204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001662 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_001662  Imp required for envelope biogenesis/organic solvent tolerance protein precursor  100 
 
 		 781 aa  1609    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0371  organic solvent tolerance protein  46.58 
 
 		 784 aa  741    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00811  organic solvent tolerance protein  88.99 
 
 		 781 aa  1474    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2864  organic solvent tolerance protein  59.77 
 
 		 787 aa  971    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000318031  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0727  organic solvent tolerance protein  38.29 
 
 		 787 aa  527  1e-148  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000065541  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3632  organic solvent tolerance protein  38.44 
 
 		 799 aa  525  1e-147  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000841674  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3829  organic solvent tolerance protein  38.44 
 
 		 801 aa  521  1e-146  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0566  organic solvent tolerance protein  38.71 
 
 		 807 aa  516  1.0000000000000001e-145  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0203405  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3441  organic solvent tolerance protein  37.64 
 
 		 780 aa  508  9.999999999999999e-143  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000745954  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0769  organic solvent tolerance protein  38.02 
 
 		 750 aa  503  1e-141  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000043296  normal  0.038123 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0099  organic solvent tolerance protein  37.9 
 
 		 786 aa  500  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0097442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3570  organic solvent tolerance protein  38.02 
 
 		 750 aa  502  1e-140  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000108275  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0104  organic solvent tolerance protein  37.58 
 
 		 784 aa  499  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00372289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0102  organic solvent tolerance protein  37.9 
 
 		 786 aa  499  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000015449  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0098  organic solvent tolerance protein  37.9 
 
 		 786 aa  500  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00167743  normal  0.0233205 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0058  organic solvent tolerance protein  38.05 
 
 		 785 aa  501  1e-140  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000119427  normal  0.365449 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00058  organic solvent tolerance protein precursor  37.74 
 
 		 784 aa  496  1e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000114767  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3545  Organic solvent tolerance protein  37.74 
 
 		 784 aa  496  1e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000267581  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3601  organic solvent tolerance protein  37.74 
 
 		 784 aa  496  1e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000724307  hitchhiker  0.00000564634 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0097  organic solvent tolerance protein  37.9 
 
 		 786 aa  498  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0159547  normal  0.564558 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0058  organic solvent tolerance protein  37.74 
 
 		 784 aa  496  1e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000825468  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0060  organic solvent tolerance protein  37.74 
 
 		 784 aa  496  1e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118129  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00057  hypothetical protein  37.74 
 
 		 784 aa  496  1e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000200577  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0048  organic solvent tolerance protein  37.63 
 
 		 784 aa  495  9.999999999999999e-139  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000576585  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0605  organic solvent tolerance protein  37.21 
 
 		 799 aa  487  1e-136  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0272025  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0603  organic solvent tolerance protein  37.07 
 
 		 781 aa  486  1e-136  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000490445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0060  organic solvent tolerance protein  37.55 
 
 		 773 aa  485  1e-135  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00055163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2816  organic solvent tolerance protein  35.82 
 
 		 764 aa  462  1e-129  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0189474  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1050  organic solvent tolerance protein  35.7 
 
 		 790 aa  464  1e-129  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1017  organic solvent tolerance protein  36.75 
 
 		 773 aa  464  1e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000878563  hitchhiker  0.00955351 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0882  organic solvent tolerance protein  36.58 
 
 		 773 aa  465  1e-129  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000270887  normal  0.785369 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0967  organic solvent tolerance protein  35.74 
 
 		 774 aa  450  1e-125  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000267662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0205  organic solvent tolerance protein  34.83 
 
 		 781 aa  450  1e-125  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.420377  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3076  organic solvent tolerance protein  34.18 
 
 		 766 aa  445  1e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0992  organic solvent tolerance protein  33.97 
 
 		 765 aa  429  1e-119  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0210027  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3636  organic solvent tolerance protein  35.12 
 
 		 765 aa  427  1e-118  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2885  organic solvent tolerance protein  33.9 
 
 		 766 aa  427  1e-118  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000379496  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0908  organic solvent tolerance protein  34.44 
 
 		 765 aa  426  1e-118  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000625202  normal  0.177324 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3112  organic solvent tolerance protein  34.44 
 
 		 765 aa  426  1e-118  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000136701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3206  organic solvent tolerance protein  34.48 
 
 		 765 aa  424  1e-117  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000004691  normal  0.810097 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0865  organic solvent tolerance protein  35.12 
 
 		 774 aa  421  1e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000634249  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03411  organic solvent tolerance protein  33.65 
 
 		 750 aa  417  9.999999999999999e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.473581  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1082  organic solvent tolerance protein  33.56 
 
 		 765 aa  411  1e-113  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000021692  normal  0.94876 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0980  organic solvent tolerance protein  33.42 
 
 		 765 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000900172  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3309  Organic solvent tolerance protein  33.42 
 
 		 765 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000208036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1049  organic solvent tolerance protein  33.42 
 
 		 765 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000815644  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4523  organic solvent tolerance protein  32.2 
 
 		 771 aa  399  1e-109  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3418  organic solvent tolerance protein  30.12 
 
 		 735 aa  380  1e-104  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000112563  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0554  organic solvent tolerance protein, putative  30.89 
 
 		 905 aa  321  3e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07770  organic solvent tolerance protein OstA precursor  30.07 
 
 		 924 aa  321  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0241314 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4624  organic solvent tolerance protein  30.69 
 
 		 926 aa  317  6e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.47424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0739  organic solvent tolerance protein OstA precursor  29.43 
 
 		 922 aa  313  6.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4010  organic solvent tolerance protein  30.56 
 
 		 938 aa  308  3e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46800  Organic solvent tolerance protein  30.03 
 
 		 919 aa  305  1.0000000000000001e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.532703  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0438  organic solvent tolerance protein  30.49 
 
 		 935 aa  302  2e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.373211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2714  Organic solvent tolerance protein  29.93 
 
 		 753 aa  298  2e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5132  organic solvent tolerance protein  29.7 
 
 		 937 aa  298  3e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.563491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0435  organic solvent tolerance protein  29.96 
 
 		 932 aa  298  4e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00337227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4798  organic solvent tolerance protein  29.49 
 
 		 934 aa  296  7e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0917  organic solvent tolerance protein  29.49 
 
 		 821 aa  283  7.000000000000001e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1724  organic solvent tolerance protein  29.21 
 
 		 738 aa  278  3e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04642  organic solvent tolerance protein  29.49 
 
 		 813 aa  276  1.0000000000000001e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0686354  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1936  organic solvent tolerance protein  30.51 
 
 		 792 aa  276  1.0000000000000001e-72  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2012  organic solvent tolerance protein  30.51 
 
 		 792 aa  275  3e-72  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0740  organic solvent tolerance protein, putative  27.55 
 
 		 860 aa  257  6e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0671  organic solvent tolerance protein  26.47 
 
 		 826 aa  256  8e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1977  Organic solvent tolerance protein  27.56 
 
 		 751 aa  252  2e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0199  organic solvent tolerance protein  27.94 
 
 		 757 aa  251  4e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0836973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1454  Organic solvent tolerance protein  27.49 
 
 		 836 aa  248  2e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591855  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0375  hypothetical protein  27.43 
 
 		 839 aa  248  3e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1519  organic solvent tolerance protein  28.47 
 
 		 912 aa  248  3e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.136547 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1698  putative organic solvent tolerance protein  27.72 
 
 		 997 aa  248  4e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.999611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2337  organic solvent tolerance transmembrane protein  27.59 
 
 		 728 aa  244  6e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.503681  normal  0.440955 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0521  organic solvent tolerance protein  26.07 
 
 		 929 aa  243  1e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1020  organic solvent tolerance protein  26.91 
 
 		 794 aa  243  1e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0350  hypothetical protein  27.04 
 
 		 839 aa  241  2.9999999999999997e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3659  organic solvent tolerance protein  27.36 
 
 		 849 aa  237  7e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.880911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1274  Organic solvent tolerance protein  25.72 
 
 		 778 aa  235  2.0000000000000002e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.436193  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0515  organic solvent tolerance transmembrane protein  27.34 
 
 		 811 aa  234  4.0000000000000004e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.877133  normal  0.048519 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0391  Organic solvent tolerance protein  27.12 
 
 		 813 aa  233  1e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.298665  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0406  Organic solvent tolerance protein  27.3 
 
 		 813 aa  230  9e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0497  organic solvent tolerance protein  27.08 
 
 		 810 aa  229  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3510  organic solvent tolerance protein  29.51 
 
 		 794 aa  226  1e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2149  organic solvent tolerance protein  27.3 
 
 		 803 aa  223  7e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.550449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0436  organic solvent tolerance protein  26.32 
 
 		 824 aa  222  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.524466 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2076  organic solvent tolerance protein  23.25 
 
 		 870 aa  217  8e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0583626  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0106  organic solvent tolerance protein  23.25 
 
 		 870 aa  216  9.999999999999999e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.307862  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1754  organic solvent tolerance protein  26.09 
 
 		 1131 aa  214  2.9999999999999995e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0989736  hitchhiker  0.000198385 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0601  organic solvent tolerance protein, putative  25.43 
 
 		 1091 aa  206  2e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4863  organic solvent tolerance protein  26.18 
 
 		 822 aa  201  3e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.102386 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3034  organic solvent tolerance protein, putative  25.54 
 
 		 701 aa  201  3e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2643  Organic solvent tolerance protein  25.54 
 
 		 727 aa  201  5e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.301946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3470  Organic solvent tolerance protein  25.36 
 
 		 791 aa  199  1.0000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.917858  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1054  organic solvent tolerance protein  25.45 
 
 		 757 aa  198  4.0000000000000005e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0233273  normal  0.775857 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4112  organic solvent tolerance protein  25.75 
 
 		 783 aa  197  5.000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4764  organic solvent tolerance protein  26.5 
 
 		 820 aa  197  9e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4076  organic solvent tolerance protein  25.75 
 
 		 814 aa  197  9e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.258262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0202  putative organic solvent tolerance transmembrane protein  25.88 
 
 		 819 aa  196  1e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.829458 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1654  organic solvent tolerance protein  26.54 
 
 		 791 aa  192  2e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0575  organic solvent tolerance protein, putative  26.44 
 
 		 787 aa  192  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>