201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA0208 on replicon NC_006348
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA0208  organic solvent tolerance protein, putative  100 
 
 
787 aa  1610    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.357539  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0871  organic solvent tolerance protein, putative  100 
 
 
787 aa  1610    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0406  Organic solvent tolerance protein  42.56 
 
 
813 aa  635    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3482  organic solvent tolerance protein  51.96 
 
 
776 aa  820    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.151246 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6038  organic solvent tolerance protein  80.05 
 
 
786 aa  1295    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0575  organic solvent tolerance protein, putative  96.32 
 
 
787 aa  1541    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2738  organic solvent tolerance protein  80.81 
 
 
786 aa  1306    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2629  organic solvent tolerance protein  80.94 
 
 
786 aa  1323    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.355062  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4024  putative organic solvent tolerance protein  72.53 
 
 
789 aa  1191    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.560503  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2115  Organic solvent tolerance protein  53.16 
 
 
808 aa  868    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0588  organic solvent tolerance protein  78.91 
 
 
786 aa  1300    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.649611  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0675  Organic solvent tolerance protein  72.37 
 
 
788 aa  1193    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2099  organic solvent tolerance protein  80.81 
 
 
786 aa  1306    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2763  organic solvent tolerance protein  80.56 
 
 
786 aa  1317    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2711  organic solvent tolerance protein  80.81 
 
 
786 aa  1306    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2737  putative organic solvent tolerance protein  100 
 
 
787 aa  1610    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2341  putative organic solvent tolerance protein  100 
 
 
787 aa  1610    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.651905  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0692  organic solvent tolerance protein  100 
 
 
787 aa  1610    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0706  organic solvent tolerance protein  100 
 
 
787 aa  1610    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2421  putative organic solvent tolerance protein  99.87 
 
 
761 aa  1554    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.644424  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0396  organic solvent tolerance protein  73.76 
 
 
788 aa  1212    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441976  normal  0.0999186 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0391  Organic solvent tolerance protein  42.8 
 
 
813 aa  634  1e-180  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.298665  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0515  organic solvent tolerance transmembrane protein  44.5 
 
 
811 aa  627  1e-178  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.877133  normal  0.048519 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0497  organic solvent tolerance protein  41.92 
 
 
810 aa  618  1e-175  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0436  organic solvent tolerance protein  43.95 
 
 
824 aa  591  1e-167  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.524466 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0098  organic solvent tolerance protein  37.29 
 
 
799 aa  500  1e-140  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3470  Organic solvent tolerance protein  38.2 
 
 
791 aa  497  1e-139  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.917858  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4863  organic solvent tolerance protein  38.17 
 
 
822 aa  494  9.999999999999999e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.102386 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4112  organic solvent tolerance protein  38.72 
 
 
783 aa  492  1e-137  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4764  organic solvent tolerance protein  37.62 
 
 
820 aa  483  1e-135  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5275  Organic solvent tolerance protein  35.9 
 
 
860 aa  481  1e-134  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4076  organic solvent tolerance protein  38.02 
 
 
814 aa  477  1e-133  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.258262  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6035  organic solvent tolerance protein  36.38 
 
 
774 aa  457  1e-127  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4812  organic solvent tolerance protein  35.97 
 
 
856 aa  448  1.0000000000000001e-124  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.685199  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1454  Organic solvent tolerance protein  36.03 
 
 
836 aa  437  1e-121  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591855  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1574  Organic solvent tolerance protein  34.34 
 
 
841 aa  435  1e-120  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0202  putative organic solvent tolerance transmembrane protein  33.86 
 
 
819 aa  428  1e-118  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.829458 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1870  organic solvent tolerance protein  34.59 
 
 
816 aa  429  1e-118  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3659  organic solvent tolerance protein  33.29 
 
 
849 aa  416  9.999999999999999e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.880911  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2337  organic solvent tolerance transmembrane protein  33.78 
 
 
728 aa  410  1e-113  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.503681  normal  0.440955 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0521  organic solvent tolerance protein  33.75 
 
 
929 aa  390  1e-107  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2714  Organic solvent tolerance protein  35.52 
 
 
753 aa  376  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2149  organic solvent tolerance protein  30.77 
 
 
803 aa  368  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.550449  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1977  Organic solvent tolerance protein  31.48 
 
 
751 aa  365  2e-99  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3911  organic solvent tolerance protein  30.45 
 
 
863 aa  361  3e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0199  organic solvent tolerance protein  31.04 
 
 
757 aa  345  2e-93  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0836973  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0601  organic solvent tolerance protein, putative  30.84 
 
 
1091 aa  316  9e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1724  organic solvent tolerance protein  31.38 
 
 
738 aa  309  1.0000000000000001e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4624  organic solvent tolerance protein  29.14 
 
 
926 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.47424  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0554  organic solvent tolerance protein, putative  28.9 
 
 
905 aa  303  1e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0438  organic solvent tolerance protein  28.63 
 
 
935 aa  302  1e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.373211  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4010  organic solvent tolerance protein  28.82 
 
 
938 aa  302  2e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4798  organic solvent tolerance protein  28.95 
 
 
934 aa  299  2e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427349  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1020  organic solvent tolerance protein  29.44 
 
 
794 aa  297  5e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04642  organic solvent tolerance protein  29.21 
 
 
813 aa  296  7e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0686354  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2643  Organic solvent tolerance protein  31.2 
 
 
727 aa  296  1e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.301946  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3034  organic solvent tolerance protein, putative  31.2 
 
 
701 aa  296  1e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0435  organic solvent tolerance protein  28.55 
 
 
932 aa  294  3e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00337227  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0375  hypothetical protein  28.95 
 
 
839 aa  291  3e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0671  organic solvent tolerance protein  29.99 
 
 
826 aa  291  3e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0350  hypothetical protein  28.72 
 
 
839 aa  290  6e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0967  organic solvent tolerance protein  30.16 
 
 
774 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000267662  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2816  organic solvent tolerance protein  28.07 
 
 
764 aa  284  5.000000000000001e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0189474  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0739  organic solvent tolerance protein OstA precursor  27.98 
 
 
922 aa  284  5.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46800  Organic solvent tolerance protein  28.33 
 
 
919 aa  282  1e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.532703  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07770  organic solvent tolerance protein OstA precursor  28.43 
 
 
924 aa  282  2e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0241314 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3206  organic solvent tolerance protein  28.03 
 
 
765 aa  281  3e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000004691  normal  0.810097 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0882  organic solvent tolerance protein  29.52 
 
 
773 aa  281  3e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000270887  normal  0.785369 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1936  organic solvent tolerance protein  27.56 
 
 
792 aa  280  8e-74  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0603  organic solvent tolerance protein  29.16 
 
 
781 aa  280  1e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000490445  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0908  organic solvent tolerance protein  27.76 
 
 
765 aa  278  3e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000625202  normal  0.177324 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3112  organic solvent tolerance protein  27.76 
 
 
765 aa  278  3e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000136701  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5132  organic solvent tolerance protein  27.48 
 
 
937 aa  277  6e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.563491  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2012  organic solvent tolerance protein  27.42 
 
 
792 aa  276  1.0000000000000001e-72  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3418  organic solvent tolerance protein  28.16 
 
 
735 aa  273  1e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000112563  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0992  organic solvent tolerance protein  27.91 
 
 
765 aa  273  1e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0210027  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0865  organic solvent tolerance protein  27.88 
 
 
774 aa  271  5e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000634249  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1274  Organic solvent tolerance protein  29.72 
 
 
778 aa  270  5.9999999999999995e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.436193  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0769  organic solvent tolerance protein  29.07 
 
 
750 aa  266  8.999999999999999e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000043296  normal  0.038123 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2076  organic solvent tolerance protein  28.94 
 
 
870 aa  266  1e-69  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0583626  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3570  organic solvent tolerance protein  29.13 
 
 
750 aa  265  2e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000108275  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3636  organic solvent tolerance protein  27.21 
 
 
765 aa  265  2e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3441  organic solvent tolerance protein  29.13 
 
 
780 aa  265  3e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000745954  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0106  organic solvent tolerance protein  28.79 
 
 
870 aa  264  4e-69  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.307862  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1017  organic solvent tolerance protein  29.55 
 
 
773 aa  264  4.999999999999999e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000878563  hitchhiker  0.00955351 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0980  organic solvent tolerance protein  28.85 
 
 
765 aa  264  4.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000900172  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3829  organic solvent tolerance protein  27.56 
 
 
801 aa  264  6e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3076  organic solvent tolerance protein  27.6 
 
 
766 aa  263  8e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0605  organic solvent tolerance protein  28.89 
 
 
799 aa  263  8e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0272025  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1082  organic solvent tolerance protein  28.7 
 
 
765 aa  263  1e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000021692  normal  0.94876 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00058  organic solvent tolerance protein precursor  27.78 
 
 
784 aa  262  2e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000114767  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3545  Organic solvent tolerance protein  27.78 
 
 
784 aa  262  2e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000267581  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0060  organic solvent tolerance protein  27.78 
 
 
784 aa  262  2e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118129  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0058  organic solvent tolerance protein  27.78 
 
 
784 aa  262  2e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000825468  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3601  organic solvent tolerance protein  27.78 
 
 
784 aa  262  2e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000724307  hitchhiker  0.00000564634 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00057  hypothetical protein  27.78 
 
 
784 aa  262  2e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000200577  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0058  organic solvent tolerance protein  27.19 
 
 
785 aa  261  3e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000119427  normal  0.365449 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0048  organic solvent tolerance protein  27.78 
 
 
784 aa  261  4e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000576585  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0097  organic solvent tolerance protein  27.34 
 
 
786 aa  260  5.0000000000000005e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0159547  normal  0.564558 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3632  organic solvent tolerance protein  27.27 
 
 
799 aa  260  7e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000841674  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>