100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0674 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_0828  hypothetical protein  40.57 
 
 
862 aa  659    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0674  hypothetical protein  100 
 
 
906 aa  1854    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.62108  hitchhiker  0.00476533 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0777  hypothetical protein  54.44 
 
 
907 aa  1003    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0492  hypothetical protein  46.42 
 
 
882 aa  798    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1942  hypothetical protein  48.95 
 
 
908 aa  820    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.328684  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0536  hypothetical protein  38.4 
 
 
880 aa  575  1.0000000000000001e-162  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.00000422486  normal  0.794266 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1298  hypothetical protein  34.52 
 
 
853 aa  515  1e-144  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.445914  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11093  hypothetical protein  28.73 
 
 
1049 aa  281  4e-74  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1691  Organic solvent tolerance protein OstA-like protein  27.29 
 
 
870 aa  248  4e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4586  organic solvent tolerance protein OstA-like protein  25.65 
 
 
922 aa  239  2e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1560  hypothetical protein  25.14 
 
 
906 aa  235  4.0000000000000004e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.40079  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0749  hypothetical protein  24.92 
 
 
899 aa  234  7.000000000000001e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0833179  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4903  Organic solvent tolerance protein OstA-like protein  24.27 
 
 
1210 aa  219  2e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6190  putative organic solvent tolerance protein OstA  24.04 
 
 
926 aa  218  5e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.235934 
 
 
-
 
NC_002950  PG1405  hypothetical protein  24.41 
 
 
951 aa  216  1.9999999999999998e-54  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.342317 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1870  Organic solvent tolerance protein OstA  22.26 
 
 
882 aa  204  4e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3634  hypothetical protein  23.39 
 
 
972 aa  203  9.999999999999999e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1645  hypothetical protein  28.06 
 
 
889 aa  119  1.9999999999999998e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2474  organic solvent tolerance protein, putative  24.14 
 
 
697 aa  75.9  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2367  organic solvent tolerance protein, putative  23.38 
 
 
628 aa  71.6  0.00000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.147572  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1159  organic solvent tolerance protein  21.9 
 
 
686 aa  70.5  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3347  Organic solvent tolerance protein  21.79 
 
 
684 aa  68.6  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0147  OstA family protein  29.57 
 
 
708 aa  67.8  0.0000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3276  organic solvent tolerance protein  27.06 
 
 
710 aa  67.4  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.112373  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0739  organic solvent tolerance protein OstA  27.81 
 
 
701 aa  65.5  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.71512e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0898  Organic solvent tolerance protein  24.26 
 
 
684 aa  63.9  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.33463e-30 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0406  Organic solvent tolerance protein  27.6 
 
 
813 aa  62.4  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0391  Organic solvent tolerance protein  27.6 
 
 
813 aa  62  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.298665  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0607  OstA family protein  22.58 
 
 
1194 aa  60.8  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00470061  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1235  Organic solvent tolerance protein  22.76 
 
 
705 aa  59.3  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0515  organic solvent tolerance transmembrane protein  27.73 
 
 
811 aa  58.5  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.877133  normal  0.048519 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2816  organic solvent tolerance protein  23.96 
 
 
764 aa  58.2  0.0000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0189474  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0375  hypothetical protein  23.03 
 
 
839 aa  57  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1413  organic solvent tolerance protein, putative  28.08 
 
 
777 aa  56.2  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000119943  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2714  Organic solvent tolerance protein  31.15 
 
 
753 aa  57  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17610  permease YjgP/YjgQ family protein  26.49 
 
 
1040 aa  57  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0350  hypothetical protein  22.7 
 
 
839 aa  56.6  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1574  Organic solvent tolerance protein  21.28 
 
 
841 aa  56.2  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0865  organic solvent tolerance protein  22.67 
 
 
774 aa  53.9  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000634249  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0685  organic solvent tolerance, putative  27.03 
 
 
792 aa  53.5  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1088  Organic solvent tolerance protein  24.19 
 
 
784 aa  53.1  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.567172  normal  0.030432 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0268  Organic solvent tolerance protein  22.44 
 
 
765 aa  53.1  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5132  organic solvent tolerance protein  27.33 
 
 
937 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.563491  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1454  Organic solvent tolerance protein  24.03 
 
 
836 aa  53.5  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591855  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0497  organic solvent tolerance protein  25.25 
 
 
810 aa  53.1  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2032  organic solvent tolerance protein  21.81 
 
 
778 aa  53.1  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0677  putative organic solvent tolerance  27.03 
 
 
792 aa  53.5  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4624  organic solvent tolerance protein  28.65 
 
 
926 aa  52.8  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.47424  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0554  organic solvent tolerance protein, putative  28.65 
 
 
905 aa  52.4  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0436  organic solvent tolerance protein  23.16 
 
 
824 aa  52  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.524466 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3076  organic solvent tolerance protein  22.71 
 
 
766 aa  52  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0371  organic solvent tolerance protein  23.93 
 
 
784 aa  52  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2603  organic solvent tolerance protein  25.68 
 
 
786 aa  51.6  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2836  organic solvent tolerance protein  23.81 
 
 
842 aa  50.8  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.324598  normal  0.142407 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0160  organic solvent tolerance protein OstA-like  23.66 
 
 
832 aa  50.8  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0601393 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1670  organic solvent tolerance protein  21.85 
 
 
756 aa  50.4  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0107497  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2421  putative organic solvent tolerance protein  26.25 
 
 
761 aa  49.7  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.644424  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4024  putative organic solvent tolerance protein  25.19 
 
 
789 aa  49.7  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.560503  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2737  putative organic solvent tolerance protein  26.25 
 
 
787 aa  49.7  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0208  organic solvent tolerance protein, putative  26.25 
 
 
787 aa  49.7  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.357539  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0871  organic solvent tolerance protein, putative  26.25 
 
 
787 aa  49.7  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2885  organic solvent tolerance protein  22.22 
 
 
766 aa  49.7  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000379496  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2341  putative organic solvent tolerance protein  26.25 
 
 
787 aa  49.7  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.651905  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0692  organic solvent tolerance protein  26.25 
 
 
787 aa  49.7  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0706  organic solvent tolerance protein  26.25 
 
 
787 aa  49.7  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2864  organic solvent tolerance protein  21.72 
 
 
787 aa  49.3  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000318031  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0435  organic solvent tolerance protein  23.77 
 
 
932 aa  49.3  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00337227  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0675  Organic solvent tolerance protein  25.65 
 
 
788 aa  48.9  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0739  organic solvent tolerance protein OstA precursor  23.1 
 
 
922 aa  48.9  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0438  organic solvent tolerance protein  23.77 
 
 
935 aa  48.9  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.373211  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0202  putative organic solvent tolerance transmembrane protein  24.05 
 
 
819 aa  48.9  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.829458 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2328  organic solvent tolerance protein  23.51 
 
 
762 aa  48.1  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000704394  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3470  Organic solvent tolerance protein  26.44 
 
 
791 aa  48.1  0.0008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.917858  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1870  organic solvent tolerance protein  22.1 
 
 
816 aa  48.1  0.0008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3636  organic solvent tolerance protein  24.18 
 
 
765 aa  47.8  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1348  Organic solvent tolerance protein  25.81 
 
 
781 aa  47.8  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0727  organic solvent tolerance protein  26.29 
 
 
787 aa  47.4  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000065541  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3208  organic solvent tolerance protein  22.53 
 
 
799 aa  47.4  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0396  organic solvent tolerance protein  24.42 
 
 
788 aa  47.8  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441976  normal  0.0999186 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3418  organic solvent tolerance protein  21.36 
 
 
735 aa  47  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000112563  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0967  organic solvent tolerance protein  22.95 
 
 
774 aa  46.2  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000267662  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4010  organic solvent tolerance protein  21.5 
 
 
938 aa  47  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4112  organic solvent tolerance protein  26.44 
 
 
783 aa  46.6  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4812  organic solvent tolerance protein  21.4 
 
 
856 aa  46.6  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.685199  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07770  organic solvent tolerance protein OstA precursor  22.33 
 
 
924 aa  47  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0241314 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0882  organic solvent tolerance protein  23.83 
 
 
773 aa  46.2  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000270887  normal  0.785369 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0588  organic solvent tolerance protein  28.65 
 
 
786 aa  45.8  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.649611  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0992  organic solvent tolerance protein  23.66 
 
 
765 aa  45.4  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0210027  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0566  organic solvent tolerance protein  23.33 
 
 
807 aa  45.1  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0203405  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6038  organic solvent tolerance protein  28.65 
 
 
786 aa  45.1  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3034  organic solvent tolerance protein, putative  24.64 
 
 
701 aa  45.1  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6035  organic solvent tolerance protein  23.57 
 
 
774 aa  45.1  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1977  Organic solvent tolerance protein  25.88 
 
 
751 aa  44.7  0.007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2643  Organic solvent tolerance protein  24.64 
 
 
727 aa  44.7  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.301946  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2738  organic solvent tolerance protein  28.57 
 
 
786 aa  44.7  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2099  organic solvent tolerance protein  28.57 
 
 
786 aa  44.7  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2711  organic solvent tolerance protein  28.57 
 
 
786 aa  44.7  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4798  organic solvent tolerance protein  22.63 
 
 
934 aa  44.7  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427349  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0161  organic solvent tolerance protein OstA-like protein  21.02 
 
 
667 aa  44.3  0.01  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2346  Organic solvent tolerance protein OstA  25.45 
 
 
993 aa  44.3  0.01  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>