79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0777 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_0828  hypothetical protein  40.54 
 
 
862 aa  655    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0674  hypothetical protein  54.44 
 
 
906 aa  984    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.62108  hitchhiker  0.00476533 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0777  hypothetical protein  100 
 
 
907 aa  1861    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0492  hypothetical protein  44.27 
 
 
882 aa  780    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1942  hypothetical protein  45.22 
 
 
908 aa  790    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.328684  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0536  hypothetical protein  37.2 
 
 
880 aa  572  1e-161  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.00000422486  normal  0.794266 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1298  hypothetical protein  33.33 
 
 
853 aa  513  1e-144  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.445914  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1560  hypothetical protein  27.37 
 
 
906 aa  284  5.000000000000001e-75  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.40079  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11093  hypothetical protein  26.27 
 
 
1049 aa  280  1e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0749  hypothetical protein  25.87 
 
 
899 aa  266  1e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0833179  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1691  Organic solvent tolerance protein OstA-like protein  27.19 
 
 
870 aa  263  1e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4586  organic solvent tolerance protein OstA-like protein  24.8 
 
 
922 aa  238  4e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1405  hypothetical protein  24.89 
 
 
951 aa  233  1e-59  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.342317 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4903  Organic solvent tolerance protein OstA-like protein  25.72 
 
 
1210 aa  228  3e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1645  hypothetical protein  24.47 
 
 
889 aa  225  2e-57  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6190  putative organic solvent tolerance protein OstA  24.14 
 
 
926 aa  225  4e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.235934 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1870  Organic solvent tolerance protein OstA  23.7 
 
 
882 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3634  hypothetical protein  25.05 
 
 
972 aa  202  1.9999999999999998e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2474  organic solvent tolerance protein, putative  22.41 
 
 
697 aa  84.3  0.000000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3276  organic solvent tolerance protein  21.74 
 
 
710 aa  70.9  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.112373  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2367  organic solvent tolerance protein, putative  22.3 
 
 
628 aa  63.2  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.147572  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1159  organic solvent tolerance protein  19.93 
 
 
686 aa  63.2  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0739  organic solvent tolerance protein OstA  26.72 
 
 
701 aa  62  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.71512e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1235  Organic solvent tolerance protein  25.34 
 
 
705 aa  60.5  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3347  Organic solvent tolerance protein  22.28 
 
 
684 aa  60.8  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0898  Organic solvent tolerance protein  22.99 
 
 
684 aa  60.1  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.33463e-30 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0515  organic solvent tolerance transmembrane protein  28.92 
 
 
811 aa  60.5  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.877133  normal  0.048519 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0391  Organic solvent tolerance protein  26.63 
 
 
813 aa  58.2  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.298665  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0406  Organic solvent tolerance protein  26.09 
 
 
813 aa  57  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2603  organic solvent tolerance protein  26.14 
 
 
786 aa  57  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0917  organic solvent tolerance protein  26.9 
 
 
821 aa  56.2  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0268  Organic solvent tolerance protein  26.84 
 
 
765 aa  55.1  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0147  OstA family protein  25.62 
 
 
708 aa  54.3  0.000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0202  putative organic solvent tolerance transmembrane protein  25.27 
 
 
819 aa  53.5  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.829458 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3208  organic solvent tolerance protein  22.73 
 
 
799 aa  52.8  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1260  organic solvent tolerance protein OstA-like  23.46 
 
 
816 aa  52.8  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.857177  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0375  hypothetical protein  23.14 
 
 
839 aa  52.4  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0677  putative organic solvent tolerance  23.55 
 
 
792 aa  52.4  0.00004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2603  OstA family protein  25.43 
 
 
816 aa  52  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.689958  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0350  hypothetical protein  22.75 
 
 
839 aa  52  0.00005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0980  organic solvent tolerance protein  22.43 
 
 
765 aa  51.6  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000900172  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0685  organic solvent tolerance, putative  23.55 
 
 
792 aa  51.2  0.00008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2696  OstA family protein  25.43 
 
 
816 aa  51.2  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.996193  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0161  organic solvent tolerance protein OstA-like protein  24.73 
 
 
667 aa  51.2  0.00008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2328  organic solvent tolerance protein  23.6 
 
 
762 aa  50.4  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000704394  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1082  organic solvent tolerance protein  21.4 
 
 
765 aa  49.7  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000021692  normal  0.94876 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3636  organic solvent tolerance protein  21.54 
 
 
765 aa  50.1  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6035  organic solvent tolerance protein  24.63 
 
 
774 aa  49.7  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1049  organic solvent tolerance protein  21.4 
 
 
765 aa  49.7  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000815644  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3309  Organic solvent tolerance protein  21.4 
 
 
765 aa  49.3  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000208036  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1759  organic solvent tolerance protein  24.67 
 
 
786 aa  48.9  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.179124  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1698  putative organic solvent tolerance protein  24.58 
 
 
997 aa  47.8  0.0008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.999611  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0554  organic solvent tolerance protein, putative  25.54 
 
 
905 aa  47.8  0.0009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46800  Organic solvent tolerance protein  29.67 
 
 
919 aa  47.4  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.532703  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4798  organic solvent tolerance protein  25.97 
 
 
934 aa  47.8  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427349  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0865  organic solvent tolerance protein  27.21 
 
 
774 aa  47.4  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000634249  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1519  organic solvent tolerance protein  24.58 
 
 
912 aa  47.8  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.136547 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4624  organic solvent tolerance protein  27.27 
 
 
926 aa  47  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.47424  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0435  organic solvent tolerance protein  25.4 
 
 
932 aa  47  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00337227  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0992  organic solvent tolerance protein  21.21 
 
 
765 aa  46.2  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0210027  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001662  Imp required for envelope biogenesis/organic solvent tolerance protein precursor  20.54 
 
 
781 aa  46.2  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0438  organic solvent tolerance protein  28.41 
 
 
935 aa  47  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.373211  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0521  organic solvent tolerance protein  23.48 
 
 
929 aa  46.6  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1054  organic solvent tolerance protein  25.96 
 
 
757 aa  46.2  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0233273  normal  0.775857 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4024  putative organic solvent tolerance protein  22.73 
 
 
789 aa  45.8  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.560503  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5132  organic solvent tolerance protein  28.24 
 
 
937 aa  45.8  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.563491  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3076  organic solvent tolerance protein  25.38 
 
 
766 aa  45.1  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4010  organic solvent tolerance protein  29.55 
 
 
938 aa  45.1  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03411  organic solvent tolerance protein  22.32 
 
 
750 aa  45.1  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.473581  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0058  Organic solvent tolerance protein  21.76 
 
 
671 aa  45.1  0.006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00811  organic solvent tolerance protein  21.35 
 
 
781 aa  45.1  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3470  Organic solvent tolerance protein  23.68 
 
 
791 aa  44.7  0.008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.917858  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3206  organic solvent tolerance protein  21.8 
 
 
765 aa  44.7  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000004691  normal  0.810097 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1454  Organic solvent tolerance protein  24.23 
 
 
836 aa  44.7  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591855  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3112  organic solvent tolerance protein  25 
 
 
765 aa  44.3  0.009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000136701  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0908  organic solvent tolerance protein  25 
 
 
765 aa  44.3  0.009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000625202  normal  0.177324 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0497  organic solvent tolerance protein  24.57 
 
 
810 aa  44.3  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0160  organic solvent tolerance protein OstA-like  20.44 
 
 
832 aa  44.7  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0601393 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2864  organic solvent tolerance protein  24.64 
 
 
787 aa  44.3  0.01  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000318031  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>