More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1117 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 
305 aa  601  1.0000000000000001e-171  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  78.36 
 
 
304 aa  484  1e-136  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0070  ribokinase-like domain-containing protein  82.62 
 
 
305 aa  483  1e-135  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.60231  normal  0.104072 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0078  ribokinase-like domain-containing protein  78.88 
 
 
302 aa  464  1e-129  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0147  ribokinase-like domain-containing protein  49.5 
 
 
318 aa  290  2e-77  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.719935  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0752  ribokinase-like domain-containing protein  38.26 
 
 
310 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  36.21 
 
 
308 aa  145  6e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0749  ribokinase  30.97 
 
 
306 aa  140  3e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000720941  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  33.77 
 
 
308 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0569  PfkB domain protein  34.34 
 
 
295 aa  137  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0735  PfkB domain-containing protein  32.27 
 
 
317 aa  134  9.999999999999999e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.263465  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0987  ribokinase  34.55 
 
 
293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.135221  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0220  ribokinase  34.98 
 
 
305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.328501  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3558  PfkB domain protein  37.88 
 
 
287 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.321996  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  34.09 
 
 
308 aa  130  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4003  ribokinase  30.52 
 
 
306 aa  129  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4124  ribokinase  30.52 
 
 
306 aa  129  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4019  ribokinase  30.52 
 
 
306 aa  129  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4074  ribokinase  30.52 
 
 
306 aa  129  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.532803  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4182  ribokinase  30.52 
 
 
306 aa  129  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1013  putative ribokinase protein  34.74 
 
 
315 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2764  PfkB domain protein  35.12 
 
 
289 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.11778  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0185  ribokinase  32.66 
 
 
291 aa  127  2.0000000000000002e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000069064  normal  0.0609987 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  33.01 
 
 
308 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0869  ribokinase-like domain-containing protein  30 
 
 
290 aa  125  8.000000000000001e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1201  ribokinase-like domain-containing protein  26.73 
 
 
298 aa  124  1e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1980  ribokinase  31.76 
 
 
302 aa  125  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0259  ribokinase  28.95 
 
 
304 aa  124  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0253  ribokinase  28.95 
 
 
304 aa  124  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  33.88 
 
 
306 aa  124  3e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2909  ribokinase  34.44 
 
 
302 aa  123  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0179509 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0692  carbohydrate kinase  32.9 
 
 
304 aa  123  5e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.19709  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3350  hypothetical protein  33.88 
 
 
315 aa  122  6e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.373497 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  30 
 
 
311 aa  122  6e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1612  ribokinase family sugar kinase  30.69 
 
 
340 aa  122  7e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0874983  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0200  ribokinase  32.39 
 
 
313 aa  122  9.999999999999999e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.933367 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0949  PfkB  37.13 
 
 
301 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  29.43 
 
 
299 aa  119  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0878  ribokinase  33.99 
 
 
321 aa  119  7e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0605401  normal  0.165576 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6906  ribokinase  30.84 
 
 
328 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.135806  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2689  ribokinase  30.29 
 
 
345 aa  118  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6290  ribokinase  31.05 
 
 
320 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.631078 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1285  ribokinase  32.17 
 
 
307 aa  117  1.9999999999999998e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000150833  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4097  ribokinase  33.87 
 
 
309 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03638  ribokinase  33.98 
 
 
309 aa  117  3e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00223583  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4277  ribokinase  33.87 
 
 
309 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.136431  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03583  hypothetical protein  33.98 
 
 
309 aa  117  3e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00147711  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4218  ribokinase  33.87 
 
 
309 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.980767 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4168  ribokinase  33.87 
 
 
309 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  32.79 
 
 
302 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0691  ribokinase family sugar kinase  31.51 
 
 
303 aa  117  3e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00280887  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4112  ribokinase  33.87 
 
 
309 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1539  ribokinase  30.72 
 
 
320 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385923  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2001  PfkB domain protein  32.21 
 
 
321 aa  116  3.9999999999999997e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4120  ribokinase  33.98 
 
 
314 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.444588  normal  0.199768 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0276  PfkB domain protein  31.27 
 
 
304 aa  116  5e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4215  ribokinase  33.33 
 
 
309 aa  115  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2878  PfkB  34.26 
 
 
290 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.662908 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5188  ribokinase  33.66 
 
 
314 aa  115  7.999999999999999e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.034479  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1534  ribokinase-like domain-containing protein  30.56 
 
 
297 aa  115  8.999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.260714 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04580  Ribokinase  29.14 
 
 
306 aa  115  8.999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0865  ribokinase  30.03 
 
 
305 aa  115  8.999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.657252 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4242  ribokinase  33.66 
 
 
309 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00710658 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3968  ribokinase  33.66 
 
 
309 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.112559  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2964  PfkB domain protein  34.24 
 
 
323 aa  114  1.0000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.330402  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3332  ribokinase  33.22 
 
 
297 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4268  ribokinase  33.66 
 
 
309 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00050994  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  29.9 
 
 
309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0943  ribokinase  35.53 
 
 
321 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.826251  normal  0.172047 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0491  PfkB  34.12 
 
 
303 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3859  ribokinase  26.65 
 
 
404 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3738  ribokinase  26.65 
 
 
404 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3816  ribokinase  26.65 
 
 
404 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3749  ribokinase  26.65 
 
 
404 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3918  ribokinase  26.65 
 
 
404 aa  114  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2838  ribokinase  29.9 
 
 
314 aa  114  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.760591  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4167  ribokinase  33.33 
 
 
309 aa  114  3e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.895072  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3974  ribokinase  29.87 
 
 
308 aa  112  5e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00187599  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  29.7 
 
 
326 aa  113  5e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4209  ribokinase  30.87 
 
 
308 aa  113  5e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.847437  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0008  ribokinase  30.87 
 
 
308 aa  112  6e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000914124  normal  0.985734 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1142  PfkB  31.33 
 
 
310 aa  112  6e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0676537  normal  0.093061 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0008  ribokinase  30.87 
 
 
308 aa  112  6e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0252287  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2014  PfkB domain protein  28.99 
 
 
324 aa  112  9e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  30.16 
 
 
310 aa  112  9e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2371  ribokinase  33.11 
 
 
306 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0559074  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3631  ribokinase  29.49 
 
 
304 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1084  PfkB domain protein  31.3 
 
 
327 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  31.46 
 
 
302 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1084  PfkB family DNA-binding protein/kinase  26.65 
 
 
404 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1113  PfkB domain protein  31.3 
 
 
327 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.941643 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6950  ribokinase  29.74 
 
 
308 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2297  ribokinase  30.29 
 
 
309 aa  110  3e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0434925  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1494  PfkB domain protein  31.73 
 
 
331 aa  110  3e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0243607  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0970  carbohydrate kinase  33.11 
 
 
314 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4112  ribokinase  34.5 
 
 
314 aa  110  4.0000000000000004e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.137764  normal  0.0163752 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4591  ribokinase  30.61 
 
 
295 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0615  PfkB  29.39 
 
 
317 aa  109  6e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  30.9 
 
 
301 aa  109  6e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2100  ribokinase  29.64 
 
 
307 aa  109  7.000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>