213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1246 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_1246  PfkB domain protein  100 
 
 
342 aa  709    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.463266  normal  0.070655 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2264  PfkB domain protein  44.38 
 
 
331 aa  306  3e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.123147 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6831  PfkB domain protein  48.44 
 
 
332 aa  300  2e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.743211 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4261  ribokinase-like domain-containing protein  37.5 
 
 
348 aa  229  4e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0669  ribokinase-like domain-containing protein  36.25 
 
 
343 aa  218  1e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11458  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  34.53 
 
 
341 aa  211  2e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.216935  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2713  PfkB domain protein  33.14 
 
 
340 aa  199  7.999999999999999e-50  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0157  KHG/KDPG family aldolase/carbohydrate kinase  33.44 
 
 
590 aa  192  1e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00034655  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4125  PfkB domain protein  32.33 
 
 
331 aa  182  6e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.197329 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0857  ribokinase-like domain-containing protein  34.32 
 
 
339 aa  182  7e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1057  PfkB domain protein  32.83 
 
 
330 aa  180  2.9999999999999997e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.443238  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1160  PfkB domain protein  32.92 
 
 
342 aa  179  7e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0880  ribokinase-like domain-containing protein  34.62 
 
 
339 aa  179  8e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2275  PfkB domain protein  34.07 
 
 
342 aa  179  9e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0419  PfkB  33.33 
 
 
340 aa  176  5e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2044  PfkB domain protein  27.88 
 
 
340 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0945186  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2385  PfkB domain protein  31 
 
 
342 aa  166  5e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0342  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  30.84 
 
 
334 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.70493  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1379  PfkB domain protein  30.09 
 
 
340 aa  162  8.000000000000001e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0398  PfkB family kinase  29.41 
 
 
339 aa  160  4e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1598  PfkB domain protein  30.09 
 
 
341 aa  159  6e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0394  ribokinase family sugar kinase  29.41 
 
 
339 aa  157  2e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3346  PfkB domain protein  30.18 
 
 
351 aa  155  8e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2739  ribokinase-like domain-containing protein  30.48 
 
 
343 aa  155  1e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000138473  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0697  2-keto-3-deoxygluconate kinase  30.37 
 
 
341 aa  152  1e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1906  carbohydrate kinase  27.76 
 
 
335 aa  151  1e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2644  PfkB  29.81 
 
 
334 aa  149  6e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2071  PfkB domain protein  32.31 
 
 
339 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.139149  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1329  2-keto-3-deoxygluconate kinase  30.96 
 
 
342 aa  147  3e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4058  PfkB domain protein  27.58 
 
 
338 aa  145  1e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1699  ribokinase-like domain-containing protein  32.73 
 
 
329 aa  142  9e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1761  ribokinase-like domain-containing protein  33.23 
 
 
368 aa  142  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.550108  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1380  PfkB domain protein  28.12 
 
 
331 aa  139  1e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000087223  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03455  2-keto-3-deoxygluconate kinase  32.13 
 
 
340 aa  135  9.999999999999999e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0227  ribokinase-like domain-containing protein  31.29 
 
 
353 aa  133  3e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3036  PfkB  30.72 
 
 
342 aa  133  3.9999999999999996e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.835222 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3516  ribokinase-like domain-containing protein  32.15 
 
 
336 aa  132  7.999999999999999e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.300255  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0674  PfkB domain protein  25.32 
 
 
337 aa  123  5e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3191  PfkB domain protein  27.43 
 
 
366 aa  119  7.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000772988  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27180  sugar kinase, ribokinase  30.7 
 
 
372 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.771219  normal  0.49339 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2870  PfkB domain protein  31.56 
 
 
318 aa  112  6e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0908  PfkB domain protein  28.92 
 
 
367 aa  112  9e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.288989  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4259  ribokinase-like domain-containing protein  28.88 
 
 
365 aa  110  4.0000000000000004e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4972  carbohydrate kinase, PfkB family  27.08 
 
 
338 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5000  carbohydrate kinase  27.38 
 
 
338 aa  108  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2098  PfkB domain protein  29.24 
 
 
360 aa  107  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4686  ribokinase-like domain-containing protein  26.13 
 
 
338 aa  108  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4737  carbohydrate kinase  25.83 
 
 
338 aa  107  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5097  carbohydrate kinase  25.83 
 
 
338 aa  107  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0463  PfkB domain protein  37.5 
 
 
318 aa  107  3e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.949852 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4596  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  26.19 
 
 
338 aa  105  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4985  carbohydrate kinase, PfkB family  26.19 
 
 
338 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0263  carbohydrate kinase, PfkB family  26.19 
 
 
338 aa  105  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.957258  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4577  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  25.53 
 
 
338 aa  103  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4957  carbohydrate kinase, PfkB family  25.97 
 
 
338 aa  103  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2208  PfkB domain protein  29.36 
 
 
366 aa  103  4e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235888  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0227  ribokinase-like domain-containing protein  23.33 
 
 
344 aa  103  5e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.068215  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1292  PfkB domain protein  29.19 
 
 
317 aa  102  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.282801  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3010  PfkB domain protein  28.65 
 
 
365 aa  102  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.489686  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0202  PfkB domain protein  29.15 
 
 
359 aa  101  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0709042  normal  0.0337983 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1671  PfkB domain protein  25.08 
 
 
338 aa  99.8  6e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2277  PfkB domain protein  27.7 
 
 
332 aa  99  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.262567  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2438  PfkB domain protein  35.43 
 
 
323 aa  97.4  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3215  PfkB domain protein  29.19 
 
 
317 aa  94.7  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  27.18 
 
 
317 aa  90.9  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2509  PfkB domain protein  29.31 
 
 
317 aa  89.7  6e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.893739 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0442  PfkB domain protein  22.94 
 
 
326 aa  88.2  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2283  PfkB domain protein  27.15 
 
 
321 aa  87  4e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.196107  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1865  ribokinase-like domain-containing protein  26.47 
 
 
320 aa  85.5  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.314409  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0078  PfkB  26.81 
 
 
318 aa  82.4  0.000000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  27.67 
 
 
329 aa  81.3  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0189  PfkB family carbohydrate kinase  26.63 
 
 
339 aa  77.8  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3911  PfkB domain protein  28.74 
 
 
321 aa  78.2  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.27465  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2132  PfkB domain protein  28.62 
 
 
344 aa  77.8  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3414  PfkB domain protein  25.54 
 
 
317 aa  73.9  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1737  PfkB  26.07 
 
 
314 aa  73.2  0.000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.482727  normal  0.803501 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1382  PfkB domain protein  26.69 
 
 
326 aa  71.6  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847746  normal  0.299274 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5056  PfkB domain protein  28.43 
 
 
320 aa  72  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29260  sugar kinase, ribokinase  27.74 
 
 
311 aa  71.6  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.466231 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01440  sugar kinase, ribokinase  28.77 
 
 
315 aa  70.1  0.00000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0115  PfkB domain protein  21.32 
 
 
313 aa  69.7  0.00000000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26890  2-ketogluconate kinase  25.23 
 
 
314 aa  68.9  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00940196  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2902  PfkB  26.25 
 
 
345 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.358173  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0130  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  23.53 
 
 
320 aa  68.9  0.0000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2291  PfkB domain protein  24.92 
 
 
329 aa  68.6  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0369  ribokinase-like domain-containing protein  26.09 
 
 
322 aa  67.4  0.0000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0756  PfkB domain protein  24.01 
 
 
329 aa  67  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0819977  normal  0.156556 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0260  2-keto-3-deoxygluconate kinase  23.38 
 
 
325 aa  66.6  0.0000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2566  ribokinase-like domain-containing protein  24.38 
 
 
316 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255946  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2815  PfkB  26.94 
 
 
314 aa  65.9  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0690  PfkB domain protein  23.84 
 
 
329 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.107436  normal  0.316336 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1486  ribokinase-like domain-containing protein  24.3 
 
 
315 aa  65.9  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0169  ribokinase-like domain-containing protein  25.75 
 
 
312 aa  65.9  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2979  putative 2-ketogluconate kinase  26.67 
 
 
316 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.441094  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1746  ribokinase-like domain-containing protein  23.63 
 
 
330 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.931195 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6346  PfkB  23.63 
 
 
330 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1733  ribokinase-like domain-containing protein  23.63 
 
 
330 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5479  PfkB domain protein  26.55 
 
 
321 aa  63.9  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35340  putative 2-ketogluconate kinase  26.94 
 
 
316 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00857937  normal  0.115887 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  27.5 
 
 
323 aa  63.5  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>