204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3340 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3340  organic solvent tolerance protein  100 
 
 		 743 aa  1518    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491125 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2311  organic solvent tolerance protein  32.17 
 
 		 842 aa  421  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2603  organic solvent tolerance protein  34.16 
 
 		 786 aa  414  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3829  putative organic solvent tolerance protein OstA (ImpA)  32.95 
 
 		 861 aa  412  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.216689  normal  0.0687208 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3473  Organic solvent tolerance protein  31.59 
 
 		 837 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0685  organic solvent tolerance, putative  32.87 
 
 		 792 aa  403  1e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1679  organic solvent tolerance protein  33.2 
 
 		 829 aa  403  1e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.495698 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0677  putative organic solvent tolerance  32.87 
 
 		 792 aa  402  9.999999999999999e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2968  organic solvent tolerance protein  30.9 
 
 		 833 aa  396  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.61435 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2342  organic solvent tolerance protein  31.96 
 
 		 831 aa  399  1e-109  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2478  organic solvent tolerance protein  31.01 
 
 		 833 aa  391  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2836  organic solvent tolerance protein  31.98 
 
 		 842 aa  388  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.324598  normal  0.142407 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1210  Organic solvent tolerance protein  30.91 
 
 		 776 aa  381  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.44229  hitchhiker  0.00000306995 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5838  Organic solvent tolerance protein  32.65 
 
 		 886 aa  377  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1759  organic solvent tolerance protein  32.04 
 
 		 786 aa  377  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.179124  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0411  organic solvent tolerance protein  32.69 
 
 		 748 aa  375  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.693712  normal  0.0669812 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1066  Organic solvent tolerance protein  31.15 
 
 		 780 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000331071 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5100  organic solvent tolerance protein  32.76 
 
 		 886 aa  370  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0299865 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1762  organic solvent tolerance protein  32.5 
 
 		 767 aa  366  1e-100  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.868226  normal  0.32659 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3941  Organic solvent tolerance protein  31.38 
 
 		 876 aa  363  4e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.911669 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3648  organic solvent tolerance protein  31.38 
 
 		 876 aa  363  5.0000000000000005e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.326034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3931  Organic solvent tolerance protein  31.07 
 
 		 862 aa  362  1e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.748868  normal  0.188644 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2626  organic solvent tolerance protein  33.29 
 
 		 746 aa  362  1e-98  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1541  organic solvent tolerance protein  32.05 
 
 		 777 aa  360  4e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0763  organic solvent tolerance protein  31.54 
 
 		 781 aa  354  2.9999999999999997e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.169469 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0434  organic solvent tolerance protein OstA-like  32.14 
 
 		 886 aa  353  5e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.435152  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0554  organic solvent tolerance protein  31 
 
 		 859 aa  348  1e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.952449  normal  0.0626467 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3044  Organic solvent tolerance protein  30.26 
 
 		 784 aa  336  7e-91  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.328846 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0506  organic solvent tolerance protein  28.83 
 
 		 791 aa  326  9e-88  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1224  organic solvent tolerance protein  30.75 
 
 		 724 aa  309  1.0000000000000001e-82  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0104539  normal  0.332289 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2223  Organic solvent tolerance protein  28.63 
 
 		 889 aa  298  2e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.653366 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2528  organic solvent tolerance protein  28.85 
 
 		 816 aa  297  5e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.150977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0889  organic solvent tolerance protein  30.04 
 
 		 756 aa  294  4e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.111396  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0652  organic solvent tolerance protein  27.73 
 
 		 892 aa  293  8e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0900  organic solvent tolerance protein  29.12 
 
 		 804 aa  266  8.999999999999999e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.403582 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1188  organic solvent tolerance protein  29.22 
 
 		 716 aa  265  3e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0274723  normal  0.555926 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1812  organic solvent tolerance protein, putative  27.91 
 
 		 715 aa  263  1e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0780027  normal  0.530576 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2902  putative organic solvent tolerance protein  28.11 
 
 		 714 aa  247  6.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1546  organic solvent tolerance protein  28.11 
 
 		 714 aa  247  6.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1119  organic solvent tolerance protein  28.49 
 
 		 712 aa  244  3e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.223918 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0947  organic solvent tolerance protein  27.67 
 
 		 731 aa  224  3e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0025554  normal  0.755835 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1724  organic solvent tolerance protein  26.35 
 
 		 738 aa  132  3e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3034  organic solvent tolerance protein, putative  35.1 
 
 		 701 aa  121  4.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2643  Organic solvent tolerance protein  35.1 
 
 		 727 aa  121  6e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.301946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2328  organic solvent tolerance protein  24.01 
 
 		 762 aa  119  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000704394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3911  organic solvent tolerance protein  25.83 
 
 		 863 aa  118  3.9999999999999997e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0098  organic solvent tolerance protein  24.74 
 
 		 799 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0601  organic solvent tolerance protein, putative  25.98 
 
 		 1091 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1235  Organic solvent tolerance protein  29.57 
 
 		 705 aa  113  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00811  organic solvent tolerance protein  23.65 
 
 		 781 aa  111  6e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0739  organic solvent tolerance protein OstA precursor  25.32 
 
 		 922 aa  110  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3418  organic solvent tolerance protein  23.04 
 
 		 735 aa  107  6e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000112563  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1454  Organic solvent tolerance protein  25.95 
 
 		 836 aa  107  8e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591855  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07770  organic solvent tolerance protein OstA precursor  24.39 
 
 		 924 aa  105  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0241314 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2337  organic solvent tolerance transmembrane protein  23.08 
 
 		 728 aa  103  8e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.503681  normal  0.440955 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3482  organic solvent tolerance protein  23.62 
 
 		 776 aa  103  8e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.151246 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2714  Organic solvent tolerance protein  27.1 
 
 		 753 aa  103  8e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3829  organic solvent tolerance protein  23.95 
 
 		 801 aa  103  9e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1274  Organic solvent tolerance protein  23.37 
 
 		 778 aa  103  1e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.436193  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1050  organic solvent tolerance protein  22.98 
 
 		 790 aa  103  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0865  organic solvent tolerance protein  26.3 
 
 		 774 aa  103  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000634249  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04642  organic solvent tolerance protein  28.44 
 
 		 813 aa  102  3e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0686354  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0898  Organic solvent tolerance protein  30.74 
 
 		 684 aa  101  5e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.33463e-30 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3632  organic solvent tolerance protein  24.18 
 
 		 799 aa  101  6e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000841674  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6038  organic solvent tolerance protein  22.64 
 
 		 786 aa  100  7e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4764  organic solvent tolerance protein  24.63 
 
 		 820 aa  100  7e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3470  Organic solvent tolerance protein  23.65 
 
 		 791 aa  100  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.917858  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2738  organic solvent tolerance protein  22.33 
 
 		 786 aa  99.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2099  organic solvent tolerance protein  22.33 
 
 		 786 aa  99.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2711  organic solvent tolerance protein  22.33 
 
 		 786 aa  99.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0727  organic solvent tolerance protein  24.25 
 
 		 787 aa  99.4  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000065541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2816  organic solvent tolerance protein  24.74 
 
 		 764 aa  99  3e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0189474  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4523  organic solvent tolerance protein  21.88 
 
 		 771 aa  98.2  4e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2629  organic solvent tolerance protein  23.45 
 
 		 786 aa  98.6  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.355062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0202  putative organic solvent tolerance transmembrane protein  29.43 
 
 		 819 aa  98.6  4e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.829458 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0671  organic solvent tolerance protein  22.32 
 
 		 826 aa  98.2  5e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0199  organic solvent tolerance protein  23.75 
 
 		 757 aa  97.8  7e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0836973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03411  organic solvent tolerance protein  23.81 
 
 		 750 aa  97.1  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.473581  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2763  organic solvent tolerance protein  23.06 
 
 		 786 aa  97.1  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1977  Organic solvent tolerance protein  24.66 
 
 		 751 aa  97.1  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3347  Organic solvent tolerance protein  30.68 
 
 		 684 aa  95.9  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2115  Organic solvent tolerance protein  24.34 
 
 		 808 aa  96.3  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0769  organic solvent tolerance protein  23.92 
 
 		 750 aa  96.3  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000043296  normal  0.038123 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1348  Organic solvent tolerance protein  27.92 
 
 		 781 aa  95.9  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0521  organic solvent tolerance protein  24.26 
 
 		 929 aa  95.9  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0967  organic solvent tolerance protein  24.75 
 
 		 774 aa  95.1  4e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000267662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3570  organic solvent tolerance protein  23.73 
 
 		 750 aa  94.7  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000108275  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3276  organic solvent tolerance protein  28.01 
 
 		 710 aa  94.4  7e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.112373  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4112  organic solvent tolerance protein  23.3 
 
 		 783 aa  94  8e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3441  organic solvent tolerance protein  23.73 
 
 		 780 aa  94.4  8e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000745954  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0739  organic solvent tolerance protein OstA  28.96 
 
 		 701 aa  94  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.71512e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2474  organic solvent tolerance protein, putative  30.38 
 
 		 697 aa  94  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0588  organic solvent tolerance protein  23.79 
 
 		 786 aa  92.4  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.649611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4863  organic solvent tolerance protein  23.61 
 
 		 822 aa  92.4  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.102386 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1082  organic solvent tolerance protein  24.49 
 
 		 765 aa  92.4  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000021692  normal  0.94876 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0992  organic solvent tolerance protein  25.49 
 
 		 765 aa  93.2  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0210027  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0406  Organic solvent tolerance protein  32.68 
 
 		 813 aa  92.4  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1049  organic solvent tolerance protein  24.95 
 
 		 765 aa  92.4  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000815644  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3309  Organic solvent tolerance protein  24.95 
 
 		 765 aa  92.4  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000208036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0980  organic solvent tolerance protein  24.49 
 
 		 765 aa  92  3e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000900172  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>