36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4586 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_11093  hypothetical protein  51.85 
 
 
1049 aa  880    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1560  hypothetical protein  53.16 
 
 
906 aa  897    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.40079  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4586  organic solvent tolerance protein OstA-like protein  100 
 
 
922 aa  1887    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1870  Organic solvent tolerance protein OstA  31.68 
 
 
882 aa  406  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1405  hypothetical protein  29.33 
 
 
951 aa  396  1e-109  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.342317 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6190  putative organic solvent tolerance protein OstA  30.63 
 
 
926 aa  395  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.235934 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0749  hypothetical protein  29.96 
 
 
899 aa  354  5e-96  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0833179  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4903  Organic solvent tolerance protein OstA-like protein  28.42 
 
 
1210 aa  336  1e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3634  hypothetical protein  29.01 
 
 
972 aa  335  2e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1645  hypothetical protein  28.45 
 
 
889 aa  319  1e-85  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1691  Organic solvent tolerance protein OstA-like protein  27.98 
 
 
870 aa  307  6e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0777  hypothetical protein  24.8 
 
 
907 aa  238  3e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1942  hypothetical protein  24.58 
 
 
908 aa  238  5.0000000000000005e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.328684  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0674  hypothetical protein  25.31 
 
 
906 aa  224  4.9999999999999996e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.62108  hitchhiker  0.00476533 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0492  hypothetical protein  23.8 
 
 
882 aa  215  2.9999999999999995e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0536  hypothetical protein  22.77 
 
 
880 aa  144  6e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.00000422486  normal  0.794266 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0828  hypothetical protein  22.72 
 
 
862 aa  129  3e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1298  hypothetical protein  21.87 
 
 
853 aa  78.6  0.0000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.445914  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2367  organic solvent tolerance protein, putative  20.18 
 
 
628 aa  63.2  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.147572  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4010  organic solvent tolerance protein  24.05 
 
 
938 aa  62  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2711  organic solvent tolerance protein  24.45 
 
 
786 aa  53.5  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2738  organic solvent tolerance protein  24.45 
 
 
786 aa  53.5  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07770  organic solvent tolerance protein OstA precursor  22.93 
 
 
924 aa  53.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0241314 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2099  organic solvent tolerance protein  24.45 
 
 
786 aa  53.5  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5132  organic solvent tolerance protein  24.42 
 
 
937 aa  52  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.563491  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0739  organic solvent tolerance protein OstA precursor  22.61 
 
 
922 aa  50.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0554  organic solvent tolerance protein, putative  23.71 
 
 
905 aa  50.8  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0865  organic solvent tolerance protein  25.93 
 
 
774 aa  50.4  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000634249  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2763  organic solvent tolerance protein  24.03 
 
 
786 aa  49.7  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2629  organic solvent tolerance protein  24.03 
 
 
786 aa  49.3  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.355062  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4624  organic solvent tolerance protein  23.4 
 
 
926 aa  48.9  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.47424  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4798  organic solvent tolerance protein  23.43 
 
 
934 aa  48.1  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427349  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3276  organic solvent tolerance protein  24.06 
 
 
710 aa  47.4  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.112373  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3636  organic solvent tolerance protein  28.81 
 
 
765 aa  45.8  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0675  Organic solvent tolerance protein  33.96 
 
 
788 aa  45.1  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0375  hypothetical protein  30.34 
 
 
839 aa  44.3  0.01  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>