290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0908 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_0908  PfkB domain protein  100 
 
 
367 aa  741    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.288989  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27180  sugar kinase, ribokinase  81.74 
 
 
372 aa  620  1e-176  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.771219  normal  0.49339 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3010  PfkB domain protein  71.58 
 
 
365 aa  534  1e-151  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.489686  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2208  PfkB domain protein  68.22 
 
 
366 aa  506  9.999999999999999e-143  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235888  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4259  ribokinase-like domain-containing protein  65.21 
 
 
365 aa  493  9.999999999999999e-139  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3191  PfkB domain protein  61.64 
 
 
366 aa  480  1e-134  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000772988  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1761  ribokinase-like domain-containing protein  58.79 
 
 
368 aa  441  1e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.550108  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0202  PfkB domain protein  57.14 
 
 
359 aa  387  1e-106  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0709042  normal  0.0337983 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0227  ribokinase-like domain-containing protein  54.24 
 
 
353 aa  371  1e-101  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2098  PfkB domain protein  45.22 
 
 
360 aa  300  2e-80  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0857  ribokinase-like domain-containing protein  38.42 
 
 
339 aa  210  3e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0880  ribokinase-like domain-containing protein  38.14 
 
 
339 aa  207  2e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2275  PfkB domain protein  38.2 
 
 
342 aa  204  2e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1160  PfkB domain protein  37.92 
 
 
342 aa  204  2e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2739  ribokinase-like domain-containing protein  37.29 
 
 
343 aa  198  1.0000000000000001e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000138473  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1598  PfkB domain protein  38.81 
 
 
341 aa  196  7e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2713  PfkB domain protein  32.39 
 
 
340 aa  180  2.9999999999999997e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0419  PfkB  35.13 
 
 
340 aa  178  1e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0157  KHG/KDPG family aldolase/carbohydrate kinase  31.92 
 
 
590 aa  175  9.999999999999999e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00034655  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4125  PfkB domain protein  32.01 
 
 
331 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.197329 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2385  PfkB domain protein  31.59 
 
 
342 aa  164  3e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0227  ribokinase-like domain-containing protein  29.86 
 
 
344 aa  162  1e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.068215  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4261  ribokinase-like domain-containing protein  33.8 
 
 
348 aa  160  3e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1057  PfkB domain protein  33.33 
 
 
330 aa  160  4e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.443238  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2044  PfkB domain protein  30.9 
 
 
340 aa  157  3e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0945186  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11458  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  30.66 
 
 
341 aa  151  1e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.216935  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0342  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  29.55 
 
 
334 aa  149  6e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.70493  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1329  2-keto-3-deoxygluconate kinase  26.32 
 
 
342 aa  149  6e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1380  PfkB domain protein  30.66 
 
 
331 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000087223  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1671  PfkB domain protein  29.68 
 
 
338 aa  144  3e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0697  2-keto-3-deoxygluconate kinase  29.72 
 
 
341 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1379  PfkB domain protein  29.01 
 
 
340 aa  142  9.999999999999999e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4058  PfkB domain protein  31.14 
 
 
338 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03455  2-keto-3-deoxygluconate kinase  31.83 
 
 
340 aa  138  2e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3346  PfkB domain protein  31.09 
 
 
351 aa  136  4e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2071  PfkB domain protein  31.87 
 
 
339 aa  136  5e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.139149  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0674  PfkB domain protein  26.05 
 
 
337 aa  130  3e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0398  PfkB family kinase  30.14 
 
 
339 aa  129  7.000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0394  ribokinase family sugar kinase  30.14 
 
 
339 aa  127  3e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2509  PfkB domain protein  33.15 
 
 
317 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.893739 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1906  carbohydrate kinase  25.87 
 
 
335 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2264  PfkB domain protein  29.12 
 
 
331 aa  117  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.123147 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1699  ribokinase-like domain-containing protein  29.59 
 
 
329 aa  114  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2644  PfkB  28.81 
 
 
334 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4957  carbohydrate kinase, PfkB family  27.82 
 
 
338 aa  113  6e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6831  PfkB domain protein  28.74 
 
 
332 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.743211 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1246  PfkB domain protein  28.57 
 
 
342 aa  111  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.463266  normal  0.070655 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4737  carbohydrate kinase  27.55 
 
 
338 aa  110  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5097  carbohydrate kinase  27.55 
 
 
338 aa  110  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2870  PfkB domain protein  29.6 
 
 
318 aa  110  3e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4577  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  27.27 
 
 
338 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2277  PfkB domain protein  28.37 
 
 
332 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.262567  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3215  PfkB domain protein  29.75 
 
 
317 aa  109  6e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3036  PfkB  29.83 
 
 
342 aa  108  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.835222 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4985  carbohydrate kinase, PfkB family  26.59 
 
 
338 aa  107  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4596  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  26.32 
 
 
338 aa  105  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5000  carbohydrate kinase  25.49 
 
 
338 aa  104  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4972  carbohydrate kinase, PfkB family  24.93 
 
 
338 aa  104  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3516  ribokinase-like domain-containing protein  31.53 
 
 
336 aa  103  4e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.300255  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0263  carbohydrate kinase, PfkB family  25.48 
 
 
338 aa  103  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.957258  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4686  ribokinase-like domain-containing protein  24.93 
 
 
338 aa  103  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0669  ribokinase-like domain-containing protein  24.08 
 
 
343 aa  103  7e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0463  PfkB domain protein  29.48 
 
 
318 aa  102  8e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.949852 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1292  PfkB domain protein  30.06 
 
 
317 aa  95.1  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.282801  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0442  PfkB domain protein  24.62 
 
 
326 aa  90.5  4e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3414  PfkB domain protein  29.65 
 
 
317 aa  88.2  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0300  myo-inositol catabolism protein  26.79 
 
 
332 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0082  myo-inositol catabolism protein IolC  24.4 
 
 
338 aa  82.4  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  30.29 
 
 
317 aa  82  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2252  carbohydrate kinase; myo-inositol catabolism protein  26.51 
 
 
332 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.608064  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2333  iolC protein  26.51 
 
 
332 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2296  myo-inositol catabolism protein  26.51 
 
 
332 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.192741  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2512  myo-inositol catabolism protein IolC  26.51 
 
 
332 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1865  ribokinase-like domain-containing protein  27.68 
 
 
320 aa  79.7  0.00000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.314409  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1268  PfkB domain protein  27.49 
 
 
333 aa  79  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.63046  normal  0.760626 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3911  PfkB domain protein  30.49 
 
 
321 aa  78.2  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.27465  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2067  ribokinase-like domain-containing protein  29.33 
 
 
324 aa  77.4  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0314864  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26890  2-ketogluconate kinase  28.14 
 
 
314 aa  77  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00940196  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0189  PfkB family carbohydrate kinase  27.25 
 
 
339 aa  77  0.0000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7803  PfkB domain protein  29.32 
 
 
640 aa  76.6  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3707  ribokinase-like domain-containing protein  25.07 
 
 
319 aa  73.9  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.973516 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2283  PfkB domain protein  26.74 
 
 
321 aa  73.2  0.000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.196107  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2438  PfkB domain protein  30.67 
 
 
323 aa  73.2  0.000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0169  ribokinase-like domain-containing protein  25.89 
 
 
312 aa  72  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2902  PfkB  28.04 
 
 
345 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.358173  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3696  ribokinase-like domain-containing protein  28.01 
 
 
301 aa  72  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.657474  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2979  putative 2-ketogluconate kinase  27.68 
 
 
316 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.441094  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2315  ribokinase-like domain-containing protein  28.57 
 
 
636 aa  70.9  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0078  PfkB  28.41 
 
 
318 aa  71.2  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0949  ribokinase-like domain-containing protein  27.11 
 
 
301 aa  70.5  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.206012 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0369  ribokinase-like domain-containing protein  28.12 
 
 
322 aa  69.7  0.00000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0933  PfkB domain protein  22.13 
 
 
313 aa  69.3  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0971681  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0377  PfkB domain protein  29.07 
 
 
319 aa  68.9  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.404819  normal  0.365266 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3547  ribokinase-like domain-containing protein  27.84 
 
 
646 aa  68.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2569  ribokinase-like domain-containing protein  27.7 
 
 
316 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5056  PfkB domain protein  26.74 
 
 
320 aa  68.6  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1737  PfkB  26.71 
 
 
314 aa  67.8  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.482727  normal  0.803501 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2413  PfkB domain protein  26.77 
 
 
642 aa  67.8  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4018  PfkB domain protein  21.86 
 
 
338 aa  67.8  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00301504  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1676  ribokinase-like domain-containing protein  27.6 
 
 
635 aa  67.8  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.588931 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>