203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2836 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_1679  organic solvent tolerance protein  48.49 
 
 
829 aa  738    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.495698 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2478  organic solvent tolerance protein  48.71 
 
 
833 aa  758    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2311  organic solvent tolerance protein  48.84 
 
 
842 aa  764    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2968  organic solvent tolerance protein  47.81 
 
 
833 aa  748    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.61435 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2342  organic solvent tolerance protein  49.87 
 
 
831 aa  759    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2836  organic solvent tolerance protein  100 
 
 
842 aa  1722    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.324598  normal  0.142407 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3473  Organic solvent tolerance protein  48.91 
 
 
837 aa  759    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5838  Organic solvent tolerance protein  43.12 
 
 
886 aa  635    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5100  organic solvent tolerance protein  44.01 
 
 
886 aa  642    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0299865 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3829  putative organic solvent tolerance protein OstA (ImpA)  48.85 
 
 
861 aa  756    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.216689  normal  0.0687208 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3941  Organic solvent tolerance protein  39.53 
 
 
876 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.911669 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3931  Organic solvent tolerance protein  40.48 
 
 
862 aa  605  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.748868  normal  0.188644 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3648  organic solvent tolerance protein  39.64 
 
 
876 aa  604  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.326034  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0554  organic solvent tolerance protein  41.5 
 
 
859 aa  600  1e-170  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.952449  normal  0.0626467 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2223  Organic solvent tolerance protein  40.25 
 
 
889 aa  569  1e-161  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.653366 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0652  organic solvent tolerance protein  39.5 
 
 
892 aa  571  1e-161  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2603  organic solvent tolerance protein  37.13 
 
 
786 aa  533  1e-150  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0685  organic solvent tolerance, putative  36.34 
 
 
792 aa  518  1.0000000000000001e-145  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0677  putative organic solvent tolerance  35.98 
 
 
792 aa  515  1e-144  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0506  organic solvent tolerance protein  36.05 
 
 
791 aa  488  1e-136  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1066  Organic solvent tolerance protein  35.42 
 
 
780 aa  484  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000331071 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1210  Organic solvent tolerance protein  35.1 
 
 
776 aa  485  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.44229  hitchhiker  0.00000306995 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0763  organic solvent tolerance protein  35.64 
 
 
781 aa  479  1e-134  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.169469 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1759  organic solvent tolerance protein  35.54 
 
 
786 aa  474  1e-132  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.179124  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1541  organic solvent tolerance protein  36.13 
 
 
777 aa  470  1.0000000000000001e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3340  organic solvent tolerance protein  31.98 
 
 
743 aa  388  1e-106  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.491125 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1762  organic solvent tolerance protein  27.57 
 
 
767 aa  289  1e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.868226  normal  0.32659 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0411  organic solvent tolerance protein  28.52 
 
 
748 aa  279  2e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.693712  normal  0.0669812 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0434  organic solvent tolerance protein OstA-like  27.93 
 
 
886 aa  251  3e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.435152  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3044  Organic solvent tolerance protein  25.6 
 
 
784 aa  243  1e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.328846 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1188  organic solvent tolerance protein  27.93 
 
 
716 aa  240  1e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0274723  normal  0.555926 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2902  putative organic solvent tolerance protein  27.79 
 
 
714 aa  236  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1546  organic solvent tolerance protein  27.79 
 
 
714 aa  236  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2528  organic solvent tolerance protein  26.57 
 
 
816 aa  234  4.0000000000000004e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.150977  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1119  organic solvent tolerance protein  26.49 
 
 
712 aa  231  4e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.223918 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0889  organic solvent tolerance protein  26.84 
 
 
756 aa  227  5.0000000000000005e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.111396  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0947  organic solvent tolerance protein  26.58 
 
 
731 aa  208  4e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0025554  normal  0.755835 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2626  organic solvent tolerance protein  31.01 
 
 
746 aa  206  1e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1812  organic solvent tolerance protein, putative  25.93 
 
 
715 aa  188  3e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0780027  normal  0.530576 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1224  organic solvent tolerance protein  24.47 
 
 
724 aa  187  9e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0104539  normal  0.332289 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0900  organic solvent tolerance protein  27.68 
 
 
804 aa  141  4.999999999999999e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.403582 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0769  organic solvent tolerance protein  25 
 
 
750 aa  132  2.0000000000000002e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000043296  normal  0.038123 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3441  organic solvent tolerance protein  25 
 
 
780 aa  133  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000745954  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3570  organic solvent tolerance protein  25 
 
 
750 aa  133  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000108275  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0727  organic solvent tolerance protein  25.52 
 
 
787 aa  131  4.0000000000000003e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000065541  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0739  organic solvent tolerance protein OstA precursor  26.42 
 
 
922 aa  128  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07770  organic solvent tolerance protein OstA precursor  25.34 
 
 
924 aa  122  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0241314 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0566  organic solvent tolerance protein  24.84 
 
 
807 aa  119  3e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0203405  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4863  organic solvent tolerance protein  24.94 
 
 
822 aa  117  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.102386 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0058  organic solvent tolerance protein  24.22 
 
 
785 aa  116  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000119427  normal  0.365449 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0554  organic solvent tolerance protein, putative  23.32 
 
 
905 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4624  organic solvent tolerance protein  25.35 
 
 
926 aa  110  9.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.47424  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4076  organic solvent tolerance protein  26.82 
 
 
814 aa  109  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.258262  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0521  organic solvent tolerance protein  23.51 
 
 
929 aa  108  3e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00811  organic solvent tolerance protein  24.67 
 
 
781 aa  108  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4010  organic solvent tolerance protein  30.99 
 
 
938 aa  107  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2816  organic solvent tolerance protein  24.59 
 
 
764 aa  106  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0189474  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001662  Imp required for envelope biogenesis/organic solvent tolerance protein precursor  24.57 
 
 
781 aa  105  5e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04642  organic solvent tolerance protein  24.33 
 
 
813 aa  104  9e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0686354  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4812  organic solvent tolerance protein  29.87 
 
 
856 aa  103  9e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.685199  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4798  organic solvent tolerance protein  26.85 
 
 
934 aa  103  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427349  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2714  Organic solvent tolerance protein  29.9 
 
 
753 aa  103  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1977  Organic solvent tolerance protein  24.42 
 
 
751 aa  102  4e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0865  organic solvent tolerance protein  31.71 
 
 
774 aa  102  4e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000634249  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5132  organic solvent tolerance protein  23.01 
 
 
937 aa  101  5e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.563491  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0435  organic solvent tolerance protein  26.3 
 
 
932 aa  101  5e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00337227  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4024  putative organic solvent tolerance protein  30 
 
 
789 aa  101  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.560503  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3911  organic solvent tolerance protein  28.12 
 
 
863 aa  100  9e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2885  organic solvent tolerance protein  26.74 
 
 
766 aa  100  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000379496  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0438  organic solvent tolerance protein  29.02 
 
 
935 aa  100  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.373211  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3076  organic solvent tolerance protein  24.73 
 
 
766 aa  99.8  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3470  Organic solvent tolerance protein  25.61 
 
 
791 aa  99  3e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.917858  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0202  putative organic solvent tolerance transmembrane protein  28.87 
 
 
819 aa  99  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.829458 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4112  organic solvent tolerance protein  25.61 
 
 
783 aa  97.1  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0396  organic solvent tolerance protein  31.34 
 
 
788 aa  96.3  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441976  normal  0.0999186 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2328  organic solvent tolerance protein  28.24 
 
 
762 aa  96.3  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000704394  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5275  Organic solvent tolerance protein  30.14 
 
 
860 aa  95.9  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0098  organic solvent tolerance protein  32.2 
 
 
799 aa  95.9  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3829  organic solvent tolerance protein  26.74 
 
 
801 aa  94.4  7e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0882  organic solvent tolerance protein  24.73 
 
 
773 aa  94.4  8e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000270887  normal  0.785369 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0605  organic solvent tolerance protein  31.55 
 
 
799 aa  94  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0272025  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3632  organic solvent tolerance protein  25.78 
 
 
799 aa  93.6  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000841674  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0391  Organic solvent tolerance protein  26.5 
 
 
813 aa  93.6  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.298665  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0675  Organic solvent tolerance protein  29.95 
 
 
788 aa  94  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0497  organic solvent tolerance protein  26.81 
 
 
810 aa  92.8  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0967  organic solvent tolerance protein  29.96 
 
 
774 aa  93.2  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000267662  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1724  organic solvent tolerance protein  26.77 
 
 
738 aa  92.8  3e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6038  organic solvent tolerance protein  27.98 
 
 
786 aa  92.4  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0992  organic solvent tolerance protein  22.83 
 
 
765 aa  92.4  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0210027  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0671  organic solvent tolerance protein  26.48 
 
 
826 aa  92  4e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0406  Organic solvent tolerance protein  26.45 
 
 
813 aa  92  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0199  organic solvent tolerance protein  26.28 
 
 
757 aa  91.7  5e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0836973  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4764  organic solvent tolerance protein  24.41 
 
 
820 aa  91.7  6e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3276  organic solvent tolerance protein  26.38 
 
 
710 aa  91.7  6e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.112373  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2643  Organic solvent tolerance protein  29.33 
 
 
727 aa  91.3  7e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.301946  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3034  organic solvent tolerance protein, putative  29.33 
 
 
701 aa  91.3  7e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0436  organic solvent tolerance protein  26.9 
 
 
824 aa  90.5  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.524466 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2099  organic solvent tolerance protein  27.52 
 
 
786 aa  89.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2711  organic solvent tolerance protein  27.52 
 
 
786 aa  89.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1936  organic solvent tolerance protein  25.25 
 
 
792 aa  89.7  2e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>