200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0098 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_5275  Organic solvent tolerance protein  53.2 
 
 		 860 aa  863    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0098  organic solvent tolerance protein  100 
 
 		 799 aa  1622    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4863  organic solvent tolerance protein  60.36 
 
 		 822 aa  947    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.102386 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4764  organic solvent tolerance protein  58.63 
 
 		 820 aa  942    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4076  organic solvent tolerance protein  60.92 
 
 		 814 aa  944    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.258262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4112  organic solvent tolerance protein  59.84 
 
 		 783 aa  949    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4812  organic solvent tolerance protein  59.29 
 
 		 856 aa  900    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.685199  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0202  putative organic solvent tolerance transmembrane protein  45.41 
 
 		 819 aa  672    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.829458 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3470  Organic solvent tolerance protein  58.68 
 
 		 791 aa  956    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.917858  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6035  organic solvent tolerance protein  54.8 
 
 		 774 aa  845    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0497  organic solvent tolerance protein  37.04 
 
 		 810 aa  514  1e-144  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0575  organic solvent tolerance protein, putative  37.38 
 
 		 787 aa  514  1e-144  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3911  organic solvent tolerance protein  39.68 
 
 		 863 aa  512  1e-143  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0515  organic solvent tolerance transmembrane protein  36.63 
 
 		 811 aa  506  9.999999999999999e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.877133  normal  0.048519 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0396  organic solvent tolerance protein  36.87 
 
 		 788 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441976  normal  0.0999186 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0406  Organic solvent tolerance protein  36.28 
 
 		 813 aa  508  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0391  Organic solvent tolerance protein  36.41 
 
 		 813 aa  509  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.298665  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0208  organic solvent tolerance protein, putative  36.77 
 
 		 787 aa  499  1e-140  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.357539  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0871  organic solvent tolerance protein, putative  36.77 
 
 		 787 aa  499  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2737  putative organic solvent tolerance protein  36.77 
 
 		 787 aa  499  1e-140  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2341  putative organic solvent tolerance protein  36.77 
 
 		 787 aa  499  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.651905  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0692  organic solvent tolerance protein  36.77 
 
 		 787 aa  499  1e-140  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0706  organic solvent tolerance protein  36.77 
 
 		 787 aa  499  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0588  organic solvent tolerance protein  35.81 
 
 		 786 aa  496  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.649611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2763  organic solvent tolerance protein  35.95 
 
 		 786 aa  496  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2421  putative organic solvent tolerance protein  37.29 
 
 		 761 aa  497  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.644424  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2629  organic solvent tolerance protein  35.95 
 
 		 786 aa  496  1e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.355062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0675  Organic solvent tolerance protein  36.61 
 
 		 788 aa  496  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6038  organic solvent tolerance protein  35.95 
 
 		 786 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4024  putative organic solvent tolerance protein  36.53 
 
 		 789 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.560503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2738  organic solvent tolerance protein  35.66 
 
 		 786 aa  491  1e-137  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2099  organic solvent tolerance protein  35.66 
 
 		 786 aa  491  1e-137  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2711  organic solvent tolerance protein  35.66 
 
 		 786 aa  491  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0436  organic solvent tolerance protein  36.1 
 
 		 824 aa  488  1e-136  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.524466 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3482  organic solvent tolerance protein  33.87 
 
 		 776 aa  437  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.151246 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2115  Organic solvent tolerance protein  34.42 
 
 		 808 aa  435  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2337  organic solvent tolerance transmembrane protein  35.83 
 
 		 728 aa  424  1e-117  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.503681  normal  0.440955 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0521  organic solvent tolerance protein  35.4 
 
 		 929 aa  424  1e-117  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3659  organic solvent tolerance protein  32.88 
 
 		 849 aa  412  1e-113  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.880911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1454  Organic solvent tolerance protein  33.87 
 
 		 836 aa  403  1e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591855  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2149  organic solvent tolerance protein  32.86 
 
 		 803 aa  369  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.550449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2714  Organic solvent tolerance protein  33.53 
 
 		 753 aa  353  5e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1574  Organic solvent tolerance protein  29.34 
 
 		 841 aa  346  8.999999999999999e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1724  organic solvent tolerance protein  31.71 
 
 		 738 aa  329  1.0000000000000001e-88  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1870  organic solvent tolerance protein  28.55 
 
 		 816 aa  323  6e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1977  Organic solvent tolerance protein  29.86 
 
 		 751 aa  317  8e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1936  organic solvent tolerance protein  28.88 
 
 		 792 aa  301  4e-80  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0671  organic solvent tolerance protein  28.88 
 
 		 826 aa  301  4e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0199  organic solvent tolerance protein  29.69 
 
 		 757 aa  299  1e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0836973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2012  organic solvent tolerance protein  29 
 
 		 792 aa  297  4e-79  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04642  organic solvent tolerance protein  28.64 
 
 		 813 aa  296  7e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0686354  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1274  Organic solvent tolerance protein  30.58 
 
 		 778 aa  291  4e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.436193  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2816  organic solvent tolerance protein  28.63 
 
 		 764 aa  274  5.000000000000001e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0189474  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0375  hypothetical protein  29.11 
 
 		 839 aa  272  2e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1020  organic solvent tolerance protein  29.46 
 
 		 794 aa  271  5e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4624  organic solvent tolerance protein  26.99 
 
 		 926 aa  267  5e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.47424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0865  organic solvent tolerance protein  28.98 
 
 		 774 aa  267  5e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000634249  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0350  hypothetical protein  28.82 
 
 		 839 aa  267  5.999999999999999e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3034  organic solvent tolerance protein, putative  28.92 
 
 		 701 aa  265  2e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2643  Organic solvent tolerance protein  28.92 
 
 		 727 aa  265  2e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.301946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0882  organic solvent tolerance protein  27.54 
 
 		 773 aa  259  1e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000270887  normal  0.785369 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0435  organic solvent tolerance protein  25.98 
 
 		 932 aa  258  3e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00337227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0967  organic solvent tolerance protein  27.31 
 
 		 774 aa  258  4e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000267662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0058  organic solvent tolerance protein  28.04 
 
 		 785 aa  257  5e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000119427  normal  0.365449 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5132  organic solvent tolerance protein  25.67 
 
 		 937 aa  257  6e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.563491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0438  organic solvent tolerance protein  25.86 
 
 		 935 aa  257  7e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.373211  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00058  organic solvent tolerance protein precursor  27.95 
 
 		 784 aa  256  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000114767  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3545  Organic solvent tolerance protein  27.95 
 
 		 784 aa  256  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000267581  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00057  hypothetical protein  27.95 
 
 		 784 aa  256  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000200577  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0554  organic solvent tolerance protein, putative  25.98 
 
 		 905 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0058  organic solvent tolerance protein  27.95 
 
 		 784 aa  256  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000825468  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3601  organic solvent tolerance protein  27.95 
 
 		 784 aa  256  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000724307  hitchhiker  0.00000564634 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0060  organic solvent tolerance protein  27.95 
 
 		 784 aa  256  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118129  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0048  organic solvent tolerance protein  27.67 
 
 		 784 aa  254  6e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000576585  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0601  organic solvent tolerance protein, putative  27.73 
 
 		 1091 aa  253  1e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0060  organic solvent tolerance protein  27.82 
 
 		 773 aa  252  2e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00055163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4798  organic solvent tolerance protein  25.5 
 
 		 934 aa  252  2e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0098  organic solvent tolerance protein  27.54 
 
 		 786 aa  251  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00167743  normal  0.0233205 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0104  organic solvent tolerance protein  27.74 
 
 		 784 aa  250  6e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00372289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3418  organic solvent tolerance protein  27.67 
 
 		 735 aa  250  8e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000112563  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0097  organic solvent tolerance protein  27.41 
 
 		 786 aa  250  9e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0159547  normal  0.564558 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0099  organic solvent tolerance protein  27.4 
 
 		 786 aa  249  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0097442  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3632  organic solvent tolerance protein  26.16 
 
 		 799 aa  249  1e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000841674  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0102  organic solvent tolerance protein  28.06 
 
 		 786 aa  249  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000015449  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0603  organic solvent tolerance protein  27.15 
 
 		 781 aa  248  2e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000490445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1017  organic solvent tolerance protein  27.2 
 
 		 773 aa  247  4.9999999999999997e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000878563  hitchhiker  0.00955351 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03411  organic solvent tolerance protein  26.59 
 
 		 750 aa  245  3e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.473581  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4010  organic solvent tolerance protein  26.05 
 
 		 938 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0727  organic solvent tolerance protein  26.18 
 
 		 787 aa  244  6e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000065541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2885  organic solvent tolerance protein  27.19 
 
 		 766 aa  243  1e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000379496  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0740  organic solvent tolerance protein, putative  25.82 
 
 		 860 aa  242  2e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3829  organic solvent tolerance protein  25.76 
 
 		 801 aa  242  2e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3076  organic solvent tolerance protein  26.88 
 
 		 766 aa  241  5.999999999999999e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0908  organic solvent tolerance protein  26.36 
 
 		 765 aa  240  6.999999999999999e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000625202  normal  0.177324 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3112  organic solvent tolerance protein  26.36 
 
 		 765 aa  240  6.999999999999999e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000136701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0739  organic solvent tolerance protein OstA precursor  25.93 
 
 		 922 aa  239  1e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1050  organic solvent tolerance protein  26.13 
 
 		 790 aa  239  2e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0605  organic solvent tolerance protein  26.56 
 
 		 799 aa  239  2e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0272025  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0992  organic solvent tolerance protein  25.95 
 
 		 765 aa  239  2e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0210027  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07770  organic solvent tolerance protein OstA precursor  26.07 
 
 		 924 aa  238  3e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0241314 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>