198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E0048 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00058  organic solvent tolerance protein precursor  99.49 
 
 		 784 aa  1619    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000114767  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3545  Organic solvent tolerance protein  99.49 
 
 		 784 aa  1619    Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000267581  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0097  organic solvent tolerance protein  90.97 
 
 		 786 aa  1506    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0159547  normal  0.564558 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3829  organic solvent tolerance protein  64.99 
 
 		 801 aa  1083    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3601  organic solvent tolerance protein  99.49 
 
 		 784 aa  1619    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000724307  hitchhiker  0.00000564634 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00057  hypothetical protein  99.49 
 
 		 784 aa  1619    Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000200577  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3570  organic solvent tolerance protein  65.96 
 
 		 750 aa  1054    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000108275  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3632  organic solvent tolerance protein  66.29 
 
 		 799 aa  1096    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000841674  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3441  organic solvent tolerance protein  66.41 
 
 		 780 aa  1097    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000745954  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0205  organic solvent tolerance protein  44.42 
 
 		 781 aa  654    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.420377  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0769  organic solvent tolerance protein  65.83 
 
 		 750 aa  1053    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000043296  normal  0.038123 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0048  organic solvent tolerance protein  100 
 
 		 784 aa  1630    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000576585  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0060  organic solvent tolerance protein  99.49 
 
 		 784 aa  1619    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118129  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0104  organic solvent tolerance protein  91.33 
 
 		 784 aa  1516    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00372289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0099  organic solvent tolerance protein  90.84 
 
 		 786 aa  1506    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0097442  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0566  organic solvent tolerance protein  62.55 
 
 		 807 aa  1023    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0203405  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0727  organic solvent tolerance protein  67.13 
 
 		 787 aa  1115    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000065541  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0605  organic solvent tolerance protein  64.19 
 
 		 799 aa  1050    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0272025  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0058  organic solvent tolerance protein  99.49 
 
 		 784 aa  1619    Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000825468  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0098  organic solvent tolerance protein  91.09 
 
 		 786 aa  1508    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00167743  normal  0.0233205 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0102  organic solvent tolerance protein  90.84 
 
 		 786 aa  1505    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000015449  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0603  organic solvent tolerance protein  83.29 
 
 		 781 aa  1389    Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000490445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0058  organic solvent tolerance protein  95.54 
 
 		 785 aa  1563    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000119427  normal  0.365449 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0060  organic solvent tolerance protein  99.22 
 
 		 773 aa  1591    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00055163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00811  organic solvent tolerance protein  37.6 
 
 		 781 aa  499  1e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001662  Imp required for envelope biogenesis/organic solvent tolerance protein precursor  37.63 
 
 		 781 aa  495  9.999999999999999e-139  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2864  organic solvent tolerance protein  35.77 
 
 		 787 aa  472  1.0000000000000001e-131  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000318031  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0992  organic solvent tolerance protein  35.1 
 
 		 765 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0210027  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2816  organic solvent tolerance protein  33.84 
 
 		 764 aa  458  1e-127  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0189474  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0882  organic solvent tolerance protein  34.79 
 
 		 773 aa  456  1.0000000000000001e-126  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000270887  normal  0.785369 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0371  organic solvent tolerance protein  35.98 
 
 		 784 aa  451  1e-125  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1017  organic solvent tolerance protein  33.33 
 
 		 773 aa  451  1e-125  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000878563  hitchhiker  0.00955351 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3636  organic solvent tolerance protein  34.59 
 
 		 765 aa  444  1e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0967  organic solvent tolerance protein  34.11 
 
 		 774 aa  442  1e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000267662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0908  organic solvent tolerance protein  34.73 
 
 		 765 aa  443  1e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000625202  normal  0.177324 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3112  organic solvent tolerance protein  34.73 
 
 		 765 aa  443  1e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000136701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3076  organic solvent tolerance protein  34.03 
 
 		 766 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0865  organic solvent tolerance protein  35.39 
 
 		 774 aa  436  1e-121  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000634249  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3206  organic solvent tolerance protein  34.47 
 
 		 765 aa  437  1e-121  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000004691  normal  0.810097 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0980  organic solvent tolerance protein  34.24 
 
 		 765 aa  433  1e-120  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000900172  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1082  organic solvent tolerance protein  33.85 
 
 		 765 aa  430  1e-119  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000021692  normal  0.94876 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1049  organic solvent tolerance protein  33.72 
 
 		 765 aa  427  1e-118  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000815644  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3309  Organic solvent tolerance protein  33.72 
 
 		 765 aa  427  1e-118  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000208036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1050  organic solvent tolerance protein  34.53 
 
 		 790 aa  410  1e-113  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2885  organic solvent tolerance protein  32.46 
 
 		 766 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000379496  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3418  organic solvent tolerance protein  32.31 
 
 		 735 aa  394  1e-108  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000112563  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4523  organic solvent tolerance protein  32.42 
 
 		 771 aa  392  1e-107  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03411  organic solvent tolerance protein  31.48 
 
 		 750 aa  377  1e-103  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.473581  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07770  organic solvent tolerance protein OstA precursor  30.25 
 
 		 924 aa  345  2e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0241314 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0739  organic solvent tolerance protein OstA precursor  29.5 
 
 		 922 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46800  Organic solvent tolerance protein  29.87 
 
 		 919 aa  334  4e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.532703  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1724  organic solvent tolerance protein  29.85 
 
 		 738 aa  319  1e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0435  organic solvent tolerance protein  28.79 
 
 		 932 aa  317  6e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00337227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4624  organic solvent tolerance protein  29.27 
 
 		 926 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.47424  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0554  organic solvent tolerance protein, putative  28.68 
 
 		 905 aa  315  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4798  organic solvent tolerance protein  28.92 
 
 		 934 aa  312  2e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4010  organic solvent tolerance protein  28.12 
 
 		 938 aa  311  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0438  organic solvent tolerance protein  28.41 
 
 		 935 aa  311  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.373211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5132  organic solvent tolerance protein  28.62 
 
 		 937 aa  306  9.000000000000001e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.563491  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0375  hypothetical protein  28.48 
 
 		 839 aa  298  2e-79  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2714  Organic solvent tolerance protein  29.14 
 
 		 753 aa  298  2e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0350  hypothetical protein  28.36 
 
 		 839 aa  297  4e-79  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1274  Organic solvent tolerance protein  28.11 
 
 		 778 aa  297  4e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.436193  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04642  organic solvent tolerance protein  29.55 
 
 		 813 aa  286  1.0000000000000001e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0686354  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0497  organic solvent tolerance protein  27.36 
 
 		 810 aa  274  4.0000000000000004e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0740  organic solvent tolerance protein, putative  27.89 
 
 		 860 aa  269  1e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0671  organic solvent tolerance protein  26.77 
 
 		 826 aa  267  5e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2337  organic solvent tolerance transmembrane protein  27.22 
 
 		 728 aa  266  8.999999999999999e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.503681  normal  0.440955 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6038  organic solvent tolerance protein  28.07 
 
 		 786 aa  264  4e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0199  organic solvent tolerance protein  26.72 
 
 		 757 aa  263  8.999999999999999e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0836973  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0406  Organic solvent tolerance protein  27.54 
 
 		 813 aa  263  1e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2763  organic solvent tolerance protein  27.14 
 
 		 786 aa  262  2e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0391  Organic solvent tolerance protein  27.61 
 
 		 813 aa  261  3e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.298665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2012  organic solvent tolerance protein  28.37 
 
 		 792 aa  261  4e-68  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2629  organic solvent tolerance protein  27.01 
 
 		 786 aa  261  5.0000000000000005e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.355062  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0208  organic solvent tolerance protein, putative  27.78 
 
 		 787 aa  260  6e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.357539  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0871  organic solvent tolerance protein, putative  27.78 
 
 		 787 aa  260  6e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2737  putative organic solvent tolerance protein  27.78 
 
 		 787 aa  260  6e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2341  putative organic solvent tolerance protein  27.78 
 
 		 787 aa  260  6e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.651905  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0692  organic solvent tolerance protein  27.78 
 
 		 787 aa  260  6e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0706  organic solvent tolerance protein  27.78 
 
 		 787 aa  260  6e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0515  organic solvent tolerance transmembrane protein  27.52 
 
 		 811 aa  260  7e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.877133  normal  0.048519 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1936  organic solvent tolerance protein  27.97 
 
 		 792 aa  260  7e-68  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0575  organic solvent tolerance protein, putative  27.43 
 
 		 787 aa  258  2e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2149  organic solvent tolerance protein  29.17 
 
 		 803 aa  259  2e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.550449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2099  organic solvent tolerance protein  26.97 
 
 		 786 aa  259  2e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2711  organic solvent tolerance protein  26.97 
 
 		 786 aa  259  2e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2421  putative organic solvent tolerance protein  27.69 
 
 		 761 aa  259  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.644424  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2738  organic solvent tolerance protein  26.97 
 
 		 786 aa  259  2e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0396  organic solvent tolerance protein  27.9 
 
 		 788 aa  256  8e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441976  normal  0.0999186 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0917  organic solvent tolerance protein  26.45 
 
 		 821 aa  254  5.000000000000001e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0436  organic solvent tolerance protein  28.82 
 
 		 824 aa  254  5.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.524466 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0098  organic solvent tolerance protein  27.67 
 
 		 799 aa  253  1e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0588  organic solvent tolerance protein  26.71 
 
 		 786 aa  250  6e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.649611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4863  organic solvent tolerance protein  26.96 
 
 		 822 aa  249  1e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.102386 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1454  Organic solvent tolerance protein  26.84 
 
 		 836 aa  249  1e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591855  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2076  organic solvent tolerance protein  27.45 
 
 		 870 aa  248  2e-64  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0583626  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0521  organic solvent tolerance protein  25.8 
 
 		 929 aa  248  4e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1977  Organic solvent tolerance protein  28.95 
 
 		 751 aa  247  6e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0106  organic solvent tolerance protein  27.01 
 
 		 870 aa  246  1.9999999999999999e-63  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.307862  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>