More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_2969 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_50040  myo-inositol catabolism protein IolC  58.15 
 
 		 647 aa  732    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1240  transferase kinase protein  55.69 
 
 		 650 aa  684    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3041  ribokinase-like domain-containing protein  99.54 
 
 		 656 aa  1344    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3500  iolC protein  55.16 
 
 		 645 aa  719    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.782212  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1600  ribokinase-like domain-containing protein  54.84 
 
 		 670 aa  729    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161608  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0913  iolC protein  56.98 
 
 		 666 aa  677    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3334  PfkB domain protein  77.71 
 
 		 647 aa  1027    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3274  carbohydrate kinase, PfkB  54.37 
 
 		 645 aa  709    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0475711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1831  iolC protein  56.98 
 
 		 666 aa  677    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.463805  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1870  PfkB family kinase  99.68 
 
 		 625 aa  1279    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0201058 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4567  PfkB family carbohydrate kinase  56.45 
 
 		 652 aa  693    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0436  iolC protein  56.98 
 
 		 666 aa  677    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.171756  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1342  ribokinase-like domain-containing protein  56.76 
 
 		 651 aa  691    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1594  ribokinase-like domain-containing protein  59.06 
 
 		 652 aa  795    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0076  myo-inositol catabolism IolC protein  51.91 
 
 		 634 aa  650    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1655  iolC protein  56.83 
 
 		 666 aa  675    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2647  iolC protein  57.26 
 
 		 666 aa  701    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.146165  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1892  ribokinase-like domain-containing protein  56.13 
 
 		 651 aa  679    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.333312 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1677  iolC protein  56.98 
 
 		 666 aa  677    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3837  ribokinase-like domain-containing protein  52.22 
 
 		 633 aa  639    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27619  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1326  putative myo-inositol catabolism LolC protein  57.37 
 
 		 680 aa  724    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0726  iolC protein  56.98 
 
 		 666 aa  677    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.179784  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2809  PfkB domain protein  56.15 
 
 		 681 aa  728    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.760381  normal  0.234684 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0941  PfkB  56.45 
 
 		 651 aa  692    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00555431  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1341  PfkB domain protein  79.15 
 
 		 634 aa  1054    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0303  myo-inositol catabolism protein  67.83 
 
 		 636 aa  910    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0985  ribokinase-like domain-containing protein  52.76 
 
 		 659 aa  644    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4660  ribokinase-like domain-containing protein  68.25 
 
 		 642 aa  870    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1303  ribokinase-like domain-containing protein  56.6 
 
 		 651 aa  686    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2996  Protein of unknown function DUF2090  78.52 
 
 		 634 aa  1050    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1401  ribokinase-like domain-containing protein  56.6 
 
 		 651 aa  695    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1423  ribokinase-like domain-containing protein  56.45 
 
 		 651 aa  692    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.693668  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4711  PfkB domain protein  67.09 
 
 		 643 aa  887    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00995478  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3314  ribokinase-like domain-containing protein  54.47 
 
 		 646 aa  680    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1444  iolC protein  56.98 
 
 		 666 aa  677    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.640476  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0065  ribokinase-like domain-containing protein  53.64 
 
 		 674 aa  673    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2969  PfkB family kinase  100 
 
 		 654 aa  1347    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3547  ribokinase-like domain-containing protein  50.87 
 
 		 646 aa  619  1e-176  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7803  PfkB domain protein  52.77 
 
 		 640 aa  617  1e-175  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2315  ribokinase-like domain-containing protein  50.08 
 
 		 636 aa  599  1e-170  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2413  PfkB domain protein  48.18 
 
 		 642 aa  596  1e-169  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1676  ribokinase-like domain-containing protein  51.35 
 
 		 635 aa  589  1e-167  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3562  ribokinase-like domain-containing protein  47.87 
 
 		 655 aa  568  1e-160  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.249096 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1728  PfkB  45.04 
 
 		 645 aa  559  1e-158  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.371371  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0982  PfkB domain protein  45.56 
 
 		 644 aa  556  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1135  PfkB domain protein  45.37 
 
 		 644 aa  553  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.488845 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3703  PfkB  39.06 
 
 		 630 aa  439  9.999999999999999e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.830468  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1622  hypothetical protein  46.37 
 
 		 628 aa  311  2e-83  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1617  hypothetical protein  46.48 
 
 		 628 aa  310  4e-83  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2333  iolC protein  33.53 
 
 		 332 aa  190  7e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2512  myo-inositol catabolism protein IolC  33.53 
 
 		 332 aa  190  7e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2296  myo-inositol catabolism protein  33.53 
 
 		 332 aa  190  8e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.192741  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2252  carbohydrate kinase; myo-inositol catabolism protein  33.53 
 
 		 332 aa  189  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.608064  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0300  myo-inositol catabolism protein  33.14 
 
 		 332 aa  187  7e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1697  PfkB domain-containing protein  34.1 
 
 		 337 aa  184  6e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5700  PfkB domain protein  32.08 
 
 		 335 aa  182  1e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.738338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0662  PfkB domain-containing protein  36.78 
 
 		 327 aa  178  3e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.478793  normal  0.638402 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3605  PfkB domain protein  37.23 
 
 		 336 aa  175  1.9999999999999998e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.24416  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4016  ribokinase-like domain-containing protein  37.2 
 
 		 322 aa  172  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213483 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5449  PfkB domain protein  36.78 
 
 		 312 aa  166  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.443082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4542  PfkB domain protein  33.13 
 
 		 317 aa  165  2.0000000000000002e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0937  PfkB domain protein  34.71 
 
 		 338 aa  166  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0820  ribokinase-like domain-containing protein  32.33 
 
 		 364 aa  164  4.0000000000000004e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.501006  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4488  PfkB domain protein  35.93 
 
 		 314 aa  162  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.3303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1803  ribokinase-like domain-containing protein  34.02 
 
 		 349 aa  161  3e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.453248 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2602  ribokinase-like domain-containing protein  34.46 
 
 		 323 aa  160  6e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.386766  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3078  PfkB domain-containing protein  35.35 
 
 		 314 aa  159  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0082  myo-inositol catabolism protein IolC  29.82 
 
 		 338 aa  157  6e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1365  PfkB domain protein  35.44 
 
 		 321 aa  155  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2742  PfkB domain protein  34.86 
 
 		 320 aa  151  3e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.118303  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0725  PfkB domain protein  34.93 
 
 		 322 aa  150  6e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5563  ribokinase-like domain-containing protein  34.15 
 
 		 320 aa  149  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8494  ribokinase-like domain-containing protein  34.15 
 
 		 321 aa  149  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.813332  normal  0.57227 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1268  PfkB domain protein  30.82 
 
 		 333 aa  146  1e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.63046  normal  0.760626 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4189  PfkB domain protein  32.64 
 
 		 317 aa  138  3.0000000000000003e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4018  PfkB domain protein  28.91 
 
 		 338 aa  138  3.0000000000000003e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00301504  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  29.2 
 
 		 326 aa  136  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3349  PfkB  29.45 
 
 		 324 aa  134  6e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0814732  normal  0.201328 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1419  PfkB  31.61 
 
 		 326 aa  132  2.0000000000000002e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.204315  normal  0.109001 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4059  PfkB domain protein  33.23 
 
 		 325 aa  130  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.867831 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4404  ribokinase-like domain-containing protein  28.87 
 
 		 322 aa  122  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  24.18 
 
 		 323 aa  121  3.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  26.06 
 
 		 323 aa  120  7e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  29.7 
 
 		 329 aa  119  1.9999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6848  PfkB domain protein  34.24 
 
 		 323 aa  119  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.71176  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1980  sugar (2-ketogluconate) kinase  28.7 
 
 		 327 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0210202 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2278  PfkB domain protein  28.92 
 
 		 327 aa  114  7.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.741137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2528  protein IolC  33.19 
 
 		 207 aa  114  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000240198 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1253  ribokinase-like domain-containing protein  28.31 
 
 		 320 aa  109  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0781765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0266  PfkB domain protein  26.88 
 
 		 324 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000598  fructokinase  25.08 
 
 		 337 aa  108  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00217717  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22680  PfkB domain protein  25 
 
 		 314 aa  109  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.531518  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1088  PfkB domain protein  26.77 
 
 		 315 aa  107  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332998  normal  0.446333 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1025  PfkB domain protein  25.89 
 
 		 333 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00743339 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  24.47 
 
 		 322 aa  105  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0954  PfkB domain protein  23.77 
 
 		 321 aa  105  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.102628  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2919  PfkB  26.53 
 
 		 325 aa  104  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000103669  normal  0.041423 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1777  PfkB domain protein  27.33 
 
 		 331 aa  103  8e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.380379  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  27.91 
 
 		 317 aa  103  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0996  PfkB domain protein  26.84 
 
 		 333 aa  103  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>