197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0889 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0889  organic solvent tolerance protein  100 
 
 		 756 aa  1534    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.111396  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1762  organic solvent tolerance protein  55.06 
 
 		 767 aa  835    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.868226  normal  0.32659 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0411  organic solvent tolerance protein  52.03 
 
 		 748 aa  761    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.693712  normal  0.0669812 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3340  organic solvent tolerance protein  29.81 
 
 		 743 aa  299  1e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491125 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3044  Organic solvent tolerance protein  25.55 
 
 		 784 aa  243  7e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.328846 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2603  organic solvent tolerance protein  25.96 
 
 		 786 aa  239  1e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0677  putative organic solvent tolerance  27.1 
 
 		 792 aa  232  2e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0685  organic solvent tolerance, putative  26.64 
 
 		 792 aa  230  6e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2836  organic solvent tolerance protein  27.03 
 
 		 842 aa  227  5.0000000000000005e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.324598  normal  0.142407 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5838  Organic solvent tolerance protein  27.01 
 
 		 886 aa  225  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2626  organic solvent tolerance protein  27.83 
 
 		 746 aa  226  2e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1541  organic solvent tolerance protein  26.98 
 
 		 777 aa  224  4.9999999999999996e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5100  organic solvent tolerance protein  26.53 
 
 		 886 aa  220  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0299865 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1759  organic solvent tolerance protein  26.32 
 
 		 786 aa  216  9.999999999999999e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.179124  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2968  organic solvent tolerance protein  25.13 
 
 		 833 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.61435 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2478  organic solvent tolerance protein  27.46 
 
 		 833 aa  215  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2311  organic solvent tolerance protein  25.36 
 
 		 842 aa  214  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3941  Organic solvent tolerance protein  26.32 
 
 		 876 aa  213  1e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.911669 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0434  organic solvent tolerance protein OstA-like  25 
 
 		 886 aa  213  1e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.435152  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3648  organic solvent tolerance protein  26.21 
 
 		 876 aa  212  2e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.326034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1679  organic solvent tolerance protein  26.1 
 
 		 829 aa  211  4e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.495698 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3829  putative organic solvent tolerance protein OstA (ImpA)  26.26 
 
 		 861 aa  209  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.216689  normal  0.0687208 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0763  organic solvent tolerance protein  27.88 
 
 		 781 aa  208  3e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.169469 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2342  organic solvent tolerance protein  26.58 
 
 		 831 aa  208  4e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3931  Organic solvent tolerance protein  26.19 
 
 		 862 aa  207  5e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.748868  normal  0.188644 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0554  organic solvent tolerance protein  26.02 
 
 		 859 aa  207  7e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.952449  normal  0.0626467 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3473  Organic solvent tolerance protein  24.84 
 
 		 837 aa  204  5e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1210  Organic solvent tolerance protein  25.36 
 
 		 776 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.44229  hitchhiker  0.00000306995 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0506  organic solvent tolerance protein  23.56 
 
 		 791 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1224  organic solvent tolerance protein  26.77 
 
 		 724 aa  196  2e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0104539  normal  0.332289 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1066  Organic solvent tolerance protein  25.7 
 
 		 780 aa  195  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000331071 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0652  organic solvent tolerance protein  24.3 
 
 		 892 aa  188  3e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2528  organic solvent tolerance protein  25.3 
 
 		 816 aa  182  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.150977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2223  Organic solvent tolerance protein  24.31 
 
 		 889 aa  174  5.999999999999999e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.653366 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2902  putative organic solvent tolerance protein  23.77 
 
 		 714 aa  169  1e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1546  organic solvent tolerance protein  23.77 
 
 		 714 aa  169  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1188  organic solvent tolerance protein  24.26 
 
 		 716 aa  169  2e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0274723  normal  0.555926 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0947  organic solvent tolerance protein  26.47 
 
 		 731 aa  167  5e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0025554  normal  0.755835 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0900  organic solvent tolerance protein  24.55 
 
 		 804 aa  162  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.403582 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1812  organic solvent tolerance protein, putative  24.8 
 
 		 715 aa  156  1e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0780027  normal  0.530576 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1119  organic solvent tolerance protein  23.44 
 
 		 712 aa  154  5.9999999999999996e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.223918 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4863  organic solvent tolerance protein  25.42 
 
 		 822 aa  114  8.000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.102386 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0202  putative organic solvent tolerance transmembrane protein  25.12 
 
 		 819 aa  103  9e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.829458 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0098  organic solvent tolerance protein  26.79 
 
 		 799 aa  101  6e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4764  organic solvent tolerance protein  24.96 
 
 		 820 aa  100  7e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1050  organic solvent tolerance protein  22.33 
 
 		 790 aa  98.6  4e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1274  Organic solvent tolerance protein  23.36 
 
 		 778 aa  96.7  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.436193  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6035  organic solvent tolerance protein  24.51 
 
 		 774 aa  95.5  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4076  organic solvent tolerance protein  25 
 
 		 814 aa  94.7  5e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.258262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0671  organic solvent tolerance protein  23.51 
 
 		 826 aa  90.1  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1977  Organic solvent tolerance protein  25.64 
 
 		 751 aa  88.6  4e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0436  organic solvent tolerance protein  23.12 
 
 		 824 aa  88.2  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.524466 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04642  organic solvent tolerance protein  29.34 
 
 		 813 aa  87.8  7e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0686354  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3470  Organic solvent tolerance protein  28.32 
 
 		 791 aa  86.7  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.917858  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0371  organic solvent tolerance protein  21.49 
 
 		 784 aa  87.4  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0406  Organic solvent tolerance protein  23.75 
 
 		 813 aa  86.7  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4812  organic solvent tolerance protein  23.99 
 
 		 856 aa  85.5  0.000000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.685199  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4112  organic solvent tolerance protein  29.52 
 
 		 783 aa  84.7  0.000000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1519  organic solvent tolerance protein  25.59 
 
 		 912 aa  84  0.00000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.136547 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1698  putative organic solvent tolerance protein  25.98 
 
 		 997 aa  83.6  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.999611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1724  organic solvent tolerance protein  25.66 
 
 		 738 aa  82.8  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0908  organic solvent tolerance protein  22.77 
 
 		 765 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000625202  normal  0.177324 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3112  organic solvent tolerance protein  22.77 
 
 		 765 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000136701  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4523  organic solvent tolerance protein  22.83 
 
 		 771 aa  81.6  0.00000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2816  organic solvent tolerance protein  22.88 
 
 		 764 aa  81.6  0.00000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0189474  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3076  organic solvent tolerance protein  22.07 
 
 		 766 aa  80.9  0.00000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3206  organic solvent tolerance protein  23.41 
 
 		 765 aa  80.9  0.00000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000004691  normal  0.810097 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5275  Organic solvent tolerance protein  29.47 
 
 		 860 aa  80.1  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2885  organic solvent tolerance protein  22.32 
 
 		 766 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000379496  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2337  organic solvent tolerance transmembrane protein  24.55 
 
 		 728 aa  79  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.503681  normal  0.440955 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3636  organic solvent tolerance protein  22.64 
 
 		 765 aa  78.6  0.0000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0675  Organic solvent tolerance protein  25.74 
 
 		 788 aa  78.6  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0588  organic solvent tolerance protein  26.77 
 
 		 786 aa  78.6  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.649611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0739  organic solvent tolerance protein OstA  25.86 
 
 		 701 aa  78.2  0.0000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.71512e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2864  organic solvent tolerance protein  26.58 
 
 		 787 aa  78.6  0.0000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000318031  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2099  organic solvent tolerance protein  26.71 
 
 		 786 aa  77.8  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2711  organic solvent tolerance protein  26.71 
 
 		 786 aa  77.8  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2738  organic solvent tolerance protein  26.71 
 
 		 786 aa  77.8  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1754  organic solvent tolerance protein  25.19 
 
 		 1131 aa  78.2  0.0000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0989736  hitchhiker  0.000198385 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1235  Organic solvent tolerance protein  25.19 
 
 		 705 aa  77  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1049  organic solvent tolerance protein  22.85 
 
 		 765 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000815644  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2763  organic solvent tolerance protein  27.51 
 
 		 786 aa  76.6  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2474  organic solvent tolerance protein, putative  20.86 
 
 		 697 aa  75.9  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1082  organic solvent tolerance protein  22.99 
 
 		 765 aa  75.9  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000021692  normal  0.94876 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2629  organic solvent tolerance protein  27.14 
 
 		 786 aa  75.9  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.355062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0865  organic solvent tolerance protein  20.9 
 
 		 774 aa  75.5  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000634249  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6038  organic solvent tolerance protein  26.22 
 
 		 786 aa  75.5  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2643  Organic solvent tolerance protein  25.94 
 
 		 727 aa  75.5  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.301946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1054  organic solvent tolerance protein  26.42 
 
 		 757 aa  75.1  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0233273  normal  0.775857 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0980  organic solvent tolerance protein  23.26 
 
 		 765 aa  75.1  0.000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000900172  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3034  organic solvent tolerance protein, putative  25.76 
 
 		 701 aa  75.1  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4624  organic solvent tolerance protein  22.16 
 
 		 926 aa  74.7  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.47424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4024  putative organic solvent tolerance protein  25.08 
 
 		 789 aa  74.7  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.560503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0199  organic solvent tolerance protein  23.32 
 
 		 757 aa  75.1  0.000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0836973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3309  Organic solvent tolerance protein  22.66 
 
 		 765 aa  75.1  0.000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000208036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4010  organic solvent tolerance protein  24.23 
 
 		 938 aa  75.1  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0350  hypothetical protein  23.03 
 
 		 839 aa  73.9  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0992  organic solvent tolerance protein  22.06 
 
 		 765 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0210027  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46800  Organic solvent tolerance protein  24.28 
 
 		 919 aa  72.8  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.532703  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0898  Organic solvent tolerance protein  22.45 
 
 		 684 aa  73.2  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.33463e-30 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>