202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3829 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1679  organic solvent tolerance protein  73.15 
 
 		 829 aa  1239    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.495698 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2478  organic solvent tolerance protein  70.73 
 
 		 833 aa  1172    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2311  organic solvent tolerance protein  68.55 
 
 		 842 aa  1139    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2968  organic solvent tolerance protein  70.54 
 
 		 833 aa  1178    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.61435 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2342  organic solvent tolerance protein  74.6 
 
 		 831 aa  1269    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2836  organic solvent tolerance protein  48.85 
 
 		 842 aa  754    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.324598  normal  0.142407 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3473  Organic solvent tolerance protein  70.25 
 
 		 837 aa  1170    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3829  putative organic solvent tolerance protein OstA (ImpA)  100 
 
 		 861 aa  1768    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.216689  normal  0.0687208 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5838  Organic solvent tolerance protein  41.2 
 
 		 886 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5100  organic solvent tolerance protein  40.91 
 
 		 886 aa  593  1e-168  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0299865 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3648  organic solvent tolerance protein  39.24 
 
 		 876 aa  579  1e-164  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.326034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3941  Organic solvent tolerance protein  39.42 
 
 		 876 aa  581  1e-164  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.911669 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3931  Organic solvent tolerance protein  39.24 
 
 		 862 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.748868  normal  0.188644 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0554  organic solvent tolerance protein  40.77 
 
 		 859 aa  568  1e-160  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.952449  normal  0.0626467 
 
 
-
 
NC_004310  BR0685  organic solvent tolerance, putative  39.08 
 
 		 792 aa  552  1e-155  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2603  organic solvent tolerance protein  39.23 
 
 		 786 aa  550  1e-155  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2223  Organic solvent tolerance protein  39.49 
 
 		 889 aa  546  1e-154  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.653366 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0677  putative organic solvent tolerance  38.59 
 
 		 792 aa  545  1e-153  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0652  organic solvent tolerance protein  38.38 
 
 		 892 aa  541  9.999999999999999e-153  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1541  organic solvent tolerance protein  40.47 
 
 		 777 aa  530  1e-149  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1210  Organic solvent tolerance protein  37.89 
 
 		 776 aa  514  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.44229  hitchhiker  0.00000306995 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1066  Organic solvent tolerance protein  37.36 
 
 		 780 aa  514  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000331071 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1759  organic solvent tolerance protein  37.16 
 
 		 786 aa  491  1e-137  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.179124  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0763  organic solvent tolerance protein  37.65 
 
 		 781 aa  486  1e-135  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.169469 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0506  organic solvent tolerance protein  35.04 
 
 		 791 aa  468  9.999999999999999e-131  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3340  organic solvent tolerance protein  33.12 
 
 		 743 aa  413  1e-114  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491125 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1762  organic solvent tolerance protein  27.55 
 
 		 767 aa  274  6e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.868226  normal  0.32659 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2626  organic solvent tolerance protein  28.23 
 
 		 746 aa  268  2.9999999999999995e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3044  Organic solvent tolerance protein  27.66 
 
 		 784 aa  260  8e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.328846 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0411  organic solvent tolerance protein  27.02 
 
 		 748 aa  259  2e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.693712  normal  0.0669812 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2528  organic solvent tolerance protein  26.52 
 
 		 816 aa  258  3e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.150977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0434  organic solvent tolerance protein OstA-like  26.88 
 
 		 886 aa  245  1.9999999999999999e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.435152  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1188  organic solvent tolerance protein  27.35 
 
 		 716 aa  236  2.0000000000000002e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0274723  normal  0.555926 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2902  putative organic solvent tolerance protein  26.08 
 
 		 714 aa  226  1e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1546  organic solvent tolerance protein  26.08 
 
 		 714 aa  226  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0947  organic solvent tolerance protein  26.83 
 
 		 731 aa  209  2e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0025554  normal  0.755835 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1224  organic solvent tolerance protein  26.23 
 
 		 724 aa  209  2e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0104539  normal  0.332289 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0889  organic solvent tolerance protein  26.16 
 
 		 756 aa  206  2e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.111396  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1119  organic solvent tolerance protein  31.63 
 
 		 712 aa  166  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.223918 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1812  organic solvent tolerance protein, putative  35.29 
 
 		 715 aa  147  9e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0780027  normal  0.530576 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0900  organic solvent tolerance protein  34.36 
 
 		 804 aa  145  3e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.403582 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3632  organic solvent tolerance protein  24.16 
 
 		 799 aa  126  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000841674  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3829  organic solvent tolerance protein  24.04 
 
 		 801 aa  122  3e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1977  Organic solvent tolerance protein  31.11 
 
 		 751 aa  117  8.999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0865  organic solvent tolerance protein  28.4 
 
 		 774 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000634249  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0603  organic solvent tolerance protein  23.71 
 
 		 781 aa  116  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000490445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0097  organic solvent tolerance protein  23.42 
 
 		 786 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0159547  normal  0.564558 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2714  Organic solvent tolerance protein  33.33 
 
 		 753 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2816  organic solvent tolerance protein  27.24 
 
 		 764 aa  113  2.0000000000000002e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0189474  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00811  organic solvent tolerance protein  24.31 
 
 		 781 aa  112  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0727  organic solvent tolerance protein  29.5 
 
 		 787 aa  113  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000065541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3470  Organic solvent tolerance protein  32.14 
 
 		 791 aa  113  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.917858  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0098  organic solvent tolerance protein  23.88 
 
 		 786 aa  112  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00167743  normal  0.0233205 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0102  organic solvent tolerance protein  23.91 
 
 		 786 aa  112  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000015449  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0099  organic solvent tolerance protein  23.91 
 
 		 786 aa  111  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0097442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001662  Imp required for envelope biogenesis/organic solvent tolerance protein precursor  23.74 
 
 		 781 aa  111  6e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4112  organic solvent tolerance protein  37.07 
 
 		 783 aa  111  7.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0605  organic solvent tolerance protein  33.17 
 
 		 799 aa  111  7.000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0272025  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0058  organic solvent tolerance protein  23.31 
 
 		 785 aa  110  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000119427  normal  0.365449 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0104  organic solvent tolerance protein  23.91 
 
 		 784 aa  109  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00372289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0371  organic solvent tolerance protein  23.09 
 
 		 784 aa  109  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0098  organic solvent tolerance protein  35.56 
 
 		 799 aa  107  8e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3034  organic solvent tolerance protein, putative  33.47 
 
 		 701 aa  107  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3911  organic solvent tolerance protein  26.14 
 
 		 863 aa  106  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2643  Organic solvent tolerance protein  33.47 
 
 		 727 aa  107  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.301946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2328  organic solvent tolerance protein  26.9 
 
 		 762 aa  107  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000704394  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0566  organic solvent tolerance protein  33.88 
 
 		 807 aa  106  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0203405  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2885  organic solvent tolerance protein  27.99 
 
 		 766 aa  105  4e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000379496  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0769  organic solvent tolerance protein  32.02 
 
 		 750 aa  104  7e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000043296  normal  0.038123 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3570  organic solvent tolerance protein  32.02 
 
 		 750 aa  104  7e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000108275  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3441  organic solvent tolerance protein  32.02 
 
 		 780 aa  104  7e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000745954  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5275  Organic solvent tolerance protein  32.89 
 
 		 860 aa  104  7e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3076  organic solvent tolerance protein  28.23 
 
 		 766 aa  102  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07770  organic solvent tolerance protein OstA precursor  22.93 
 
 		 924 aa  103  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0241314 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0396  organic solvent tolerance protein  32.54 
 
 		 788 aa  102  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441976  normal  0.0999186 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0675  Organic solvent tolerance protein  33.01 
 
 		 788 aa  102  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0967  organic solvent tolerance protein  27.95 
 
 		 774 aa  102  4e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000267662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4863  organic solvent tolerance protein  29.79 
 
 		 822 aa  102  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.102386 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00058  organic solvent tolerance protein precursor  28.92 
 
 		 784 aa  101  5e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000114767  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3545  Organic solvent tolerance protein  28.92 
 
 		 784 aa  101  5e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000267581  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0058  organic solvent tolerance protein  28.92 
 
 		 784 aa  101  5e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000825468  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3601  organic solvent tolerance protein  28.92 
 
 		 784 aa  101  5e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000724307  hitchhiker  0.00000564634 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0060  organic solvent tolerance protein  28.92 
 
 		 784 aa  101  5e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118129  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00057  hypothetical protein  28.92 
 
 		 784 aa  101  5e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000200577  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0438  organic solvent tolerance protein  23.41 
 
 		 935 aa  101  5e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.373211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4024  putative organic solvent tolerance protein  32.54 
 
 		 789 aa  101  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.560503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0882  organic solvent tolerance protein  26.94 
 
 		 773 aa  101  7e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000270887  normal  0.785369 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0202  putative organic solvent tolerance transmembrane protein  33.65 
 
 		 819 aa  100  8e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.829458 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0048  organic solvent tolerance protein  28.48 
 
 		 784 aa  100  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000576585  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4010  organic solvent tolerance protein  23.43 
 
 		 938 aa  100  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46800  Organic solvent tolerance protein  23.39 
 
 		 919 aa  99.8  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.532703  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5132  organic solvent tolerance protein  28 
 
 		 937 aa  99.4  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.563491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0992  organic solvent tolerance protein  29.82 
 
 		 765 aa  99.4  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0210027  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4798  organic solvent tolerance protein  26.3 
 
 		 934 aa  98.6  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0060  organic solvent tolerance protein  28.17 
 
 		 773 aa  98.6  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00055163  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0554  organic solvent tolerance protein, putative  23.2 
 
 		 905 aa  98.2  6e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3636  organic solvent tolerance protein  26.17 
 
 		 765 aa  97.8  7e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6038  organic solvent tolerance protein  32.06 
 
 		 786 aa  97.8  8e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6035  organic solvent tolerance protein  31.98 
 
 		 774 aa  97.4  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2711  organic solvent tolerance protein  31.9 
 
 		 786 aa  96.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>