More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03455 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_03455  2-keto-3-deoxygluconate kinase  100 
 
 
340 aa  679    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2071  PfkB domain protein  65.98 
 
 
339 aa  415  9.999999999999999e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.139149  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3036  PfkB  49.41 
 
 
342 aa  270  2.9999999999999997e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.835222 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3516  ribokinase-like domain-containing protein  48.36 
 
 
336 aa  248  7e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.300255  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1699  ribokinase-like domain-containing protein  47.16 
 
 
329 aa  239  5e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0419  PfkB  38.08 
 
 
340 aa  232  8.000000000000001e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1057  PfkB domain protein  39.12 
 
 
330 aa  224  2e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.443238  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2739  ribokinase-like domain-containing protein  37.2 
 
 
343 aa  216  5e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000138473  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4261  ribokinase-like domain-containing protein  34.2 
 
 
348 aa  213  2.9999999999999995e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4125  PfkB domain protein  37.24 
 
 
331 aa  210  3e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.197329 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1160  PfkB domain protein  36.94 
 
 
342 aa  209  7e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2275  PfkB domain protein  37.24 
 
 
342 aa  208  1e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11458  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  32.54 
 
 
341 aa  207  2e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.216935  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0880  ribokinase-like domain-containing protein  34.51 
 
 
339 aa  205  1e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1598  PfkB domain protein  36.13 
 
 
341 aa  204  2e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2713  PfkB domain protein  32.66 
 
 
340 aa  203  4e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0857  ribokinase-like domain-containing protein  34.51 
 
 
339 aa  202  7e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0157  KHG/KDPG family aldolase/carbohydrate kinase  32.85 
 
 
590 aa  199  7.999999999999999e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00034655  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0342  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  34.23 
 
 
334 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.70493  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2044  PfkB domain protein  32.75 
 
 
340 aa  197  2.0000000000000003e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0945186  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3346  PfkB domain protein  36.86 
 
 
351 aa  189  4e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4058  PfkB domain protein  33.24 
 
 
338 aa  188  1e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0697  2-keto-3-deoxygluconate kinase  32.56 
 
 
341 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2644  PfkB  35.37 
 
 
334 aa  181  2e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1329  2-keto-3-deoxygluconate kinase  31.61 
 
 
342 aa  179  5.999999999999999e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2385  PfkB domain protein  31.25 
 
 
342 aa  177  3e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0669  ribokinase-like domain-containing protein  33.54 
 
 
343 aa  175  9e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0674  PfkB domain protein  31.58 
 
 
337 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4577  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  31.76 
 
 
338 aa  171  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4985  carbohydrate kinase, PfkB family  31.76 
 
 
338 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1379  PfkB domain protein  30.84 
 
 
340 aa  170  3e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4957  carbohydrate kinase, PfkB family  31.76 
 
 
338 aa  169  5e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4737  carbohydrate kinase  31.76 
 
 
338 aa  169  6e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5097  carbohydrate kinase  31.76 
 
 
338 aa  169  6e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4972  carbohydrate kinase, PfkB family  30.88 
 
 
338 aa  168  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5000  carbohydrate kinase  31.18 
 
 
338 aa  168  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4596  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  31.18 
 
 
338 aa  166  5e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4686  ribokinase-like domain-containing protein  30.29 
 
 
338 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0263  carbohydrate kinase, PfkB family  30.59 
 
 
338 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.957258  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1380  PfkB domain protein  29.12 
 
 
331 aa  159  5e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000087223  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27180  sugar kinase, ribokinase  33.05 
 
 
372 aa  159  9e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.771219  normal  0.49339 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2208  PfkB domain protein  35.28 
 
 
366 aa  157  2e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235888  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2264  PfkB domain protein  30.79 
 
 
331 aa  155  1e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.123147 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0908  PfkB domain protein  31.83 
 
 
367 aa  145  1e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.288989  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1292  PfkB domain protein  33.33 
 
 
317 aa  144  1e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.282801  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3215  PfkB domain protein  30.52 
 
 
317 aa  143  4e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0398  PfkB family kinase  28.41 
 
 
339 aa  143  5e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2509  PfkB domain protein  32.54 
 
 
317 aa  142  9e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.893739 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6831  PfkB domain protein  29.85 
 
 
332 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.743211 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0227  ribokinase-like domain-containing protein  26.81 
 
 
344 aa  140  3e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.068215  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0463  PfkB domain protein  35.15 
 
 
318 aa  140  3.9999999999999997e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.949852 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1246  PfkB domain protein  32.13 
 
 
342 aa  140  3.9999999999999997e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.463266  normal  0.070655 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0394  ribokinase family sugar kinase  28.02 
 
 
339 aa  139  4.999999999999999e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0442  PfkB domain protein  27.99 
 
 
326 aa  139  1e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3010  PfkB domain protein  33.9 
 
 
365 aa  136  5e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.489686  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1671  PfkB domain protein  25.37 
 
 
338 aa  135  7.000000000000001e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0227  ribokinase-like domain-containing protein  32.29 
 
 
353 aa  135  9.999999999999999e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1906  carbohydrate kinase  26.69 
 
 
335 aa  133  5e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2283  PfkB domain protein  35.08 
 
 
321 aa  132  6e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.196107  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2870  PfkB domain protein  33.13 
 
 
318 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3191  PfkB domain protein  28.28 
 
 
366 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000772988  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2098  PfkB domain protein  30.09 
 
 
360 aa  129  1.0000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1761  ribokinase-like domain-containing protein  30.12 
 
 
368 aa  127  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.550108  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0202  PfkB domain protein  34.09 
 
 
359 aa  127  3e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0709042  normal  0.0337983 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2277  PfkB domain protein  31.34 
 
 
332 aa  126  6e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.262567  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4259  ribokinase-like domain-containing protein  29.94 
 
 
365 aa  125  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5056  PfkB domain protein  33.85 
 
 
320 aa  123  5e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0949  ribokinase-like domain-containing protein  31.96 
 
 
301 aa  113  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.206012 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  31.01 
 
 
329 aa  112  8.000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0189  PfkB family carbohydrate kinase  31.79 
 
 
339 aa  110  3e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3911  PfkB domain protein  28.53 
 
 
321 aa  107  3e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.27465  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3696  ribokinase-like domain-containing protein  30.38 
 
 
301 aa  103  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.657474  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2132  PfkB domain protein  34.36 
 
 
344 aa  99.4  9e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26890  2-ketogluconate kinase  30.58 
 
 
314 aa  99  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00940196  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  28.57 
 
 
317 aa  98.2  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4291  PfkB domain protein  33.02 
 
 
342 aa  98.2  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.672218 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2067  ribokinase-like domain-containing protein  30.07 
 
 
324 aa  97.8  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0314864  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1865  ribokinase-like domain-containing protein  27.88 
 
 
320 aa  97.8  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.314409  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1382  PfkB domain protein  33.14 
 
 
326 aa  95.9  8e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847746  normal  0.299274 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2154  putative 2-keto-gluconokinase  30.48 
 
 
329 aa  95.5  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.376694  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2288  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  30.48 
 
 
329 aa  95.5  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2291  PfkB domain protein  28.44 
 
 
329 aa  95.5  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2096  putative 2-keto-gluconokinase  30.16 
 
 
329 aa  94.4  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0961  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  30.16 
 
 
329 aa  94  4e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0169  ribokinase-like domain-containing protein  28.62 
 
 
312 aa  94  4e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2815  PfkB  33.33 
 
 
314 aa  93.6  5e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6346  PfkB  30.58 
 
 
330 aa  92.4  9e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1733  ribokinase-like domain-containing protein  30.58 
 
 
330 aa  92.4  9e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2296  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  34.25 
 
 
329 aa  92.4  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0502  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  27.59 
 
 
320 aa  92  1e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1746  ribokinase-like domain-containing protein  30.58 
 
 
330 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.931195 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0690  PfkB domain protein  30.31 
 
 
329 aa  90.9  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.107436  normal  0.316336 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0377  PfkB domain protein  28.74 
 
 
319 aa  89.7  6e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.404819  normal  0.365266 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2566  ribokinase-like domain-containing protein  30.86 
 
 
316 aa  89.7  7e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255946  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1654  ribokinase-like domain-containing protein  29.06 
 
 
330 aa  89.4  8e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.909879 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5029  ribokinase family sugar kinase  30.25 
 
 
330 aa  89.4  9e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.351369 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1526  ribokinase-like domain-containing protein  30.12 
 
 
328 aa  89  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.198304  normal  0.764115 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0275  PfkB domain-containing protein  29.9 
 
 
312 aa  89  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0501  PfkB domain protein  27.24 
 
 
320 aa  88.6  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.501412  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1654  ribokinase-like domain-containing protein  28.44 
 
 
330 aa  87  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.290792  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>