More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2315 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0982  PfkB domain protein  53.88 
 
 
644 aa  640    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3562  ribokinase-like domain-containing protein  53.34 
 
 
655 aa  640    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.249096 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2413  PfkB domain protein  55.68 
 
 
642 aa  674    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3837  ribokinase-like domain-containing protein  69.46 
 
 
633 aa  904    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27619  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2315  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 
636 aa  1285    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0076  myo-inositol catabolism IolC protein  70.82 
 
 
634 aa  921    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1676  ribokinase-like domain-containing protein  75.96 
 
 
635 aa  955    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1135  PfkB domain protein  54.04 
 
 
644 aa  637    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.488845 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7803  PfkB domain protein  75.31 
 
 
640 aa  968    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3547  ribokinase-like domain-containing protein  77.01 
 
 
646 aa  993    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2996  Protein of unknown function DUF2090  51.51 
 
 
634 aa  620  1e-176  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1341  PfkB domain protein  51.03 
 
 
634 aa  618  1e-175  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3334  PfkB domain protein  51.09 
 
 
647 aa  617  1e-175  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0303  myo-inositol catabolism protein  49.69 
 
 
636 aa  606  9.999999999999999e-173  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3041  ribokinase-like domain-containing protein  50.39 
 
 
656 aa  603  1.0000000000000001e-171  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2969  PfkB family kinase  50.08 
 
 
654 aa  599  1e-170  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4711  PfkB domain protein  50 
 
 
643 aa  598  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00995478  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1870  PfkB family kinase  50.32 
 
 
625 aa  595  1e-169  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0201058 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4660  ribokinase-like domain-containing protein  49.45 
 
 
642 aa  597  1e-169  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1594  ribokinase-like domain-containing protein  46.79 
 
 
652 aa  577  1.0000000000000001e-163  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50040  myo-inositol catabolism protein IolC  48.22 
 
 
647 aa  566  1e-160  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3500  iolC protein  47.29 
 
 
645 aa  561  1e-158  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.782212  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3274  carbohydrate kinase, PfkB  46.33 
 
 
645 aa  553  1e-156  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0475711  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1600  ribokinase-like domain-containing protein  45.24 
 
 
670 aa  533  1e-150  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161608  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2809  PfkB domain protein  46.74 
 
 
681 aa  529  1e-149  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.760381  normal  0.234684 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1240  transferase kinase protein  48.15 
 
 
650 aa  524  1e-147  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1326  putative myo-inositol catabolism LolC protein  46.43 
 
 
680 aa  525  1e-147  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1728  PfkB  45.44 
 
 
645 aa  519  1e-146  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.371371  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2647  iolC protein  47.06 
 
 
666 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.146165  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1303  ribokinase-like domain-containing protein  48.11 
 
 
651 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1342  ribokinase-like domain-containing protein  47.96 
 
 
651 aa  514  1e-144  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0065  ribokinase-like domain-containing protein  46.59 
 
 
674 aa  513  1e-144  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4567  PfkB family carbohydrate kinase  47.8 
 
 
652 aa  511  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3314  ribokinase-like domain-containing protein  46.66 
 
 
646 aa  509  1e-143  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1677  iolC protein  47.31 
 
 
666 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0913  iolC protein  47.31 
 
 
666 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1831  iolC protein  47.31 
 
 
666 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.463805  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1655  iolC protein  47.31 
 
 
666 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0726  iolC protein  47.31 
 
 
666 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.179784  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1892  ribokinase-like domain-containing protein  48.74 
 
 
651 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.333312 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1401  ribokinase-like domain-containing protein  47.96 
 
 
651 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1444  iolC protein  47.31 
 
 
666 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.640476  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0436  iolC protein  47.31 
 
 
666 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.171756  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0941  PfkB  47.8 
 
 
651 aa  504  1e-141  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00555431  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1423  ribokinase-like domain-containing protein  47.8 
 
 
651 aa  504  1e-141  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.693668  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0985  ribokinase-like domain-containing protein  46.25 
 
 
659 aa  491  1e-137  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3703  PfkB  38.41 
 
 
630 aa  402  1e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.830468  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1622  hypothetical protein  44.44 
 
 
628 aa  307  5.0000000000000004e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1617  hypothetical protein  44.8 
 
 
628 aa  305  2.0000000000000002e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1697  PfkB domain-containing protein  38.57 
 
 
337 aa  208  3e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5700  PfkB domain protein  35.14 
 
 
335 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.738338  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0662  PfkB domain-containing protein  38.39 
 
 
327 aa  174  3.9999999999999995e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.478793  normal  0.638402 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0300  myo-inositol catabolism protein  31.34 
 
 
332 aa  172  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2333  iolC protein  31.16 
 
 
332 aa  172  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2296  myo-inositol catabolism protein  31.16 
 
 
332 aa  172  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.192741  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2252  carbohydrate kinase; myo-inositol catabolism protein  31.16 
 
 
332 aa  172  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.608064  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2512  myo-inositol catabolism protein IolC  31.16 
 
 
332 aa  172  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3605  PfkB domain protein  37.58 
 
 
336 aa  163  1e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.24416  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4016  ribokinase-like domain-containing protein  37.12 
 
 
322 aa  160  8e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.213483 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0725  PfkB domain protein  36.25 
 
 
322 aa  154  5.9999999999999996e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0082  myo-inositol catabolism protein IolC  30.72 
 
 
338 aa  153  8.999999999999999e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5449  PfkB domain protein  38.04 
 
 
312 aa  151  3e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.443082  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1803  ribokinase-like domain-containing protein  35.45 
 
 
349 aa  150  9e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.453248 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2602  ribokinase-like domain-containing protein  35.49 
 
 
323 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.386766  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0937  PfkB domain protein  34.63 
 
 
338 aa  149  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1365  PfkB domain protein  37.73 
 
 
321 aa  149  1.0000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4018  PfkB domain protein  29.74 
 
 
338 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00301504  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5563  ribokinase-like domain-containing protein  35.6 
 
 
320 aa  147  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0820  ribokinase-like domain-containing protein  32.93 
 
 
364 aa  147  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.501006  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4189  PfkB domain protein  34.43 
 
 
317 aa  146  1e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8494  ribokinase-like domain-containing protein  33.74 
 
 
321 aa  145  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.813332  normal  0.57227 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  31.56 
 
 
326 aa  145  3e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4488  PfkB domain protein  34.24 
 
 
314 aa  143  8e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.3303  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2742  PfkB domain protein  37.5 
 
 
320 aa  142  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.118303  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4542  PfkB domain protein  32.53 
 
 
317 aa  142  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1268  PfkB domain protein  31.33 
 
 
333 aa  139  1e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.63046  normal  0.760626 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3078  PfkB domain-containing protein  32.11 
 
 
314 aa  135  3e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4404  ribokinase-like domain-containing protein  31.66 
 
 
322 aa  135  3e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3349  PfkB  32.21 
 
 
324 aa  131  5.0000000000000004e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0814732  normal  0.201328 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4059  PfkB domain protein  34.93 
 
 
325 aa  126  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.867831 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  24.63 
 
 
323 aa  126  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3559  ribokinase-like domain-containing protein  31.8 
 
 
340 aa  123  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  31.12 
 
 
329 aa  122  3e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1419  PfkB  30.21 
 
 
326 aa  120  7.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.204315  normal  0.109001 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1737  PfkB  31.14 
 
 
314 aa  116  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.482727  normal  0.803501 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18220  Fructokinase  29.32 
 
 
320 aa  116  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.749798  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1088  PfkB domain protein  28.66 
 
 
315 aa  115  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332998  normal  0.446333 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3414  PfkB domain protein  29.39 
 
 
317 aa  115  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0954  PfkB domain protein  25.08 
 
 
321 aa  114  5e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.102628  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0169  ribokinase-like domain-containing protein  27.96 
 
 
312 aa  114  6e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  24.78 
 
 
323 aa  113  9e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  24.49 
 
 
322 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1025  PfkB domain protein  26.84 
 
 
333 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00743339 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2029  PfkB domain-containing protein  26.74 
 
 
323 aa  112  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.159361  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1980  sugar (2-ketogluconate) kinase  31.4 
 
 
327 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0210202 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0996  PfkB domain protein  26.84 
 
 
333 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6848  PfkB domain protein  33.33 
 
 
323 aa  108  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.71176  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3707  ribokinase-like domain-containing protein  26.73 
 
 
319 aa  108  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.973516 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1486  ribokinase-like domain-containing protein  31.72 
 
 
315 aa  109  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000598  fructokinase  26.37 
 
 
337 aa  108  3e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00217717  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>