208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3076 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_3309  Organic solvent tolerance protein  70.14 
 
 		 765 aa  1113    Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000208036  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3636  organic solvent tolerance protein  70.83 
 
 		 765 aa  1110    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1017  organic solvent tolerance protein  68.43 
 
 		 773 aa  1107    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000878563  hitchhiker  0.00955351 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1082  organic solvent tolerance protein  70.27 
 
 		 765 aa  1113    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000021692  normal  0.94876 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1049  organic solvent tolerance protein  70.14 
 
 		 765 aa  1113    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000815644  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2885  organic solvent tolerance protein  74.67 
 
 		 766 aa  1196    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000379496  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0865  organic solvent tolerance protein  68.73 
 
 		 774 aa  1110    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000634249  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0908  organic solvent tolerance protein  71.61 
 
 		 765 aa  1142    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000625202  normal  0.177324 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3112  organic solvent tolerance protein  71.61 
 
 		 765 aa  1142    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000136701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3076  organic solvent tolerance protein  100 
 
 		 766 aa  1582    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3206  organic solvent tolerance protein  71.48 
 
 		 765 aa  1144    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000004691  normal  0.810097 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2816  organic solvent tolerance protein  66.67 
 
 		 764 aa  1091    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0189474  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0967  organic solvent tolerance protein  68.86 
 
 		 774 aa  1122    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000267662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0980  organic solvent tolerance protein  70.27 
 
 		 765 aa  1114    Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000900172  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0882  organic solvent tolerance protein  67.31 
 
 		 773 aa  1081    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000270887  normal  0.785369 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0992  organic solvent tolerance protein  70.14 
 
 		 765 aa  1130    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0210027  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3418  organic solvent tolerance protein  39.1 
 
 		 735 aa  549  1e-155  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000112563  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03411  organic solvent tolerance protein  38.12 
 
 		 750 aa  545  1e-153  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.473581  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4523  organic solvent tolerance protein  38.84 
 
 		 771 aa  533  1e-150  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0371  organic solvent tolerance protein  37.68 
 
 		 784 aa  476  1e-133  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1050  organic solvent tolerance protein  36.03 
 
 		 790 aa  474  1e-132  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00811  organic solvent tolerance protein  36.29 
 
 		 781 aa  454  1.0000000000000001e-126  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0727  organic solvent tolerance protein  35.82 
 
 		 787 aa  450  1e-125  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000065541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0058  organic solvent tolerance protein  34.64 
 
 		 785 aa  449  1e-125  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000119427  normal  0.365449 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3632  organic solvent tolerance protein  34.54 
 
 		 799 aa  451  1e-125  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000841674  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0205  organic solvent tolerance protein  33.71 
 
 		 781 aa  449  1e-125  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.420377  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3829  organic solvent tolerance protein  34.45 
 
 		 801 aa  451  1e-125  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00058  organic solvent tolerance protein precursor  34.16 
 
 		 784 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000114767  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3545  Organic solvent tolerance protein  34.16 
 
 		 784 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000267581  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0566  organic solvent tolerance protein  34.49 
 
 		 807 aa  449  1.0000000000000001e-124  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0203405  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3601  organic solvent tolerance protein  34.16 
 
 		 784 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000724307  hitchhiker  0.00000564634 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00057  hypothetical protein  34.16 
 
 		 784 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000200577  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0605  organic solvent tolerance protein  34.94 
 
 		 799 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0272025  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0060  organic solvent tolerance protein  34.16 
 
 		 784 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118129  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0058  organic solvent tolerance protein  34.16 
 
 		 784 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000825468  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001662  Imp required for envelope biogenesis/organic solvent tolerance protein precursor  34.18 
 
 		 781 aa  445  1e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0048  organic solvent tolerance protein  34.03 
 
 		 784 aa  441  9.999999999999999e-123  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000576585  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0060  organic solvent tolerance protein  33.9 
 
 		 773 aa  440  9.999999999999999e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00055163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0099  organic solvent tolerance protein  33.85 
 
 		 786 aa  438  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0097442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0102  organic solvent tolerance protein  33.85 
 
 		 786 aa  438  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000015449  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0097  organic solvent tolerance protein  33.55 
 
 		 786 aa  436  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0159547  normal  0.564558 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0098  organic solvent tolerance protein  33.55 
 
 		 786 aa  437  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00167743  normal  0.0233205 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3441  organic solvent tolerance protein  33.38 
 
 		 780 aa  434  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000745954  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0104  organic solvent tolerance protein  33.51 
 
 		 784 aa  434  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00372289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0603  organic solvent tolerance protein  33.38 
 
 		 781 aa  433  1e-120  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000490445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2864  organic solvent tolerance protein  34.86 
 
 		 787 aa  432  1e-120  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000318031  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3570  organic solvent tolerance protein  34.04 
 
 		 750 aa  430  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000108275  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0769  organic solvent tolerance protein  33.91 
 
 		 750 aa  431  1e-119  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000043296  normal  0.038123 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4624  organic solvent tolerance protein  29.06 
 
 		 926 aa  364  3e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.47424  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0554  organic solvent tolerance protein, putative  28.62 
 
 		 905 aa  362  2e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0438  organic solvent tolerance protein  30.3 
 
 		 935 aa  353  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.373211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4010  organic solvent tolerance protein  31.13 
 
 		 938 aa  353  7e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5132  organic solvent tolerance protein  28.61 
 
 		 937 aa  348  2e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.563491  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46800  Organic solvent tolerance protein  30.03 
 
 		 919 aa  348  3e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.532703  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0435  organic solvent tolerance protein  30.43 
 
 		 932 aa  347  5e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00337227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0739  organic solvent tolerance protein OstA precursor  29.08 
 
 		 922 aa  338  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1724  organic solvent tolerance protein  30.52 
 
 		 738 aa  337  3.9999999999999995e-91  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2714  Organic solvent tolerance protein  30.07 
 
 		 753 aa  335  2e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07770  organic solvent tolerance protein OstA precursor  27.83 
 
 		 924 aa  332  2e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0241314 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4798  organic solvent tolerance protein  28.87 
 
 		 934 aa  330  4e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0740  organic solvent tolerance protein, putative  30.67 
 
 		 860 aa  327  6e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04642  organic solvent tolerance protein  30.45 
 
 		 813 aa  315  9.999999999999999e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0686354  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2337  organic solvent tolerance transmembrane protein  30.11 
 
 		 728 aa  313  4.999999999999999e-84  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.503681  normal  0.440955 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1977  Organic solvent tolerance protein  32.01 
 
 		 751 aa  313  1e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0199  organic solvent tolerance protein  27.2 
 
 		 757 aa  304  5.000000000000001e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0836973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1454  Organic solvent tolerance protein  30.96 
 
 		 836 aa  302  1e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591855  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3659  organic solvent tolerance protein  33.22 
 
 		 849 aa  301  4e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.880911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0497  organic solvent tolerance protein  26.65 
 
 		 810 aa  295  2e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0515  organic solvent tolerance transmembrane protein  28.61 
 
 		 811 aa  295  3e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.877133  normal  0.048519 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0406  Organic solvent tolerance protein  28.57 
 
 		 813 aa  295  3e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0391  Organic solvent tolerance protein  28.72 
 
 		 813 aa  293  7e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.298665  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0375  hypothetical protein  27.31 
 
 		 839 aa  293  7e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3510  organic solvent tolerance protein  30.21 
 
 		 794 aa  292  1e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1020  organic solvent tolerance protein  28.38 
 
 		 794 aa  291  2e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0436  organic solvent tolerance protein  27.82 
 
 		 824 aa  291  3e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.524466 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0521  organic solvent tolerance protein  28.98 
 
 		 929 aa  290  7e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0601  organic solvent tolerance protein, putative  27.26 
 
 		 1091 aa  290  8e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2012  organic solvent tolerance protein  29.09 
 
 		 792 aa  290  9e-77  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0671  organic solvent tolerance protein  27.6 
 
 		 826 aa  290  9e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0350  hypothetical protein  27.23 
 
 		 839 aa  288  2e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1936  organic solvent tolerance protein  28.95 
 
 		 792 aa  287  5.999999999999999e-76  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2149  organic solvent tolerance protein  26.83 
 
 		 803 aa  283  6.000000000000001e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.550449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0917  organic solvent tolerance protein  27.89 
 
 		 821 aa  280  1e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3470  Organic solvent tolerance protein  29.03 
 
 		 791 aa  275  2.0000000000000002e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.917858  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4764  organic solvent tolerance protein  28.78 
 
 		 820 aa  275  2.0000000000000002e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0675  Organic solvent tolerance protein  27.36 
 
 		 788 aa  272  2e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2099  organic solvent tolerance protein  27.79 
 
 		 786 aa  271  4e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2738  organic solvent tolerance protein  27.79 
 
 		 786 aa  271  4e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2711  organic solvent tolerance protein  27.79 
 
 		 786 aa  271  4e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6038  organic solvent tolerance protein  27.23 
 
 		 786 aa  270  5.9999999999999995e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1274  Organic solvent tolerance protein  27.01 
 
 		 778 aa  270  1e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.436193  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4112  organic solvent tolerance protein  28.86 
 
 		 783 aa  269  1e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0396  organic solvent tolerance protein  27.93 
 
 		 788 aa  269  1e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441976  normal  0.0999186 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0575  organic solvent tolerance protein, putative  28.1 
 
 		 787 aa  267  7e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0588  organic solvent tolerance protein  27.11 
 
 		 786 aa  265  2e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.649611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4024  putative organic solvent tolerance protein  27.18 
 
 		 789 aa  266  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.560503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2629  organic solvent tolerance protein  27.23 
 
 		 786 aa  265  4e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.355062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0871  organic solvent tolerance protein, putative  27.6 
 
 		 787 aa  263  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2763  organic solvent tolerance protein  27.08 
 
 		 786 aa  263  1e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0692  organic solvent tolerance protein  27.6 
 
 		 787 aa  263  1e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>