292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1057 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_1057  PfkB domain protein  100 
 
 
330 aa  678    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.443238  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4125  PfkB domain protein  51.67 
 
 
331 aa  364  1e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.197329 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4261  ribokinase-like domain-containing protein  45.56 
 
 
348 aa  317  2e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11458  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  41.76 
 
 
341 aa  285  5e-76  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.216935  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1160  PfkB domain protein  45.06 
 
 
342 aa  282  6.000000000000001e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2275  PfkB domain protein  45.06 
 
 
342 aa  281  1e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0157  KHG/KDPG family aldolase/carbohydrate kinase  43.02 
 
 
590 aa  278  1e-73  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00034655  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0419  PfkB  42.15 
 
 
340 aa  268  7e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2739  ribokinase-like domain-containing protein  42.27 
 
 
343 aa  265  7e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000138473  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2713  PfkB domain protein  38.53 
 
 
340 aa  263  3e-69  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0880  ribokinase-like domain-containing protein  41.06 
 
 
339 aa  260  2e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0857  ribokinase-like domain-containing protein  40.47 
 
 
339 aa  259  3e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0669  ribokinase-like domain-containing protein  37.8 
 
 
343 aa  251  9.000000000000001e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1598  PfkB domain protein  40.76 
 
 
341 aa  250  3e-65  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2044  PfkB domain protein  37.87 
 
 
340 aa  244  1.9999999999999999e-63  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0945186  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2385  PfkB domain protein  39.36 
 
 
342 aa  227  2e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0342  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  38.74 
 
 
334 aa  222  9e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.70493  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3036  PfkB  38.8 
 
 
342 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.835222 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03455  2-keto-3-deoxygluconate kinase  39.12 
 
 
340 aa  212  7e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2071  PfkB domain protein  39.58 
 
 
339 aa  211  2e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.139149  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1379  PfkB domain protein  33.92 
 
 
340 aa  209  7e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2264  PfkB domain protein  35.31 
 
 
331 aa  207  1e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.123147 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4058  PfkB domain protein  36.14 
 
 
338 aa  207  2e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1380  PfkB domain protein  34.46 
 
 
331 aa  206  4e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000087223  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6831  PfkB domain protein  34.23 
 
 
332 aa  204  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.743211 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0398  PfkB family kinase  32.84 
 
 
339 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2644  PfkB  35.31 
 
 
334 aa  197  3e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1699  ribokinase-like domain-containing protein  38.34 
 
 
329 aa  194  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0394  ribokinase family sugar kinase  32.25 
 
 
339 aa  192  6e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3516  ribokinase-like domain-containing protein  37.09 
 
 
336 aa  190  2.9999999999999997e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.300255  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3346  PfkB domain protein  34.29 
 
 
351 aa  189  8e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1671  PfkB domain protein  33.04 
 
 
338 aa  187  2e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0697  2-keto-3-deoxygluconate kinase  31.55 
 
 
341 aa  179  8e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3191  PfkB domain protein  33.14 
 
 
366 aa  176  5e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000772988  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0674  PfkB domain protein  31.09 
 
 
337 aa  176  7e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1329  2-keto-3-deoxygluconate kinase  30.79 
 
 
342 aa  174  1.9999999999999998e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0227  ribokinase-like domain-containing protein  31.46 
 
 
344 aa  172  5e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.068215  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1246  PfkB domain protein  32.83 
 
 
342 aa  171  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.463266  normal  0.070655 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2870  PfkB domain protein  33.63 
 
 
318 aa  163  4.0000000000000004e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2208  PfkB domain protein  34.48 
 
 
366 aa  161  1e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235888  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4259  ribokinase-like domain-containing protein  33.14 
 
 
365 aa  160  4e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27180  sugar kinase, ribokinase  32.95 
 
 
372 aa  158  9e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.771219  normal  0.49339 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2509  PfkB domain protein  31.37 
 
 
317 aa  155  7e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.893739 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1906  carbohydrate kinase  28.1 
 
 
335 aa  152  5.9999999999999996e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0463  PfkB domain protein  33.04 
 
 
318 aa  152  8e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.949852 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1761  ribokinase-like domain-containing protein  31.2 
 
 
368 aa  149  4e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.550108  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0227  ribokinase-like domain-containing protein  32.65 
 
 
353 aa  149  9e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0908  PfkB domain protein  33.33 
 
 
367 aa  148  1.0000000000000001e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.288989  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0202  PfkB domain protein  34.9 
 
 
359 aa  147  3e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0709042  normal  0.0337983 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2277  PfkB domain protein  32.13 
 
 
332 aa  146  6e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.262567  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4577  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  30.18 
 
 
338 aa  142  9e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4957  carbohydrate kinase, PfkB family  30.18 
 
 
338 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4596  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  29.88 
 
 
338 aa  140  3e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4686  ribokinase-like domain-containing protein  28.53 
 
 
338 aa  140  3e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4972  carbohydrate kinase, PfkB family  29.57 
 
 
338 aa  140  3e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4985  carbohydrate kinase, PfkB family  29.57 
 
 
338 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3010  PfkB domain protein  34.77 
 
 
365 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.489686  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4737  carbohydrate kinase  29.45 
 
 
338 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5097  carbohydrate kinase  29.45 
 
 
338 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1292  PfkB domain protein  32.48 
 
 
317 aa  139  7e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.282801  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0263  carbohydrate kinase, PfkB family  29.27 
 
 
338 aa  138  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.957258  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0442  PfkB domain protein  28.57 
 
 
326 aa  138  1e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5000  carbohydrate kinase  29.27 
 
 
338 aa  137  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3215  PfkB domain protein  30 
 
 
317 aa  137  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2283  PfkB domain protein  29.85 
 
 
321 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.196107  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2098  PfkB domain protein  28.82 
 
 
360 aa  124  2e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3911  PfkB domain protein  29.72 
 
 
321 aa  111  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.27465  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2132  PfkB domain protein  28.16 
 
 
344 aa  102  7e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  27.36 
 
 
317 aa  101  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5056  PfkB domain protein  26.44 
 
 
320 aa  95.1  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0377  PfkB domain protein  34.1 
 
 
319 aa  94  3e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.404819  normal  0.365266 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2438  PfkB domain protein  31.27 
 
 
323 aa  93.2  5e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0949  ribokinase-like domain-containing protein  27.1 
 
 
301 aa  89.7  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.206012 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  28.01 
 
 
329 aa  87.8  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3696  ribokinase-like domain-containing protein  26.45 
 
 
301 aa  87.4  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.657474  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0078  PfkB  27.78 
 
 
318 aa  84.7  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0082  myo-inositol catabolism protein IolC  23.25 
 
 
338 aa  84.3  0.000000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1297  2-keto-3-deoxygalactonate kinase / 2-keto-3-deoxygluconate kinase  24.46 
 
 
308 aa  82.8  0.000000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1865  ribokinase-like domain-containing protein  26.03 
 
 
320 aa  82.8  0.000000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.314409  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0006  PfkB domain protein  25.62 
 
 
312 aa  82.4  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.997573  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0189  PfkB family carbohydrate kinase  27.3 
 
 
339 aa  81.3  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0369  ribokinase-like domain-containing protein  27.05 
 
 
322 aa  79  0.0000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3887  PfkB domain-containing protein  25.27 
 
 
314 aa  75.9  0.0000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.316925  normal  0.428898 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01440  sugar kinase, ribokinase  25.15 
 
 
315 aa  75.9  0.0000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4291  PfkB domain protein  26.84 
 
 
342 aa  74.7  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.672218 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1382  PfkB domain protein  25.96 
 
 
326 aa  74.3  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847746  normal  0.299274 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29260  sugar kinase, ribokinase  27.04 
 
 
311 aa  73.9  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.466231 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3008  PfkB domain protein  26.64 
 
 
343 aa  72.4  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.554278  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5081  ribokinase family sugar kinase  29.1 
 
 
308 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89362  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1626  PfkB domain protein  25.73 
 
 
319 aa  70.9  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  0.814532 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4676  PfkB domain protein  30 
 
 
327 aa  70.1  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0212656  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0722  PfkB domain protein  28.93 
 
 
363 aa  69.7  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.140829 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0933  PfkB domain protein  24.16 
 
 
313 aa  69.3  0.00000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0971681  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2815  PfkB  30 
 
 
314 aa  68.2  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0274  PfkB  22.56 
 
 
306 aa  67  0.0000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2291  PfkB domain protein  24.92 
 
 
329 aa  66.6  0.0000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4018  PfkB domain protein  22.57 
 
 
338 aa  66.6  0.0000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00301504  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5016  PfkB domain protein  32.5 
 
 
321 aa  66.2  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.816187  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2594  PfkB  25.78 
 
 
319 aa  65.9  0.0000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.2534  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1737  PfkB  25.08 
 
 
314 aa  65.1  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.482727  normal  0.803501 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>