200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1519 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1519  organic solvent tolerance protein  100 
 
 		 912 aa  1872    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.136547 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1698  putative organic solvent tolerance protein  96.29 
 
 		 997 aa  1725    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.999611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1754  organic solvent tolerance protein  53.91 
 
 		 1131 aa  988    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0989736  hitchhiker  0.000198385 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07770  organic solvent tolerance protein OstA precursor  29.49 
 
 		 924 aa  298  2e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0241314 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0739  organic solvent tolerance protein OstA precursor  29.09 
 
 		 922 aa  295  4e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2714  Organic solvent tolerance protein  29.31 
 
 		 753 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0435  organic solvent tolerance protein  28.66 
 
 		 932 aa  274  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00337227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4624  organic solvent tolerance protein  28.43 
 
 		 926 aa  274  6e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.47424  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0601  organic solvent tolerance protein, putative  27.93 
 
 		 1091 aa  273  9e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0438  organic solvent tolerance protein  28.64 
 
 		 935 aa  273  1e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.373211  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46800  Organic solvent tolerance protein  28.31 
 
 		 919 aa  272  2e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.532703  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4010  organic solvent tolerance protein  26.87 
 
 		 938 aa  270  8e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4798  organic solvent tolerance protein  28.4 
 
 		 934 aa  267  7e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0391  Organic solvent tolerance protein  30.19 
 
 		 813 aa  264  6.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.298665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5132  organic solvent tolerance protein  27.46 
 
 		 937 aa  263  1e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.563491  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0375  hypothetical protein  29.04 
 
 		 839 aa  262  2e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0882  organic solvent tolerance protein  28.83 
 
 		 773 aa  262  2e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000270887  normal  0.785369 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0406  Organic solvent tolerance protein  29.87 
 
 		 813 aa  261  3e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0554  organic solvent tolerance protein, putative  28.43 
 
 		 905 aa  259  2e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1274  Organic solvent tolerance protein  31.6 
 
 		 778 aa  258  5e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.436193  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0350  hypothetical protein  30.38 
 
 		 839 aa  257  6e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1977  Organic solvent tolerance protein  29.35 
 
 		 751 aa  257  7e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3076  organic solvent tolerance protein  27.08 
 
 		 766 aa  255  3e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0497  organic solvent tolerance protein  28.79 
 
 		 810 aa  254  5.000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1020  organic solvent tolerance protein  28.42 
 
 		 794 aa  254  5.000000000000001e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0515  organic solvent tolerance transmembrane protein  29.87 
 
 		 811 aa  254  6e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.877133  normal  0.048519 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1017  organic solvent tolerance protein  28.61 
 
 		 773 aa  254  6e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000878563  hitchhiker  0.00955351 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0436  organic solvent tolerance protein  28.77 
 
 		 824 aa  250  8e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.524466 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0199  organic solvent tolerance protein  29.52 
 
 		 757 aa  249  2e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0836973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0740  organic solvent tolerance protein, putative  26.41 
 
 		 860 aa  248  4e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001662  Imp required for envelope biogenesis/organic solvent tolerance protein precursor  28.47 
 
 		 781 aa  248  4e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3418  organic solvent tolerance protein  28.22 
 
 		 735 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000112563  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00811  organic solvent tolerance protein  27.99 
 
 		 781 aa  244  6e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0967  organic solvent tolerance protein  27.52 
 
 		 774 aa  242  2.9999999999999997e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000267662  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3636  organic solvent tolerance protein  27.11 
 
 		 765 aa  239  2e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2885  organic solvent tolerance protein  27.09 
 
 		 766 aa  239  2e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000379496  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04642  organic solvent tolerance protein  27.73 
 
 		 813 aa  239  2e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0686354  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0917  organic solvent tolerance protein  26.15 
 
 		 821 aa  236  1.0000000000000001e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0521  organic solvent tolerance protein  27.8 
 
 		 929 aa  234  6e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3510  organic solvent tolerance protein  28.71 
 
 		 794 aa  232  2e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00058  organic solvent tolerance protein precursor  27.39 
 
 		 784 aa  232  3e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000114767  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3545  Organic solvent tolerance protein  27.39 
 
 		 784 aa  232  3e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000267581  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0058  organic solvent tolerance protein  27.39 
 
 		 784 aa  232  3e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000825468  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0060  organic solvent tolerance protein  27.39 
 
 		 784 aa  232  3e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118129  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00057  hypothetical protein  27.39 
 
 		 784 aa  232  3e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000200577  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3601  organic solvent tolerance protein  27.39 
 
 		 784 aa  232  3e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000724307  hitchhiker  0.00000564634 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0058  organic solvent tolerance protein  27.42 
 
 		 785 aa  231  4e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000119427  normal  0.365449 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2337  organic solvent tolerance transmembrane protein  24.77 
 
 		 728 aa  231  6e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.503681  normal  0.440955 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3632  organic solvent tolerance protein  27.32 
 
 		 799 aa  230  9e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000841674  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03411  organic solvent tolerance protein  26.68 
 
 		 750 aa  229  1e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.473581  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0908  organic solvent tolerance protein  27.64 
 
 		 765 aa  230  1e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000625202  normal  0.177324 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3112  organic solvent tolerance protein  27.64 
 
 		 765 aa  230  1e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000136701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3206  organic solvent tolerance protein  27.21 
 
 		 765 aa  229  2e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000004691  normal  0.810097 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0048  organic solvent tolerance protein  27.26 
 
 		 784 aa  229  2e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000576585  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1724  organic solvent tolerance protein  26.85 
 
 		 738 aa  228  3e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0992  organic solvent tolerance protein  27.21 
 
 		 765 aa  228  3e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0210027  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1049  organic solvent tolerance protein  27.42 
 
 		 765 aa  228  5.0000000000000005e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000815644  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0102  organic solvent tolerance protein  27.66 
 
 		 786 aa  228  6e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000015449  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3309  Organic solvent tolerance protein  27.42 
 
 		 765 aa  227  8e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000208036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0060  organic solvent tolerance protein  27.13 
 
 		 773 aa  227  9e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00055163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0099  organic solvent tolerance protein  27.05 
 
 		 786 aa  226  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0097442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3829  organic solvent tolerance protein  27.67 
 
 		 801 aa  226  2e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1454  Organic solvent tolerance protein  28.19 
 
 		 836 aa  225  3e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591855  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0865  organic solvent tolerance protein  27.34 
 
 		 774 aa  225  3e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000634249  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2115  Organic solvent tolerance protein  28.06 
 
 		 808 aa  224  4e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0104  organic solvent tolerance protein  27.21 
 
 		 784 aa  224  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00372289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0098  organic solvent tolerance protein  26.92 
 
 		 786 aa  224  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00167743  normal  0.0233205 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1082  organic solvent tolerance protein  27.47 
 
 		 765 aa  224  6e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000021692  normal  0.94876 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0980  organic solvent tolerance protein  27.47 
 
 		 765 aa  224  6e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000900172  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0371  organic solvent tolerance protein  25.46 
 
 		 784 aa  224  7e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0727  organic solvent tolerance protein  27.37 
 
 		 787 aa  224  8e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000065541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2816  organic solvent tolerance protein  25.22 
 
 		 764 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0189474  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0575  organic solvent tolerance protein, putative  27.29 
 
 		 787 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0671  organic solvent tolerance protein  25.92 
 
 		 826 aa  222  1.9999999999999999e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4076  organic solvent tolerance protein  29.64 
 
 		 814 aa  222  1.9999999999999999e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.258262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2149  organic solvent tolerance protein  28.73 
 
 		 803 aa  222  3e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.550449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3482  organic solvent tolerance protein  28.57 
 
 		 776 aa  221  5e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.151246 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0097  organic solvent tolerance protein  26.79 
 
 		 786 aa  221  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0159547  normal  0.564558 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0208  organic solvent tolerance protein, putative  27.24 
 
 		 787 aa  220  1e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.357539  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0871  organic solvent tolerance protein, putative  27.24 
 
 		 787 aa  220  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0769  organic solvent tolerance protein  26.62 
 
 		 750 aa  220  1e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000043296  normal  0.038123 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2737  putative organic solvent tolerance protein  27.24 
 
 		 787 aa  220  1e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2341  putative organic solvent tolerance protein  27.24 
 
 		 787 aa  220  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.651905  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0692  organic solvent tolerance protein  27.24 
 
 		 787 aa  220  1e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0706  organic solvent tolerance protein  27.24 
 
 		 787 aa  220  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2421  putative organic solvent tolerance protein  27.24 
 
 		 761 aa  219  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.644424  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0603  organic solvent tolerance protein  26.81 
 
 		 781 aa  219  2e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000490445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3441  organic solvent tolerance protein  26.62 
 
 		 780 aa  218  2.9999999999999998e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000745954  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3570  organic solvent tolerance protein  26.62 
 
 		 750 aa  218  2.9999999999999998e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000108275  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0396  organic solvent tolerance protein  28.35 
 
 		 788 aa  217  7e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441976  normal  0.0999186 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2099  organic solvent tolerance protein  26.95 
 
 		 786 aa  217  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2711  organic solvent tolerance protein  26.95 
 
 		 786 aa  217  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2738  organic solvent tolerance protein  26.95 
 
 		 786 aa  217  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2629  organic solvent tolerance protein  27.01 
 
 		 786 aa  216  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.355062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6038  organic solvent tolerance protein  26.42 
 
 		 786 aa  215  2.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2763  organic solvent tolerance protein  26.87 
 
 		 786 aa  214  7e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2012  organic solvent tolerance protein  26.02 
 
 		 792 aa  214  7.999999999999999e-54  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1936  organic solvent tolerance protein  25.93 
 
 		 792 aa  213  1e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3659  organic solvent tolerance protein  25.97 
 
 		 849 aa  211  5e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.880911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4863  organic solvent tolerance protein  28.51 
 
 		 822 aa  210  1e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.102386 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>