271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3516 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009427  Saro_3516  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 		 336 aa  662    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.300255  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3036  PfkB  59.82 
 
 		 342 aa  364  1e-99  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.835222 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03455  2-keto-3-deoxygluconate kinase  48.36 
 
 		 340 aa  251  1e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2071  PfkB domain protein  47.34 
 
 		 339 aa  250  3e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.139149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1699  ribokinase-like domain-containing protein  46.53 
 
 		 329 aa  230  3e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2739  ribokinase-like domain-containing protein  39.76 
 
 		 343 aa  213  3.9999999999999995e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000138473  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1057  PfkB domain protein  37.09 
 
 		 330 aa  211  1e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.443238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0880  ribokinase-like domain-containing protein  37.94 
 
 		 339 aa  209  4e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0857  ribokinase-like domain-containing protein  36.63 
 
 		 339 aa  208  1e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1598  PfkB domain protein  38.51 
 
 		 341 aa  206  4e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4125  PfkB domain protein  37.43 
 
 		 331 aa  204  2e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.197329 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2385  PfkB domain protein  35.69 
 
 		 342 aa  203  4e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2275  PfkB domain protein  37.9 
 
 		 342 aa  193  3e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1160  PfkB domain protein  37.32 
 
 		 342 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2044  PfkB domain protein  30.47 
 
 		 340 aa  190  2.9999999999999997e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0945186  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0157  KHG/KDPG family aldolase/carbohydrate kinase  35.22 
 
 		 590 aa  188  1e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00034655  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1380  PfkB domain protein  34.74 
 
 		 331 aa  187  3e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000087223  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4261  ribokinase-like domain-containing protein  33.33 
 
 		 348 aa  186  4e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2713  PfkB domain protein  32.92 
 
 		 340 aa  185  1.0000000000000001e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0419  PfkB  34.66 
 
 		 340 aa  185  1.0000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1379  PfkB domain protein  33.92 
 
 		 340 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1329  2-keto-3-deoxygluconate kinase  33.13 
 
 		 342 aa  182  5.0000000000000004e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11458  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  33.04 
 
 		 341 aa  181  2e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.216935  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0674  PfkB domain protein  31.43 
 
 		 337 aa  179  4.999999999999999e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0697  2-keto-3-deoxygluconate kinase  30.61 
 
 		 341 aa  173  3.9999999999999995e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3346  PfkB domain protein  34.99 
 
 		 351 aa  173  3.9999999999999995e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4058  PfkB domain protein  31.69 
 
 		 338 aa  168  1e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0342  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  29.55 
 
 		 334 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.70493  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0669  ribokinase-like domain-containing protein  31.04 
 
 		 343 aa  159  5e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2644  PfkB  33.23 
 
 		 334 aa  158  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0398  PfkB family kinase  32.12 
 
 		 339 aa  158  1e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0394  ribokinase family sugar kinase  31.21 
 
 		 339 aa  155  6e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1671  PfkB domain protein  31.4 
 
 		 338 aa  155  1e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1246  PfkB domain protein  32.13 
 
 		 342 aa  154  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.463266  normal  0.070655 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2509  PfkB domain protein  34.53 
 
 		 317 aa  154  2e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.893739 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4686  ribokinase-like domain-containing protein  29.91 
 
 		 338 aa  153  4e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2264  PfkB domain protein  29.81 
 
 		 331 aa  151  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.123147 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4972  carbohydrate kinase, PfkB family  29.91 
 
 		 338 aa  149  4e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4596  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  30.43 
 
 		 338 aa  149  8e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5000  carbohydrate kinase  29.86 
 
 		 338 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4577  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  30.14 
 
 		 338 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4985  carbohydrate kinase, PfkB family  30.43 
 
 		 338 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4737  carbohydrate kinase  30.14 
 
 		 338 aa  147  3e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5097  carbohydrate kinase  30.14 
 
 		 338 aa  147  3e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0263  carbohydrate kinase, PfkB family  29.33 
 
 		 338 aa  146  5e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.957258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2277  PfkB domain protein  33.82 
 
 		 332 aa  145  1e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.262567  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4957  carbohydrate kinase, PfkB family  29.86 
 
 		 338 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6831  PfkB domain protein  32.74 
 
 		 332 aa  142  9e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.743211 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0227  ribokinase-like domain-containing protein  28.48 
 
 		 344 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.068215  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0442  PfkB domain protein  29.6 
 
 		 326 aa  139  4.999999999999999e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1906  carbohydrate kinase  27.1 
 
 		 335 aa  138  1e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3215  PfkB domain protein  31.1 
 
 		 317 aa  136  6.0000000000000005e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1292  PfkB domain protein  33.97 
 
 		 317 aa  134  3e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.282801  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2283  PfkB domain protein  34.7 
 
 		 321 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.196107  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0463  PfkB domain protein  32.34 
 
 		 318 aa  125  1e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.949852 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1761  ribokinase-like domain-containing protein  30.59 
 
 		 368 aa  122  9e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.550108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4259  ribokinase-like domain-containing protein  29.31 
 
 		 365 aa  122  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2870  PfkB domain protein  31.37 
 
 		 318 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27180  sugar kinase, ribokinase  31.16 
 
 		 372 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.771219  normal  0.49339 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2208  PfkB domain protein  33.43 
 
 		 366 aa  119  9e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3191  PfkB domain protein  27.93 
 
 		 366 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000772988  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5056  PfkB domain protein  35.71 
 
 		 320 aa  118  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0908  PfkB domain protein  31.69 
 
 		 367 aa  119  9.999999999999999e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.288989  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0227  ribokinase-like domain-containing protein  32.46 
 
 		 353 aa  117  1.9999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2098  PfkB domain protein  31.32 
 
 		 360 aa  117  1.9999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3911  PfkB domain protein  29.27 
 
 		 321 aa  109  9.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.27465  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4291  PfkB domain protein  33.94 
 
 		 342 aa  106  5e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.672218 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3010  PfkB domain protein  33.14 
 
 		 365 aa  105  8e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.489686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0202  PfkB domain protein  33.24 
 
 		 359 aa  104  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0709042  normal  0.0337983 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1865  ribokinase-like domain-containing protein  30 
 
 		 320 aa  101  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.314409  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2815  PfkB  36.28 
 
 		 314 aa  101  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3696  ribokinase-like domain-containing protein  31.75 
 
 		 301 aa  99.8  6e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.657474  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2132  PfkB domain protein  32.29 
 
 		 344 aa  99.4  9e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0949  ribokinase-like domain-containing protein  31.75 
 
 		 301 aa  97.8  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.206012 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0006  PfkB domain protein  29.36 
 
 		 312 aa  97.4  3e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.997573  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0377  PfkB domain protein  30.65 
 
 		 319 aa  95.9  9e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.404819  normal  0.365266 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  29.08 
 
 		 317 aa  94.4  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0189  PfkB family carbohydrate kinase  32.14 
 
 		 339 aa  88.6  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  34.29 
 
 		 329 aa  87.8  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2438  PfkB domain protein  40.7 
 
 		 323 aa  87.4  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1382  PfkB domain protein  31.42 
 
 		 326 aa  86.7  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847746  normal  0.299274 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5479  PfkB domain protein  36.15 
 
 		 321 aa  86.7  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0722  PfkB domain protein  32.14 
 
 		 363 aa  83.6  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.140829 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0078  PfkB  32.48 
 
 		 318 aa  83.6  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1626  PfkB domain protein  31.19 
 
 		 319 aa  78.6  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  0.814532 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4676  PfkB domain protein  34.83 
 
 		 327 aa  76.3  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0212656  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0130  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  23.32 
 
 		 320 aa  75.9  0.000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2566  ribokinase-like domain-containing protein  30.1 
 
 		 316 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255946  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3008  PfkB domain protein  29.7 
 
 		 343 aa  72  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.554278  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0115  PfkB domain protein  19.74 
 
 		 313 aa  70.9  0.00000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01440  sugar kinase, ribokinase  28.94 
 
 		 315 aa  70.9  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1737  PfkB  29.53 
 
 		 314 aa  70.5  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.482727  normal  0.803501 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2067  ribokinase-like domain-containing protein  31.27 
 
 		 324 aa  69.7  0.00000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0314864  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26890  2-ketogluconate kinase  27.46 
 
 		 314 aa  69.7  0.00000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00940196  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3887  PfkB domain-containing protein  26.1 
 
 		 314 aa  69.3  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.316925  normal  0.428898 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0260  2-keto-3-deoxygluconate kinase  31.21 
 
 		 325 aa  68.9  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3414  PfkB domain protein  29.35 
 
 		 317 aa  68.9  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2428  PfkB domain protein  31.69 
 
 		 318 aa  66.2  0.0000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000311556  hitchhiker  0.00635887 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0274  PfkB  26.51 
 
 		 306 aa  65.9  0.0000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3378  PfkB domain protein  29.25 
 
 		 316 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0607501 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>