199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0740 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0740  organic solvent tolerance protein, putative  100 
 
 		 860 aa  1779    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0554  organic solvent tolerance protein, putative  32.7 
 
 		 905 aa  414  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4624  organic solvent tolerance protein  32.26 
 
 		 926 aa  410  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.47424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4010  organic solvent tolerance protein  31.76 
 
 		 938 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5132  organic solvent tolerance protein  32.08 
 
 		 937 aa  405  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.563491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07770  organic solvent tolerance protein OstA precursor  32.78 
 
 		 924 aa  404  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0241314 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0739  organic solvent tolerance protein OstA precursor  32.34 
 
 		 922 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46800  Organic solvent tolerance protein  32.03 
 
 		 919 aa  393  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.532703  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4798  organic solvent tolerance protein  29.98 
 
 		 934 aa  391  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0438  organic solvent tolerance protein  31.51 
 
 		 935 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.373211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0435  organic solvent tolerance protein  31.03 
 
 		 932 aa  385  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00337227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3510  organic solvent tolerance protein  31.42 
 
 		 794 aa  356  1e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2714  Organic solvent tolerance protein  32.21 
 
 		 753 aa  350  8e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0917  organic solvent tolerance protein  30.84 
 
 		 821 aa  337  7e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0199  organic solvent tolerance protein  30.88 
 
 		 757 aa  335  2e-90  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0836973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0882  organic solvent tolerance protein  30.47 
 
 		 773 aa  333  7.000000000000001e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000270887  normal  0.785369 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1017  organic solvent tolerance protein  31.03 
 
 		 773 aa  332  3e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000878563  hitchhiker  0.00955351 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0865  organic solvent tolerance protein  31.48 
 
 		 774 aa  328  3e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000634249  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3076  organic solvent tolerance protein  30.67 
 
 		 766 aa  327  7e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0967  organic solvent tolerance protein  30.22 
 
 		 774 aa  318  3e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000267662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2885  organic solvent tolerance protein  29.78 
 
 		 766 aa  316  9.999999999999999e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000379496  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1724  organic solvent tolerance protein  28.65 
 
 		 738 aa  312  2e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2816  organic solvent tolerance protein  29.52 
 
 		 764 aa  311  2.9999999999999997e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0189474  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03411  organic solvent tolerance protein  29.82 
 
 		 750 aa  310  1.0000000000000001e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.473581  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2337  organic solvent tolerance transmembrane protein  29.31 
 
 		 728 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.503681  normal  0.440955 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0375  hypothetical protein  26.95 
 
 		 839 aa  306  8.000000000000001e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0350  hypothetical protein  26.95 
 
 		 839 aa  306  1.0000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2012  organic solvent tolerance protein  30.26 
 
 		 792 aa  305  2.0000000000000002e-81  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0205  organic solvent tolerance protein  29.2 
 
 		 781 aa  305  2.0000000000000002e-81  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.420377  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1936  organic solvent tolerance protein  29.99 
 
 		 792 aa  301  3e-80  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04642  organic solvent tolerance protein  30.24 
 
 		 813 aa  301  3e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0686354  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1977  Organic solvent tolerance protein  29.95 
 
 		 751 aa  300  6e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0671  organic solvent tolerance protein  29.06 
 
 		 826 aa  299  1e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0992  organic solvent tolerance protein  29.63 
 
 		 765 aa  297  7e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0210027  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3206  organic solvent tolerance protein  28.84 
 
 		 765 aa  296  1e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000004691  normal  0.810097 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1082  organic solvent tolerance protein  29.01 
 
 		 765 aa  296  2e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000021692  normal  0.94876 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0908  organic solvent tolerance protein  28.7 
 
 		 765 aa  294  4e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000625202  normal  0.177324 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3112  organic solvent tolerance protein  28.7 
 
 		 765 aa  294  4e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000136701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0980  organic solvent tolerance protein  28.61 
 
 		 765 aa  294  5e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000900172  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3636  organic solvent tolerance protein  28.99 
 
 		 765 aa  292  1e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1049  organic solvent tolerance protein  28.87 
 
 		 765 aa  292  1e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000815644  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3309  Organic solvent tolerance protein  28.87 
 
 		 765 aa  292  2e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000208036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0104  organic solvent tolerance protein  28.31 
 
 		 784 aa  286  8e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00372289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3418  organic solvent tolerance protein  27.66 
 
 		 735 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000112563  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1020  organic solvent tolerance protein  28.98 
 
 		 794 aa  286  2.0000000000000002e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1454  Organic solvent tolerance protein  28.72 
 
 		 836 aa  286  2.0000000000000002e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591855  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0099  organic solvent tolerance protein  28.5 
 
 		 786 aa  285  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0097442  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0601  organic solvent tolerance protein, putative  27.77 
 
 		 1091 aa  284  4.0000000000000003e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0098  organic solvent tolerance protein  28.5 
 
 		 786 aa  285  4.0000000000000003e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00167743  normal  0.0233205 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2149  organic solvent tolerance protein  26.83 
 
 		 803 aa  284  4.0000000000000003e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.550449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0102  organic solvent tolerance protein  28.37 
 
 		 786 aa  284  4.0000000000000003e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000015449  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0097  organic solvent tolerance protein  28.5 
 
 		 786 aa  283  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0159547  normal  0.564558 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0521  organic solvent tolerance protein  28.72 
 
 		 929 aa  281  3e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3659  organic solvent tolerance protein  27.65 
 
 		 849 aa  281  5e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.880911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1274  Organic solvent tolerance protein  27.17 
 
 		 778 aa  279  1e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.436193  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0603  organic solvent tolerance protein  28.03 
 
 		 781 aa  280  1e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000490445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3570  organic solvent tolerance protein  28 
 
 		 750 aa  274  5.000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000108275  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0769  organic solvent tolerance protein  28 
 
 		 750 aa  274  6e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000043296  normal  0.038123 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3632  organic solvent tolerance protein  28.31 
 
 		 799 aa  273  8.000000000000001e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000841674  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3441  organic solvent tolerance protein  28 
 
 		 780 aa  273  8.000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000745954  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1054  organic solvent tolerance protein  27.56 
 
 		 757 aa  272  2e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0233273  normal  0.775857 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00058  organic solvent tolerance protein precursor  27.89 
 
 		 784 aa  270  1e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000114767  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3545  Organic solvent tolerance protein  27.89 
 
 		 784 aa  270  1e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000267581  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3601  organic solvent tolerance protein  27.89 
 
 		 784 aa  270  1e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000724307  hitchhiker  0.00000564634 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0058  organic solvent tolerance protein  27.89 
 
 		 784 aa  270  1e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000825468  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0727  organic solvent tolerance protein  28.7 
 
 		 787 aa  270  1e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000065541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0048  organic solvent tolerance protein  27.89 
 
 		 784 aa  269  1e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000576585  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00057  hypothetical protein  27.89 
 
 		 784 aa  270  1e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000200577  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0060  organic solvent tolerance protein  27.89 
 
 		 784 aa  270  1e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118129  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0058  organic solvent tolerance protein  27.63 
 
 		 785 aa  266  2e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000119427  normal  0.365449 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0060  organic solvent tolerance protein  28.1 
 
 		 773 aa  265  3e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00055163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3829  organic solvent tolerance protein  27.64 
 
 		 801 aa  263  8.999999999999999e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2738  organic solvent tolerance protein  28.74 
 
 		 786 aa  261  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2099  organic solvent tolerance protein  28.74 
 
 		 786 aa  261  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2711  organic solvent tolerance protein  28.74 
 
 		 786 aa  261  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0391  Organic solvent tolerance protein  27.48 
 
 		 813 aa  261  6e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.298665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6038  organic solvent tolerance protein  27.61 
 
 		 786 aa  260  9e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00811  organic solvent tolerance protein  28.35 
 
 		 781 aa  259  2e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001662  Imp required for envelope biogenesis/organic solvent tolerance protein precursor  27.55 
 
 		 781 aa  257  7e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1698  putative organic solvent tolerance protein  26.9 
 
 		 997 aa  257  7e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.999611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2629  organic solvent tolerance protein  28.74 
 
 		 786 aa  257  7e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.355062  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0515  organic solvent tolerance transmembrane protein  26.71 
 
 		 811 aa  256  9e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.877133  normal  0.048519 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2763  organic solvent tolerance protein  28.4 
 
 		 786 aa  256  9e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0406  Organic solvent tolerance protein  27.1 
 
 		 813 aa  255  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0566  organic solvent tolerance protein  26.34 
 
 		 807 aa  254  3e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0203405  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0588  organic solvent tolerance protein  28.74 
 
 		 786 aa  254  4.0000000000000004e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.649611  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4523  organic solvent tolerance protein  26.61 
 
 		 771 aa  254  5.000000000000001e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0497  organic solvent tolerance protein  25.89 
 
 		 810 aa  252  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0436  organic solvent tolerance protein  25.8 
 
 		 824 aa  250  9e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.524466 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0371  organic solvent tolerance protein  26.14 
 
 		 784 aa  250  1e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1519  organic solvent tolerance protein  26.41 
 
 		 912 aa  248  4e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.136547 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0605  organic solvent tolerance protein  26.28 
 
 		 799 aa  246  1.9999999999999999e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0272025  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0202  putative organic solvent tolerance transmembrane protein  26.59 
 
 		 819 aa  244  7e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.829458 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0396  organic solvent tolerance protein  26.84 
 
 		 788 aa  243  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441976  normal  0.0999186 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0098  organic solvent tolerance protein  25.82 
 
 		 799 aa  242  2.9999999999999997e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1050  organic solvent tolerance protein  25.52 
 
 		 790 aa  242  2.9999999999999997e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2076  organic solvent tolerance protein  26.1 
 
 		 870 aa  241  5.999999999999999e-62  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0583626  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0106  organic solvent tolerance protein  26.23 
 
 		 870 aa  240  8e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.307862  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4863  organic solvent tolerance protein  26.37 
 
 		 822 aa  238  4e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.102386 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4076  organic solvent tolerance protein  25.94 
 
 		 814 aa  234  4.0000000000000004e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.258262  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>