233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1235 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_1235  Organic solvent tolerance protein  100 
 
 
705 aa  1456    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3276  organic solvent tolerance protein  43.16 
 
 
710 aa  580  1e-164  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.112373  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1159  organic solvent tolerance protein  43.18 
 
 
686 aa  561  1e-158  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2474  organic solvent tolerance protein, putative  42.14 
 
 
697 aa  554  1e-156  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2367  organic solvent tolerance protein, putative  43.88 
 
 
628 aa  532  1e-149  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.147572  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0898  Organic solvent tolerance protein  38.08 
 
 
684 aa  458  1e-127  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.33463e-30 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3347  Organic solvent tolerance protein  37.37 
 
 
684 aa  444  1e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0739  organic solvent tolerance protein OstA  30.91 
 
 
701 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.71512e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3208  organic solvent tolerance protein  26.16 
 
 
799 aa  211  4e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1088  Organic solvent tolerance protein  25.77 
 
 
784 aa  201  3e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.567172  normal  0.030432 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1670  organic solvent tolerance protein  25.39 
 
 
756 aa  198  3e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0107497  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0268  Organic solvent tolerance protein  24.74 
 
 
765 aa  177  5e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1413  organic solvent tolerance protein, putative  25 
 
 
777 aa  161  4e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000119943  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1348  Organic solvent tolerance protein  25.09 
 
 
781 aa  154  7e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4523  organic solvent tolerance protein  25.45 
 
 
771 aa  153  1e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2328  organic solvent tolerance protein  22.3 
 
 
762 aa  147  8.000000000000001e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000704394  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5132  organic solvent tolerance protein  26.82 
 
 
937 aa  146  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.563491  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2714  Organic solvent tolerance protein  27.93 
 
 
753 aa  144  8e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4624  organic solvent tolerance protein  27.34 
 
 
926 aa  141  3e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.47424  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0438  organic solvent tolerance protein  27.39 
 
 
935 aa  140  6e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.373211  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0199  organic solvent tolerance protein  24.32 
 
 
757 aa  140  6e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0836973  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4010  organic solvent tolerance protein  26.37 
 
 
938 aa  139  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2032  organic solvent tolerance protein  24.08 
 
 
778 aa  139  2e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00811  organic solvent tolerance protein  27.9 
 
 
781 aa  137  5e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0554  organic solvent tolerance protein, putative  27.36 
 
 
905 aa  137  9e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1454  Organic solvent tolerance protein  25.24 
 
 
836 aa  136  9.999999999999999e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591855  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1050  organic solvent tolerance protein  22.02 
 
 
790 aa  136  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3418  organic solvent tolerance protein  24.54 
 
 
735 aa  135  3e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000112563  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0391  Organic solvent tolerance protein  24.46 
 
 
813 aa  134  6e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.298665  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03411  organic solvent tolerance protein  32.45 
 
 
750 aa  134  6e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.473581  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1274  Organic solvent tolerance protein  23.89 
 
 
778 aa  134  6.999999999999999e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.436193  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0515  organic solvent tolerance transmembrane protein  22.66 
 
 
811 aa  133  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.877133  normal  0.048519 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001662  Imp required for envelope biogenesis/organic solvent tolerance protein precursor  27.01 
 
 
781 aa  133  1.0000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0406  Organic solvent tolerance protein  23.88 
 
 
813 aa  133  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4798  organic solvent tolerance protein  30.74 
 
 
934 aa  131  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427349  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0435  organic solvent tolerance protein  26.97 
 
 
932 aa  131  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00337227  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0739  organic solvent tolerance protein OstA precursor  25.05 
 
 
922 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2337  organic solvent tolerance transmembrane protein  22.32 
 
 
728 aa  129  3e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.503681  normal  0.440955 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0371  organic solvent tolerance protein  25.4 
 
 
784 aa  127  6e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0740  organic solvent tolerance protein, putative  26.46 
 
 
860 aa  127  6e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0521  organic solvent tolerance protein  21.68 
 
 
929 aa  125  2e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2816  organic solvent tolerance protein  22.74 
 
 
764 aa  125  3e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0189474  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2864  organic solvent tolerance protein  26.01 
 
 
787 aa  123  9.999999999999999e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000318031  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1054  organic solvent tolerance protein  24.93 
 
 
757 aa  121  3.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0233273  normal  0.775857 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0882  organic solvent tolerance protein  24.29 
 
 
773 aa  121  3.9999999999999996e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000270887  normal  0.785369 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1017  organic solvent tolerance protein  22.98 
 
 
773 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000878563  hitchhiker  0.00955351 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07770  organic solvent tolerance protein OstA precursor  24.14 
 
 
924 aa  117  5e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0241314 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3034  organic solvent tolerance protein, putative  25.57 
 
 
701 aa  116  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2643  Organic solvent tolerance protein  25.57 
 
 
727 aa  116  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.301946  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0992  organic solvent tolerance protein  25.19 
 
 
765 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0210027  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0497  organic solvent tolerance protein  21.15 
 
 
810 aa  115  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2885  organic solvent tolerance protein  24.09 
 
 
766 aa  115  3e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000379496  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3076  organic solvent tolerance protein  22.32 
 
 
766 aa  115  4.0000000000000004e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0865  organic solvent tolerance protein  21.32 
 
 
774 aa  114  5e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000634249  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1724  organic solvent tolerance protein  23.24 
 
 
738 aa  114  6e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3340  organic solvent tolerance protein  30.37 
 
 
743 aa  114  8.000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.491125 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3636  organic solvent tolerance protein  25.65 
 
 
765 aa  114  8.000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0908  organic solvent tolerance protein  25.56 
 
 
765 aa  114  8.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000625202  normal  0.177324 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3112  organic solvent tolerance protein  25.56 
 
 
765 aa  114  8.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000136701  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0601  organic solvent tolerance protein, putative  22.59 
 
 
1091 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3206  organic solvent tolerance protein  24.39 
 
 
765 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000004691  normal  0.810097 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46800  Organic solvent tolerance protein  30.13 
 
 
919 aa  112  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.532703  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0675  Organic solvent tolerance protein  22.5 
 
 
788 aa  112  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3510  organic solvent tolerance protein  26.56 
 
 
794 aa  112  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0437  Organic solvent tolerance protein  23.29 
 
 
680 aa  111  4.0000000000000004e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0967  organic solvent tolerance protein  24.41 
 
 
774 aa  110  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000267662  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2149  organic solvent tolerance protein  23.97 
 
 
803 aa  109  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.550449  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3482  organic solvent tolerance protein  22.67 
 
 
776 aa  109  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.151246 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04642  organic solvent tolerance protein  26.61 
 
 
813 aa  107  6e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0686354  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0727  organic solvent tolerance protein  23.86 
 
 
787 aa  107  7e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000065541  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0575  organic solvent tolerance protein, putative  21.98 
 
 
787 aa  106  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0917  organic solvent tolerance protein  26.21 
 
 
821 aa  107  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0436  organic solvent tolerance protein  21.33 
 
 
824 aa  107  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.524466 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0205  organic solvent tolerance protein  23.54 
 
 
781 aa  107  1e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.420377  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0208  organic solvent tolerance protein, putative  22.38 
 
 
787 aa  105  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.357539  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0871  organic solvent tolerance protein, putative  22.38 
 
 
787 aa  105  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0566  organic solvent tolerance protein  24.85 
 
 
807 aa  105  3e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0203405  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1049  organic solvent tolerance protein  24.2 
 
 
765 aa  105  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000815644  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2737  putative organic solvent tolerance protein  22.38 
 
 
787 aa  105  3e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2341  putative organic solvent tolerance protein  22.38 
 
 
787 aa  105  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.651905  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0692  organic solvent tolerance protein  22.38 
 
 
787 aa  105  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0706  organic solvent tolerance protein  22.38 
 
 
787 aa  105  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3309  Organic solvent tolerance protein  24.2 
 
 
765 aa  105  4e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000208036  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0058  Organic solvent tolerance protein  24.85 
 
 
671 aa  105  4e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2421  putative organic solvent tolerance protein  22.38 
 
 
761 aa  105  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.644424  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0160  organic solvent tolerance protein OstA-like  30.13 
 
 
832 aa  104  5e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0601393 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0396  organic solvent tolerance protein  22.14 
 
 
788 aa  104  6e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441976  normal  0.0999186 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1977  Organic solvent tolerance protein  24.78 
 
 
751 aa  103  9e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1574  Organic solvent tolerance protein  23.1 
 
 
841 aa  102  3e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0980  organic solvent tolerance protein  24.25 
 
 
765 aa  102  3e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000900172  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2763  organic solvent tolerance protein  21.45 
 
 
786 aa  100  7e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1082  organic solvent tolerance protein  22.7 
 
 
765 aa  100  9e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000021692  normal  0.94876 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0098  organic solvent tolerance protein  23.56 
 
 
799 aa  100  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4024  putative organic solvent tolerance protein  21.93 
 
 
789 aa  100  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.560503  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2629  organic solvent tolerance protein  21.45 
 
 
786 aa  100  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.355062  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6038  organic solvent tolerance protein  21.92 
 
 
786 aa  99.4  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0099  organic solvent tolerance protein  21.35 
 
 
786 aa  98.6  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0097442  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0102  organic solvent tolerance protein  21.35 
 
 
786 aa  98.6  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000015449  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3470  Organic solvent tolerance protein  25.37 
 
 
791 aa  98.2  4e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.917858  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0588  organic solvent tolerance protein  22.37 
 
 
786 aa  98.2  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.649611  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>