More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1160 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1160  PfkB domain protein  100 
 
 		 342 aa  691    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2275  PfkB domain protein  98.25 
 
 		 342 aa  681    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0419  PfkB  61.58 
 
 		 340 aa  426  1e-118  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0857  ribokinase-like domain-containing protein  59.65 
 
 		 339 aa  423  1e-117  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0880  ribokinase-like domain-containing protein  59.94 
 
 		 339 aa  423  1e-117  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1598  PfkB domain protein  61 
 
 		 341 aa  420  1e-116  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2739  ribokinase-like domain-containing protein  58.48 
 
 		 343 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000138473  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0157  KHG/KDPG family aldolase/carbohydrate kinase  56.3 
 
 		 590 aa  396  1e-109  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00034655  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2713  PfkB domain protein  54.41 
 
 		 340 aa  383  1e-105  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4261  ribokinase-like domain-containing protein  47.97 
 
 		 348 aa  310  2e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1057  PfkB domain protein  45.06 
 
 		 330 aa  282  7.000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.443238  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2385  PfkB domain protein  42.27 
 
 		 342 aa  280  4e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1379  PfkB domain protein  41.11 
 
 		 340 aa  277  2e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11458  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  42.98 
 
 		 341 aa  275  1.0000000000000001e-72  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.216935  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1380  PfkB domain protein  41.44 
 
 		 331 aa  269  4e-71  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000087223  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4125  PfkB domain protein  43.02 
 
 		 331 aa  267  2e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.197329 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3346  PfkB domain protein  41.28 
 
 		 351 aa  254  2.0000000000000002e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2044  PfkB domain protein  36.55 
 
 		 340 aa  236  3e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0945186  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4058  PfkB domain protein  38.35 
 
 		 338 aa  236  3e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0342  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  35.86 
 
 		 334 aa  223  3e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.70493  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0669  ribokinase-like domain-containing protein  32.27 
 
 		 343 aa  222  6e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1761  ribokinase-like domain-containing protein  39.6 
 
 		 368 aa  221  1.9999999999999999e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.550108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0398  PfkB family kinase  37.18 
 
 		 339 aa  217  2e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2208  PfkB domain protein  40.68 
 
 		 366 aa  211  1e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1671  PfkB domain protein  34.82 
 
 		 338 aa  211  1e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2644  PfkB  37.1 
 
 		 334 aa  211  1e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0394  ribokinase family sugar kinase  36.31 
 
 		 339 aa  211  2e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27180  sugar kinase, ribokinase  38.66 
 
 		 372 aa  208  1e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.771219  normal  0.49339 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2071  PfkB domain protein  39.04 
 
 		 339 aa  208  1e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.139149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6831  PfkB domain protein  38.46 
 
 		 332 aa  205  1e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.743211 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4259  ribokinase-like domain-containing protein  37.71 
 
 		 365 aa  205  1e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0674  PfkB domain protein  34.71 
 
 		 337 aa  204  3e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1329  2-keto-3-deoxygluconate kinase  34 
 
 		 342 aa  202  8e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3191  PfkB domain protein  35.75 
 
 		 366 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000772988  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0697  2-keto-3-deoxygluconate kinase  35.09 
 
 		 341 aa  199  6e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03455  2-keto-3-deoxygluconate kinase  36.94 
 
 		 340 aa  197  3e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2264  PfkB domain protein  34.14 
 
 		 331 aa  192  1e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.123147 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2509  PfkB domain protein  37.83 
 
 		 317 aa  191  2e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.893739 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0908  PfkB domain protein  37.92 
 
 		 367 aa  190  2.9999999999999997e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.288989  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3215  PfkB domain protein  35.82 
 
 		 317 aa  186  4e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1292  PfkB domain protein  38.39 
 
 		 317 aa  186  5e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.282801  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0227  ribokinase-like domain-containing protein  32.54 
 
 		 344 aa  186  6e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.068215  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3010  PfkB domain protein  37.71 
 
 		 365 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.489686  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0463  PfkB domain protein  37.57 
 
 		 318 aa  183  3e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.949852 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2870  PfkB domain protein  36.42 
 
 		 318 aa  181  1e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0227  ribokinase-like domain-containing protein  35.49 
 
 		 353 aa  181  2e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5000  carbohydrate kinase  30.55 
 
 		 338 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2098  PfkB domain protein  34.55 
 
 		 360 aa  179  4.999999999999999e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4686  ribokinase-like domain-containing protein  30.26 
 
 		 338 aa  178  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3036  PfkB  34.47 
 
 		 342 aa  176  4e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.835222 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4972  carbohydrate kinase, PfkB family  30.26 
 
 		 338 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4957  carbohydrate kinase, PfkB family  29.97 
 
 		 338 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4737  carbohydrate kinase  29.68 
 
 		 338 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5097  carbohydrate kinase  29.68 
 
 		 338 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4596  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  29.97 
 
 		 338 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4985  carbohydrate kinase, PfkB family  29.97 
 
 		 338 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1246  PfkB domain protein  33.87 
 
 		 342 aa  171  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.463266  normal  0.070655 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1906  carbohydrate kinase  30.12 
 
 		 335 aa  171  2e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0263  carbohydrate kinase, PfkB family  29.68 
 
 		 338 aa  170  3e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.957258  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4577  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  29.39 
 
 		 338 aa  170  4e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1699  ribokinase-like domain-containing protein  35.26 
 
 		 329 aa  168  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3516  ribokinase-like domain-containing protein  37.03 
 
 		 336 aa  166  4e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.300255  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2283  PfkB domain protein  32.84 
 
 		 321 aa  151  2e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.196107  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0202  PfkB domain protein  34.47 
 
 		 359 aa  149  6e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0709042  normal  0.0337983 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0442  PfkB domain protein  27.25 
 
 		 326 aa  147  3e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2277  PfkB domain protein  30.38 
 
 		 332 aa  145  9e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.262567  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3911  PfkB domain protein  32.04 
 
 		 321 aa  139  6e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.27465  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5056  PfkB domain protein  31.5 
 
 		 320 aa  125  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0377  PfkB domain protein  29.97 
 
 		 319 aa  119  7e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.404819  normal  0.365266 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0006  PfkB domain protein  29.82 
 
 		 312 aa  118  9.999999999999999e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.997573  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2132  PfkB domain protein  30.03 
 
 		 344 aa  115  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4291  PfkB domain protein  31.38 
 
 		 342 aa  112  6e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.672218 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2438  PfkB domain protein  31.37 
 
 		 323 aa  113  6e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  32.14 
 
 		 317 aa  109  6e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  29.02 
 
 		 329 aa  102  1e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0369  ribokinase-like domain-containing protein  30.1 
 
 		 322 aa  101  2e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0078  PfkB  30.54 
 
 		 318 aa  99.8  6e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01440  sugar kinase, ribokinase  24.34 
 
 		 315 aa  96.3  6e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3696  ribokinase-like domain-containing protein  32.84 
 
 		 301 aa  93.2  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.657474  normal  0.0341375 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0933  PfkB domain protein  26.95 
 
 		 313 aa  89  1e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0971681  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0949  ribokinase-like domain-containing protein  32.32 
 
 		 301 aa  89  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.206012 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  28.9 
 
 		 326 aa  87  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1297  2-keto-3-deoxygalactonate kinase / 2-keto-3-deoxygluconate kinase  26.71 
 
 		 308 aa  86.7  6e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5016  PfkB domain protein  35.47 
 
 		 321 aa  85.5  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.816187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4676  PfkB domain protein  32.31 
 
 		 327 aa  84.3  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0212656  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0082  myo-inositol catabolism protein IolC  25.48 
 
 		 338 aa  84.3  0.000000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5081  ribokinase family sugar kinase  26.16 
 
 		 308 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3707  ribokinase-like domain-containing protein  25.76 
 
 		 319 aa  83.6  0.000000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.973516 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0722  PfkB domain protein  31.4 
 
 		 363 aa  83.2  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.140829 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1626  PfkB domain protein  26.97 
 
 		 319 aa  82.4  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  0.814532 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6298  PfkB  26.41 
 
 		 308 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1865  ribokinase-like domain-containing protein  27.06 
 
 		 320 aa  82.4  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.314409  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1781  ribokinase-like domain-containing protein  26.41 
 
 		 308 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630486  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4404  ribokinase-like domain-containing protein  28.37 
 
 		 322 aa  80.5  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1806  ribokinase-like domain-containing protein  25.33 
 
 		 308 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.420282 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2753  PfkB  27.37 
 
 		 308 aa  79.7  0.00000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.116104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5091  PfkB  27.42 
 
 		 309 aa  79.3  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.170499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0954  PfkB domain protein  25.84 
 
 		 321 aa  78.6  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.102628  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4018  PfkB domain protein  25.08 
 
 		 338 aa  78.2  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00301504  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0025  ribokinase-like domain-containing protein  23.05 
 
 		 307 aa  78.2  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.112625  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>