193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1020 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_1020  organic solvent tolerance protein  100 
 
 
794 aa  1585    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0199  organic solvent tolerance protein  44.16 
 
 
757 aa  579  1e-164  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0836973  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2714  Organic solvent tolerance protein  37.33 
 
 
753 aa  394  1e-108  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1977  Organic solvent tolerance protein  35.56 
 
 
751 aa  390  1e-107  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0671  organic solvent tolerance protein  31.84 
 
 
826 aa  355  1e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1724  organic solvent tolerance protein  33.77 
 
 
738 aa  351  2e-95  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04642  organic solvent tolerance protein  31.84 
 
 
813 aa  352  2e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0686354  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0438  organic solvent tolerance protein  30.22 
 
 
935 aa  351  3e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.373211  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0601  organic solvent tolerance protein, putative  31.04 
 
 
1091 aa  347  6e-94  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0435  organic solvent tolerance protein  29.46 
 
 
932 aa  343  1e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00337227  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0739  organic solvent tolerance protein OstA precursor  29.82 
 
 
922 aa  336  1e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0521  organic solvent tolerance protein  30.65 
 
 
929 aa  335  2e-90  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4624  organic solvent tolerance protein  30.49 
 
 
926 aa  334  3e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.47424  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1454  Organic solvent tolerance protein  33.33 
 
 
836 aa  332  2e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591855  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07770  organic solvent tolerance protein OstA precursor  29.43 
 
 
924 aa  332  2e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0241314 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4798  organic solvent tolerance protein  28.71 
 
 
934 aa  332  2e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427349  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46800  Organic solvent tolerance protein  30.48 
 
 
919 aa  331  4e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.532703  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0554  organic solvent tolerance protein, putative  29.27 
 
 
905 aa  330  9e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2337  organic solvent tolerance transmembrane protein  31.96 
 
 
728 aa  329  2.0000000000000001e-88  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.503681  normal  0.440955 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0391  Organic solvent tolerance protein  30.24 
 
 
813 aa  327  4.0000000000000003e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.298665  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5132  organic solvent tolerance protein  29.35 
 
 
937 aa  327  6e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.563491  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4010  organic solvent tolerance protein  30.23 
 
 
938 aa  327  7e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0497  organic solvent tolerance protein  29.5 
 
 
810 aa  326  8.000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0406  Organic solvent tolerance protein  30.11 
 
 
813 aa  326  1e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1936  organic solvent tolerance protein  30.67 
 
 
792 aa  323  7e-87  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0515  organic solvent tolerance transmembrane protein  29.16 
 
 
811 aa  322  9.999999999999999e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.877133  normal  0.048519 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2012  organic solvent tolerance protein  30.4 
 
 
792 aa  319  1e-85  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3470  Organic solvent tolerance protein  32.69 
 
 
791 aa  318  4e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.917858  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4112  organic solvent tolerance protein  32.69 
 
 
783 aa  316  9.999999999999999e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4024  putative organic solvent tolerance protein  30.08 
 
 
789 aa  312  2e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.560503  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0375  hypothetical protein  30.28 
 
 
839 aa  311  2.9999999999999997e-83  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0675  Organic solvent tolerance protein  28.7 
 
 
788 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3659  organic solvent tolerance protein  33.75 
 
 
849 aa  310  5.9999999999999995e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.880911  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2099  organic solvent tolerance protein  29.1 
 
 
786 aa  310  5.9999999999999995e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2738  organic solvent tolerance protein  29.1 
 
 
786 aa  310  5.9999999999999995e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2711  organic solvent tolerance protein  29.1 
 
 
786 aa  310  5.9999999999999995e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0350  hypothetical protein  30.12 
 
 
839 aa  309  1.0000000000000001e-82  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6038  organic solvent tolerance protein  28.53 
 
 
786 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0396  organic solvent tolerance protein  30.03 
 
 
788 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441976  normal  0.0999186 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2763  organic solvent tolerance protein  29.38 
 
 
786 aa  308  3e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2629  organic solvent tolerance protein  29.38 
 
 
786 aa  307  5.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.355062  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0917  organic solvent tolerance protein  31.9 
 
 
821 aa  306  7e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4764  organic solvent tolerance protein  30.8 
 
 
820 aa  303  8.000000000000001e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6035  organic solvent tolerance protein  30.18 
 
 
774 aa  302  1e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2149  organic solvent tolerance protein  30.25 
 
 
803 aa  301  3e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.550449  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2421  putative organic solvent tolerance protein  29.45 
 
 
761 aa  301  4e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.644424  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0208  organic solvent tolerance protein, putative  29.44 
 
 
787 aa  300  5e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.357539  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0871  organic solvent tolerance protein, putative  29.44 
 
 
787 aa  300  5e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2737  putative organic solvent tolerance protein  29.44 
 
 
787 aa  300  5e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2341  putative organic solvent tolerance protein  29.44 
 
 
787 aa  300  5e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.651905  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0692  organic solvent tolerance protein  29.44 
 
 
787 aa  300  5e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0706  organic solvent tolerance protein  29.44 
 
 
787 aa  300  5e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0436  organic solvent tolerance protein  28.47 
 
 
824 aa  300  6e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.524466 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0588  organic solvent tolerance protein  28.57 
 
 
786 aa  300  8e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.649611  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0575  organic solvent tolerance protein, putative  29.08 
 
 
787 aa  298  2e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3510  organic solvent tolerance protein  31.18 
 
 
794 aa  296  7e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0882  organic solvent tolerance protein  29.78 
 
 
773 aa  293  9e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000270887  normal  0.785369 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3076  organic solvent tolerance protein  28.38 
 
 
766 aa  292  2e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1017  organic solvent tolerance protein  29.3 
 
 
773 aa  287  5e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000878563  hitchhiker  0.00955351 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0740  organic solvent tolerance protein, putative  28.85 
 
 
860 aa  286  2.0000000000000002e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4863  organic solvent tolerance protein  30.83 
 
 
822 aa  283  6.000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.102386 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0106  organic solvent tolerance protein  27.53 
 
 
870 aa  283  1e-74  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.307862  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2076  organic solvent tolerance protein  27.59 
 
 
870 aa  283  1e-74  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0583626  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0098  organic solvent tolerance protein  29.6 
 
 
799 aa  280  8e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4812  organic solvent tolerance protein  30.09 
 
 
856 aa  277  5e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.685199  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3418  organic solvent tolerance protein  28.92 
 
 
735 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000112563  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0980  organic solvent tolerance protein  28.19 
 
 
765 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000900172  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3482  organic solvent tolerance protein  29.05 
 
 
776 aa  274  4.0000000000000004e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.151246 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2816  organic solvent tolerance protein  29.69 
 
 
764 aa  273  6e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0189474  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0908  organic solvent tolerance protein  28.29 
 
 
765 aa  273  8.000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000625202  normal  0.177324 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3112  organic solvent tolerance protein  28.29 
 
 
765 aa  273  8.000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000136701  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1049  organic solvent tolerance protein  27.91 
 
 
765 aa  273  9e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000815644  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3309  Organic solvent tolerance protein  27.91 
 
 
765 aa  273  1e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000208036  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3206  organic solvent tolerance protein  28.29 
 
 
765 aa  272  2e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000004691  normal  0.810097 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3636  organic solvent tolerance protein  28.06 
 
 
765 aa  271  4e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1082  organic solvent tolerance protein  27.77 
 
 
765 aa  271  4e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000021692  normal  0.94876 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0202  putative organic solvent tolerance transmembrane protein  30.21 
 
 
819 aa  269  2e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.829458 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0967  organic solvent tolerance protein  27.68 
 
 
774 aa  268  2.9999999999999995e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000267662  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1274  Organic solvent tolerance protein  28.62 
 
 
778 aa  268  2.9999999999999995e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.436193  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0865  organic solvent tolerance protein  28.01 
 
 
774 aa  266  8.999999999999999e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000634249  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0992  organic solvent tolerance protein  27.91 
 
 
765 aa  266  8.999999999999999e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0210027  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4076  organic solvent tolerance protein  30.1 
 
 
814 aa  266  2e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.258262  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2885  organic solvent tolerance protein  26.15 
 
 
766 aa  265  3e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000379496  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1698  putative organic solvent tolerance protein  29.21 
 
 
997 aa  265  3e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.999611  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0205  organic solvent tolerance protein  28.65 
 
 
781 aa  261  4e-68  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.420377  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1050  organic solvent tolerance protein  25.07 
 
 
790 aa  258  3e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1519  organic solvent tolerance protein  28.55 
 
 
912 aa  257  5e-67  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.136547 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2115  Organic solvent tolerance protein  27.96 
 
 
808 aa  253  1e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4523  organic solvent tolerance protein  27.07 
 
 
771 aa  248  3e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001662  Imp required for envelope biogenesis/organic solvent tolerance protein precursor  27.11 
 
 
781 aa  248  3e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00811  organic solvent tolerance protein  27.13 
 
 
781 aa  245  1.9999999999999999e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03411  organic solvent tolerance protein  26.25 
 
 
750 aa  244  3.9999999999999997e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.473581  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3829  organic solvent tolerance protein  27.37 
 
 
801 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3570  organic solvent tolerance protein  26.51 
 
 
750 aa  241  2.9999999999999997e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000108275  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0769  organic solvent tolerance protein  26.51 
 
 
750 aa  241  2.9999999999999997e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000043296  normal  0.038123 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3441  organic solvent tolerance protein  26.51 
 
 
780 aa  240  5.999999999999999e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000745954  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1574  Organic solvent tolerance protein  25.94 
 
 
841 aa  239  2e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0727  organic solvent tolerance protein  27.51 
 
 
787 aa  239  2e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000065541  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0371  organic solvent tolerance protein  25.93 
 
 
784 aa  238  2e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1870  organic solvent tolerance protein  25.9 
 
 
816 aa  238  3e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>