206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2885 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009831  Ssed_0967  organic solvent tolerance protein  67.57 
 
 
774 aa  1080    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000267662  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3636  organic solvent tolerance protein  69.14 
 
 
765 aa  1071    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3309  Organic solvent tolerance protein  68.71 
 
 
765 aa  1075    Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000208036  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2885  organic solvent tolerance protein  100 
 
 
766 aa  1593    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000379496  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1017  organic solvent tolerance protein  66.15 
 
 
773 aa  1053    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000878563  hitchhiker  0.00955351 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1082  organic solvent tolerance protein  69.1 
 
 
765 aa  1080    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000021692  normal  0.94876 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0865  organic solvent tolerance protein  66.28 
 
 
774 aa  1048    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000634249  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0908  organic solvent tolerance protein  69.4 
 
 
765 aa  1092    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000625202  normal  0.177324 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3112  organic solvent tolerance protein  69.4 
 
 
765 aa  1092    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000136701  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3076  organic solvent tolerance protein  74.67 
 
 
766 aa  1223    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3206  organic solvent tolerance protein  69.01 
 
 
765 aa  1091    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000004691  normal  0.810097 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2816  organic solvent tolerance protein  64.45 
 
 
764 aa  1039    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0189474  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1049  organic solvent tolerance protein  68.71 
 
 
765 aa  1076    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000815644  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0980  organic solvent tolerance protein  68.84 
 
 
765 aa  1077    Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000900172  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0882  organic solvent tolerance protein  65.77 
 
 
773 aa  1038    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000270887  normal  0.785369 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0992  organic solvent tolerance protein  66.62 
 
 
765 aa  1063    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0210027  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3418  organic solvent tolerance protein  38.11 
 
 
735 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000112563  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03411  organic solvent tolerance protein  37.08 
 
 
750 aa  535  1e-151  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.473581  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4523  organic solvent tolerance protein  36.19 
 
 
771 aa  510  1e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1050  organic solvent tolerance protein  34.83 
 
 
790 aa  463  1e-129  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0371  organic solvent tolerance protein  35.82 
 
 
784 aa  452  1e-125  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3632  organic solvent tolerance protein  33.67 
 
 
799 aa  442  1e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000841674  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00811  organic solvent tolerance protein  34.3 
 
 
781 aa  445  1e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0727  organic solvent tolerance protein  33.29 
 
 
787 aa  435  1e-120  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000065541  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3829  organic solvent tolerance protein  32.71 
 
 
801 aa  435  1e-120  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001662  Imp required for envelope biogenesis/organic solvent tolerance protein precursor  34.03 
 
 
781 aa  434  1e-120  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0566  organic solvent tolerance protein  33.89 
 
 
807 aa  427  1e-118  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0203405  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0205  organic solvent tolerance protein  32.66 
 
 
781 aa  427  1e-118  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.420377  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3441  organic solvent tolerance protein  32.66 
 
 
780 aa  429  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000745954  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0769  organic solvent tolerance protein  33.16 
 
 
750 aa  425  1e-117  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000043296  normal  0.038123 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3570  organic solvent tolerance protein  33.16 
 
 
750 aa  424  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000108275  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0605  organic solvent tolerance protein  33.21 
 
 
799 aa  426  1e-117  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0272025  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00058  organic solvent tolerance protein precursor  32.08 
 
 
784 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000114767  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3545  Organic solvent tolerance protein  32.08 
 
 
784 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000267581  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3601  organic solvent tolerance protein  32.08 
 
 
784 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000724307  hitchhiker  0.00000564634 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0097  organic solvent tolerance protein  31.98 
 
 
786 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0159547  normal  0.564558 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0098  organic solvent tolerance protein  31.98 
 
 
786 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00167743  normal  0.0233205 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00057  hypothetical protein  32.08 
 
 
784 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000200577  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0060  organic solvent tolerance protein  32.08 
 
 
784 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118129  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0099  organic solvent tolerance protein  31.98 
 
 
786 aa  418  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0097442  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0058  organic solvent tolerance protein  32.08 
 
 
784 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000825468  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0102  organic solvent tolerance protein  31.98 
 
 
786 aa  418  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000015449  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0058  organic solvent tolerance protein  31.78 
 
 
785 aa  413  1e-114  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000119427  normal  0.365449 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0048  organic solvent tolerance protein  31.95 
 
 
784 aa  413  1e-114  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000576585  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0104  organic solvent tolerance protein  31.69 
 
 
784 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00372289  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0060  organic solvent tolerance protein  32.33 
 
 
773 aa  410  1e-113  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00055163  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0603  organic solvent tolerance protein  31.78 
 
 
781 aa  409  1.0000000000000001e-112  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000490445  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2864  organic solvent tolerance protein  31.8 
 
 
787 aa  395  1e-108  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000318031  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0554  organic solvent tolerance protein, putative  28.85 
 
 
905 aa  366  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4624  organic solvent tolerance protein  29.04 
 
 
926 aa  366  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.47424  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2714  Organic solvent tolerance protein  30.82 
 
 
753 aa  358  1.9999999999999998e-97  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4010  organic solvent tolerance protein  28.75 
 
 
938 aa  357  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46800  Organic solvent tolerance protein  28.87 
 
 
919 aa  356  1e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.532703  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0438  organic solvent tolerance protein  29.65 
 
 
935 aa  351  3e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.373211  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0739  organic solvent tolerance protein OstA precursor  28.08 
 
 
922 aa  348  2e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1724  organic solvent tolerance protein  29.71 
 
 
738 aa  347  5e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07770  organic solvent tolerance protein OstA precursor  27.85 
 
 
924 aa  343  5e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0241314 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5132  organic solvent tolerance protein  27.83 
 
 
937 aa  341  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.563491  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0435  organic solvent tolerance protein  29.11 
 
 
932 aa  338  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00337227  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4798  organic solvent tolerance protein  28.42 
 
 
934 aa  337  5e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427349  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0740  organic solvent tolerance protein, putative  29.68 
 
 
860 aa  318  3e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1454  Organic solvent tolerance protein  28.57 
 
 
836 aa  311  2.9999999999999997e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591855  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2337  organic solvent tolerance transmembrane protein  28.85 
 
 
728 aa  309  1.0000000000000001e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.503681  normal  0.440955 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0406  Organic solvent tolerance protein  28.44 
 
 
813 aa  302  1e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0391  Organic solvent tolerance protein  28.59 
 
 
813 aa  301  4e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.298665  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0199  organic solvent tolerance protein  27.32 
 
 
757 aa  298  3e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0836973  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3659  organic solvent tolerance protein  26.86 
 
 
849 aa  297  5e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.880911  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0497  organic solvent tolerance protein  27.65 
 
 
810 aa  295  2e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0436  organic solvent tolerance protein  28.55 
 
 
824 aa  295  2e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.524466 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3510  organic solvent tolerance protein  28.33 
 
 
794 aa  295  2e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1977  Organic solvent tolerance protein  27.82 
 
 
751 aa  292  1e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0375  hypothetical protein  28.18 
 
 
839 aa  291  4e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0515  organic solvent tolerance transmembrane protein  27.11 
 
 
811 aa  289  1e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.877133  normal  0.048519 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0350  hypothetical protein  27.94 
 
 
839 aa  286  1.0000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0521  organic solvent tolerance protein  26.61 
 
 
929 aa  285  2.0000000000000002e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2149  organic solvent tolerance protein  26.21 
 
 
803 aa  280  7e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.550449  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0671  organic solvent tolerance protein  27.72 
 
 
826 aa  279  1e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0917  organic solvent tolerance protein  26.96 
 
 
821 aa  278  2e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04642  organic solvent tolerance protein  28.26 
 
 
813 aa  278  3e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0686354  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0601  organic solvent tolerance protein, putative  27.71 
 
 
1091 aa  276  8e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2012  organic solvent tolerance protein  27.96 
 
 
792 aa  275  3e-72  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1274  Organic solvent tolerance protein  27.07 
 
 
778 aa  273  1e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.436193  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1936  organic solvent tolerance protein  27.82 
 
 
792 aa  271  4e-71  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1020  organic solvent tolerance protein  26.2 
 
 
794 aa  271  5e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3470  Organic solvent tolerance protein  27.77 
 
 
791 aa  270  5.9999999999999995e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.917858  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4112  organic solvent tolerance protein  27.85 
 
 
783 aa  268  2.9999999999999995e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0396  organic solvent tolerance protein  27.44 
 
 
788 aa  265  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441976  normal  0.0999186 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4764  organic solvent tolerance protein  27.9 
 
 
820 aa  265  3e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6038  organic solvent tolerance protein  27.32 
 
 
786 aa  262  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0575  organic solvent tolerance protein, putative  28.7 
 
 
787 aa  262  2e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2738  organic solvent tolerance protein  27.72 
 
 
786 aa  261  3e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2099  organic solvent tolerance protein  27.72 
 
 
786 aa  261  3e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2711  organic solvent tolerance protein  27.72 
 
 
786 aa  261  3e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2629  organic solvent tolerance protein  28.05 
 
 
786 aa  260  7e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.355062  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0588  organic solvent tolerance protein  27.83 
 
 
786 aa  260  8e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.649611  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2076  organic solvent tolerance protein  26.75 
 
 
870 aa  259  1e-67  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0583626  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0871  organic solvent tolerance protein, putative  28.24 
 
 
787 aa  258  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2341  putative organic solvent tolerance protein  28.24 
 
 
787 aa  258  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.651905  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0692  organic solvent tolerance protein  28.24 
 
 
787 aa  258  2e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0706  organic solvent tolerance protein  28.24 
 
 
787 aa  258  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>