More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4261 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4261  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 
348 aa  722    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11458  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  69.79 
 
 
341 aa  504  9.999999999999999e-143  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.216935  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1057  PfkB domain protein  45.56 
 
 
330 aa  317  2e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.443238  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1160  PfkB domain protein  47.97 
 
 
342 aa  310  2e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2275  PfkB domain protein  47.67 
 
 
342 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2739  ribokinase-like domain-containing protein  47.83 
 
 
343 aa  300  2e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000138473  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4125  PfkB domain protein  42.23 
 
 
331 aa  295  8e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.197329 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0419  PfkB  44.48 
 
 
340 aa  295  1e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2713  PfkB domain protein  41.98 
 
 
340 aa  288  8e-77  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0669  ribokinase-like domain-containing protein  41.86 
 
 
343 aa  288  1e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1598  PfkB domain protein  45.75 
 
 
341 aa  274  1.0000000000000001e-72  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0157  KHG/KDPG family aldolase/carbohydrate kinase  42.86 
 
 
590 aa  264  1e-69  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00034655  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2044  PfkB domain protein  39.13 
 
 
340 aa  263  4e-69  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0945186  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0857  ribokinase-like domain-containing protein  42.11 
 
 
339 aa  262  8e-69  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0880  ribokinase-like domain-containing protein  41.94 
 
 
339 aa  261  1e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2264  PfkB domain protein  37.15 
 
 
331 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.123147 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0342  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  36.69 
 
 
334 aa  233  3e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.70493  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6831  PfkB domain protein  38.02 
 
 
332 aa  230  3e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.743211 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2385  PfkB domain protein  37.79 
 
 
342 aa  228  1e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1246  PfkB domain protein  37.5 
 
 
342 aa  221  9.999999999999999e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.463266  normal  0.070655 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1379  PfkB domain protein  37.03 
 
 
340 aa  215  9e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4058  PfkB domain protein  36.83 
 
 
338 aa  207  2e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1380  PfkB domain protein  35.78 
 
 
331 aa  202  6e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000087223  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3346  PfkB domain protein  35.28 
 
 
351 aa  197  2.0000000000000003e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03455  2-keto-3-deoxygluconate kinase  34.2 
 
 
340 aa  195  9e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2071  PfkB domain protein  35.01 
 
 
339 aa  194  2e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.139149  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0398  PfkB family kinase  32.08 
 
 
339 aa  189  5e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2644  PfkB  32.45 
 
 
334 aa  186  4e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0394  ribokinase family sugar kinase  32.57 
 
 
339 aa  185  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3036  PfkB  34.36 
 
 
342 aa  182  5.0000000000000004e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.835222 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1761  ribokinase-like domain-containing protein  33.71 
 
 
368 aa  178  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.550108  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1329  2-keto-3-deoxygluconate kinase  31.2 
 
 
342 aa  177  2e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1699  ribokinase-like domain-containing protein  34.85 
 
 
329 aa  174  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0697  2-keto-3-deoxygluconate kinase  32.46 
 
 
341 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0674  PfkB domain protein  32.17 
 
 
337 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4259  ribokinase-like domain-containing protein  32.48 
 
 
365 aa  170  3e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3191  PfkB domain protein  32.95 
 
 
366 aa  169  9e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000772988  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0227  ribokinase-like domain-containing protein  31.94 
 
 
344 aa  168  1e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.068215  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3516  ribokinase-like domain-containing protein  33.33 
 
 
336 aa  168  1e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.300255  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1906  carbohydrate kinase  29.71 
 
 
335 aa  165  9e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1671  PfkB domain protein  30.65 
 
 
338 aa  163  4.0000000000000004e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0227  ribokinase-like domain-containing protein  32.45 
 
 
353 aa  162  9e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27180  sugar kinase, ribokinase  33.33 
 
 
372 aa  160  4e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.771219  normal  0.49339 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2208  PfkB domain protein  32.03 
 
 
366 aa  154  2.9999999999999998e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235888  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3010  PfkB domain protein  33.62 
 
 
365 aa  151  1e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.489686  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2870  PfkB domain protein  32.74 
 
 
318 aa  150  3e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0908  PfkB domain protein  33.8 
 
 
367 aa  149  7e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.288989  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4596  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  29.57 
 
 
338 aa  143  4e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0463  PfkB domain protein  31.07 
 
 
318 aa  143  4e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.949852 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4577  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  29.38 
 
 
338 aa  142  8e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4686  ribokinase-like domain-containing protein  28.66 
 
 
338 aa  142  9e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4737  carbohydrate kinase  29.08 
 
 
338 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5097  carbohydrate kinase  29.08 
 
 
338 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4957  carbohydrate kinase, PfkB family  29.08 
 
 
338 aa  140  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4985  carbohydrate kinase, PfkB family  28.96 
 
 
338 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3215  PfkB domain protein  29.38 
 
 
317 aa  139  6e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2509  PfkB domain protein  30.12 
 
 
317 aa  139  6e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.893739 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5000  carbohydrate kinase  28.78 
 
 
338 aa  137  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4972  carbohydrate kinase, PfkB family  28.05 
 
 
338 aa  137  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0263  carbohydrate kinase, PfkB family  28.05 
 
 
338 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.957258  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2098  PfkB domain protein  31.43 
 
 
360 aa  133  5e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2277  PfkB domain protein  29.03 
 
 
332 aa  132  7.999999999999999e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.262567  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2283  PfkB domain protein  31.34 
 
 
321 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.196107  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0202  PfkB domain protein  31.34 
 
 
359 aa  131  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0709042  normal  0.0337983 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0442  PfkB domain protein  27.7 
 
 
326 aa  127  3e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1292  PfkB domain protein  29.81 
 
 
317 aa  126  5e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.282801  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3911  PfkB domain protein  29.52 
 
 
321 aa  123  4e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.27465  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0369  ribokinase-like domain-containing protein  28.72 
 
 
322 aa  106  6e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  29.33 
 
 
317 aa  98.2  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2438  PfkB domain protein  27.81 
 
 
323 aa  95.5  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2132  PfkB domain protein  27.98 
 
 
344 aa  94  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5056  PfkB domain protein  27.08 
 
 
320 aa  87.8  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4291  PfkB domain protein  30.79 
 
 
342 aa  87.4  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.672218 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1297  2-keto-3-deoxygalactonate kinase / 2-keto-3-deoxygluconate kinase  25.15 
 
 
308 aa  87.4  3e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0377  PfkB domain protein  26.57 
 
 
319 aa  87.4  4e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.404819  normal  0.365266 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  26.21 
 
 
329 aa  84.3  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1737  PfkB  25.68 
 
 
314 aa  83.6  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.482727  normal  0.803501 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0933  PfkB domain protein  25.96 
 
 
313 aa  83.2  0.000000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0971681  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3414  PfkB domain protein  25.08 
 
 
317 aa  83.2  0.000000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1865  ribokinase-like domain-containing protein  26.75 
 
 
320 aa  79.7  0.00000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.314409  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4676  PfkB domain protein  30 
 
 
327 aa  79.3  0.00000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0212656  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0275  PfkB domain-containing protein  26.13 
 
 
312 aa  79  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2428  PfkB domain protein  29.85 
 
 
318 aa  77.4  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000311556  hitchhiker  0.00635887 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0115  PfkB domain protein  24.91 
 
 
313 aa  77.4  0.0000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5016  PfkB domain protein  29.63 
 
 
321 aa  77.8  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.816187  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3696  ribokinase-like domain-containing protein  27.1 
 
 
301 aa  75.9  0.0000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.657474  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0502  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  25.68 
 
 
320 aa  75.9  0.0000000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0949  ribokinase-like domain-containing protein  26.53 
 
 
301 aa  75.5  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.206012 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5081  ribokinase family sugar kinase  29.47 
 
 
308 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89362  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2291  PfkB domain protein  25.66 
 
 
329 aa  74.7  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5091  PfkB  25.94 
 
 
309 aa  75.1  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.170499  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0006  PfkB domain protein  26.89 
 
 
312 aa  74.3  0.000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.997573  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1489  ribokinase-like domain-containing protein  29.95 
 
 
308 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538606  normal  0.0997526 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4198  PfkB domain protein  28.64 
 
 
308 aa  73.6  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2815  PfkB  26.87 
 
 
314 aa  73.6  0.000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0078  PfkB  26.85 
 
 
318 aa  73.6  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3559  ribokinase-like domain-containing protein  24.83 
 
 
340 aa  73.6  0.000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4308  PfkB domain protein  28.64 
 
 
308 aa  73.6  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.600778  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26890  2-ketogluconate kinase  23.65 
 
 
314 aa  73.6  0.000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00940196  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1382  PfkB domain protein  24.75 
 
 
326 aa  73.2  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847746  normal  0.299274 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>