More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E3639 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E3639  kinase, pfkB family  100 
 
 
318 aa  657    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000277248  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3290  PfkB domain protein  51.45 
 
 
320 aa  328  6e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3180  ribokinase-like domain-containing protein  49.21 
 
 
322 aa  315  5e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.714221  normal  0.0291745 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3416  ribokinase-like domain-containing protein  49.2 
 
 
311 aa  301  1e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.155618  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0457  ribokinase-like domain-containing protein  46.35 
 
 
313 aa  288  6e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4766  ribokinase-like domain-containing protein  44.59 
 
 
313 aa  266  2e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.417619 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2482  ribokinase-like domain-containing protein  43.59 
 
 
349 aa  266  4e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0289  ribokinase-like domain-containing protein  45.86 
 
 
315 aa  258  7e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2146  fructokinase protein  42.59 
 
 
318 aa  250  2e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00000404752  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0700  ribokinase-like domain-containing protein  41.56 
 
 
319 aa  250  2e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.503063 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5928  ribokinase family sugar kinase  41.77 
 
 
318 aa  246  3e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2513  ribokinase-like domain-containing protein  41.25 
 
 
319 aa  246  4e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.333907 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2645  ribokinase-like domain-containing protein  41.25 
 
 
319 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4848  ribokinase-like domain-containing protein  40.45 
 
 
313 aa  245  6e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.247088  normal  0.684962 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2621  ribokinase-like domain-containing protein  41.77 
 
 
318 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.712892  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1987  PfkB  41.77 
 
 
318 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.903006  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2597  ribokinase-like domain-containing protein  41.77 
 
 
318 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3107  ribokinase-like domain-containing protein  41.46 
 
 
318 aa  241  9e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00442891  hitchhiker  0.000119063 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3538  PfkB domain protein  38.1 
 
 
310 aa  237  2e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000797657  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22680  PfkB domain protein  38.1 
 
 
314 aa  234  1.0000000000000001e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.531518  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0639  PfkB  40 
 
 
323 aa  230  2e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.202169  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1032  carbohydrate kinase  41.51 
 
 
318 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0869  PfkB family kinase  41.51 
 
 
318 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0331  carbohydrate kinase  41.19 
 
 
318 aa  216  4e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0561614  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0077  carbohydrate kinase  41.19 
 
 
318 aa  216  4e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0873  PfkB family kinase  41.19 
 
 
318 aa  216  4e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0629  carbohydrate kinase  41.19 
 
 
318 aa  216  4e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2463  carbohydrate kinase  41.19 
 
 
318 aa  216  4e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0290  PfkB domain protein  36.86 
 
 
325 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0388  PfkB domain protein  37.79 
 
 
299 aa  210  3e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0615  PfkB  37.46 
 
 
317 aa  209  4e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0261  PfkB domain protein  36.54 
 
 
325 aa  209  7e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3586  tagatose-6-phosphate kinase  37.9 
 
 
326 aa  203  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00711887  normal  0.431843 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1366  ribokinase-like domain-containing protein  33.96 
 
 
320 aa  187  2e-46  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0693  carbohydrate kinase  37.59 
 
 
271 aa  160  3e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1494  fructokinase, putative  31.35 
 
 
319 aa  131  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.215965  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  30.42 
 
 
317 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  29.63 
 
 
323 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  28.62 
 
 
322 aa  116  6e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3707  ribokinase-like domain-containing protein  30.34 
 
 
319 aa  113  3e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.973516 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000598  fructokinase  30.03 
 
 
337 aa  114  3e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00217717  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  30.65 
 
 
323 aa  113  4.0000000000000004e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  27.96 
 
 
326 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0600  aminoimidazole riboside kinase  31.03 
 
 
323 aa  110  4.0000000000000004e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1297  2-keto-3-deoxygalactonate kinase / 2-keto-3-deoxygluconate kinase  30.48 
 
 
308 aa  110  5e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2113  ribokinase-like domain-containing protein  28.08 
 
 
319 aa  108  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.398904  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2077  ribokinase-like domain-containing protein  28.08 
 
 
319 aa  108  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4404  ribokinase-like domain-containing protein  27.83 
 
 
322 aa  105  8e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  29.29 
 
 
329 aa  102  9e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0716  fructokinase  28.12 
 
 
313 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1489  ribokinase-like domain-containing protein  29.71 
 
 
308 aa  101  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538606  normal  0.0997526 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0666  fructokinase  28.12 
 
 
313 aa  102  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0752  fructokinase  28.12 
 
 
313 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5081  ribokinase family sugar kinase  29.09 
 
 
308 aa  101  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89362  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1849  PfkB domain protein  30.13 
 
 
316 aa  100  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0541004  normal  0.0446674 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0169  ribokinase-like domain-containing protein  28.71 
 
 
312 aa  100  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7727  ribokinase-like domain-containing protein  29.49 
 
 
314 aa  100  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4023  PfkB  30.11 
 
 
311 aa  99.8  6e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.102186  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0971  aminoimidazole riboside kinase  29.73 
 
 
308 aa  99.4  7e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00309121  normal  0.0346902 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  27.45 
 
 
305 aa  98.6  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0974  ribokinase-like domain-containing protein  31.65 
 
 
312 aa  98.6  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.715323  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0933  PfkB domain protein  26.71 
 
 
313 aa  98.2  2e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0971681  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5056  PfkB domain protein  27.6 
 
 
320 aa  98.2  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4798  ribokinase-like domain-containing protein  28.57 
 
 
317 aa  95.9  8e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.28126  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2260  carbohydrate kinase  29.45 
 
 
308 aa  95.5  9e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.11211  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1694  ribokinase-like domain-containing protein  28.99 
 
 
308 aa  95.5  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1272  fructokinase  27.58 
 
 
338 aa  95.1  1e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0808  fructokinase  28.92 
 
 
313 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1253  ribokinase-like domain-containing protein  28.57 
 
 
320 aa  94.4  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0781765  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1721  ribokinase-like domain-containing protein  28.36 
 
 
308 aa  94.4  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2019  aminoimidazole riboside kinase  30.39 
 
 
298 aa  94  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0270358  normal  0.162694 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1510  fructokinase  26.65 
 
 
315 aa  93.6  3e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00409278  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01230  fructokinase  27.15 
 
 
328 aa  94  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0230962  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0915  fructokinase  28.62 
 
 
313 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1782  fructokinase  26.79 
 
 
315 aa  93.6  4e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0521883  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4769  2-Keto-3-deoxygluconate kinase  29.67 
 
 
311 aa  93.2  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6346  PfkB  26.99 
 
 
330 aa  93.2  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1733  ribokinase-like domain-containing protein  26.99 
 
 
330 aa  93.2  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1526  ribokinase-like domain-containing protein  26.73 
 
 
328 aa  92.8  7e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.198304  normal  0.764115 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2569  ribokinase-like domain-containing protein  26.79 
 
 
316 aa  92.8  7e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1676  ribokinase-like domain-containing protein  25.42 
 
 
635 aa  92.8  8e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6298  PfkB  28.88 
 
 
308 aa  92.4  9e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1781  ribokinase-like domain-containing protein  28.88 
 
 
308 aa  92.4  9e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630486  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1154  ribokinase-like domain-containing protein  24.3 
 
 
319 aa  92  1e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1746  ribokinase-like domain-containing protein  26.99 
 
 
330 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.931195 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3592  aminoimidazole riboside kinase  28.57 
 
 
304 aa  92  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000158875 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1789  ribokinase  28.66 
 
 
297 aa  92  1e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000225274  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  25.3 
 
 
308 aa  92  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1486  ribokinase-like domain-containing protein  26.6 
 
 
315 aa  92  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1630  PfkB domain protein  28.24 
 
 
341 aa  91.3  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1806  ribokinase-like domain-containing protein  28.36 
 
 
308 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.420282 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5029  ribokinase family sugar kinase  26.9 
 
 
330 aa  91.7  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.351369 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1240  ribokinase-like domain-containing protein  27.27 
 
 
338 aa  91.3  2e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.36269  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2647  aminoimidazole riboside kinase  28.57 
 
 
304 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2096  putative 2-keto-gluconokinase  26.91 
 
 
329 aa  90.1  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2336  ribokinase family sugar kinase  29.49 
 
 
316 aa  90.5  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.197466  normal  0.0950231 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0025  ribokinase-like domain-containing protein  25.62 
 
 
307 aa  89.7  6e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.112625  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4085  PfkB domain protein  25.86 
 
 
322 aa  89.7  6e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.212948  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2326  carbohydrate kinase  30.07 
 
 
308 aa  89.7  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.473076  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0734  fructokinase  26.25 
 
 
310 aa  89.4  7e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.399737  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>