196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5275 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0098  organic solvent tolerance protein  53.2 
 
 		 799 aa  881    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4863  organic solvent tolerance protein  51.37 
 
 		 822 aa  845    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.102386 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3470  Organic solvent tolerance protein  48.68 
 
 		 791 aa  832    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.917858  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6035  organic solvent tolerance protein  49.76 
 
 		 774 aa  783    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5275  Organic solvent tolerance protein  100 
 
 		 860 aa  1755    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4764  organic solvent tolerance protein  51.4 
 
 		 820 aa  815    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4076  organic solvent tolerance protein  51.33 
 
 		 814 aa  829    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.258262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4112  organic solvent tolerance protein  48.72 
 
 		 783 aa  823    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4812  organic solvent tolerance protein  51.76 
 
 		 856 aa  801    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.685199  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0202  putative organic solvent tolerance transmembrane protein  39.08 
 
 		 819 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.829458 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0436  organic solvent tolerance protein  36.73 
 
 		 824 aa  505  1e-141  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.524466 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0497  organic solvent tolerance protein  35.62 
 
 		 810 aa  497  1e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0396  organic solvent tolerance protein  37.43 
 
 		 788 aa  498  1e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441976  normal  0.0999186 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0515  organic solvent tolerance transmembrane protein  35.33 
 
 		 811 aa  489  1e-137  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.877133  normal  0.048519 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2629  organic solvent tolerance protein  36.25 
 
 		 786 aa  485  1e-135  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.355062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0391  Organic solvent tolerance protein  34.76 
 
 		 813 aa  484  1e-135  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.298665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0588  organic solvent tolerance protein  36.64 
 
 		 786 aa  485  1e-135  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.649611  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0406  Organic solvent tolerance protein  34.52 
 
 		 813 aa  483  1e-135  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0208  organic solvent tolerance protein, putative  35.33 
 
 		 787 aa  479  1e-134  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.357539  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0871  organic solvent tolerance protein, putative  35.33 
 
 		 787 aa  479  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6038  organic solvent tolerance protein  35.9 
 
 		 786 aa  482  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0575  organic solvent tolerance protein, putative  35.79 
 
 		 787 aa  481  1e-134  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2763  organic solvent tolerance protein  36.13 
 
 		 786 aa  479  1e-134  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2737  putative organic solvent tolerance protein  35.33 
 
 		 787 aa  479  1e-134  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2341  putative organic solvent tolerance protein  35.33 
 
 		 787 aa  479  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.651905  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0692  organic solvent tolerance protein  35.33 
 
 		 787 aa  479  1e-134  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0706  organic solvent tolerance protein  35.33 
 
 		 787 aa  479  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2099  organic solvent tolerance protein  35.97 
 
 		 786 aa  478  1e-133  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2711  organic solvent tolerance protein  35.97 
 
 		 786 aa  478  1e-133  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2738  organic solvent tolerance protein  35.97 
 
 		 786 aa  478  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2421  putative organic solvent tolerance protein  35.24 
 
 		 761 aa  478  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.644424  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0675  Organic solvent tolerance protein  35.4 
 
 		 788 aa  474  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4024  putative organic solvent tolerance protein  35.59 
 
 		 789 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.560503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3911  organic solvent tolerance protein  35.25 
 
 		 863 aa  439  9.999999999999999e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2115  Organic solvent tolerance protein  33.03 
 
 		 808 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2337  organic solvent tolerance transmembrane protein  32.34 
 
 		 728 aa  402  9.999999999999999e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.503681  normal  0.440955 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0521  organic solvent tolerance protein  33.84 
 
 		 929 aa  394  1e-108  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1454  Organic solvent tolerance protein  32.42 
 
 		 836 aa  385  1e-105  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591855  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3482  organic solvent tolerance protein  31.43 
 
 		 776 aa  374  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.151246 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3659  organic solvent tolerance protein  30.31 
 
 		 849 aa  369  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.880911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2149  organic solvent tolerance protein  30.8 
 
 		 803 aa  363  1e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.550449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1574  Organic solvent tolerance protein  29.63 
 
 		 841 aa  351  3e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1870  organic solvent tolerance protein  29.43 
 
 		 816 aa  338  2.9999999999999997e-91  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2714  Organic solvent tolerance protein  30.86 
 
 		 753 aa  306  1.0000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0671  organic solvent tolerance protein  29.58 
 
 		 826 aa  299  1e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1724  organic solvent tolerance protein  29.9 
 
 		 738 aa  296  8e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1936  organic solvent tolerance protein  29.18 
 
 		 792 aa  284  6.000000000000001e-75  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1274  Organic solvent tolerance protein  29.71 
 
 		 778 aa  283  1e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.436193  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0554  organic solvent tolerance protein, putative  28.65 
 
 		 905 aa  280  8e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2012  organic solvent tolerance protein  29.18 
 
 		 792 aa  279  1e-73  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5132  organic solvent tolerance protein  28.02 
 
 		 937 aa  274  6e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.563491  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0375  hypothetical protein  27.22 
 
 		 839 aa  271  2.9999999999999997e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4010  organic solvent tolerance protein  27.64 
 
 		 938 aa  270  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0350  hypothetical protein  27.1 
 
 		 839 aa  270  1e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1977  Organic solvent tolerance protein  28.96 
 
 		 751 aa  270  1e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4624  organic solvent tolerance protein  27.98 
 
 		 926 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.47424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4798  organic solvent tolerance protein  27.69 
 
 		 934 aa  262  2e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0438  organic solvent tolerance protein  27.4 
 
 		 935 aa  261  3e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.373211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0435  organic solvent tolerance protein  27.49 
 
 		 932 aa  258  3e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00337227  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46800  Organic solvent tolerance protein  27.57 
 
 		 919 aa  258  4e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.532703  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0882  organic solvent tolerance protein  28.18 
 
 		 773 aa  257  6e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000270887  normal  0.785369 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0739  organic solvent tolerance protein OstA precursor  26.21 
 
 		 922 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04642  organic solvent tolerance protein  27.26 
 
 		 813 aa  256  1.0000000000000001e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0686354  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0199  organic solvent tolerance protein  29.42 
 
 		 757 aa  256  2.0000000000000002e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0836973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0967  organic solvent tolerance protein  27.37 
 
 		 774 aa  254  3e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000267662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0865  organic solvent tolerance protein  27.64 
 
 		 774 aa  253  8.000000000000001e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000634249  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2076  organic solvent tolerance protein  27.23 
 
 		 870 aa  251  5e-65  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0583626  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0106  organic solvent tolerance protein  27.23 
 
 		 870 aa  250  9e-65  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.307862  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07770  organic solvent tolerance protein OstA precursor  25.56 
 
 		 924 aa  249  1e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0241314 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2816  organic solvent tolerance protein  27.45 
 
 		 764 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0189474  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1017  organic solvent tolerance protein  26.84 
 
 		 773 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000878563  hitchhiker  0.00955351 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0601  organic solvent tolerance protein, putative  26.79 
 
 		 1091 aa  234  5e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0992  organic solvent tolerance protein  25.27 
 
 		 765 aa  232  3e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0210027  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1049  organic solvent tolerance protein  25.79 
 
 		 765 aa  231  4e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000815644  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3309  Organic solvent tolerance protein  25.79 
 
 		 765 aa  231  5e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000208036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2885  organic solvent tolerance protein  25.6 
 
 		 766 aa  231  5e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000379496  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1082  organic solvent tolerance protein  25.53 
 
 		 765 aa  231  6e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000021692  normal  0.94876 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0980  organic solvent tolerance protein  25.28 
 
 		 765 aa  230  8e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000900172  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3206  organic solvent tolerance protein  24.88 
 
 		 765 aa  228  5.0000000000000005e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000004691  normal  0.810097 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3636  organic solvent tolerance protein  24.94 
 
 		 765 aa  226  2e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0908  organic solvent tolerance protein  25.26 
 
 		 765 aa  226  2e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000625202  normal  0.177324 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3112  organic solvent tolerance protein  25.26 
 
 		 765 aa  226  2e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000136701  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00058  organic solvent tolerance protein precursor  25.06 
 
 		 784 aa  223  8e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000114767  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3545  Organic solvent tolerance protein  25.06 
 
 		 784 aa  223  8e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000267581  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0060  organic solvent tolerance protein  25.06 
 
 		 784 aa  223  8e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118129  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3601  organic solvent tolerance protein  25.06 
 
 		 784 aa  223  8e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000724307  hitchhiker  0.00000564634 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0058  organic solvent tolerance protein  25.06 
 
 		 784 aa  223  8e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000825468  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00057  hypothetical protein  25.06 
 
 		 784 aa  223  8e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000200577  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0727  organic solvent tolerance protein  24.71 
 
 		 787 aa  222  3e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000065541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3076  organic solvent tolerance protein  26.59 
 
 		 766 aa  221  3e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1050  organic solvent tolerance protein  25.99 
 
 		 790 aa  221  3.9999999999999997e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0060  organic solvent tolerance protein  25.14 
 
 		 773 aa  219  1e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00055163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0048  organic solvent tolerance protein  24.94 
 
 		 784 aa  219  1e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000576585  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0603  organic solvent tolerance protein  25.11 
 
 		 781 aa  218  2.9999999999999998e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000490445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0102  organic solvent tolerance protein  24.66 
 
 		 786 aa  216  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000015449  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0058  organic solvent tolerance protein  24.8 
 
 		 785 aa  217  9.999999999999999e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000119427  normal  0.365449 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0099  organic solvent tolerance protein  24.66 
 
 		 786 aa  216  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0097442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0098  organic solvent tolerance protein  24.66 
 
 		 786 aa  216  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00167743  normal  0.0233205 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0097  organic solvent tolerance protein  24.66 
 
 		 786 aa  216  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0159547  normal  0.564558 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0104  organic solvent tolerance protein  24.37 
 
 		 784 aa  214  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00372289  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>