196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0601 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0601  organic solvent tolerance protein, putative  100 
 
 		 1091 aa  2253    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1724  organic solvent tolerance protein  34.29 
 
 		 738 aa  419  9.999999999999999e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0199  organic solvent tolerance protein  33.9 
 
 		 757 aa  413  1e-114  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0836973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2714  Organic solvent tolerance protein  34.66 
 
 		 753 aa  405  1e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5132  organic solvent tolerance protein  32.27 
 
 		 937 aa  360  9.999999999999999e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.563491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0739  organic solvent tolerance protein OstA precursor  31.61 
 
 		 922 aa  357  8.999999999999999e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4010  organic solvent tolerance protein  31.36 
 
 		 938 aa  355  2e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0438  organic solvent tolerance protein  31.37 
 
 		 935 aa  351  6e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.373211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0435  organic solvent tolerance protein  31.26 
 
 		 932 aa  348  3e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00337227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07770  organic solvent tolerance protein OstA precursor  30.55 
 
 		 924 aa  347  6e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0241314 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0554  organic solvent tolerance protein, putative  30.55 
 
 		 905 aa  345  4e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4624  organic solvent tolerance protein  30.81 
 
 		 926 aa  345  4e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.47424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0521  organic solvent tolerance protein  31.34 
 
 		 929 aa  343  9e-93  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4798  organic solvent tolerance protein  30.53 
 
 		 934 aa  343  1e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1020  organic solvent tolerance protein  31.18 
 
 		 794 aa  343  1e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0515  organic solvent tolerance transmembrane protein  32.54 
 
 		 811 aa  339  1.9999999999999998e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.877133  normal  0.048519 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0671  organic solvent tolerance protein  30.46 
 
 		 826 aa  338  2.9999999999999997e-91  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04642  organic solvent tolerance protein  30.3 
 
 		 813 aa  337  5.999999999999999e-91  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0686354  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0391  Organic solvent tolerance protein  31.37 
 
 		 813 aa  337  7.999999999999999e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.298665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1454  Organic solvent tolerance protein  30.62 
 
 		 836 aa  336  1e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591855  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0406  Organic solvent tolerance protein  31.84 
 
 		 813 aa  333  8e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1977  Organic solvent tolerance protein  31.52 
 
 		 751 aa  333  1e-89  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2337  organic solvent tolerance transmembrane protein  30.49 
 
 		 728 aa  332  3e-89  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.503681  normal  0.440955 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46800  Organic solvent tolerance protein  29.61 
 
 		 919 aa  330  7e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.532703  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0497  organic solvent tolerance protein  30.48 
 
 		 810 aa  330  8e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1936  organic solvent tolerance protein  31.23 
 
 		 792 aa  330  1.0000000000000001e-88  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2012  organic solvent tolerance protein  31.1 
 
 		 792 aa  327  6e-88  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0917  organic solvent tolerance protein  29.55 
 
 		 821 aa  323  8e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6038  organic solvent tolerance protein  30.93 
 
 		 786 aa  318  3e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0208  organic solvent tolerance protein, putative  30.99 
 
 		 787 aa  315  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.357539  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0871  organic solvent tolerance protein, putative  30.99 
 
 		 787 aa  315  2.9999999999999996e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2738  organic solvent tolerance protein  30.65 
 
 		 786 aa  315  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2099  organic solvent tolerance protein  30.65 
 
 		 786 aa  315  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2711  organic solvent tolerance protein  30.65 
 
 		 786 aa  315  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2737  putative organic solvent tolerance protein  30.99 
 
 		 787 aa  315  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2341  putative organic solvent tolerance protein  30.99 
 
 		 787 aa  315  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.651905  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0692  organic solvent tolerance protein  30.99 
 
 		 787 aa  315  2.9999999999999996e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0706  organic solvent tolerance protein  30.99 
 
 		 787 aa  315  2.9999999999999996e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0436  organic solvent tolerance protein  30.78 
 
 		 824 aa  314  4.999999999999999e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.524466 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4024  putative organic solvent tolerance protein  30 
 
 		 789 aa  313  7.999999999999999e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.560503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2763  organic solvent tolerance protein  30.57 
 
 		 786 aa  313  1e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2421  putative organic solvent tolerance protein  30.99 
 
 		 761 aa  313  1e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.644424  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2149  organic solvent tolerance protein  31.01 
 
 		 803 aa  312  2e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.550449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0675  Organic solvent tolerance protein  29.78 
 
 		 788 aa  312  2e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2629  organic solvent tolerance protein  30.57 
 
 		 786 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.355062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0575  organic solvent tolerance protein, putative  30.32 
 
 		 787 aa  311  4e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0375  hypothetical protein  30.66 
 
 		 839 aa  306  1.0000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3659  organic solvent tolerance protein  27.62 
 
 		 849 aa  306  1.0000000000000001e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.880911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3482  organic solvent tolerance protein  29.77 
 
 		 776 aa  305  4.0000000000000003e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.151246 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0396  organic solvent tolerance protein  29.89 
 
 		 788 aa  304  7.000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441976  normal  0.0999186 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3418  organic solvent tolerance protein  28.65 
 
 		 735 aa  303  2e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000112563  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0588  organic solvent tolerance protein  29.25 
 
 		 786 aa  302  2e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.649611  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0350  hypothetical protein  31.12 
 
 		 839 aa  302  3e-80  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0882  organic solvent tolerance protein  28.88 
 
 		 773 aa  301  3e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000270887  normal  0.785369 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1017  organic solvent tolerance protein  27.47 
 
 		 773 aa  300  8e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000878563  hitchhiker  0.00955351 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0992  organic solvent tolerance protein  29.96 
 
 		 765 aa  297  9e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0210027  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3470  Organic solvent tolerance protein  30.32 
 
 		 791 aa  295  3e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.917858  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4112  organic solvent tolerance protein  30.32 
 
 		 783 aa  293  1e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1082  organic solvent tolerance protein  28.82 
 
 		 765 aa  291  3e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000021692  normal  0.94876 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0908  organic solvent tolerance protein  29.46 
 
 		 765 aa  289  2e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000625202  normal  0.177324 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3112  organic solvent tolerance protein  29.46 
 
 		 765 aa  289  2e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000136701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3076  organic solvent tolerance protein  27.26 
 
 		 766 aa  288  4e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2816  organic solvent tolerance protein  28.06 
 
 		 764 aa  288  4e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0189474  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1049  organic solvent tolerance protein  28.38 
 
 		 765 aa  287  7e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000815644  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0980  organic solvent tolerance protein  28.53 
 
 		 765 aa  287  7e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000900172  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3309  Organic solvent tolerance protein  28.38 
 
 		 765 aa  287  7e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000208036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3206  organic solvent tolerance protein  28.87 
 
 		 765 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000004691  normal  0.810097 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0740  organic solvent tolerance protein, putative  27.77 
 
 		 860 aa  284  5.000000000000001e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03411  organic solvent tolerance protein  27.72 
 
 		 750 aa  283  9e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.473581  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3636  organic solvent tolerance protein  28.03 
 
 		 765 aa  282  2e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0865  organic solvent tolerance protein  28.71 
 
 		 774 aa  281  4e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000634249  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0967  organic solvent tolerance protein  27.95 
 
 		 774 aa  280  9e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000267662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1698  putative organic solvent tolerance protein  28.3 
 
 		 997 aa  279  2e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.999611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2115  Organic solvent tolerance protein  29.08 
 
 		 808 aa  279  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2076  organic solvent tolerance protein  29.82 
 
 		 870 aa  276  1.0000000000000001e-72  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0583626  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0106  organic solvent tolerance protein  29.82 
 
 		 870 aa  275  3e-72  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.307862  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1274  Organic solvent tolerance protein  26.63 
 
 		 778 aa  275  4.0000000000000004e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.436193  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1519  organic solvent tolerance protein  27.93 
 
 		 912 aa  273  1e-71  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.136547 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3510  organic solvent tolerance protein  29.65 
 
 		 794 aa  269  2.9999999999999995e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2885  organic solvent tolerance protein  27.22 
 
 		 766 aa  266  2e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000379496  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6035  organic solvent tolerance protein  28.48 
 
 		 774 aa  266  2e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1574  Organic solvent tolerance protein  27.54 
 
 		 841 aa  263  1e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4764  organic solvent tolerance protein  27.51 
 
 		 820 aa  263  1e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4812  organic solvent tolerance protein  27.96 
 
 		 856 aa  263  1e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.685199  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0202  putative organic solvent tolerance transmembrane protein  26.99 
 
 		 819 aa  261  6e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.829458 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4076  organic solvent tolerance protein  28.79 
 
 		 814 aa  260  9e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.258262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1870  organic solvent tolerance protein  27.3 
 
 		 816 aa  259  2e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4523  organic solvent tolerance protein  25.44 
 
 		 771 aa  258  4e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1754  organic solvent tolerance protein  27.31 
 
 		 1131 aa  257  8e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0989736  hitchhiker  0.000198385 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4863  organic solvent tolerance protein  28.21 
 
 		 822 aa  257  1.0000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.102386 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0098  organic solvent tolerance protein  27.73 
 
 		 799 aa  253  2e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0727  organic solvent tolerance protein  26.12 
 
 		 787 aa  235  3e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000065541  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3632  organic solvent tolerance protein  26.24 
 
 		 799 aa  234  6e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000841674  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5275  Organic solvent tolerance protein  26.79 
 
 		 860 aa  232  3e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0205  organic solvent tolerance protein  25.6 
 
 		 781 aa  232  4e-59  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.420377  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0058  organic solvent tolerance protein  25.71 
 
 		 785 aa  231  7e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000119427  normal  0.365449 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1050  organic solvent tolerance protein  25.28 
 
 		 790 aa  228  6e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00058  organic solvent tolerance protein precursor  25.6 
 
 		 784 aa  227  1e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000114767  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3545  Organic solvent tolerance protein  25.6 
 
 		 784 aa  227  1e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000267581  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0060  organic solvent tolerance protein  25.6 
 
 		 784 aa  227  1e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118129  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>