288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0202 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_0202  PfkB domain protein  100 
 
 
359 aa  689    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0709042  normal  0.0337983 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27180  sugar kinase, ribokinase  59.94 
 
 
372 aa  415  9.999999999999999e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.771219  normal  0.49339 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2208  PfkB domain protein  61.1 
 
 
366 aa  405  1.0000000000000001e-112  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235888  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3010  PfkB domain protein  61.88 
 
 
365 aa  400  9.999999999999999e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.489686  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0908  PfkB domain protein  56.99 
 
 
367 aa  385  1e-106  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.288989  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3191  PfkB domain protein  50 
 
 
366 aa  385  1e-106  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000772988  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4259  ribokinase-like domain-containing protein  52.49 
 
 
365 aa  372  1e-102  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0227  ribokinase-like domain-containing protein  55.46 
 
 
353 aa  357  1.9999999999999998e-97  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1761  ribokinase-like domain-containing protein  48.21 
 
 
368 aa  338  5.9999999999999996e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.550108  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2098  PfkB domain protein  41.85 
 
 
360 aa  248  1e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4125  PfkB domain protein  33.53 
 
 
331 aa  163  4.0000000000000004e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.197329 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2739  ribokinase-like domain-containing protein  34 
 
 
343 aa  159  1e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000138473  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1160  PfkB domain protein  34.47 
 
 
342 aa  156  4e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2385  PfkB domain protein  30.35 
 
 
342 aa  155  1e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0227  ribokinase-like domain-containing protein  29.46 
 
 
344 aa  154  2e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.068215  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1057  PfkB domain protein  34.9 
 
 
330 aa  153  4e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.443238  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1329  2-keto-3-deoxygluconate kinase  28.41 
 
 
342 aa  153  5.9999999999999996e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2275  PfkB domain protein  34.19 
 
 
342 aa  152  7e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4058  PfkB domain protein  28.61 
 
 
338 aa  150  4e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11458  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  30.23 
 
 
341 aa  147  3e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.216935  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2713  PfkB domain protein  28.37 
 
 
340 aa  147  4.0000000000000006e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0342  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  30.55 
 
 
334 aa  146  6e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.70493  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1598  PfkB domain protein  32.38 
 
 
341 aa  145  1e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4261  ribokinase-like domain-containing protein  31.34 
 
 
348 aa  143  4e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0419  PfkB  32.68 
 
 
340 aa  142  8e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2044  PfkB domain protein  25.8 
 
 
340 aa  141  9.999999999999999e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0945186  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0157  KHG/KDPG family aldolase/carbohydrate kinase  30.77 
 
 
590 aa  141  1.9999999999999998e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00034655  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0697  2-keto-3-deoxygluconate kinase  27.76 
 
 
341 aa  139  8.999999999999999e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2071  PfkB domain protein  35.63 
 
 
339 aa  138  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.139149  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0880  ribokinase-like domain-containing protein  30.66 
 
 
339 aa  136  5e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0857  ribokinase-like domain-containing protein  30.37 
 
 
339 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1671  PfkB domain protein  28.07 
 
 
338 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1380  PfkB domain protein  30.06 
 
 
331 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000087223  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3215  PfkB domain protein  32.84 
 
 
317 aa  127  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0398  PfkB family kinase  31.62 
 
 
339 aa  124  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03455  2-keto-3-deoxygluconate kinase  33.81 
 
 
340 aa  122  7e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2264  PfkB domain protein  31.5 
 
 
331 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.123147 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1906  carbohydrate kinase  28.03 
 
 
335 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2870  PfkB domain protein  32.26 
 
 
318 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0674  PfkB domain protein  27.03 
 
 
337 aa  117  3e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2509  PfkB domain protein  31.4 
 
 
317 aa  117  3.9999999999999997e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.893739 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0394  ribokinase family sugar kinase  29.18 
 
 
339 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3346  PfkB domain protein  29.97 
 
 
351 aa  117  5e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1292  PfkB domain protein  32.71 
 
 
317 aa  116  6e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.282801  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6831  PfkB domain protein  29.57 
 
 
332 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.743211 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1379  PfkB domain protein  28.25 
 
 
340 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3036  PfkB  32.64 
 
 
342 aa  114  3e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.835222 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1246  PfkB domain protein  30.84 
 
 
342 aa  110  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.463266  normal  0.070655 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2644  PfkB  30.72 
 
 
334 aa  108  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1699  ribokinase-like domain-containing protein  33.63 
 
 
329 aa  107  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2277  PfkB domain protein  32.45 
 
 
332 aa  103  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.262567  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4737  carbohydrate kinase  26.41 
 
 
338 aa  102  7e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5097  carbohydrate kinase  26.41 
 
 
338 aa  102  7e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4957  carbohydrate kinase, PfkB family  26.41 
 
 
338 aa  102  9e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4577  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  26.41 
 
 
338 aa  102  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0463  PfkB domain protein  32.53 
 
 
318 aa  102  1e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.949852 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0669  ribokinase-like domain-containing protein  24.48 
 
 
343 aa  102  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4972  carbohydrate kinase, PfkB family  26.19 
 
 
338 aa  100  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0263  carbohydrate kinase, PfkB family  26.19 
 
 
338 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.957258  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4985  carbohydrate kinase, PfkB family  26.19 
 
 
338 aa  96.3  7e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4596  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  26.19 
 
 
338 aa  96.3  8e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3516  ribokinase-like domain-containing protein  31.56 
 
 
336 aa  93.2  6e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.300255  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5000  carbohydrate kinase  25.3 
 
 
338 aa  92.8  8e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0933  PfkB domain protein  26.71 
 
 
313 aa  91.7  2e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0971681  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2283  PfkB domain protein  31.3 
 
 
321 aa  91.7  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.196107  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4686  ribokinase-like domain-containing protein  25.44 
 
 
338 aa  91.3  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0006  PfkB domain protein  30.51 
 
 
312 aa  89.7  6e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.997573  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3414  PfkB domain protein  29.1 
 
 
317 aa  89.7  8e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0169  ribokinase-like domain-containing protein  28.7 
 
 
312 aa  87.8  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3911  PfkB domain protein  30.29 
 
 
321 aa  87  5e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.27465  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0369  ribokinase-like domain-containing protein  32.64 
 
 
322 aa  86.3  7e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2438  PfkB domain protein  33.13 
 
 
323 aa  86.3  8e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  31.78 
 
 
317 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7727  ribokinase-like domain-containing protein  33.22 
 
 
314 aa  84.7  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0275  PfkB domain-containing protein  30.77 
 
 
312 aa  83.6  0.000000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0442  PfkB domain protein  25.42 
 
 
326 aa  83.6  0.000000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1865  ribokinase-like domain-containing protein  29.7 
 
 
320 aa  83.2  0.000000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.314409  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01440  sugar kinase, ribokinase  34.73 
 
 
315 aa  82.8  0.000000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26890  2-ketogluconate kinase  28.53 
 
 
314 aa  79.3  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00940196  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2132  PfkB domain protein  33.14 
 
 
344 aa  79  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2979  putative 2-ketogluconate kinase  30.58 
 
 
316 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.441094  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2902  PfkB  28.34 
 
 
345 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.358173  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0078  PfkB  32.14 
 
 
318 aa  77.8  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1486  ribokinase-like domain-containing protein  30.03 
 
 
315 aa  76.6  0.0000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2067  ribokinase-like domain-containing protein  32.32 
 
 
324 aa  76.6  0.0000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0314864  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2296  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  31.93 
 
 
329 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1980  sugar (2-ketogluconate) kinase  29.54 
 
 
327 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0210202 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5479  PfkB domain protein  32.81 
 
 
321 aa  75.9  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2096  putative 2-keto-gluconokinase  32.81 
 
 
329 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2288  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  32.31 
 
 
329 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2154  putative 2-keto-gluconokinase  32.31 
 
 
329 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.376694  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3696  ribokinase-like domain-containing protein  31.15 
 
 
301 aa  74.3  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.657474  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1268  PfkB domain protein  28.36 
 
 
333 aa  73.9  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.63046  normal  0.760626 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0189  PfkB family carbohydrate kinase  27.65 
 
 
339 aa  73.6  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5056  PfkB domain protein  31.45 
 
 
320 aa  73.6  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0961  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  32 
 
 
329 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1489  ribokinase-like domain-containing protein  32.2 
 
 
308 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538606  normal  0.0997526 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3349  PfkB  28.05 
 
 
324 aa  73.6  0.000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0814732  normal  0.201328 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35340  putative 2-ketogluconate kinase  29.66 
 
 
316 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00857937  normal  0.115887 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0949  ribokinase-like domain-containing protein  30.53 
 
 
301 aa  72.8  0.000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.206012 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>