297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1379 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_1379  PfkB domain protein  100 
 
 
340 aa  707    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0157  KHG/KDPG family aldolase/carbohydrate kinase  40.71 
 
 
590 aa  290  2e-77  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00034655  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0880  ribokinase-like domain-containing protein  44.71 
 
 
339 aa  291  2e-77  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0419  PfkB  41.59 
 
 
340 aa  290  3e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0857  ribokinase-like domain-containing protein  44.12 
 
 
339 aa  288  8e-77  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2713  PfkB domain protein  39.05 
 
 
340 aa  279  4e-74  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1598  PfkB domain protein  43.45 
 
 
341 aa  279  6e-74  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1160  PfkB domain protein  41.11 
 
 
342 aa  277  2e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2275  PfkB domain protein  41.11 
 
 
342 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2739  ribokinase-like domain-containing protein  42.11 
 
 
343 aa  272  6e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000138473  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1380  PfkB domain protein  35.67 
 
 
331 aa  216  4e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000087223  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0342  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  34.03 
 
 
334 aa  215  9e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.70493  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4261  ribokinase-like domain-containing protein  37.03 
 
 
348 aa  215  9e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2385  PfkB domain protein  35.09 
 
 
342 aa  213  5.999999999999999e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0669  ribokinase-like domain-containing protein  33.53 
 
 
343 aa  212  7e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2044  PfkB domain protein  32.36 
 
 
340 aa  209  5e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0945186  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1057  PfkB domain protein  33.92 
 
 
330 aa  209  7e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.443238  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3346  PfkB domain protein  35.65 
 
 
351 aa  208  1e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11458  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  36.15 
 
 
341 aa  196  4.0000000000000005e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.216935  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2071  PfkB domain protein  32.94 
 
 
339 aa  192  5e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.139149  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4058  PfkB domain protein  32.45 
 
 
338 aa  191  2e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4125  PfkB domain protein  30.79 
 
 
331 aa  185  9e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.197329 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0697  2-keto-3-deoxygluconate kinase  30.29 
 
 
341 aa  182  6e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2644  PfkB  32.83 
 
 
334 aa  181  1e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3215  PfkB domain protein  31.95 
 
 
317 aa  174  1.9999999999999998e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3036  PfkB  32.46 
 
 
342 aa  172  1e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.835222 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0398  PfkB family kinase  30.75 
 
 
339 aa  170  3e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1329  2-keto-3-deoxygluconate kinase  28.4 
 
 
342 aa  169  6e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1699  ribokinase-like domain-containing protein  34.53 
 
 
329 aa  169  9e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1761  ribokinase-like domain-containing protein  31.44 
 
 
368 aa  165  9e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.550108  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3516  ribokinase-like domain-containing protein  32.84 
 
 
336 aa  164  1.0000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.300255  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0394  ribokinase family sugar kinase  29.89 
 
 
339 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6831  PfkB domain protein  31.56 
 
 
332 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.743211 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0674  PfkB domain protein  28.44 
 
 
337 aa  160  4e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2509  PfkB domain protein  31.66 
 
 
317 aa  159  8e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.893739 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3191  PfkB domain protein  28.57 
 
 
366 aa  159  9e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000772988  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03455  2-keto-3-deoxygluconate kinase  30.84 
 
 
340 aa  158  1e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4259  ribokinase-like domain-containing protein  29.55 
 
 
365 aa  158  1e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4985  carbohydrate kinase, PfkB family  30.03 
 
 
338 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4737  carbohydrate kinase  29.13 
 
 
338 aa  156  6e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5097  carbohydrate kinase  29.13 
 
 
338 aa  156  6e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4972  carbohydrate kinase, PfkB family  29.43 
 
 
338 aa  155  7e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4577  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  29.13 
 
 
338 aa  155  9e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4596  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  29.73 
 
 
338 aa  155  9e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4957  carbohydrate kinase, PfkB family  29.13 
 
 
338 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0463  PfkB domain protein  31.85 
 
 
318 aa  155  1e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.949852 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1246  PfkB domain protein  30.09 
 
 
342 aa  154  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.463266  normal  0.070655 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0263  carbohydrate kinase, PfkB family  29.13 
 
 
338 aa  154  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.957258  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1292  PfkB domain protein  31.78 
 
 
317 aa  152  5.9999999999999996e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.282801  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4686  ribokinase-like domain-containing protein  28.53 
 
 
338 aa  152  7e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5000  carbohydrate kinase  28.74 
 
 
338 aa  151  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2870  PfkB domain protein  29.97 
 
 
318 aa  151  2e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1906  carbohydrate kinase  27.73 
 
 
335 aa  149  8e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27180  sugar kinase, ribokinase  30 
 
 
372 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.771219  normal  0.49339 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2208  PfkB domain protein  31.55 
 
 
366 aa  147  3e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235888  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2264  PfkB domain protein  28.17 
 
 
331 aa  142  8e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.123147 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0227  ribokinase-like domain-containing protein  29.34 
 
 
344 aa  141  9.999999999999999e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.068215  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3911  PfkB domain protein  30.21 
 
 
321 aa  140  3e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.27465  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1671  PfkB domain protein  27.67 
 
 
338 aa  139  7e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2283  PfkB domain protein  30.15 
 
 
321 aa  135  9.999999999999999e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.196107  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3010  PfkB domain protein  31.14 
 
 
365 aa  133  5e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.489686  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0908  PfkB domain protein  28.92 
 
 
367 aa  133  5e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.288989  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2098  PfkB domain protein  26.7 
 
 
360 aa  132  1.0000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2277  PfkB domain protein  28.32 
 
 
332 aa  129  9.000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.262567  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0227  ribokinase-like domain-containing protein  27.54 
 
 
353 aa  129  9.000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0442  PfkB domain protein  24.93 
 
 
326 aa  126  6e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0202  PfkB domain protein  28.25 
 
 
359 aa  111  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0709042  normal  0.0337983 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2438  PfkB domain protein  28.72 
 
 
323 aa  104  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0006  PfkB domain protein  25.15 
 
 
312 aa  100  5e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.997573  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  28.06 
 
 
317 aa  97.8  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1297  2-keto-3-deoxygalactonate kinase / 2-keto-3-deoxygluconate kinase  26.73 
 
 
308 aa  96.7  5e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0377  PfkB domain protein  28.36 
 
 
319 aa  92.8  8e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.404819  normal  0.365266 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5016  PfkB domain protein  33.66 
 
 
321 aa  86.7  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.816187  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7727  ribokinase-like domain-containing protein  27.99 
 
 
314 aa  82.8  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4676  PfkB domain protein  30.81 
 
 
327 aa  82.4  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0212656  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4018  PfkB domain protein  22.29 
 
 
338 aa  82.4  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00301504  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01440  sugar kinase, ribokinase  24.53 
 
 
315 aa  80.9  0.00000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5056  PfkB domain protein  25 
 
 
320 aa  80.5  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0369  ribokinase-like domain-containing protein  25.59 
 
 
322 aa  79.7  0.00000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0078  PfkB  25.39 
 
 
318 aa  78.6  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2291  PfkB domain protein  27.1 
 
 
329 aa  77.4  0.0000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4291  PfkB domain protein  26.56 
 
 
342 aa  74.7  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.672218 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2815  PfkB  27.49 
 
 
314 aa  74.3  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3696  ribokinase-like domain-containing protein  24.33 
 
 
301 aa  73.9  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.657474  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0189  PfkB family carbohydrate kinase  26.49 
 
 
339 aa  73.6  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3349  PfkB  27.55 
 
 
324 aa  73.6  0.000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0814732  normal  0.201328 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0275  PfkB domain-containing protein  25.23 
 
 
312 aa  72.8  0.000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2132  PfkB domain protein  25.24 
 
 
344 aa  72.4  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0722  PfkB domain protein  25.93 
 
 
363 aa  71.2  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.140829 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1865  ribokinase-like domain-containing protein  22.78 
 
 
320 aa  71.6  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.314409  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  26.32 
 
 
329 aa  71.2  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3008  PfkB domain protein  27.1 
 
 
343 aa  70.1  0.00000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.554278  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0949  ribokinase-like domain-containing protein  23.73 
 
 
301 aa  69.7  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.206012 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0933  PfkB domain protein  22.6 
 
 
313 aa  68.2  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0971681  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1268  PfkB domain protein  25.57 
 
 
333 aa  68.2  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.63046  normal  0.760626 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4542  PfkB domain protein  24.37 
 
 
317 aa  67.8  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0266  PfkB domain protein  24.09 
 
 
324 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0082  myo-inositol catabolism protein IolC  22.85 
 
 
338 aa  67.4  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1382  PfkB domain protein  24.38 
 
 
326 aa  66.6  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847746  normal  0.299274 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01731  putative carbohydrate kinase  25.66 
 
 
346 aa  66.6  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>