196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5100 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3648  organic solvent tolerance protein  67.94 
 
 		 876 aa  1235    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.326034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3931  Organic solvent tolerance protein  68.19 
 
 		 862 aa  1228    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.748868  normal  0.188644 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5100  organic solvent tolerance protein  100 
 
 		 886 aa  1806    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0299865 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0652  organic solvent tolerance protein  41.45 
 
 		 892 aa  677    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2223  Organic solvent tolerance protein  41.97 
 
 		 889 aa  645    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.653366 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0554  organic solvent tolerance protein  66.47 
 
 		 859 aa  1191    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.952449  normal  0.0626467 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2836  organic solvent tolerance protein  43.92 
 
 		 842 aa  644    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.324598  normal  0.142407 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3941  Organic solvent tolerance protein  68.17 
 
 		 876 aa  1238    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.911669 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5838  Organic solvent tolerance protein  88.09 
 
 		 886 aa  1591    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2342  organic solvent tolerance protein  42.43 
 
 		 831 aa  615  1e-175  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1679  organic solvent tolerance protein  41.27 
 
 		 829 aa  614  9.999999999999999e-175  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.495698 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2311  organic solvent tolerance protein  41.7 
 
 		 842 aa  614  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2968  organic solvent tolerance protein  40.51 
 
 		 833 aa  612  1e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.61435 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3473  Organic solvent tolerance protein  40.61 
 
 		 837 aa  606  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2478  organic solvent tolerance protein  39.95 
 
 		 833 aa  597  1e-169  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3829  putative organic solvent tolerance protein OstA (ImpA)  40.21 
 
 		 861 aa  594  1e-168  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.216689  normal  0.0687208 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2603  organic solvent tolerance protein  36.55 
 
 		 786 aa  485  1e-135  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0685  organic solvent tolerance, putative  36.34 
 
 		 792 aa  475  1e-132  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0677  putative organic solvent tolerance  36 
 
 		 792 aa  468  9.999999999999999e-131  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1759  organic solvent tolerance protein  35.69 
 
 		 786 aa  462  9.999999999999999e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.179124  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1210  Organic solvent tolerance protein  34.43 
 
 		 776 aa  446  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.44229  hitchhiker  0.00000306995 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1541  organic solvent tolerance protein  33.33 
 
 		 777 aa  442  9.999999999999999e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1066  Organic solvent tolerance protein  34.49 
 
 		 780 aa  436  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000331071 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0763  organic solvent tolerance protein  35.56 
 
 		 781 aa  424  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.169469 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0506  organic solvent tolerance protein  32.91 
 
 		 791 aa  413  1e-114  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3340  organic solvent tolerance protein  32.67 
 
 		 743 aa  374  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491125 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1762  organic solvent tolerance protein  28.01 
 
 		 767 aa  268  2.9999999999999995e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.868226  normal  0.32659 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0411  organic solvent tolerance protein  27.6 
 
 		 748 aa  261  4e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.693712  normal  0.0669812 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3044  Organic solvent tolerance protein  26.91 
 
 		 784 aa  253  1e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.328846 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2528  organic solvent tolerance protein  25.63 
 
 		 816 aa  227  7e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.150977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0889  organic solvent tolerance protein  26.53 
 
 		 756 aa  220  1e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.111396  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0434  organic solvent tolerance protein OstA-like  28.17 
 
 		 886 aa  216  1.9999999999999998e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.435152  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2626  organic solvent tolerance protein  25.36 
 
 		 746 aa  209  2e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1188  organic solvent tolerance protein  28.3 
 
 		 716 aa  207  9e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0274723  normal  0.555926 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1812  organic solvent tolerance protein, putative  27.06 
 
 		 715 aa  174  5e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0780027  normal  0.530576 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0947  organic solvent tolerance protein  26.77 
 
 		 731 aa  172  3e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0025554  normal  0.755835 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0900  organic solvent tolerance protein  23.19 
 
 		 804 aa  158  4e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.403582 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1224  organic solvent tolerance protein  24.65 
 
 		 724 aa  153  1e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0104539  normal  0.332289 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2902  putative organic solvent tolerance protein  31.37 
 
 		 714 aa  144  5e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1546  organic solvent tolerance protein  31.37 
 
 		 714 aa  144  5e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1119  organic solvent tolerance protein  30.86 
 
 		 712 aa  127  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.223918 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3470  Organic solvent tolerance protein  28.07 
 
 		 791 aa  108  6e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.917858  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0396  organic solvent tolerance protein  29.01 
 
 		 788 aa  106  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441976  normal  0.0999186 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04642  organic solvent tolerance protein  28.29 
 
 		 813 aa  106  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0686354  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4112  organic solvent tolerance protein  30.29 
 
 		 783 aa  105  4e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4764  organic solvent tolerance protein  30.38 
 
 		 820 aa  102  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4010  organic solvent tolerance protein  30.64 
 
 		 938 aa  102  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5132  organic solvent tolerance protein  28.29 
 
 		 937 aa  100  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.563491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0675  Organic solvent tolerance protein  29.18 
 
 		 788 aa  99.8  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0671  organic solvent tolerance protein  27.68 
 
 		 826 aa  99  4e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0865  organic solvent tolerance protein  29.3 
 
 		 774 aa  98.2  6e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000634249  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2328  organic solvent tolerance protein  29.93 
 
 		 762 aa  97.1  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000704394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0098  organic solvent tolerance protein  24.19 
 
 		 799 aa  95.5  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2714  Organic solvent tolerance protein  31.46 
 
 		 753 aa  95.1  5e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4798  organic solvent tolerance protein  28.38 
 
 		 934 aa  95.1  5e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2816  organic solvent tolerance protein  30.71 
 
 		 764 aa  95.1  5e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0189474  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4812  organic solvent tolerance protein  25 
 
 		 856 aa  94.7  6e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.685199  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1936  organic solvent tolerance protein  27.05 
 
 		 792 aa  94.4  8e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46800  Organic solvent tolerance protein  31.44 
 
 		 919 aa  94.4  9e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.532703  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0435  organic solvent tolerance protein  28.38 
 
 		 932 aa  94.4  9e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00337227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6038  organic solvent tolerance protein  28.84 
 
 		 786 aa  93.6  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4024  putative organic solvent tolerance protein  28.27 
 
 		 789 aa  94  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.560503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0438  organic solvent tolerance protein  28.38 
 
 		 935 aa  93.6  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.373211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4863  organic solvent tolerance protein  26.27 
 
 		 822 aa  93.6  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.102386 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2012  organic solvent tolerance protein  27.05 
 
 		 792 aa  92.8  2e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3076  organic solvent tolerance protein  27.76 
 
 		 766 aa  93.6  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0739  organic solvent tolerance protein OstA precursor  29.26 
 
 		 922 aa  92.8  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0740  organic solvent tolerance protein, putative  26.64 
 
 		 860 aa  91.7  5e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00811  organic solvent tolerance protein  26.09 
 
 		 781 aa  91.7  6e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07770  organic solvent tolerance protein OstA precursor  28.82 
 
 		 924 aa  91.3  7e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0241314 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2738  organic solvent tolerance protein  28.37 
 
 		 786 aa  91.3  8e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2099  organic solvent tolerance protein  28.37 
 
 		 786 aa  91.3  8e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2711  organic solvent tolerance protein  28.37 
 
 		 786 aa  91.3  8e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0588  organic solvent tolerance protein  27.08 
 
 		 786 aa  91.3  8e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.649611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0967  organic solvent tolerance protein  28.91 
 
 		 774 aa  90.5  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000267662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2643  Organic solvent tolerance protein  28.24 
 
 		 727 aa  90.1  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.301946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4624  organic solvent tolerance protein  27.71 
 
 		 926 aa  90.1  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.47424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3829  organic solvent tolerance protein  25.42 
 
 		 801 aa  89.7  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3034  organic solvent tolerance protein, putative  28.24 
 
 		 701 aa  90.1  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0992  organic solvent tolerance protein  23.01 
 
 		 765 aa  89.4  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0210027  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0554  organic solvent tolerance protein, putative  27.71 
 
 		 905 aa  89  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6035  organic solvent tolerance protein  24.92 
 
 		 774 aa  89  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2763  organic solvent tolerance protein  28.37 
 
 		 786 aa  89  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2629  organic solvent tolerance protein  28.37 
 
 		 786 aa  89  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.355062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2885  organic solvent tolerance protein  27.23 
 
 		 766 aa  88.2  6e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000379496  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0882  organic solvent tolerance protein  27.8 
 
 		 773 aa  87.8  7e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000270887  normal  0.785369 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5275  Organic solvent tolerance protein  31.11 
 
 		 860 aa  87.4  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0908  organic solvent tolerance protein  25.35 
 
 		 765 aa  87  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000625202  normal  0.177324 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3112  organic solvent tolerance protein  25.35 
 
 		 765 aa  87  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000136701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3911  organic solvent tolerance protein  31.84 
 
 		 863 aa  87  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0605  organic solvent tolerance protein  27.7 
 
 		 799 aa  87  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0272025  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4076  organic solvent tolerance protein  23.82 
 
 		 814 aa  85.9  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.258262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3276  organic solvent tolerance protein  28.91 
 
 		 710 aa  86.3  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.112373  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0208  organic solvent tolerance protein, putative  27.17 
 
 		 787 aa  85.5  0.000000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.357539  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2115  Organic solvent tolerance protein  29.28 
 
 		 808 aa  85.5  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2737  putative organic solvent tolerance protein  27.17 
 
 		 787 aa  85.5  0.000000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2341  putative organic solvent tolerance protein  27.17 
 
 		 787 aa  85.5  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.651905  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0692  organic solvent tolerance protein  27.17 
 
 		 787 aa  85.5  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0706  organic solvent tolerance protein  27.17 
 
 		 787 aa  85.5  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2421  putative organic solvent tolerance protein  27.17 
 
 		 761 aa  85.5  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.644424  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>