101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0492 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_0536  hypothetical protein  43.28 
 
 		 880 aa  693    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.00000422486  normal  0.794266 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1942  hypothetical protein  56.01 
 
 		 908 aa  1040    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.328684  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0492  hypothetical protein  100 
 
 		 882 aa  1812    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0777  hypothetical protein  44.27 
 
 		 907 aa  780    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0674  hypothetical protein  46.42 
 
 		 906 aa  778    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.62108  hitchhiker  0.00476533 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0828  hypothetical protein  46.54 
 
 		 862 aa  778    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1298  hypothetical protein  36.99 
 
 		 853 aa  584  1.0000000000000001e-165  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.445914  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0749  hypothetical protein  24.86 
 
 		 899 aa  249  1e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0833179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1691  Organic solvent tolerance protein OstA-like protein  25.84 
 
 		 870 aa  225  3e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1405  hypothetical protein  23.63 
 
 		 951 aa  220  1e-55  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.342317 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1870  Organic solvent tolerance protein OstA  24.8 
 
 		 882 aa  220  1e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1560  hypothetical protein  24.13 
 
 		 906 aa  218  2.9999999999999998e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.40079  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11093  hypothetical protein  24.15 
 
 		 1049 aa  217  9e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4586  organic solvent tolerance protein OstA-like protein  23.8 
 
 		 922 aa  214  3.9999999999999995e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4903  Organic solvent tolerance protein OstA-like protein  23.68 
 
 		 1210 aa  211  7e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6190  putative organic solvent tolerance protein OstA  22.07 
 
 		 926 aa  198  5.000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.235934 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1645  hypothetical protein  26.5 
 
 		 889 aa  145  5e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3634  hypothetical protein  28.61 
 
 		 972 aa  126  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1159  organic solvent tolerance protein  24.4 
 
 		 686 aa  89.4  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3347  Organic solvent tolerance protein  23.11 
 
 		 684 aa  68.2  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0898  Organic solvent tolerance protein  23.42 
 
 		 684 aa  67.4  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.33463e-30 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2474  organic solvent tolerance protein, putative  22.99 
 
 		 697 aa  65.1  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3276  organic solvent tolerance protein  24.21 
 
 		 710 aa  65.1  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.112373  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2367  organic solvent tolerance protein, putative  25.57 
 
 		 628 aa  62.8  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.147572  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1519  organic solvent tolerance protein  23.66 
 
 		 912 aa  62  0.00000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.136547 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0147  OstA family protein  28.08 
 
 		 708 aa  62  0.00000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1235  Organic solvent tolerance protein  21.83 
 
 		 705 aa  61.6  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0675  Organic solvent tolerance protein  24.09 
 
 		 788 aa  60.1  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4624  organic solvent tolerance protein  27.37 
 
 		 926 aa  59.3  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.47424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0160  organic solvent tolerance protein OstA-like  25 
 
 		 832 aa  58.9  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0601393 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4024  putative organic solvent tolerance protein  24.09 
 
 		 789 aa  58.2  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.560503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0396  organic solvent tolerance protein  24.5 
 
 		 788 aa  58.2  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441976  normal  0.0999186 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0554  organic solvent tolerance protein, putative  27.37 
 
 		 905 aa  58.2  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3470  Organic solvent tolerance protein  26.16 
 
 		 791 aa  55.5  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.917858  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3208  organic solvent tolerance protein  22.96 
 
 		 799 aa  55.5  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3076  organic solvent tolerance protein  22.44 
 
 		 766 aa  54.7  0.000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1698  putative organic solvent tolerance protein  22.57 
 
 		 997 aa  54.7  0.000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.999611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4112  organic solvent tolerance protein  25.74 
 
 		 783 aa  54.3  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5132  organic solvent tolerance protein  28.05 
 
 		 937 aa  53.5  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.563491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6035  organic solvent tolerance protein  25 
 
 		 774 aa  53.5  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0739  organic solvent tolerance protein OstA  23.79 
 
 		 701 aa  52.8  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.71512e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3418  organic solvent tolerance protein  23.31 
 
 		 735 aa  52.4  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000112563  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0235  putative periplasmic protein  20.5 
 
 		 744 aa  52.4  0.00004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.919677  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0435  organic solvent tolerance protein  25.93 
 
 		 932 aa  52  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00337227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2816  organic solvent tolerance protein  23.44 
 
 		 764 aa  52  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0189474  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0406  Organic solvent tolerance protein  23.91 
 
 		 813 aa  52  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0098  organic solvent tolerance protein  23.4 
 
 		 799 aa  51.6  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2421  putative organic solvent tolerance protein  23.96 
 
 		 761 aa  51.6  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.644424  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0882  organic solvent tolerance protein  21.32 
 
 		 773 aa  51.6  0.00006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000270887  normal  0.785369 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1754  organic solvent tolerance protein  23.25 
 
 		 1131 aa  51.6  0.00007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0989736  hitchhiker  0.000198385 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0865  organic solvent tolerance protein  23.49 
 
 		 774 aa  51.2  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000634249  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2328  organic solvent tolerance protein  22.14 
 
 		 762 aa  50.8  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000704394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0438  organic solvent tolerance protein  25.95 
 
 		 935 aa  50.4  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.373211  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0208  organic solvent tolerance protein, putative  23.95 
 
 		 787 aa  50.1  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.357539  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0871  organic solvent tolerance protein, putative  23.95 
 
 		 787 aa  50.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2737  putative organic solvent tolerance protein  23.95 
 
 		 787 aa  50.1  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2341  putative organic solvent tolerance protein  23.95 
 
 		 787 aa  50.1  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.651905  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0692  organic solvent tolerance protein  23.95 
 
 		 787 aa  50.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0706  organic solvent tolerance protein  23.95 
 
 		 787 aa  50.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4798  organic solvent tolerance protein  26.86 
 
 		 934 aa  50.1  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0391  Organic solvent tolerance protein  23.68 
 
 		 813 aa  50.1  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.298665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0992  organic solvent tolerance protein  30.34 
 
 		 765 aa  49.3  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0210027  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0588  organic solvent tolerance protein  24.29 
 
 		 786 aa  49.3  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.649611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1574  Organic solvent tolerance protein  21.05 
 
 		 841 aa  49.3  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6038  organic solvent tolerance protein  24.4 
 
 		 786 aa  48.9  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1413  organic solvent tolerance protein, putative  22.73 
 
 		 777 aa  48.5  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000119943  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0575  organic solvent tolerance protein, putative  24.17 
 
 		 787 aa  48.5  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0202  putative organic solvent tolerance transmembrane protein  23.35 
 
 		 819 aa  48.9  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.829458 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0506  organic solvent tolerance protein  21.31 
 
 		 791 aa  48.5  0.0006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2603  OstA family protein  24.05 
 
 		 816 aa  48.1  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.689958  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0350  hypothetical protein  22.42 
 
 		 839 aa  48.1  0.0008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00811  organic solvent tolerance protein  27.27 
 
 		 781 aa  47.8  0.0009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0967  organic solvent tolerance protein  20.5 
 
 		 774 aa  47.8  0.0009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000267662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2099  organic solvent tolerance protein  23.6 
 
 		 786 aa  47.4  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2711  organic solvent tolerance protein  23.6 
 
 		 786 aa  47.4  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2738  organic solvent tolerance protein  23.6 
 
 		 786 aa  47.4  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0371  organic solvent tolerance protein  24.88 
 
 		 784 aa  47.4  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0515  organic solvent tolerance transmembrane protein  21.15 
 
 		 811 aa  46.6  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.877133  normal  0.048519 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3636  organic solvent tolerance protein  22.41 
 
 		 765 aa  47  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0375  hypothetical protein  22.06 
 
 		 839 aa  47  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2885  organic solvent tolerance protein  21.58 
 
 		 766 aa  47  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000379496  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0436  organic solvent tolerance protein  23.83 
 
 		 824 aa  46.6  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.524466 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07770  organic solvent tolerance protein OstA precursor  26.39 
 
 		 924 aa  46.6  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0241314 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1017  organic solvent tolerance protein  29.21 
 
 		 773 aa  47  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000878563  hitchhiker  0.00955351 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2696  OstA family protein  23.9 
 
 		 816 aa  47  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.996193  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1759  organic solvent tolerance protein  22.61 
 
 		 786 aa  45.8  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.179124  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2629  organic solvent tolerance protein  23.2 
 
 		 786 aa  45.8  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.355062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17610  permease YjgP/YjgQ family protein  26.02 
 
 		 1040 aa  46.2  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0908  organic solvent tolerance protein  29.21 
 
 		 765 aa  45.4  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000625202  normal  0.177324 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3112  organic solvent tolerance protein  29.21 
 
 		 765 aa  45.4  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000136701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2763  organic solvent tolerance protein  23.2 
 
 		 786 aa  45.4  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3206  organic solvent tolerance protein  29.21 
 
 		 765 aa  45.4  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000004691  normal  0.810097 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0763  organic solvent tolerance protein  22.97 
 
 		 781 aa  45.1  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.169469 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0727  organic solvent tolerance protein  22.03 
 
 		 787 aa  45.1  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000065541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0161  organic solvent tolerance protein OstA-like protein  21.47 
 
 		 667 aa  45.1  0.006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0739  organic solvent tolerance protein OstA precursor  25.32 
 
 		 922 aa  45.1  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0098  organic solvent tolerance protein  25 
 
 		 786 aa  44.7  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00167743  normal  0.0233205 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0097  organic solvent tolerance protein  25 
 
 		 786 aa  44.7  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0159547  normal  0.564558 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2864  organic solvent tolerance protein  21.67 
 
 		 787 aa  44.3  0.009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000318031  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0099  organic solvent tolerance protein  25 
 
 		 786 aa  44.3  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0097442  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>