More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0880 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_0857  ribokinase-like domain-containing protein  98.53 
 
 
339 aa  689    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0880  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 
339 aa  698    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2275  PfkB domain protein  59.65 
 
 
342 aa  422  1e-117  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1160  PfkB domain protein  59.94 
 
 
342 aa  423  1e-117  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0419  PfkB  54.73 
 
 
340 aa  392  1e-108  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0157  KHG/KDPG family aldolase/carbohydrate kinase  53.25 
 
 
590 aa  388  1e-106  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00034655  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2713  PfkB domain protein  52.52 
 
 
340 aa  374  1e-102  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1598  PfkB domain protein  52.66 
 
 
341 aa  352  4e-96  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2739  ribokinase-like domain-containing protein  53.67 
 
 
343 aa  346  3e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000138473  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1379  PfkB domain protein  44.71 
 
 
340 aa  291  2e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2385  PfkB domain protein  42.65 
 
 
342 aa  276  5e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1380  PfkB domain protein  42.3 
 
 
331 aa  266  2.9999999999999995e-70  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000087223  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4261  ribokinase-like domain-containing protein  41.94 
 
 
348 aa  261  1e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1057  PfkB domain protein  41.06 
 
 
330 aa  260  2e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.443238  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3346  PfkB domain protein  39.71 
 
 
351 aa  243  3e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4125  PfkB domain protein  40.94 
 
 
331 aa  243  3e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.197329 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2044  PfkB domain protein  37.17 
 
 
340 aa  242  6e-63  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0945186  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11458  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  40.06 
 
 
341 aa  239  5.999999999999999e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.216935  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4058  PfkB domain protein  38.44 
 
 
338 aa  232  7.000000000000001e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0674  PfkB domain protein  37.09 
 
 
337 aa  229  5e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1329  2-keto-3-deoxygluconate kinase  35.07 
 
 
342 aa  211  2e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0669  ribokinase-like domain-containing protein  31.96 
 
 
343 aa  210  4e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0342  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  37.01 
 
 
334 aa  208  9e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.70493  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6831  PfkB domain protein  38.21 
 
 
332 aa  206  5e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.743211 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1761  ribokinase-like domain-containing protein  37.97 
 
 
368 aa  206  6e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.550108  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2644  PfkB  37.1 
 
 
334 aa  205  8e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2509  PfkB domain protein  36.75 
 
 
317 aa  204  1e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.893739 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3191  PfkB domain protein  38.14 
 
 
366 aa  204  2e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000772988  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3215  PfkB domain protein  37.05 
 
 
317 aa  204  2e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0697  2-keto-3-deoxygluconate kinase  33.63 
 
 
341 aa  203  4e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2071  PfkB domain protein  36.75 
 
 
339 aa  202  5e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.139149  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27180  sugar kinase, ribokinase  37.46 
 
 
372 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.771219  normal  0.49339 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03455  2-keto-3-deoxygluconate kinase  34.41 
 
 
340 aa  197  3e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1671  PfkB domain protein  34.34 
 
 
338 aa  197  3e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0398  PfkB family kinase  34.49 
 
 
339 aa  196  5.000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4259  ribokinase-like domain-containing protein  36.65 
 
 
365 aa  194  2e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0227  ribokinase-like domain-containing protein  34.73 
 
 
344 aa  194  2e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.068215  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0908  PfkB domain protein  38.14 
 
 
367 aa  194  3e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.288989  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4686  ribokinase-like domain-containing protein  32.94 
 
 
338 aa  193  4e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2208  PfkB domain protein  37.96 
 
 
366 aa  192  5e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235888  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3036  PfkB  34.33 
 
 
342 aa  192  9e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.835222 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0394  ribokinase family sugar kinase  33.91 
 
 
339 aa  191  2e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1292  PfkB domain protein  37.19 
 
 
317 aa  190  2.9999999999999997e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.282801  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1699  ribokinase-like domain-containing protein  36.11 
 
 
329 aa  188  9e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4957  carbohydrate kinase, PfkB family  32.16 
 
 
338 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4737  carbohydrate kinase  31.87 
 
 
338 aa  186  4e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5097  carbohydrate kinase  31.87 
 
 
338 aa  186  4e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4577  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  31.87 
 
 
338 aa  185  9e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4972  carbohydrate kinase, PfkB family  32.07 
 
 
338 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5000  carbohydrate kinase  32.07 
 
 
338 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4596  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  32.36 
 
 
338 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3516  ribokinase-like domain-containing protein  37.94 
 
 
336 aa  183  3e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.300255  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4985  carbohydrate kinase, PfkB family  32.07 
 
 
338 aa  181  1e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0263  carbohydrate kinase, PfkB family  31.2 
 
 
338 aa  181  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.957258  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0463  PfkB domain protein  35.74 
 
 
318 aa  180  2e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.949852 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3010  PfkB domain protein  36.83 
 
 
365 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.489686  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2264  PfkB domain protein  33.13 
 
 
331 aa  176  4e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.123147 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2870  PfkB domain protein  33.03 
 
 
318 aa  174  9.999999999999999e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1246  PfkB domain protein  35.49 
 
 
342 aa  171  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.463266  normal  0.070655 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2098  PfkB domain protein  33.8 
 
 
360 aa  169  4e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0227  ribokinase-like domain-containing protein  33.72 
 
 
353 aa  161  1e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2277  PfkB domain protein  30.41 
 
 
332 aa  161  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.262567  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2283  PfkB domain protein  33.13 
 
 
321 aa  157  3e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.196107  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1906  carbohydrate kinase  28.57 
 
 
335 aa  154  2e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0442  PfkB domain protein  28.12 
 
 
326 aa  150  3e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3911  PfkB domain protein  30.86 
 
 
321 aa  136  5e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.27465  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0202  PfkB domain protein  30.66 
 
 
359 aa  128  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0709042  normal  0.0337983 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0006  PfkB domain protein  28.96 
 
 
312 aa  120  3e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.997573  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0377  PfkB domain protein  26.75 
 
 
319 aa  113  4.0000000000000004e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.404819  normal  0.365266 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3696  ribokinase-like domain-containing protein  29.39 
 
 
301 aa  110  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.657474  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5056  PfkB domain protein  29.21 
 
 
320 aa  110  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2438  PfkB domain protein  31.33 
 
 
323 aa  109  9.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2132  PfkB domain protein  28.97 
 
 
344 aa  108  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01440  sugar kinase, ribokinase  26.92 
 
 
315 aa  108  2e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0949  ribokinase-like domain-containing protein  28.21 
 
 
301 aa  105  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.206012 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4291  PfkB domain protein  29.5 
 
 
342 aa  103  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.672218 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0078  PfkB  29.52 
 
 
318 aa  101  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2815  PfkB  31.11 
 
 
314 aa  95.9  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  28.05 
 
 
317 aa  95.1  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0722  PfkB domain protein  28.84 
 
 
363 aa  89.7  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.140829 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1297  2-keto-3-deoxygalactonate kinase / 2-keto-3-deoxygluconate kinase  25.68 
 
 
308 aa  89.7  7e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0025  ribokinase-like domain-containing protein  27.53 
 
 
307 aa  89.4  8e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.112625  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4122  PfkB  26.03 
 
 
320 aa  89  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  24.84 
 
 
329 aa  87  4e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1865  ribokinase-like domain-containing protein  25.49 
 
 
320 aa  86.7  6e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.314409  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0082  myo-inositol catabolism protein IolC  23.87 
 
 
338 aa  86.3  7e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1382  PfkB domain protein  25 
 
 
326 aa  84  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847746  normal  0.299274 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0369  ribokinase-like domain-containing protein  26.16 
 
 
322 aa  82  0.00000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5016  PfkB domain protein  33.66 
 
 
321 aa  82  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.816187  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2291  PfkB domain protein  24.38 
 
 
329 aa  80.5  0.00000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0189  PfkB family carbohydrate kinase  24.75 
 
 
339 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2118  PfkB domain protein  29.19 
 
 
307 aa  76.3  0.0000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01230  fructokinase  25.59 
 
 
311 aa  75.5  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.826599  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0115  PfkB domain protein  24.68 
 
 
313 aa  75.5  0.000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0059  ribokinase-like domain-containing protein  31.15 
 
 
319 aa  75.1  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0933  PfkB domain protein  23.68 
 
 
313 aa  74.7  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0971681  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1366  ribokinase-like domain-containing protein  26.18 
 
 
320 aa  75.1  0.000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  26.63 
 
 
326 aa  74.3  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3707  ribokinase-like domain-containing protein  24.68 
 
 
319 aa  74.3  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.973516 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  26.74 
 
 
323 aa  73.9  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>