93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0828 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0828  hypothetical protein  100 
 
 		 862 aa  1770    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0674  hypothetical protein  40.57 
 
 		 906 aa  647    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.62108  hitchhiker  0.00476533 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0777  hypothetical protein  40.54 
 
 		 907 aa  659    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0492  hypothetical protein  46.54 
 
 		 882 aa  783    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1942  hypothetical protein  44.77 
 
 		 908 aa  782    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.328684  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1298  hypothetical protein  40.47 
 
 		 853 aa  655    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.445914  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0536  hypothetical protein  43.79 
 
 		 880 aa  713    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.00000422486  normal  0.794266 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0749  hypothetical protein  24.4 
 
 		 899 aa  196  2e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0833179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1691  Organic solvent tolerance protein OstA-like protein  25.84 
 
 		 870 aa  187  9e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6190  putative organic solvent tolerance protein OstA  22 
 
 		 926 aa  176  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.235934 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11093  hypothetical protein  23.65 
 
 		 1049 aa  149  2.0000000000000003e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4586  organic solvent tolerance protein OstA-like protein  22.73 
 
 		 922 aa  131  5.0000000000000004e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1560  hypothetical protein  21.39 
 
 		 906 aa  127  7e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.40079  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4903  Organic solvent tolerance protein OstA-like protein  29.09 
 
 		 1210 aa  122  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1645  hypothetical protein  25.18 
 
 		 889 aa  115  3e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1405  hypothetical protein  27.13 
 
 		 951 aa  113  2.0000000000000002e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.342317 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3634  hypothetical protein  29.59 
 
 		 972 aa  107  9e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1870  Organic solvent tolerance protein OstA  24.03 
 
 		 882 aa  92  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1159  organic solvent tolerance protein  23.98 
 
 		 686 aa  82.4  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2474  organic solvent tolerance protein, putative  24.74 
 
 		 697 aa  79.3  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2367  organic solvent tolerance protein, putative  25.9 
 
 		 628 aa  75.1  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.147572  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1235  Organic solvent tolerance protein  24.84 
 
 		 705 aa  72.8  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3276  organic solvent tolerance protein  22.61 
 
 		 710 aa  72.4  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.112373  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0898  Organic solvent tolerance protein  24.64 
 
 		 684 aa  69.3  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.33463e-30 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3347  Organic solvent tolerance protein  24.15 
 
 		 684 aa  67  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0396  organic solvent tolerance protein  24.3 
 
 		 788 aa  62.4  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441976  normal  0.0999186 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0739  organic solvent tolerance protein OstA  25.76 
 
 		 701 aa  62  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.71512e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1574  Organic solvent tolerance protein  22.96 
 
 		 841 aa  61.2  0.00000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001662  Imp required for envelope biogenesis/organic solvent tolerance protein precursor  19.94 
 
 		 781 aa  61.2  0.00000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0675  Organic solvent tolerance protein  23.4 
 
 		 788 aa  60.1  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0147  OstA family protein  25.7 
 
 		 708 aa  59.7  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4024  putative organic solvent tolerance protein  23.4 
 
 		 789 aa  59.7  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.560503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00811  organic solvent tolerance protein  21.05 
 
 		 781 aa  58.9  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0515  organic solvent tolerance transmembrane protein  20.71 
 
 		 811 aa  58.5  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.877133  normal  0.048519 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2836  organic solvent tolerance protein  23.33 
 
 		 842 aa  56.6  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.324598  normal  0.142407 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0391  Organic solvent tolerance protein  22.15 
 
 		 813 aa  57  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.298665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1088  Organic solvent tolerance protein  22.94 
 
 		 784 aa  57  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.567172  normal  0.030432 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0406  Organic solvent tolerance protein  23.46 
 
 		 813 aa  55.8  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0436  organic solvent tolerance protein  23.24 
 
 		 824 aa  55.5  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.524466 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0160  organic solvent tolerance protein OstA-like  26.82 
 
 		 832 aa  55.5  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0601393 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2711  organic solvent tolerance protein  25.38 
 
 		 786 aa  54.7  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2738  organic solvent tolerance protein  25.38 
 
 		 786 aa  54.7  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2099  organic solvent tolerance protein  25.38 
 
 		 786 aa  54.7  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0497  organic solvent tolerance protein  22.39 
 
 		 810 aa  54.7  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2864  organic solvent tolerance protein  19.61 
 
 		 787 aa  53.5  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000318031  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0588  organic solvent tolerance protein  25.12 
 
 		 786 aa  52.8  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.649611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6038  organic solvent tolerance protein  24.87 
 
 		 786 aa  52.8  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2763  organic solvent tolerance protein  24.87 
 
 		 786 aa  51.6  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2629  organic solvent tolerance protein  24.87 
 
 		 786 aa  51.6  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.355062  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0350  hypothetical protein  22.9 
 
 		 839 aa  50.8  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3208  organic solvent tolerance protein  20.72 
 
 		 799 aa  50.8  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2421  putative organic solvent tolerance protein  24.14 
 
 		 761 aa  50.4  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.644424  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2714  Organic solvent tolerance protein  23.73 
 
 		 753 aa  49.7  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0706  organic solvent tolerance protein  24.68 
 
 		 787 aa  50.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0692  organic solvent tolerance protein  24.68 
 
 		 787 aa  50.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2341  putative organic solvent tolerance protein  24.68 
 
 		 787 aa  50.1  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.651905  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0208  organic solvent tolerance protein, putative  24.68 
 
 		 787 aa  50.1  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.357539  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2737  putative organic solvent tolerance protein  24.68 
 
 		 787 aa  50.1  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0871  organic solvent tolerance protein, putative  24.68 
 
 		 787 aa  50.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4624  organic solvent tolerance protein  21.98 
 
 		 926 aa  49.3  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.47424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1454  Organic solvent tolerance protein  22.34 
 
 		 836 aa  48.9  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591855  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0375  hypothetical protein  22.14 
 
 		 839 aa  48.9  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1348  Organic solvent tolerance protein  21.49 
 
 		 781 aa  48.9  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2328  organic solvent tolerance protein  19.3 
 
 		 762 aa  48.9  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000704394  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0554  organic solvent tolerance protein, putative  27.64 
 
 		 905 aa  48.5  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5132  organic solvent tolerance protein  24.32 
 
 		 937 aa  48.5  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.563491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1519  organic solvent tolerance protein  20.87 
 
 		 912 aa  48.5  0.0005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.136547 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1754  organic solvent tolerance protein  22.34 
 
 		 1131 aa  48.5  0.0005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0989736  hitchhiker  0.000198385 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0268  Organic solvent tolerance protein  23.16 
 
 		 765 aa  48.5  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2115  Organic solvent tolerance protein  22 
 
 		 808 aa  48.1  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1413  organic solvent tolerance protein, putative  22.88 
 
 		 777 aa  47.8  0.0009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000119943  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0652  organic solvent tolerance protein  22.62 
 
 		 892 aa  47.4  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0575  organic solvent tolerance protein, putative  24.89 
 
 		 787 aa  47.4  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0865  organic solvent tolerance protein  21.03 
 
 		 774 aa  47.8  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000634249  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3470  Organic solvent tolerance protein  22.73 
 
 		 791 aa  47.4  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.917858  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2603  OstA family protein  22.34 
 
 		 816 aa  46.6  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.689958  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4523  organic solvent tolerance protein  25 
 
 		 771 aa  46.6  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3076  organic solvent tolerance protein  22.73 
 
 		 766 aa  45.8  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4112  organic solvent tolerance protein  22.73 
 
 		 783 aa  46.2  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1698  putative organic solvent tolerance protein  21.26 
 
 		 997 aa  45.8  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.999611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0438  organic solvent tolerance protein  22.78 
 
 		 935 aa  45.8  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.373211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6035  organic solvent tolerance protein  21.62 
 
 		 774 aa  45.8  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0435  organic solvent tolerance protein  22.78 
 
 		 932 aa  45.8  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00337227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0677  putative organic solvent tolerance  22.64 
 
 		 792 aa  45.8  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0202  putative organic solvent tolerance transmembrane protein  23.85 
 
 		 819 aa  45.1  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.829458 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2696  OstA family protein  24.85 
 
 		 816 aa  44.7  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.996193  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2885  organic solvent tolerance protein  23.78 
 
 		 766 aa  44.7  0.008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000379496  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1260  organic solvent tolerance protein OstA-like  20.3 
 
 		 816 aa  44.7  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.857177  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0685  organic solvent tolerance, putative  22.64 
 
 		 792 aa  44.7  0.008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0371  organic solvent tolerance protein  21.51 
 
 		 784 aa  44.7  0.008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0506  organic solvent tolerance protein  21.81 
 
 		 791 aa  44.7  0.008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4798  organic solvent tolerance protein  22.46 
 
 		 934 aa  44.7  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03411  organic solvent tolerance protein  26 
 
 		 750 aa  44.7  0.008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.473581  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>