199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_1574 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_1574  Organic solvent tolerance protein  100 
 
 		 841 aa  1724    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1870  organic solvent tolerance protein  77.38 
 
 		 816 aa  1297    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0497  organic solvent tolerance protein  39.17 
 
 		 810 aa  553  1e-156  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0406  Organic solvent tolerance protein  39.87 
 
 		 813 aa  551  1e-155  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0391  Organic solvent tolerance protein  39.77 
 
 		 813 aa  550  1e-155  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.298665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0436  organic solvent tolerance protein  39.79 
 
 		 824 aa  547  1e-154  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.524466 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0515  organic solvent tolerance transmembrane protein  38.15 
 
 		 811 aa  525  1e-147  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.877133  normal  0.048519 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0675  Organic solvent tolerance protein  35.98 
 
 		 788 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2629  organic solvent tolerance protein  35.06 
 
 		 786 aa  444  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.355062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2763  organic solvent tolerance protein  35.32 
 
 		 786 aa  443  1e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0588  organic solvent tolerance protein  34.97 
 
 		 786 aa  439  1e-121  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.649611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0396  organic solvent tolerance protein  34.58 
 
 		 788 aa  433  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441976  normal  0.0999186 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0208  organic solvent tolerance protein, putative  34.4 
 
 		 787 aa  432  1e-119  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.357539  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0871  organic solvent tolerance protein, putative  34.4 
 
 		 787 aa  432  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0575  organic solvent tolerance protein, putative  34.64 
 
 		 787 aa  431  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4024  putative organic solvent tolerance protein  34.68 
 
 		 789 aa  431  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.560503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2737  putative organic solvent tolerance protein  34.4 
 
 		 787 aa  432  1e-119  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2341  putative organic solvent tolerance protein  34.4 
 
 		 787 aa  432  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.651905  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0692  organic solvent tolerance protein  34.4 
 
 		 787 aa  432  1e-119  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0706  organic solvent tolerance protein  34.4 
 
 		 787 aa  432  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2421  putative organic solvent tolerance protein  34.93 
 
 		 761 aa  430  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.644424  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2738  organic solvent tolerance protein  34.41 
 
 		 786 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2099  organic solvent tolerance protein  34.41 
 
 		 786 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2711  organic solvent tolerance protein  34.41 
 
 		 786 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6038  organic solvent tolerance protein  34.2 
 
 		 786 aa  424  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2115  Organic solvent tolerance protein  31.02 
 
 		 808 aa  387  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3482  organic solvent tolerance protein  31.78 
 
 		 776 aa  380  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.151246 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4076  organic solvent tolerance protein  31.22 
 
 		 814 aa  377  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.258262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2337  organic solvent tolerance transmembrane protein  30.51 
 
 		 728 aa  373  1e-102  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.503681  normal  0.440955 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4863  organic solvent tolerance protein  30.42 
 
 		 822 aa  372  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.102386 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3470  Organic solvent tolerance protein  31.42 
 
 		 791 aa  366  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.917858  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4764  organic solvent tolerance protein  29.73 
 
 		 820 aa  365  2e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4112  organic solvent tolerance protein  31.42 
 
 		 783 aa  364  4e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3659  organic solvent tolerance protein  29.57 
 
 		 849 aa  362  2e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.880911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6035  organic solvent tolerance protein  30.56 
 
 		 774 aa  359  9e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4812  organic solvent tolerance protein  29.76 
 
 		 856 aa  355  2e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.685199  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1454  Organic solvent tolerance protein  30.34 
 
 		 836 aa  353  5e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591855  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5275  Organic solvent tolerance protein  29.63 
 
 		 860 aa  350  8e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0098  organic solvent tolerance protein  29.34 
 
 		 799 aa  345  2e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2149  organic solvent tolerance protein  29.1 
 
 		 803 aa  335  2e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.550449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0521  organic solvent tolerance protein  29.12 
 
 		 929 aa  325  2e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0202  putative organic solvent tolerance transmembrane protein  27.63 
 
 		 819 aa  302  2e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.829458 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0375  hypothetical protein  28.54 
 
 		 839 aa  285  2.0000000000000002e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0350  hypothetical protein  28.41 
 
 		 839 aa  284  4.0000000000000003e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0199  organic solvent tolerance protein  27.14 
 
 		 757 aa  284  6.000000000000001e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0836973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3911  organic solvent tolerance protein  26.46 
 
 		 863 aa  270  1e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0601  organic solvent tolerance protein, putative  27.4 
 
 		 1091 aa  265  3e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2714  Organic solvent tolerance protein  26.56 
 
 		 753 aa  259  1e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1724  organic solvent tolerance protein  27.14 
 
 		 738 aa  258  3e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1977  Organic solvent tolerance protein  25.68 
 
 		 751 aa  244  3.9999999999999997e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4624  organic solvent tolerance protein  25.82 
 
 		 926 aa  239  2e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.47424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4010  organic solvent tolerance protein  25.37 
 
 		 938 aa  239  2e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0671  organic solvent tolerance protein  25.55 
 
 		 826 aa  237  7e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1274  Organic solvent tolerance protein  27.57 
 
 		 778 aa  237  8e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.436193  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07770  organic solvent tolerance protein OstA precursor  25.15 
 
 		 924 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0241314 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1020  organic solvent tolerance protein  25.94 
 
 		 794 aa  236  1.0000000000000001e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0554  organic solvent tolerance protein, putative  25.35 
 
 		 905 aa  236  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0739  organic solvent tolerance protein OstA precursor  24.82 
 
 		 922 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4798  organic solvent tolerance protein  26.04 
 
 		 934 aa  234  5e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1936  organic solvent tolerance protein  25.56 
 
 		 792 aa  233  8.000000000000001e-60  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0435  organic solvent tolerance protein  25.35 
 
 		 932 aa  233  9e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00337227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0438  organic solvent tolerance protein  25.69 
 
 		 935 aa  230  1e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.373211  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46800  Organic solvent tolerance protein  24.25 
 
 		 919 aa  228  3e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.532703  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2012  organic solvent tolerance protein  25.85 
 
 		 792 aa  228  3e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04642  organic solvent tolerance protein  24.94 
 
 		 813 aa  227  8e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0686354  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0967  organic solvent tolerance protein  24.6 
 
 		 774 aa  226  1e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000267662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5132  organic solvent tolerance protein  24.14 
 
 		 937 aa  226  1e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.563491  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3636  organic solvent tolerance protein  25.53 
 
 		 765 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0908  organic solvent tolerance protein  25.92 
 
 		 765 aa  222  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000625202  normal  0.177324 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3112  organic solvent tolerance protein  25.92 
 
 		 765 aa  222  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000136701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3206  organic solvent tolerance protein  25.72 
 
 		 765 aa  220  1e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000004691  normal  0.810097 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1082  organic solvent tolerance protein  25.56 
 
 		 765 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000021692  normal  0.94876 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1017  organic solvent tolerance protein  25.35 
 
 		 773 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000878563  hitchhiker  0.00955351 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3510  organic solvent tolerance protein  25.44 
 
 		 794 aa  215  1.9999999999999998e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1049  organic solvent tolerance protein  25.56 
 
 		 765 aa  214  7.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000815644  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3309  Organic solvent tolerance protein  25.56 
 
 		 765 aa  214  7.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000208036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0882  organic solvent tolerance protein  24.55 
 
 		 773 aa  213  9e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000270887  normal  0.785369 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2816  organic solvent tolerance protein  24.04 
 
 		 764 aa  213  1e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0189474  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0980  organic solvent tolerance protein  25.42 
 
 		 765 aa  213  2e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000900172  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0992  organic solvent tolerance protein  24.54 
 
 		 765 aa  210  7e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0210027  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0740  organic solvent tolerance protein, putative  25.3 
 
 		 860 aa  210  1e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0865  organic solvent tolerance protein  24.14 
 
 		 774 aa  209  2e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000634249  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0917  organic solvent tolerance protein  24.43 
 
 		 821 aa  207  6e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0727  organic solvent tolerance protein  25.21 
 
 		 787 aa  205  2e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000065541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03411  organic solvent tolerance protein  26.3 
 
 		 750 aa  203  9.999999999999999e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.473581  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1050  organic solvent tolerance protein  23.27 
 
 		 790 aa  201  3.9999999999999996e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3076  organic solvent tolerance protein  23.21 
 
 		 766 aa  200  7e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2885  organic solvent tolerance protein  23.79 
 
 		 766 aa  200  7.999999999999999e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000379496  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0769  organic solvent tolerance protein  24.67 
 
 		 750 aa  197  8.000000000000001e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000043296  normal  0.038123 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3570  organic solvent tolerance protein  24.53 
 
 		 750 aa  194  4e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000108275  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3441  organic solvent tolerance protein  24.53 
 
 		 780 aa  194  5e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000745954  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0106  organic solvent tolerance protein  24.96 
 
 		 870 aa  193  1e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.307862  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2076  organic solvent tolerance protein  24.71 
 
 		 870 aa  192  2e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0583626  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3418  organic solvent tolerance protein  24.71 
 
 		 735 aa  189  1e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000112563  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0603  organic solvent tolerance protein  24.9 
 
 		 781 aa  189  3e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000490445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3829  organic solvent tolerance protein  23.58 
 
 		 801 aa  187  7e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0605  organic solvent tolerance protein  24.76 
 
 		 799 aa  186  1.0000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0272025  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0566  organic solvent tolerance protein  23.9 
 
 		 807 aa  184  4.0000000000000006e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0203405  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3632  organic solvent tolerance protein  23.27 
 
 		 799 aa  184  7e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000841674  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0102  organic solvent tolerance protein  24.63 
 
 		 786 aa  184  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000015449  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>