More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5491 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_5491  PfkB domain protein  100 
 
 		 320 aa  612  9.999999999999999e-175  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.386009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0189  PfkB family carbohydrate kinase  59.67 
 
 		 339 aa  317  1e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1382  PfkB domain protein  60.48 
 
 		 326 aa  301  7.000000000000001e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847746  normal  0.299274 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3887  PfkB domain-containing protein  47.14 
 
 		 314 aa  233  3e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.316925  normal  0.428898 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1865  ribokinase-like domain-containing protein  49.15 
 
 		 320 aa  226  4e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.314409  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0722  PfkB domain protein  48.26 
 
 		 363 aa  204  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.140829 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5479  PfkB domain protein  50.85 
 
 		 321 aa  203  3e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5056  PfkB domain protein  44.37 
 
 		 320 aa  185  7e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3696  ribokinase-like domain-containing protein  41.02 
 
 		 301 aa  177  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.657474  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2132  PfkB domain protein  43.37 
 
 		 344 aa  176  6e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  40.19 
 
 		 329 aa  170  3e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0949  ribokinase-like domain-containing protein  38.7 
 
 		 301 aa  166  6.9999999999999995e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.206012 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3008  PfkB domain protein  44.98 
 
 		 343 aa  162  7e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.554278  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0115  PfkB domain protein  33.68 
 
 		 313 aa  162  9e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3378  PfkB domain protein  40 
 
 		 316 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0607501 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  39.54 
 
 		 317 aa  156  5.0000000000000005e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2380  ribokinase-like domain-containing protein  39.67 
 
 		 316 aa  153  4e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2979  putative 2-ketogluconate kinase  39 
 
 		 316 aa  151  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.441094  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2278  PfkB domain protein  36.36 
 
 		 327 aa  152  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.741137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2566  ribokinase-like domain-containing protein  39.07 
 
 		 316 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255946  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5016  PfkB domain protein  41.58 
 
 		 321 aa  150  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.816187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35340  putative 2-ketogluconate kinase  38.67 
 
 		 316 aa  147  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00857937  normal  0.115887 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01440  sugar kinase, ribokinase  40.55 
 
 		 315 aa  146  4.0000000000000006e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26890  2-ketogluconate kinase  38.74 
 
 		 314 aa  145  7.0000000000000006e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00940196  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3559  ribokinase-like domain-containing protein  36.54 
 
 		 340 aa  144  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0078  PfkB  41.04 
 
 		 318 aa  143  3e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4291  PfkB domain protein  40.33 
 
 		 342 aa  143  4e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.672218 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0059  ribokinase-like domain-containing protein  35.02 
 
 		 319 aa  143  4e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6346  PfkB  38.21 
 
 		 330 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1733  ribokinase-like domain-containing protein  38.21 
 
 		 330 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2438  PfkB domain protein  36.13 
 
 		 323 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0130  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  32.78 
 
 		 320 aa  140  1.9999999999999998e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1253  ribokinase-like domain-containing protein  36.33 
 
 		 320 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0781765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1980  sugar (2-ketogluconate) kinase  36 
 
 		 327 aa  139  6e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0210202 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1746  ribokinase-like domain-containing protein  37.87 
 
 		 330 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.931195 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0274  PfkB  35.53 
 
 		 306 aa  138  1e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1654  ribokinase-like domain-containing protein  36.88 
 
 		 330 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.909879 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0169  ribokinase-like domain-containing protein  34.95 
 
 		 312 aa  137  3.0000000000000003e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1737  PfkB  36.89 
 
 		 314 aa  137  3.0000000000000003e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.482727  normal  0.803501 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1654  ribokinase-like domain-containing protein  36.54 
 
 		 330 aa  136  4e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.290792  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7727  ribokinase-like domain-containing protein  37.13 
 
 		 314 aa  136  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5029  ribokinase family sugar kinase  35.71 
 
 		 330 aa  136  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.351369 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0756  PfkB domain protein  36.25 
 
 		 329 aa  135  9e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0819977  normal  0.156556 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2902  PfkB  36.72 
 
 		 345 aa  135  9e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.358173  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1626  PfkB domain protein  37.67 
 
 		 319 aa  134  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  0.814532 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2428  PfkB domain protein  40.66 
 
 		 318 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000311556  hitchhiker  0.00635887 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2296  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  37.54 
 
 		 329 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1526  ribokinase-like domain-containing protein  36.84 
 
 		 328 aa  133  5e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.198304  normal  0.764115 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1486  ribokinase-like domain-containing protein  35.81 
 
 		 315 aa  131  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2096  putative 2-keto-gluconokinase  36.21 
 
 		 329 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2067  ribokinase-like domain-containing protein  38.64 
 
 		 324 aa  129  5.0000000000000004e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0314864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0369  ribokinase-like domain-containing protein  35.02 
 
 		 322 aa  129  6e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2288  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  36.07 
 
 		 329 aa  129  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2154  putative 2-keto-gluconokinase  36.07 
 
 		 329 aa  129  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.376694  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0690  PfkB domain protein  35.41 
 
 		 329 aa  129  6e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.107436  normal  0.316336 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3414  PfkB domain protein  35.08 
 
 		 317 aa  128  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0961  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  35.74 
 
 		 329 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2509  PfkB domain protein  34.07 
 
 		 317 aa  127  3e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.893739 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2569  ribokinase-like domain-containing protein  34.95 
 
 		 316 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1741  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  31.97 
 
 		 270 aa  125  1e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0502  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  29.34 
 
 		 320 aa  125  1e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2283  PfkB domain protein  36.5 
 
 		 321 aa  123  4e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.196107  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2277  PfkB domain protein  31.9 
 
 		 332 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.262567  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3707  ribokinase-like domain-containing protein  31.33 
 
 		 319 aa  117  3e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.973516 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0463  PfkB domain protein  34.36 
 
 		 318 aa  116  5e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.949852 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0227  ribokinase-like domain-containing protein  26.09 
 
 		 344 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.068215  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29260  sugar kinase, ribokinase  34.26 
 
 		 311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.466231 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2071  PfkB domain protein  34.97 
 
 		 339 aa  113  4.0000000000000004e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.139149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0442  PfkB domain protein  27.36 
 
 		 326 aa  112  6e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2870  PfkB domain protein  32.04 
 
 		 318 aa  112  7.000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4676  PfkB domain protein  39.2 
 
 		 327 aa  112  8.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0212656  normal  0.717354 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0933  PfkB domain protein  30.57 
 
 		 313 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0971681  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1297  2-keto-3-deoxygalactonate kinase / 2-keto-3-deoxygluconate kinase  32.05 
 
 		 308 aa  110  3e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1721  ribokinase-like domain-containing protein  35.39 
 
 		 308 aa  109  6e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1694  ribokinase-like domain-containing protein  35.39 
 
 		 308 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0974  ribokinase-like domain-containing protein  32.09 
 
 		 312 aa  108  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.715323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2336  ribokinase family sugar kinase  33.21 
 
 		 316 aa  107  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.197466  normal  0.0950231 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18220  Fructokinase  30.48 
 
 		 320 aa  106  6e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.749798  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6298  PfkB  33.33 
 
 		 308 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1806  ribokinase-like domain-containing protein  33.33 
 
 		 308 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.420282 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1781  ribokinase-like domain-containing protein  33.33 
 
 		 308 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630486  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2739  ribokinase-like domain-containing protein  29.19 
 
 		 343 aa  105  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000138473  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3215  PfkB domain protein  31.44 
 
 		 317 aa  104  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1358  2-keto-3-deoxygluconate kinase  36.56 
 
 		 291 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1489  ribokinase-like domain-containing protein  33.84 
 
 		 308 aa  105  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538606  normal  0.0997526 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5081  ribokinase family sugar kinase  33.74 
 
 		 308 aa  103  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2291  PfkB domain protein  34.43 
 
 		 329 aa  103  3e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1849  PfkB domain protein  33.74 
 
 		 316 aa  103  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0541004  normal  0.0446674 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3911  PfkB domain protein  31.37 
 
 		 321 aa  103  5e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.27465  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1671  PfkB domain protein  24.53 
 
 		 338 aa  101  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0082  myo-inositol catabolism protein IolC  27.07 
 
 		 338 aa  100  4e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1292  PfkB domain protein  30.07 
 
 		 317 aa  99  9e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.282801  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3932  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  29.52 
 
 		 309 aa  97.4  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3274  carbohydrate kinase, PfkB  29.3 
 
 		 645 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0475711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3036  PfkB  33.33 
 
 		 342 aa  96.7  4e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.835222 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03374  ketodeoxygluconokinase  30.1 
 
 		 309 aa  96.3  6e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4890  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  29.77 
 
 		 309 aa  96.3  6e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.327816  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03327  hypothetical protein  30.1 
 
 		 309 aa  96.3  6e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4014  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  30.1 
 
 		 309 aa  96.3  6e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03455  2-keto-3-deoxygluconate kinase  33.23 
 
 		 340 aa  96.3  7e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>