206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1724 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_1724  organic solvent tolerance protein  100 
 
 
738 aa  1500    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2714  Organic solvent tolerance protein  46.29 
 
 
753 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2012  organic solvent tolerance protein  35.54 
 
 
792 aa  447  1.0000000000000001e-124  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1936  organic solvent tolerance protein  35.54 
 
 
792 aa  446  1.0000000000000001e-124  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04642  organic solvent tolerance protein  36.29 
 
 
813 aa  448  1.0000000000000001e-124  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0686354  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0739  organic solvent tolerance protein OstA precursor  34.13 
 
 
922 aa  438  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07770  organic solvent tolerance protein OstA precursor  33.96 
 
 
924 aa  434  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0241314 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0601  organic solvent tolerance protein, putative  34.29 
 
 
1091 aa  431  1e-119  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0521  organic solvent tolerance protein  35.64 
 
 
929 aa  430  1e-119  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0438  organic solvent tolerance protein  33.09 
 
 
935 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.373211  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0554  organic solvent tolerance protein, putative  33.75 
 
 
905 aa  428  1e-118  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4798  organic solvent tolerance protein  32.38 
 
 
934 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427349  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0671  organic solvent tolerance protein  33.84 
 
 
826 aa  429  1e-118  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4624  organic solvent tolerance protein  33.42 
 
 
926 aa  424  1e-117  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.47424  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0435  organic solvent tolerance protein  32.67 
 
 
932 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00337227  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2337  organic solvent tolerance transmembrane protein  36.27 
 
 
728 aa  415  1e-114  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.503681  normal  0.440955 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5132  organic solvent tolerance protein  32.88 
 
 
937 aa  415  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.563491  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4010  organic solvent tolerance protein  32.96 
 
 
938 aa  414  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1977  Organic solvent tolerance protein  36.93 
 
 
751 aa  415  1e-114  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46800  Organic solvent tolerance protein  34.13 
 
 
919 aa  408  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.532703  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1454  Organic solvent tolerance protein  34.58 
 
 
836 aa  402  9.999999999999999e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591855  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0199  organic solvent tolerance protein  34.78 
 
 
757 aa  399  9.999999999999999e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0836973  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3659  organic solvent tolerance protein  32.41 
 
 
849 aa  393  1e-108  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.880911  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2149  organic solvent tolerance protein  31.35 
 
 
803 aa  387  1e-106  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.550449  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0967  organic solvent tolerance protein  31.41 
 
 
774 aa  380  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000267662  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1017  organic solvent tolerance protein  31.48 
 
 
773 aa  376  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000878563  hitchhiker  0.00955351 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3418  organic solvent tolerance protein  32.13 
 
 
735 aa  377  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000112563  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0882  organic solvent tolerance protein  31.93 
 
 
773 aa  374  1e-102  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000270887  normal  0.785369 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0917  organic solvent tolerance protein  33.46 
 
 
821 aa  370  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2816  organic solvent tolerance protein  31.56 
 
 
764 aa  365  1e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0189474  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03411  organic solvent tolerance protein  31.57 
 
 
750 aa  363  9e-99  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.473581  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0865  organic solvent tolerance protein  30.37 
 
 
774 aa  362  1e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000634249  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1020  organic solvent tolerance protein  33.91 
 
 
794 aa  360  6e-98  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0908  organic solvent tolerance protein  30.41 
 
 
765 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000625202  normal  0.177324 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3112  organic solvent tolerance protein  30.41 
 
 
765 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000136701  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0497  organic solvent tolerance protein  30.86 
 
 
810 aa  356  7.999999999999999e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4523  organic solvent tolerance protein  29.07 
 
 
771 aa  355  1e-96  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0436  organic solvent tolerance protein  32.81 
 
 
824 aa  355  2e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.524466 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0992  organic solvent tolerance protein  29.23 
 
 
765 aa  353  4e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0210027  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3206  organic solvent tolerance protein  30.14 
 
 
765 aa  353  5e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000004691  normal  0.810097 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3636  organic solvent tolerance protein  30.43 
 
 
765 aa  353  8e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2076  organic solvent tolerance protein  31.07 
 
 
870 aa  353  8.999999999999999e-96  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0583626  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0106  organic solvent tolerance protein  31.07 
 
 
870 aa  352  1e-95  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.307862  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3076  organic solvent tolerance protein  30.61 
 
 
766 aa  350  4e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0375  hypothetical protein  31.45 
 
 
839 aa  350  5e-95  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2885  organic solvent tolerance protein  29.02 
 
 
766 aa  350  6e-95  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000379496  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0980  organic solvent tolerance protein  30.35 
 
 
765 aa  350  6e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000900172  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0350  hypothetical protein  31.32 
 
 
839 aa  349  9e-95  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1049  organic solvent tolerance protein  29.97 
 
 
765 aa  348  1e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000815644  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1082  organic solvent tolerance protein  30.35 
 
 
765 aa  349  1e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000021692  normal  0.94876 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3309  Organic solvent tolerance protein  29.97 
 
 
765 aa  348  2e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000208036  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4863  organic solvent tolerance protein  32.37 
 
 
822 aa  347  3e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.102386 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1274  Organic solvent tolerance protein  31.81 
 
 
778 aa  347  5e-94  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.436193  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0391  Organic solvent tolerance protein  31.68 
 
 
813 aa  345  1e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.298665  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0515  organic solvent tolerance transmembrane protein  31.77 
 
 
811 aa  342  1e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.877133  normal  0.048519 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0406  Organic solvent tolerance protein  31.13 
 
 
813 aa  340  7e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6035  organic solvent tolerance protein  33.43 
 
 
774 aa  340  7e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4764  organic solvent tolerance protein  32.21 
 
 
820 aa  339  9e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3470  Organic solvent tolerance protein  31.99 
 
 
791 aa  338  1.9999999999999998e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.917858  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0098  organic solvent tolerance protein  31.48 
 
 
799 aa  337  3.9999999999999995e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2099  organic solvent tolerance protein  31.71 
 
 
786 aa  333  7.000000000000001e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2711  organic solvent tolerance protein  31.71 
 
 
786 aa  333  7.000000000000001e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4112  organic solvent tolerance protein  32.69 
 
 
783 aa  333  7.000000000000001e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2738  organic solvent tolerance protein  31.71 
 
 
786 aa  333  7.000000000000001e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3510  organic solvent tolerance protein  32.09 
 
 
794 aa  333  9e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6038  organic solvent tolerance protein  32.06 
 
 
786 aa  332  1e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1050  organic solvent tolerance protein  28.16 
 
 
790 aa  331  4e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4812  organic solvent tolerance protein  31.67 
 
 
856 aa  330  5.0000000000000004e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.685199  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2629  organic solvent tolerance protein  31.1 
 
 
786 aa  330  8e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.355062  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0588  organic solvent tolerance protein  31.42 
 
 
786 aa  329  9e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.649611  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3632  organic solvent tolerance protein  29.07 
 
 
799 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000841674  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2763  organic solvent tolerance protein  30.96 
 
 
786 aa  329  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0727  organic solvent tolerance protein  29.9 
 
 
787 aa  328  2.0000000000000001e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000065541  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4076  organic solvent tolerance protein  30.92 
 
 
814 aa  326  8.000000000000001e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.258262  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0740  organic solvent tolerance protein, putative  28.65 
 
 
860 aa  322  9.999999999999999e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0048  organic solvent tolerance protein  29.85 
 
 
784 aa  322  1.9999999999999998e-86  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000576585  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0396  organic solvent tolerance protein  31.21 
 
 
788 aa  322  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441976  normal  0.0999186 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00058  organic solvent tolerance protein precursor  29.85 
 
 
784 aa  320  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000114767  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3545  Organic solvent tolerance protein  29.85 
 
 
784 aa  320  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000267581  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0060  organic solvent tolerance protein  29.85 
 
 
784 aa  320  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118129  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3829  organic solvent tolerance protein  28.87 
 
 
801 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0058  organic solvent tolerance protein  29.85 
 
 
784 aa  320  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000825468  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00057  hypothetical protein  29.85 
 
 
784 aa  320  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000200577  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3601  organic solvent tolerance protein  29.85 
 
 
784 aa  320  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000724307  hitchhiker  0.00000564634 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0060  organic solvent tolerance protein  29.72 
 
 
773 aa  320  7.999999999999999e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00055163  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0575  organic solvent tolerance protein, putative  30.96 
 
 
787 aa  319  1e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0058  organic solvent tolerance protein  30.12 
 
 
785 aa  318  2e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000119427  normal  0.365449 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0208  organic solvent tolerance protein, putative  31.81 
 
 
787 aa  318  3e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.357539  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0871  organic solvent tolerance protein, putative  31.81 
 
 
787 aa  318  3e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0605  organic solvent tolerance protein  30.28 
 
 
799 aa  318  3e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0272025  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2737  putative organic solvent tolerance protein  31.81 
 
 
787 aa  318  3e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2341  putative organic solvent tolerance protein  31.81 
 
 
787 aa  318  3e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.651905  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0692  organic solvent tolerance protein  31.81 
 
 
787 aa  318  3e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0706  organic solvent tolerance protein  31.81 
 
 
787 aa  318  3e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2421  putative organic solvent tolerance protein  32.16 
 
 
761 aa  318  3e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.644424  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0675  Organic solvent tolerance protein  30.94 
 
 
788 aa  317  5e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0202  putative organic solvent tolerance transmembrane protein  31.57 
 
 
819 aa  317  5e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.829458 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0603  organic solvent tolerance protein  31.34 
 
 
781 aa  317  5e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000490445  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0104  organic solvent tolerance protein  29.27 
 
 
784 aa  315  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00372289  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0098  organic solvent tolerance protein  29.86 
 
 
786 aa  314  3.9999999999999997e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00167743  normal  0.0233205 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>