199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4863 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_6035  organic solvent tolerance protein  55.95 
 
 		 774 aa  889    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0098  organic solvent tolerance protein  59.42 
 
 		 799 aa  967    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4863  organic solvent tolerance protein  100 
 
 		 822 aa  1674    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.102386 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3470  Organic solvent tolerance protein  58.03 
 
 		 791 aa  942    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.917858  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4764  organic solvent tolerance protein  59.51 
 
 		 820 aa  939    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4076  organic solvent tolerance protein  76.99 
 
 		 814 aa  1309    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.258262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4112  organic solvent tolerance protein  59.11 
 
 		 783 aa  944    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5275  Organic solvent tolerance protein  51.37 
 
 		 860 aa  845    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4812  organic solvent tolerance protein  57.92 
 
 		 856 aa  896    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.685199  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0202  putative organic solvent tolerance transmembrane protein  45.67 
 
 		 819 aa  627  1e-178  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.829458 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0497  organic solvent tolerance protein  38.71 
 
 		 810 aa  539  9.999999999999999e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3911  organic solvent tolerance protein  39.55 
 
 		 863 aa  531  1e-149  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0396  organic solvent tolerance protein  38.28 
 
 		 788 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441976  normal  0.0999186 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0436  organic solvent tolerance protein  39.74 
 
 		 824 aa  515  1e-144  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.524466 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0391  Organic solvent tolerance protein  36.63 
 
 		 813 aa  514  1e-144  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.298665  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0515  organic solvent tolerance transmembrane protein  37.96 
 
 		 811 aa  509  1e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.877133  normal  0.048519 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0406  Organic solvent tolerance protein  36.51 
 
 		 813 aa  511  1e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2099  organic solvent tolerance protein  38 
 
 		 786 aa  502  1e-141  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2711  organic solvent tolerance protein  38 
 
 		 786 aa  502  1e-141  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2738  organic solvent tolerance protein  38 
 
 		 786 aa  502  1e-141  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6038  organic solvent tolerance protein  38 
 
 		 786 aa  502  1e-140  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0588  organic solvent tolerance protein  38 
 
 		 786 aa  497  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.649611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0575  organic solvent tolerance protein, putative  38.27 
 
 		 787 aa  498  1e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4024  putative organic solvent tolerance protein  37.13 
 
 		 789 aa  498  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.560503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2629  organic solvent tolerance protein  38 
 
 		 786 aa  496  1e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.355062  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0208  organic solvent tolerance protein, putative  38.17 
 
 		 787 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.357539  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0871  organic solvent tolerance protein, putative  38.17 
 
 		 787 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0675  Organic solvent tolerance protein  36.65 
 
 		 788 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2763  organic solvent tolerance protein  37.74 
 
 		 786 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2737  putative organic solvent tolerance protein  38.17 
 
 		 787 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2341  putative organic solvent tolerance protein  38.17 
 
 		 787 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.651905  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0692  organic solvent tolerance protein  38.17 
 
 		 787 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0706  organic solvent tolerance protein  38.17 
 
 		 787 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2421  putative organic solvent tolerance protein  38.17 
 
 		 761 aa  495  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.644424  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2337  organic solvent tolerance transmembrane protein  37.79 
 
 		 728 aa  459  9.999999999999999e-129  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.503681  normal  0.440955 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0521  organic solvent tolerance protein  35.94 
 
 		 929 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2115  Organic solvent tolerance protein  34.75 
 
 		 808 aa  442  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3659  organic solvent tolerance protein  33.29 
 
 		 849 aa  433  1e-120  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.880911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3482  organic solvent tolerance protein  34.38 
 
 		 776 aa  425  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.151246 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1454  Organic solvent tolerance protein  34.83 
 
 		 836 aa  411  1e-113  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591855  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2149  organic solvent tolerance protein  32.45 
 
 		 803 aa  378  1e-103  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.550449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1574  Organic solvent tolerance protein  30.42 
 
 		 841 aa  372  1e-101  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1870  organic solvent tolerance protein  29.59 
 
 		 816 aa  350  5e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2714  Organic solvent tolerance protein  32.93 
 
 		 753 aa  348  2e-94  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1724  organic solvent tolerance protein  32.37 
 
 		 738 aa  340  8e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04642  organic solvent tolerance protein  32.03 
 
 		 813 aa  333  6e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0686354  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0671  organic solvent tolerance protein  30.48 
 
 		 826 aa  327  8.000000000000001e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0199  organic solvent tolerance protein  30.5 
 
 		 757 aa  317  8e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0836973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1977  Organic solvent tolerance protein  31.23 
 
 		 751 aa  310  5.9999999999999995e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1936  organic solvent tolerance protein  29.75 
 
 		 792 aa  306  1.0000000000000001e-81  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1274  Organic solvent tolerance protein  32.38 
 
 		 778 aa  303  8.000000000000001e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.436193  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2012  organic solvent tolerance protein  30.24 
 
 		 792 aa  302  2e-80  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2643  Organic solvent tolerance protein  29.22 
 
 		 727 aa  288  2e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.301946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3034  organic solvent tolerance protein, putative  29.22 
 
 		 701 aa  288  2e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0435  organic solvent tolerance protein  28.02 
 
 		 932 aa  287  5.999999999999999e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00337227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0438  organic solvent tolerance protein  28.43 
 
 		 935 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.373211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4798  organic solvent tolerance protein  28.33 
 
 		 934 aa  285  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0739  organic solvent tolerance protein OstA precursor  28.09 
 
 		 922 aa  282  2e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4010  organic solvent tolerance protein  28.75 
 
 		 938 aa  281  2e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0375  hypothetical protein  29.24 
 
 		 839 aa  281  3e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5132  organic solvent tolerance protein  27.1 
 
 		 937 aa  281  3e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.563491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4624  organic solvent tolerance protein  28.42 
 
 		 926 aa  280  9e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.47424  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0350  hypothetical protein  27.61 
 
 		 839 aa  280  1e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1020  organic solvent tolerance protein  30.51 
 
 		 794 aa  275  3e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07770  organic solvent tolerance protein OstA precursor  27.75 
 
 		 924 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0241314 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0554  organic solvent tolerance protein, putative  28.19 
 
 		 905 aa  270  8e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1050  organic solvent tolerance protein  27.25 
 
 		 790 aa  265  4e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0967  organic solvent tolerance protein  27.46 
 
 		 774 aa  263  1e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000267662  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46800  Organic solvent tolerance protein  27.24 
 
 		 919 aa  263  1e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.532703  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0882  organic solvent tolerance protein  27.2 
 
 		 773 aa  262  2e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000270887  normal  0.785369 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0601  organic solvent tolerance protein, putative  27.79 
 
 		 1091 aa  256  8e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2816  organic solvent tolerance protein  27.46 
 
 		 764 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0189474  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0058  organic solvent tolerance protein  27.43 
 
 		 785 aa  254  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000119427  normal  0.365449 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0102  organic solvent tolerance protein  27.25 
 
 		 786 aa  254  5.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000015449  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0865  organic solvent tolerance protein  27.19 
 
 		 774 aa  254  5.000000000000001e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000634249  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0099  organic solvent tolerance protein  27.25 
 
 		 786 aa  254  5.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0097442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0098  organic solvent tolerance protein  27.25 
 
 		 786 aa  253  9.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00167743  normal  0.0233205 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0104  organic solvent tolerance protein  27.32 
 
 		 784 aa  253  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00372289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3418  organic solvent tolerance protein  29.21 
 
 		 735 aa  253  1e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000112563  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0097  organic solvent tolerance protein  27.25 
 
 		 786 aa  253  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0159547  normal  0.564558 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0048  organic solvent tolerance protein  26.96 
 
 		 784 aa  250  8e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000576585  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00058  organic solvent tolerance protein precursor  26.84 
 
 		 784 aa  248  4e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000114767  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3545  Organic solvent tolerance protein  26.84 
 
 		 784 aa  248  4e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000267581  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0060  organic solvent tolerance protein  26.84 
 
 		 784 aa  248  4e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118129  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00057  hypothetical protein  26.84 
 
 		 784 aa  248  4e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000200577  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3601  organic solvent tolerance protein  26.84 
 
 		 784 aa  248  4e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000724307  hitchhiker  0.00000564634 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0058  organic solvent tolerance protein  26.84 
 
 		 784 aa  248  4e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000825468  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2076  organic solvent tolerance protein  26.43 
 
 		 870 aa  246  9.999999999999999e-64  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0583626  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1017  organic solvent tolerance protein  27.27 
 
 		 773 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000878563  hitchhiker  0.00955351 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0106  organic solvent tolerance protein  26.43 
 
 		 870 aa  245  1.9999999999999999e-63  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.307862  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3076  organic solvent tolerance protein  27.38 
 
 		 766 aa  244  3.9999999999999997e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0060  organic solvent tolerance protein  26.71 
 
 		 773 aa  243  1e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00055163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0603  organic solvent tolerance protein  26.18 
 
 		 781 aa  242  2e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000490445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2885  organic solvent tolerance protein  26.8 
 
 		 766 aa  240  8e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000379496  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0740  organic solvent tolerance protein, putative  26.37 
 
 		 860 aa  238  4e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03411  organic solvent tolerance protein  27.21 
 
 		 750 aa  237  7e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.473581  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3636  organic solvent tolerance protein  25.03 
 
 		 765 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0992  organic solvent tolerance protein  26.29 
 
 		 765 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0210027  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0605  organic solvent tolerance protein  27.2 
 
 		 799 aa  234  5e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0272025  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0908  organic solvent tolerance protein  24.66 
 
 		 765 aa  231  4e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000625202  normal  0.177324 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>