26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3634 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4903  Organic solvent tolerance protein OstA-like protein  49.3 
 
 		 1210 aa  915    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3634  hypothetical protein  100 
 
 		 972 aa  1986    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0749  hypothetical protein  34.04 
 
 		 899 aa  472  1.0000000000000001e-131  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0833179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1870  Organic solvent tolerance protein OstA  32.9 
 
 		 882 aa  429  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1405  hypothetical protein  31.21 
 
 		 951 aa  409  1.0000000000000001e-112  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.342317 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6190  putative organic solvent tolerance protein OstA  30.17 
 
 		 926 aa  366  1e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.235934 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1645  hypothetical protein  29.27 
 
 		 889 aa  360  6e-98  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11093  hypothetical protein  31.15 
 
 		 1049 aa  346  1e-93  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1560  hypothetical protein  30.91 
 
 		 906 aa  345  2.9999999999999997e-93  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.40079  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4586  organic solvent tolerance protein OstA-like protein  29.14 
 
 		 922 aa  342  1e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1691  Organic solvent tolerance protein OstA-like protein  28.82 
 
 		 870 aa  297  6e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0777  hypothetical protein  25.16 
 
 		 907 aa  206  2e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0674  hypothetical protein  23.01 
 
 		 906 aa  194  5e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.62108  hitchhiker  0.00476533 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1942  hypothetical protein  30.11 
 
 		 908 aa  140  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.328684  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0492  hypothetical protein  28.61 
 
 		 882 aa  130  1.0000000000000001e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0828  hypothetical protein  29.48 
 
 		 862 aa  106  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1298  hypothetical protein  25.94 
 
 		 853 aa  99.4  3e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.445914  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0536  hypothetical protein  25.66 
 
 		 880 aa  91.3  9e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.00000422486  normal  0.794266 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2367  organic solvent tolerance protein, putative  23.67 
 
 		 628 aa  59.7  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.147572  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0898  Organic solvent tolerance protein  24.31 
 
 		 684 aa  49.3  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.33463e-30 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3347  Organic solvent tolerance protein  22.75 
 
 		 684 aa  48.5  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1159  organic solvent tolerance protein  22.06 
 
 		 686 aa  48.5  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0147  OstA family protein  25.38 
 
 		 708 aa  48.1  0.0008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1088  Organic solvent tolerance protein  25 
 
 		 784 aa  46.2  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.567172  normal  0.030432 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2474  organic solvent tolerance protein, putative  24.07 
 
 		 697 aa  45.8  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0157  permease YjgP/YjgQ family protein  28.32 
 
 		 1111 aa  45.4  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000684055  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>