More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3346 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3346  PfkB domain protein  100 
 
 		 351 aa  709    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1160  PfkB domain protein  41.28 
 
 		 342 aa  262  8e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2275  PfkB domain protein  40.99 
 
 		 342 aa  261  2e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2713  PfkB domain protein  36.6 
 
 		 340 aa  258  1e-67  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0419  PfkB  41.04 
 
 		 340 aa  258  2e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0857  ribokinase-like domain-containing protein  40 
 
 		 339 aa  252  6e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0880  ribokinase-like domain-containing protein  39.71 
 
 		 339 aa  251  1e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0157  KHG/KDPG family aldolase/carbohydrate kinase  36.52 
 
 		 590 aa  248  2e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00034655  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2739  ribokinase-like domain-containing protein  38.9 
 
 		 343 aa  243  3.9999999999999997e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000138473  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1598  PfkB domain protein  38.95 
 
 		 341 aa  241  1e-62  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4125  PfkB domain protein  35.92 
 
 		 331 aa  218  8.999999999999998e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.197329 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1379  PfkB domain protein  35.65 
 
 		 340 aa  215  7e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1380  PfkB domain protein  34.64 
 
 		 331 aa  213  4.9999999999999996e-54  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000087223  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4261  ribokinase-like domain-containing protein  35.28 
 
 		 348 aa  207  3e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2385  PfkB domain protein  33.93 
 
 		 342 aa  204  2e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0342  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  35.59 
 
 		 334 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.70493  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1057  PfkB domain protein  34.39 
 
 		 330 aa  197  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.443238  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2044  PfkB domain protein  31.49 
 
 		 340 aa  195  9e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0945186  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0669  ribokinase-like domain-containing protein  31.58 
 
 		 343 aa  184  2.0000000000000003e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11458  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  32.67 
 
 		 341 aa  184  2.0000000000000003e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.216935  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03455  2-keto-3-deoxygluconate kinase  36.86 
 
 		 340 aa  183  4.0000000000000006e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0674  PfkB domain protein  29.74 
 
 		 337 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2071  PfkB domain protein  34.93 
 
 		 339 aa  177  3e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.139149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2264  PfkB domain protein  33.03 
 
 		 331 aa  168  2e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.123147 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1671  PfkB domain protein  30.51 
 
 		 338 aa  168  2e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3036  PfkB  34.69 
 
 		 342 aa  166  5e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.835222 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1699  ribokinase-like domain-containing protein  38.25 
 
 		 329 aa  166  5e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2509  PfkB domain protein  32.73 
 
 		 317 aa  162  8.000000000000001e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.893739 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4058  PfkB domain protein  27.25 
 
 		 338 aa  157  2e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6831  PfkB domain protein  31.36 
 
 		 332 aa  157  4e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.743211 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4985  carbohydrate kinase, PfkB family  31.23 
 
 		 338 aa  156  6e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3215  PfkB domain protein  32.44 
 
 		 317 aa  156  6e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1329  2-keto-3-deoxygluconate kinase  29.59 
 
 		 342 aa  155  8e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3516  ribokinase-like domain-containing protein  34.99 
 
 		 336 aa  155  1e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.300255  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4577  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  30.95 
 
 		 338 aa  154  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4596  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  31.23 
 
 		 338 aa  154  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4737  carbohydrate kinase  31.81 
 
 		 338 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5097  carbohydrate kinase  31.81 
 
 		 338 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4972  carbohydrate kinase, PfkB family  29.89 
 
 		 338 aa  153  4e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0697  2-keto-3-deoxygluconate kinase  30.12 
 
 		 341 aa  152  5.9999999999999996e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4957  carbohydrate kinase, PfkB family  31.34 
 
 		 338 aa  152  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1906  carbohydrate kinase  29.88 
 
 		 335 aa  150  3e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1246  PfkB domain protein  29.62 
 
 		 342 aa  149  5e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.463266  normal  0.070655 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4686  ribokinase-like domain-containing protein  29.6 
 
 		 338 aa  149  9e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0263  carbohydrate kinase, PfkB family  29.31 
 
 		 338 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.957258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2644  PfkB  28.74 
 
 		 334 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5000  carbohydrate kinase  30.46 
 
 		 338 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2277  PfkB domain protein  34.62 
 
 		 332 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.262567  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0227  ribokinase-like domain-containing protein  28.61 
 
 		 344 aa  146  6e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.068215  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1761  ribokinase-like domain-containing protein  29.66 
 
 		 368 aa  143  4e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.550108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0398  PfkB family kinase  28.32 
 
 		 339 aa  142  9e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0394  ribokinase family sugar kinase  28.93 
 
 		 339 aa  138  1e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0227  ribokinase-like domain-containing protein  31.3 
 
 		 353 aa  138  1e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2208  PfkB domain protein  31.04 
 
 		 366 aa  137  3.0000000000000003e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27180  sugar kinase, ribokinase  30.17 
 
 		 372 aa  135  7.000000000000001e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.771219  normal  0.49339 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0908  PfkB domain protein  31.01 
 
 		 367 aa  131  2.0000000000000002e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.288989  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2283  PfkB domain protein  31.67 
 
 		 321 aa  129  7.000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.196107  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1292  PfkB domain protein  31.37 
 
 		 317 aa  127  2.0000000000000002e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.282801  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3191  PfkB domain protein  26.39 
 
 		 366 aa  127  3e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000772988  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3010  PfkB domain protein  32.03 
 
 		 365 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.489686  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2870  PfkB domain protein  28.74 
 
 		 318 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4259  ribokinase-like domain-containing protein  27.37 
 
 		 365 aa  117  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0442  PfkB domain protein  27.51 
 
 		 326 aa  117  3e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0202  PfkB domain protein  29.97 
 
 		 359 aa  116  5e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0709042  normal  0.0337983 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2098  PfkB domain protein  27.4 
 
 		 360 aa  115  2.0000000000000002e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0463  PfkB domain protein  28.83 
 
 		 318 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.949852 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3911  PfkB domain protein  29.34 
 
 		 321 aa  105  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.27465  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5056  PfkB domain protein  28.71 
 
 		 320 aa  102  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2438  PfkB domain protein  32.53 
 
 		 323 aa  101  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0006  PfkB domain protein  31.03 
 
 		 312 aa  88.6  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.997573  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1865  ribokinase-like domain-containing protein  27.5 
 
 		 320 aa  88.6  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.314409  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2132  PfkB domain protein  28.12 
 
 		 344 aa  86.3  7e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0369  ribokinase-like domain-containing protein  28.24 
 
 		 322 aa  86.3  7e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0722  PfkB domain protein  29.88 
 
 		 363 aa  85.1  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.140829 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4676  PfkB domain protein  32.97 
 
 		 327 aa  85.9  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0212656  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0189  PfkB family carbohydrate kinase  28.05 
 
 		 339 aa  84.7  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3414  PfkB domain protein  29.13 
 
 		 317 aa  85.1  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  27.78 
 
 		 329 aa  84.7  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7727  ribokinase-like domain-containing protein  30.42 
 
 		 314 aa  82.8  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5016  PfkB domain protein  36.41 
 
 		 321 aa  82.8  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.816187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5479  PfkB domain protein  30.51 
 
 		 321 aa  82.8  0.000000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  29.56 
 
 		 317 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1626  PfkB domain protein  30.5 
 
 		 319 aa  81.3  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  0.814532 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0377  PfkB domain protein  30.2 
 
 		 319 aa  82  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.404819  normal  0.365266 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1382  PfkB domain protein  28.66 
 
 		 326 aa  81.6  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847746  normal  0.299274 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0275  PfkB domain-containing protein  27.39 
 
 		 312 aa  80.1  0.00000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0933  PfkB domain protein  23.93 
 
 		 313 aa  79.3  0.00000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0971681  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3696  ribokinase-like domain-containing protein  31.53 
 
 		 301 aa  79.3  0.00000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.657474  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1297  2-keto-3-deoxygalactonate kinase / 2-keto-3-deoxygluconate kinase  25.08 
 
 		 308 aa  79.3  0.00000000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0949  ribokinase-like domain-containing protein  31.03 
 
 		 301 aa  79  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.206012 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1737  PfkB  34.39 
 
 		 314 aa  79.3  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.482727  normal  0.803501 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2815  PfkB  29.35 
 
 		 314 aa  79.3  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1486  ribokinase-like domain-containing protein  34.46 
 
 		 315 aa  78.6  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2902  PfkB  32.81 
 
 		 345 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.358173  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01440  sugar kinase, ribokinase  28.4 
 
 		 315 aa  73.6  0.000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1366  ribokinase-like domain-containing protein  26.11 
 
 		 320 aa  73.6  0.000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4291  PfkB domain protein  28.09 
 
 		 342 aa  72.8  0.000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.672218 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0974  ribokinase-like domain-containing protein  30.73 
 
 		 312 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.715323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2594  PfkB  34.25 
 
 		 319 aa  72.4  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.2534  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2096  putative 2-keto-gluconokinase  26.43 
 
 		 329 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>