More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2644 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2644  PfkB  100 
 
 		 334 aa  689    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0419  PfkB  39.3 
 
 		 340 aa  244  9.999999999999999e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0157  KHG/KDPG family aldolase/carbohydrate kinase  37.17 
 
 		 590 aa  224  2e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00034655  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2713  PfkB domain protein  35.88 
 
 		 340 aa  221  9.999999999999999e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2275  PfkB domain protein  37.1 
 
 		 342 aa  211  1e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1160  PfkB domain protein  37.1 
 
 		 342 aa  211  1e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0857  ribokinase-like domain-containing protein  37.1 
 
 		 339 aa  206  4e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0880  ribokinase-like domain-containing protein  37.1 
 
 		 339 aa  205  8e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4125  PfkB domain protein  36.31 
 
 		 331 aa  203  3e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.197329 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2739  ribokinase-like domain-containing protein  36.73 
 
 		 343 aa  200  1.9999999999999998e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000138473  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1598  PfkB domain protein  37.06 
 
 		 341 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1057  PfkB domain protein  35.31 
 
 		 330 aa  197  3e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.443238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1380  PfkB domain protein  35.84 
 
 		 331 aa  191  1e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000087223  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2044  PfkB domain protein  32.52 
 
 		 340 aa  187  2e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0945186  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4261  ribokinase-like domain-containing protein  32.45 
 
 		 348 aa  186  4e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4058  PfkB domain protein  34.35 
 
 		 338 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1379  PfkB domain protein  32.83 
 
 		 340 aa  181  1e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1329  2-keto-3-deoxygluconate kinase  33.33 
 
 		 342 aa  180  2.9999999999999997e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0697  2-keto-3-deoxygluconate kinase  34.76 
 
 		 341 aa  177  3e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11458  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  32.65 
 
 		 341 aa  176  3e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.216935  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2071  PfkB domain protein  38.14 
 
 		 339 aa  174  9.999999999999999e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.139149  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2385  PfkB domain protein  32.17 
 
 		 342 aa  171  2e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0342  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  33.92 
 
 		 334 aa  169  8e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.70493  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03455  2-keto-3-deoxygluconate kinase  33.43 
 
 		 340 aa  167  2.9999999999999998e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0669  ribokinase-like domain-containing protein  30.13 
 
 		 343 aa  166  5.9999999999999996e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0674  PfkB domain protein  31.45 
 
 		 337 aa  160  4e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0394  ribokinase family sugar kinase  29.59 
 
 		 339 aa  157  3e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1699  ribokinase-like domain-containing protein  32.83 
 
 		 329 aa  155  8e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0398  PfkB family kinase  28.99 
 
 		 339 aa  154  2e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3036  PfkB  33.23 
 
 		 342 aa  151  2e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.835222 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4972  carbohydrate kinase, PfkB family  30.84 
 
 		 338 aa  150  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4957  carbohydrate kinase, PfkB family  32 
 
 		 338 aa  150  4e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6831  PfkB domain protein  29.34 
 
 		 332 aa  149  5e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.743211 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4985  carbohydrate kinase, PfkB family  30.53 
 
 		 338 aa  149  5e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5000  carbohydrate kinase  31.15 
 
 		 338 aa  149  7e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4577  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  31.69 
 
 		 338 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4596  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  30.53 
 
 		 338 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0263  carbohydrate kinase, PfkB family  30.53 
 
 		 338 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.957258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4686  ribokinase-like domain-containing protein  30.53 
 
 		 338 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4737  carbohydrate kinase  31.69 
 
 		 338 aa  147  3e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5097  carbohydrate kinase  31.69 
 
 		 338 aa  147  3e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3346  PfkB domain protein  28.74 
 
 		 351 aa  145  1e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2264  PfkB domain protein  28.75 
 
 		 331 aa  144  1e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.123147 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1246  PfkB domain protein  30 
 
 		 342 aa  144  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.463266  normal  0.070655 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2870  PfkB domain protein  33.63 
 
 		 318 aa  144  3e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0463  PfkB domain protein  33.44 
 
 		 318 aa  141  9.999999999999999e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.949852 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1906  carbohydrate kinase  29.65 
 
 		 335 aa  139  7.999999999999999e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3516  ribokinase-like domain-containing protein  33.23 
 
 		 336 aa  137  4e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.300255  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0227  ribokinase-like domain-containing protein  35.31 
 
 		 353 aa  134  1.9999999999999998e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2208  PfkB domain protein  32.51 
 
 		 366 aa  129  6e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2509  PfkB domain protein  30.3 
 
 		 317 aa  126  5e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.893739 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3215  PfkB domain protein  30.22 
 
 		 317 aa  122  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1761  ribokinase-like domain-containing protein  30.68 
 
 		 368 aa  122  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.550108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1292  PfkB domain protein  41.52 
 
 		 317 aa  121  1.9999999999999998e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.282801  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0442  PfkB domain protein  26.9 
 
 		 326 aa  120  3e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0227  ribokinase-like domain-containing protein  28.4 
 
 		 344 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.068215  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1671  PfkB domain protein  26.77 
 
 		 338 aa  113  4.0000000000000004e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2283  PfkB domain protein  27.93 
 
 		 321 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.196107  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3191  PfkB domain protein  28.9 
 
 		 366 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000772988  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3911  PfkB domain protein  29.32 
 
 		 321 aa  110  4.0000000000000004e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.27465  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4259  ribokinase-like domain-containing protein  28.86 
 
 		 365 aa  107  3e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2277  PfkB domain protein  30.03 
 
 		 332 aa  107  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.262567  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27180  sugar kinase, ribokinase  29.13 
 
 		 372 aa  107  4e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.771219  normal  0.49339 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0908  PfkB domain protein  28.81 
 
 		 367 aa  105  1e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.288989  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0202  PfkB domain protein  30.72 
 
 		 359 aa  105  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0709042  normal  0.0337983 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3010  PfkB domain protein  30.95 
 
 		 365 aa  105  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.489686  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2098  PfkB domain protein  25.8 
 
 		 360 aa  101  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5056  PfkB domain protein  27.3 
 
 		 320 aa  99  9e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  28.48 
 
 		 317 aa  95.9  9e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3696  ribokinase-like domain-containing protein  28.94 
 
 		 301 aa  87.8  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.657474  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2132  PfkB domain protein  28.21 
 
 		 344 aa  87.4  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0949  ribokinase-like domain-containing protein  30.06 
 
 		 301 aa  87  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.206012 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1382  PfkB domain protein  29.26 
 
 		 326 aa  85.1  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847746  normal  0.299274 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2815  PfkB  31.64 
 
 		 314 aa  85.9  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0078  PfkB  28.03 
 
 		 318 aa  84.7  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3414  PfkB domain protein  25.87 
 
 		 317 aa  84.7  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  26.94 
 
 		 329 aa  85.1  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1737  PfkB  25.77 
 
 		 314 aa  84.3  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.482727  normal  0.803501 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0082  myo-inositol catabolism protein IolC  22.61 
 
 		 338 aa  84  0.000000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0377  PfkB domain protein  28.13 
 
 		 319 aa  82.8  0.000000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.404819  normal  0.365266 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5479  PfkB domain protein  29.18 
 
 		 321 aa  80.9  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0059  ribokinase-like domain-containing protein  28.09 
 
 		 319 aa  80.1  0.00000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26890  2-ketogluconate kinase  26.09 
 
 		 314 aa  79.7  0.00000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00940196  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2438  PfkB domain protein  28.92 
 
 		 323 aa  79.3  0.00000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0722  PfkB domain protein  27.63 
 
 		 363 aa  77.8  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.140829 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0189  PfkB family carbohydrate kinase  26.11 
 
 		 339 aa  75.1  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0130  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  27.96 
 
 		 322 aa  73.9  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.760619 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1486  ribokinase-like domain-containing protein  24.62 
 
 		 315 aa  74.3  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  26.15 
 
 		 326 aa  73.9  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0169  ribokinase-like domain-containing protein  25.45 
 
 		 312 aa  74.3  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01440  sugar kinase, ribokinase  26.54 
 
 		 315 aa  73.9  0.000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4291  PfkB domain protein  27.56 
 
 		 342 aa  73.6  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.672218 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3707  ribokinase-like domain-containing protein  23.9 
 
 		 319 aa  72.8  0.000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.973516 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4018  PfkB domain protein  21.74 
 
 		 338 aa  71.2  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00301504  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2428  PfkB domain protein  26.82 
 
 		 318 aa  70.9  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000311556  hitchhiker  0.00635887 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4676  PfkB domain protein  31.98 
 
 		 327 aa  70.9  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0212656  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2566  ribokinase-like domain-containing protein  26.52 
 
 		 316 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255946  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1865  ribokinase-like domain-containing protein  26.71 
 
 		 320 aa  68.9  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.314409  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0662  PfkB domain-containing protein  24.03 
 
 		 327 aa  68.6  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.478793  normal  0.638402 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1654  ribokinase-like domain-containing protein  24.69 
 
 		 330 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.290792  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>