202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2115 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2629  organic solvent tolerance protein  55.01 
 
 		 786 aa  891    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.355062  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0208  organic solvent tolerance protein, putative  53.16 
 
 		 787 aa  865    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.357539  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0871  organic solvent tolerance protein, putative  53.16 
 
 		 787 aa  865    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6038  organic solvent tolerance protein  54.49 
 
 		 786 aa  887    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0575  organic solvent tolerance protein, putative  52.98 
 
 		 787 aa  859    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0588  organic solvent tolerance protein  55.14 
 
 		 786 aa  892    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.649611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0675  Organic solvent tolerance protein  55.58 
 
 		 788 aa  924    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4024  putative organic solvent tolerance protein  55.64 
 
 		 789 aa  919    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.560503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0396  organic solvent tolerance protein  56.65 
 
 		 788 aa  941    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441976  normal  0.0999186 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2099  organic solvent tolerance protein  55.01 
 
 		 786 aa  891    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2763  organic solvent tolerance protein  54.88 
 
 		 786 aa  887    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2711  organic solvent tolerance protein  55.01 
 
 		 786 aa  891    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2737  putative organic solvent tolerance protein  53.16 
 
 		 787 aa  865    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2341  putative organic solvent tolerance protein  53.16 
 
 		 787 aa  865    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.651905  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0692  organic solvent tolerance protein  53.16 
 
 		 787 aa  865    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0706  organic solvent tolerance protein  53.16 
 
 		 787 aa  865    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2421  putative organic solvent tolerance protein  54.27 
 
 		 761 aa  860    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.644424  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2738  organic solvent tolerance protein  55.01 
 
 		 786 aa  891    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3482  organic solvent tolerance protein  66.32 
 
 		 776 aa  1083    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.151246 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2115  Organic solvent tolerance protein  100 
 
 		 808 aa  1656    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0515  organic solvent tolerance transmembrane protein  43.56 
 
 		 811 aa  591  1e-167  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.877133  normal  0.048519 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0406  Organic solvent tolerance protein  41.74 
 
 		 813 aa  587  1e-166  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0497  organic solvent tolerance protein  40.55 
 
 		 810 aa  585  1.0000000000000001e-165  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0391  Organic solvent tolerance protein  41.74 
 
 		 813 aa  585  1.0000000000000001e-165  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.298665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0436  organic solvent tolerance protein  38.04 
 
 		 824 aa  536  1e-151  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.524466 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4863  organic solvent tolerance protein  34.75 
 
 		 822 aa  443  1e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.102386 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4076  organic solvent tolerance protein  35.12 
 
 		 814 aa  436  1e-121  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.258262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0098  organic solvent tolerance protein  34.72 
 
 		 799 aa  432  1e-120  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3470  Organic solvent tolerance protein  34.45 
 
 		 791 aa  420  1e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.917858  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5275  Organic solvent tolerance protein  32.86 
 
 		 860 aa  414  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2337  organic solvent tolerance transmembrane protein  34.32 
 
 		 728 aa  413  1e-114  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.503681  normal  0.440955 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4112  organic solvent tolerance protein  34.46 
 
 		 783 aa  414  1e-114  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1454  Organic solvent tolerance protein  33.88 
 
 		 836 aa  403  1e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591855  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4764  organic solvent tolerance protein  32.47 
 
 		 820 aa  403  1e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3659  organic solvent tolerance protein  33.85 
 
 		 849 aa  398  1e-109  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.880911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6035  organic solvent tolerance protein  33.2 
 
 		 774 aa  393  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4812  organic solvent tolerance protein  34.44 
 
 		 856 aa  394  1e-108  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.685199  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1574  Organic solvent tolerance protein  31.02 
 
 		 841 aa  387  1e-106  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0521  organic solvent tolerance protein  32.32 
 
 		 929 aa  384  1e-105  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1870  organic solvent tolerance protein  31.43 
 
 		 816 aa  374  1e-102  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0202  putative organic solvent tolerance transmembrane protein  31.76 
 
 		 819 aa  371  1e-101  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.829458 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3911  organic solvent tolerance protein  31.85 
 
 		 863 aa  349  1e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2714  Organic solvent tolerance protein  32.28 
 
 		 753 aa  333  6e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2149  organic solvent tolerance protein  28.01 
 
 		 803 aa  320  5e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.550449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1977  Organic solvent tolerance protein  28.69 
 
 		 751 aa  309  1.0000000000000001e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0375  hypothetical protein  29.23 
 
 		 839 aa  309  1.0000000000000001e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0350  hypothetical protein  29.1 
 
 		 839 aa  307  4.0000000000000004e-82  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0199  organic solvent tolerance protein  32.52 
 
 		 757 aa  304  4.0000000000000003e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0836973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1274  Organic solvent tolerance protein  30.61 
 
 		 778 aa  297  5e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.436193  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1724  organic solvent tolerance protein  30 
 
 		 738 aa  290  6e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0438  organic solvent tolerance protein  28.09 
 
 		 935 aa  287  7e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.373211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0671  organic solvent tolerance protein  29.26 
 
 		 826 aa  285  2.0000000000000002e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4624  organic solvent tolerance protein  29.01 
 
 		 926 aa  285  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.47424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4798  organic solvent tolerance protein  28.38 
 
 		 934 aa  285  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0435  organic solvent tolerance protein  28.89 
 
 		 932 aa  282  1e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00337227  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0601  organic solvent tolerance protein, putative  29.08 
 
 		 1091 aa  280  5e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0554  organic solvent tolerance protein, putative  28.52 
 
 		 905 aa  280  6e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1936  organic solvent tolerance protein  27.24 
 
 		 792 aa  278  3e-73  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04642  organic solvent tolerance protein  28.28 
 
 		 813 aa  276  9e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0686354  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2012  organic solvent tolerance protein  27.37 
 
 		 792 aa  275  2.0000000000000002e-72  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0739  organic solvent tolerance protein OstA precursor  27.89 
 
 		 922 aa  270  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07770  organic solvent tolerance protein OstA precursor  28.61 
 
 		 924 aa  269  2e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0241314 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4010  organic solvent tolerance protein  26.53 
 
 		 938 aa  259  1e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5132  organic solvent tolerance protein  27.12 
 
 		 937 aa  257  5e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.563491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2643  Organic solvent tolerance protein  28.17 
 
 		 727 aa  254  3e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.301946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3034  organic solvent tolerance protein, putative  28.17 
 
 		 701 aa  254  6e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1020  organic solvent tolerance protein  27.96 
 
 		 794 aa  251  3e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0967  organic solvent tolerance protein  27.37 
 
 		 774 aa  249  2e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000267662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2076  organic solvent tolerance protein  27.79 
 
 		 870 aa  248  4e-64  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0583626  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0106  organic solvent tolerance protein  27.79 
 
 		 870 aa  247  4.9999999999999997e-64  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.307862  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0605  organic solvent tolerance protein  27.51 
 
 		 799 aa  246  9.999999999999999e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0272025  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46800  Organic solvent tolerance protein  26.31 
 
 		 919 aa  243  1e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.532703  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0882  organic solvent tolerance protein  26.64 
 
 		 773 aa  239  1e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000270887  normal  0.785369 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3829  organic solvent tolerance protein  27.12 
 
 		 801 aa  238  3e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2816  organic solvent tolerance protein  26.15 
 
 		 764 aa  235  3e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0189474  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3632  organic solvent tolerance protein  26.81 
 
 		 799 aa  235  3e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000841674  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4523  organic solvent tolerance protein  24.26 
 
 		 771 aa  234  6e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3441  organic solvent tolerance protein  27.69 
 
 		 780 aa  233  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000745954  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0908  organic solvent tolerance protein  25.93 
 
 		 765 aa  232  2e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000625202  normal  0.177324 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3112  organic solvent tolerance protein  25.93 
 
 		 765 aa  232  2e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000136701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3570  organic solvent tolerance protein  27.69 
 
 		 750 aa  232  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000108275  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0769  organic solvent tolerance protein  27.54 
 
 		 750 aa  231  3e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000043296  normal  0.038123 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3206  organic solvent tolerance protein  26.37 
 
 		 765 aa  231  5e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000004691  normal  0.810097 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0865  organic solvent tolerance protein  25.75 
 
 		 774 aa  230  7e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000634249  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3309  Organic solvent tolerance protein  26.38 
 
 		 765 aa  229  1e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000208036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0727  organic solvent tolerance protein  28.32 
 
 		 787 aa  229  2e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000065541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1017  organic solvent tolerance protein  26.42 
 
 		 773 aa  229  2e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000878563  hitchhiker  0.00955351 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1049  organic solvent tolerance protein  26.38 
 
 		 765 aa  229  2e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000815644  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0992  organic solvent tolerance protein  25.33 
 
 		 765 aa  229  2e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0210027  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1082  organic solvent tolerance protein  26.65 
 
 		 765 aa  228  3e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000021692  normal  0.94876 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3418  organic solvent tolerance protein  27.3 
 
 		 735 aa  228  3e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000112563  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3076  organic solvent tolerance protein  26.2 
 
 		 766 aa  228  3e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1050  organic solvent tolerance protein  24.74 
 
 		 790 aa  228  4e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1698  putative organic solvent tolerance protein  28.5 
 
 		 997 aa  226  1e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.999611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0980  organic solvent tolerance protein  26.49 
 
 		 765 aa  226  1e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000900172  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1654  organic solvent tolerance protein  27.03 
 
 		 791 aa  225  2e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1519  organic solvent tolerance protein  28.06 
 
 		 912 aa  224  4e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.136547 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0740  organic solvent tolerance protein, putative  26.22 
 
 		 860 aa  221  3e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0566  organic solvent tolerance protein  25.73 
 
 		 807 aa  219  1e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0203405  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0603  organic solvent tolerance protein  27.13 
 
 		 781 aa  219  1e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000490445  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>