200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1977 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1977  Organic solvent tolerance protein  100 
 
 		 751 aa  1509    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2714  Organic solvent tolerance protein  43.77 
 
 		 753 aa  489  1e-137  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0199  organic solvent tolerance protein  38.9 
 
 		 757 aa  429  1e-119  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0836973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1724  organic solvent tolerance protein  38.1 
 
 		 738 aa  398  1e-109  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1020  organic solvent tolerance protein  35.56 
 
 		 794 aa  390  1e-107  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2337  organic solvent tolerance transmembrane protein  35.15 
 
 		 728 aa  374  1e-102  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.503681  normal  0.440955 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2763  organic solvent tolerance protein  30.35 
 
 		 786 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2629  organic solvent tolerance protein  30.47 
 
 		 786 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.355062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0521  organic solvent tolerance protein  34.01 
 
 		 929 aa  369  1e-101  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2738  organic solvent tolerance protein  30.5 
 
 		 786 aa  372  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2099  organic solvent tolerance protein  30.5 
 
 		 786 aa  372  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2711  organic solvent tolerance protein  30.5 
 
 		 786 aa  372  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0588  organic solvent tolerance protein  30.16 
 
 		 786 aa  365  1e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.649611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6038  organic solvent tolerance protein  29.86 
 
 		 786 aa  363  6e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0208  organic solvent tolerance protein, putative  31.38 
 
 		 787 aa  362  2e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.357539  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0871  organic solvent tolerance protein, putative  31.38 
 
 		 787 aa  362  2e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2737  putative organic solvent tolerance protein  31.38 
 
 		 787 aa  362  2e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2341  putative organic solvent tolerance protein  31.38 
 
 		 787 aa  362  2e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.651905  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0692  organic solvent tolerance protein  31.38 
 
 		 787 aa  362  2e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0706  organic solvent tolerance protein  31.38 
 
 		 787 aa  362  2e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04642  organic solvent tolerance protein  33.33 
 
 		 813 aa  360  8e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0686354  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0575  organic solvent tolerance protein, putative  30.91 
 
 		 787 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2421  putative organic solvent tolerance protein  31.2 
 
 		 761 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.644424  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0554  organic solvent tolerance protein, putative  32.29 
 
 		 905 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0396  organic solvent tolerance protein  30.27 
 
 		 788 aa  353  8e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441976  normal  0.0999186 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4624  organic solvent tolerance protein  32.71 
 
 		 926 aa  353  8.999999999999999e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.47424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0739  organic solvent tolerance protein OstA precursor  33.33 
 
 		 922 aa  350  7e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5132  organic solvent tolerance protein  30.82 
 
 		 937 aa  349  1e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.563491  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0515  organic solvent tolerance transmembrane protein  31.07 
 
 		 811 aa  348  2e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.877133  normal  0.048519 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0438  organic solvent tolerance protein  31.34 
 
 		 935 aa  347  3e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.373211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1454  Organic solvent tolerance protein  36.36 
 
 		 836 aa  346  8.999999999999999e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591855  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2149  organic solvent tolerance protein  33.6 
 
 		 803 aa  345  2e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.550449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0671  organic solvent tolerance protein  31.76 
 
 		 826 aa  343  5.999999999999999e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07770  organic solvent tolerance protein OstA precursor  32.09 
 
 		 924 aa  343  7e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0241314 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0435  organic solvent tolerance protein  31.59 
 
 		 932 aa  339  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00337227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0391  Organic solvent tolerance protein  29.59 
 
 		 813 aa  339  9.999999999999999e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.298665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0675  Organic solvent tolerance protein  29.46 
 
 		 788 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4010  organic solvent tolerance protein  32.12 
 
 		 938 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0917  organic solvent tolerance protein  32.86 
 
 		 821 aa  337  5e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2012  organic solvent tolerance protein  31.21 
 
 		 792 aa  335  1e-90  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0406  Organic solvent tolerance protein  29.32 
 
 		 813 aa  334  3e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0601  organic solvent tolerance protein, putative  31.52 
 
 		 1091 aa  334  3e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0375  hypothetical protein  30.29 
 
 		 839 aa  333  9e-90  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0350  hypothetical protein  30.16 
 
 		 839 aa  332  1e-89  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1936  organic solvent tolerance protein  31.21 
 
 		 792 aa  332  1e-89  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4024  putative organic solvent tolerance protein  28.9 
 
 		 789 aa  329  1.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.560503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4798  organic solvent tolerance protein  30.41 
 
 		 934 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3482  organic solvent tolerance protein  29.1 
 
 		 776 aa  323  6e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.151246 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3470  Organic solvent tolerance protein  31.24 
 
 		 791 aa  322  1.9999999999999998e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.917858  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46800  Organic solvent tolerance protein  31.91 
 
 		 919 aa  319  1e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.532703  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4112  organic solvent tolerance protein  32.35 
 
 		 783 aa  319  1e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3659  organic solvent tolerance protein  30.75 
 
 		 849 aa  316  9e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.880911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0098  organic solvent tolerance protein  31.52 
 
 		 799 aa  316  9.999999999999999e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1274  Organic solvent tolerance protein  30.58 
 
 		 778 aa  315  1.9999999999999998e-84  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.436193  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0497  organic solvent tolerance protein  31.05 
 
 		 810 aa  313  7.999999999999999e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3076  organic solvent tolerance protein  32.01 
 
 		 766 aa  313  1e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03411  organic solvent tolerance protein  31.41 
 
 		 750 aa  312  1e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.473581  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4863  organic solvent tolerance protein  31.23 
 
 		 822 aa  311  2e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.102386 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0436  organic solvent tolerance protein  29.55 
 
 		 824 aa  310  5.9999999999999995e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.524466 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2115  Organic solvent tolerance protein  28.69 
 
 		 808 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2816  organic solvent tolerance protein  29.09 
 
 		 764 aa  307  5.0000000000000004e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0189474  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0205  organic solvent tolerance protein  29.89 
 
 		 781 aa  304  3.0000000000000004e-81  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.420377  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0967  organic solvent tolerance protein  28.67 
 
 		 774 aa  303  6.000000000000001e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000267662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3418  organic solvent tolerance protein  29.67 
 
 		 735 aa  303  7.000000000000001e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000112563  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0980  organic solvent tolerance protein  28.81 
 
 		 765 aa  303  1e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000900172  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1082  organic solvent tolerance protein  28.67 
 
 		 765 aa  301  3e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000021692  normal  0.94876 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3309  Organic solvent tolerance protein  28.71 
 
 		 765 aa  301  4e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000208036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0740  organic solvent tolerance protein, putative  29.95 
 
 		 860 aa  300  5e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1049  organic solvent tolerance protein  28.57 
 
 		 765 aa  300  9e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000815644  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0865  organic solvent tolerance protein  32.57 
 
 		 774 aa  298  2e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000634249  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0992  organic solvent tolerance protein  31.14 
 
 		 765 aa  298  2e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0210027  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4812  organic solvent tolerance protein  31.67 
 
 		 856 aa  297  6e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.685199  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0882  organic solvent tolerance protein  28.27 
 
 		 773 aa  295  2e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000270887  normal  0.785369 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1017  organic solvent tolerance protein  28.14 
 
 		 773 aa  294  4e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000878563  hitchhiker  0.00955351 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2885  organic solvent tolerance protein  27.96 
 
 		 766 aa  293  8e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000379496  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0202  putative organic solvent tolerance transmembrane protein  31.79 
 
 		 819 aa  293  1e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.829458 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6035  organic solvent tolerance protein  33.17 
 
 		 774 aa  292  2e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3206  organic solvent tolerance protein  28.1 
 
 		 765 aa  291  4e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000004691  normal  0.810097 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0908  organic solvent tolerance protein  27.97 
 
 		 765 aa  289  1e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000625202  normal  0.177324 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3112  organic solvent tolerance protein  27.97 
 
 		 765 aa  289  1e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000136701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3510  organic solvent tolerance protein  33.18 
 
 		 794 aa  289  1e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4076  organic solvent tolerance protein  30.36 
 
 		 814 aa  289  2e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.258262  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3636  organic solvent tolerance protein  27.85 
 
 		 765 aa  286  8e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2643  Organic solvent tolerance protein  28.68 
 
 		 727 aa  285  3.0000000000000004e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.301946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3034  organic solvent tolerance protein, putative  28.68 
 
 		 701 aa  285  3.0000000000000004e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2076  organic solvent tolerance protein  27.83 
 
 		 870 aa  284  4.0000000000000003e-75  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0583626  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0106  organic solvent tolerance protein  27.83 
 
 		 870 aa  284  5.000000000000001e-75  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.307862  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4764  organic solvent tolerance protein  30.42 
 
 		 820 aa  281  2e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4523  organic solvent tolerance protein  26.68 
 
 		 771 aa  276  9e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5275  Organic solvent tolerance protein  29.1 
 
 		 860 aa  270  8e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0727  organic solvent tolerance protein  28.47 
 
 		 787 aa  268  2.9999999999999995e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000065541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3829  organic solvent tolerance protein  28.02 
 
 		 801 aa  262  2e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3632  organic solvent tolerance protein  28.65 
 
 		 799 aa  259  2e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000841674  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1519  organic solvent tolerance protein  29.35 
 
 		 912 aa  257  5e-67  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.136547 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1698  putative organic solvent tolerance protein  30.11 
 
 		 997 aa  257  7e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.999611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1050  organic solvent tolerance protein  26.31 
 
 		 790 aa  257  7e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0102  organic solvent tolerance protein  28.24 
 
 		 786 aa  255  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000015449  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00811  organic solvent tolerance protein  27.06 
 
 		 781 aa  254  3e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0099  organic solvent tolerance protein  28.24 
 
 		 786 aa  254  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0097442  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0605  organic solvent tolerance protein  29.73 
 
 		 799 aa  255  3e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0272025  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>