256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4125 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4125  PfkB domain protein  100 
 
 		 331 aa  679    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.197329 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1057  PfkB domain protein  51.67 
 
 		 330 aa  364  1e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.443238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4261  ribokinase-like domain-containing protein  42.23 
 
 		 348 aa  295  7e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2713  PfkB domain protein  42.27 
 
 		 340 aa  278  9e-74  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0419  PfkB  43.44 
 
 		 340 aa  277  1e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2739  ribokinase-like domain-containing protein  44.48 
 
 		 343 aa  271  1e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000138473  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11458  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  38.57 
 
 		 341 aa  268  7e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.216935  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1160  PfkB domain protein  43.02 
 
 		 342 aa  267  2e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2275  PfkB domain protein  43.31 
 
 		 342 aa  266  4e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2044  PfkB domain protein  37.35 
 
 		 340 aa  247  2e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0945186  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1598  PfkB domain protein  40.88 
 
 		 341 aa  246  4.9999999999999997e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0157  KHG/KDPG family aldolase/carbohydrate kinase  38.24 
 
 		 590 aa  243  3e-63  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00034655  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0880  ribokinase-like domain-containing protein  40.94 
 
 		 339 aa  243  3e-63  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0857  ribokinase-like domain-containing protein  40.35 
 
 		 339 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2385  PfkB domain protein  37.28 
 
 		 342 aa  236  4e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0669  ribokinase-like domain-containing protein  35.42 
 
 		 343 aa  232  7.000000000000001e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0342  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  37.8 
 
 		 334 aa  223  3e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.70493  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2071  PfkB domain protein  38.28 
 
 		 339 aa  213  2.9999999999999995e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.139149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4058  PfkB domain protein  36.36 
 
 		 338 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6831  PfkB domain protein  35.51 
 
 		 332 aa  210  3e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.743211 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3346  PfkB domain protein  35.92 
 
 		 351 aa  209  7e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1380  PfkB domain protein  36.31 
 
 		 331 aa  206  6e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000087223  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2644  PfkB  36.31 
 
 		 334 aa  203  3e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3036  PfkB  38.34 
 
 		 342 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.835222 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2264  PfkB domain protein  31.87 
 
 		 331 aa  194  1e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.123147 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03455  2-keto-3-deoxygluconate kinase  37.24 
 
 		 340 aa  192  7e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1379  PfkB domain protein  30.79 
 
 		 340 aa  185  9e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3516  ribokinase-like domain-containing protein  37.43 
 
 		 336 aa  182  8.000000000000001e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.300255  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1329  2-keto-3-deoxygluconate kinase  30.81 
 
 		 342 aa  180  2.9999999999999997e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3191  PfkB domain protein  33.99 
 
 		 366 aa  180  2.9999999999999997e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000772988  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0697  2-keto-3-deoxygluconate kinase  30.26 
 
 		 341 aa  176  4e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1246  PfkB domain protein  32.33 
 
 		 342 aa  176  6e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.463266  normal  0.070655 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0674  PfkB domain protein  32.06 
 
 		 337 aa  175  9.999999999999999e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4259  ribokinase-like domain-containing protein  34.88 
 
 		 365 aa  173  2.9999999999999996e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1761  ribokinase-like domain-containing protein  34.09 
 
 		 368 aa  172  5.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.550108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1699  ribokinase-like domain-containing protein  35.11 
 
 		 329 aa  171  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0398  PfkB family kinase  30.21 
 
 		 339 aa  171  2e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0394  ribokinase family sugar kinase  30.21 
 
 		 339 aa  170  3e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2208  PfkB domain protein  32.86 
 
 		 366 aa  167  2e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0227  ribokinase-like domain-containing protein  31.48 
 
 		 344 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.068215  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2870  PfkB domain protein  33.23 
 
 		 318 aa  162  5.0000000000000005e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27180  sugar kinase, ribokinase  31.07 
 
 		 372 aa  159  8e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.771219  normal  0.49339 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1671  PfkB domain protein  30.35 
 
 		 338 aa  157  3e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0227  ribokinase-like domain-containing protein  33.43 
 
 		 353 aa  156  4e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0463  PfkB domain protein  34.73 
 
 		 318 aa  156  6e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.949852 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0202  PfkB domain protein  33.53 
 
 		 359 aa  155  1e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0709042  normal  0.0337983 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0908  PfkB domain protein  32.01 
 
 		 367 aa  154  2e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.288989  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1906  carbohydrate kinase  29.39 
 
 		 335 aa  154  2.9999999999999998e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3215  PfkB domain protein  30.94 
 
 		 317 aa  152  8.999999999999999e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2509  PfkB domain protein  32.21 
 
 		 317 aa  150  2e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.893739 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4957  carbohydrate kinase, PfkB family  31.99 
 
 		 338 aa  149  7e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4972  carbohydrate kinase, PfkB family  31.06 
 
 		 338 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4577  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  31.68 
 
 		 338 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4985  carbohydrate kinase, PfkB family  31.37 
 
 		 338 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4737  carbohydrate kinase  31.37 
 
 		 338 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4596  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  31.06 
 
 		 338 aa  144  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5097  carbohydrate kinase  31.37 
 
 		 338 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0263  carbohydrate kinase, PfkB family  30.43 
 
 		 338 aa  144  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.957258  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2098  PfkB domain protein  30.09 
 
 		 360 aa  144  3e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3010  PfkB domain protein  32.29 
 
 		 365 aa  143  4e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.489686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4686  ribokinase-like domain-containing protein  30.43 
 
 		 338 aa  143  5e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1292  PfkB domain protein  32.27 
 
 		 317 aa  141  1.9999999999999998e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.282801  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5000  carbohydrate kinase  29.69 
 
 		 338 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2283  PfkB domain protein  31.17 
 
 		 321 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.196107  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2277  PfkB domain protein  27.54 
 
 		 332 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.262567  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0442  PfkB domain protein  28.16 
 
 		 326 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3911  PfkB domain protein  27.24 
 
 		 321 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.27465  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1382  PfkB domain protein  28.57 
 
 		 326 aa  100  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847746  normal  0.299274 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  25.4 
 
 		 317 aa  97.4  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  25.97 
 
 		 329 aa  96.3  7e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3696  ribokinase-like domain-containing protein  28.25 
 
 		 301 aa  91.7  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.657474  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0189  PfkB family carbohydrate kinase  25.88 
 
 		 339 aa  88.2  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0949  ribokinase-like domain-containing protein  26.58 
 
 		 301 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.206012 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0377  PfkB domain protein  25.69 
 
 		 319 aa  85.1  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.404819  normal  0.365266 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0369  ribokinase-like domain-containing protein  28.2 
 
 		 322 aa  84.7  0.000000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0933  PfkB domain protein  24.92 
 
 		 313 aa  83.2  0.000000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0971681  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2132  PfkB domain protein  25.8 
 
 		 344 aa  82.4  0.000000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5056  PfkB domain protein  24.76 
 
 		 320 aa  78.6  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01440  sugar kinase, ribokinase  25.15 
 
 		 315 aa  78.6  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0006  PfkB domain protein  27.14 
 
 		 312 aa  75.5  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.997573  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5081  ribokinase family sugar kinase  28.62 
 
 		 308 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89362  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3414  PfkB domain protein  25.08 
 
 		 317 aa  74.3  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2438  PfkB domain protein  24.83 
 
 		 323 aa  72.8  0.000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7727  ribokinase-like domain-containing protein  26.62 
 
 		 314 aa  70.9  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29260  sugar kinase, ribokinase  26.62 
 
 		 311 aa  70.9  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.466231 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0078  PfkB  25.31 
 
 		 318 aa  70.5  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3485  PfkB domain protein  27.21 
 
 		 347 aa  70.5  0.00000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1865  ribokinase-like domain-containing protein  22.97 
 
 		 320 aa  68.9  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.314409  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0722  PfkB domain protein  26.4 
 
 		 363 aa  67  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.140829 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0025  ribokinase-like domain-containing protein  26.47 
 
 		 307 aa  66.6  0.0000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.112625  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5091  PfkB  24.13 
 
 		 309 aa  66.2  0.0000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.170499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1489  ribokinase-like domain-containing protein  25.85 
 
 		 308 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538606  normal  0.0997526 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3008  PfkB domain protein  25.69 
 
 		 343 aa  66.2  0.0000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.554278  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0130  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  23.47 
 
 		 320 aa  65.9  0.0000000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1297  2-keto-3-deoxygalactonate kinase / 2-keto-3-deoxygluconate kinase  23.29 
 
 		 308 aa  65.9  0.0000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5016  PfkB domain protein  31.5 
 
 		 321 aa  65.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.816187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3707  ribokinase-like domain-containing protein  21.5 
 
 		 319 aa  64.7  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.973516 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0082  myo-inositol catabolism protein IolC  23.78 
 
 		 338 aa  64.3  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5491  PfkB domain protein  26.61 
 
 		 320 aa  65.1  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.386009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2067  ribokinase-like domain-containing protein  25.8 
 
 		 324 aa  64.7  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0314864  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>