domain-containing protein  24.32 
 
 
315 aa  79  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0189  PfkB family carbohydrate kinase  24.18 
 
 
339 aa  78.6  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0130  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  23.9 
 
 
320 aa  78.2  0.0000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26890  2-ketogluconate kinase  26.12 
 
 
314 aa  77.8  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00940196  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5056  PfkB domain protein  23.37 
 
 
320 aa  77  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3485  PfkB domain protein  23.75 
 
 
347 aa  77  0.0000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2291  PfkB domain protein  28.57 
 
 
329 aa  76.6  0.0000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3559  ribokinase-like domain-containing protein  24.22 
 
 
340 aa  76.3  0.0000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0059  ribokinase-like domain-containing protein  23.17 
 
 
319 aa  76.3  0.0000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0501  PfkB domain protein  23.03 
 
 
320 aa  76.3  0.0000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.501412  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0274  PfkB  22.88 
 
 
306 aa  75.5  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  25.66 
 
 
329 aa  75.5  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0690  PfkB domain protein  24.24 
 
 
329 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.107436  normal  0.316336 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  23.86 
 
 
323 aa  74.3  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0756  PfkB domain protein  24.4 
 
 
329 aa  74.3  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0819977  normal  0.156556 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2067  ribokinase-like domain-containing protein  23.83 
 
 
324 aa  73.2  0.000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0314864  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01440  sugar kinase, ribokinase  22.78 
 
 
315 aa  72.8  0.000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>