191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_1546 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2902  putative organic solvent tolerance protein  100 
 
 		 714 aa  1423    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1546  organic solvent tolerance protein  100 
 
 		 714 aa  1423    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1119  organic solvent tolerance protein  83.61 
 
 		 712 aa  1161    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.223918 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0947  organic solvent tolerance protein  45.29 
 
 		 731 aa  583  1.0000000000000001e-165  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0025554  normal  0.755835 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1188  organic solvent tolerance protein  45.16 
 
 		 716 aa  573  1.0000000000000001e-162  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0274723  normal  0.555926 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0900  organic solvent tolerance protein  44.55 
 
 		 804 aa  570  1e-161  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.403582 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1812  organic solvent tolerance protein, putative  43.12 
 
 		 715 aa  549  1e-155  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0780027  normal  0.530576 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3340  organic solvent tolerance protein  27.57 
 
 		 743 aa  255  2.0000000000000002e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491125 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2836  organic solvent tolerance protein  27.69 
 
 		 842 aa  244  3e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.324598  normal  0.142407 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2311  organic solvent tolerance protein  27.06 
 
 		 842 aa  242  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3829  putative organic solvent tolerance protein OstA (ImpA)  26.12 
 
 		 861 aa  234  3e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.216689  normal  0.0687208 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2342  organic solvent tolerance protein  27.72 
 
 		 831 aa  233  1e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2528  organic solvent tolerance protein  26.1 
 
 		 816 aa  230  8e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.150977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3473  Organic solvent tolerance protein  26.29 
 
 		 837 aa  227  7e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2626  organic solvent tolerance protein  27.04 
 
 		 746 aa  226  1e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2478  organic solvent tolerance protein  26.59 
 
 		 833 aa  225  2e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2968  organic solvent tolerance protein  26.29 
 
 		 833 aa  225  3e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.61435 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1679  organic solvent tolerance protein  25.38 
 
 		 829 aa  224  4e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.495698 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1224  organic solvent tolerance protein  27.45 
 
 		 724 aa  222  1.9999999999999999e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0104539  normal  0.332289 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1759  organic solvent tolerance protein  25.67 
 
 		 786 aa  216  9.999999999999999e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.179124  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3648  organic solvent tolerance protein  25.07 
 
 		 876 aa  207  6e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.326034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2603  organic solvent tolerance protein  24.93 
 
 		 786 aa  207  7e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3941  Organic solvent tolerance protein  25.07 
 
 		 876 aa  207  7e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.911669 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3931  Organic solvent tolerance protein  25.17 
 
 		 862 aa  206  1e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.748868  normal  0.188644 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5838  Organic solvent tolerance protein  26.83 
 
 		 886 aa  203  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0763  organic solvent tolerance protein  26.67 
 
 		 781 aa  201  3e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.169469 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5100  organic solvent tolerance protein  26.29 
 
 		 886 aa  201  5e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0299865 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1541  organic solvent tolerance protein  25.39 
 
 		 777 aa  198  2.0000000000000003e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0554  organic solvent tolerance protein  26.05 
 
 		 859 aa  197  7e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.952449  normal  0.0626467 
 
 
-
 
NC_004310  BR0685  organic solvent tolerance, putative  23.84 
 
 		 792 aa  195  2e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0411  organic solvent tolerance protein  26.36 
 
 		 748 aa  195  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.693712  normal  0.0669812 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1762  organic solvent tolerance protein  24.56 
 
 		 767 aa  192  2e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.868226  normal  0.32659 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0677  putative organic solvent tolerance  23.48 
 
 		 792 aa  191  4e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1210  Organic solvent tolerance protein  24.18 
 
 		 776 aa  191  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.44229  hitchhiker  0.00000306995 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1066  Organic solvent tolerance protein  24.13 
 
 		 780 aa  191  5.999999999999999e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000331071 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0506  organic solvent tolerance protein  22.44 
 
 		 791 aa  188  4e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3044  Organic solvent tolerance protein  23.16 
 
 		 784 aa  179  1e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.328846 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0889  organic solvent tolerance protein  23.86 
 
 		 756 aa  177  6e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.111396  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0434  organic solvent tolerance protein OstA-like  25 
 
 		 886 aa  156  1e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.435152  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2223  Organic solvent tolerance protein  23.14 
 
 		 889 aa  139  3.0000000000000003e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.653366 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0652  organic solvent tolerance protein  21.98 
 
 		 892 aa  137  5e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2816  organic solvent tolerance protein  22.73 
 
 		 764 aa  91.3  6e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0189474  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0908  organic solvent tolerance protein  23.59 
 
 		 765 aa  89.7  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000625202  normal  0.177324 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3112  organic solvent tolerance protein  23.59 
 
 		 765 aa  89.7  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000136701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2643  Organic solvent tolerance protein  23.39 
 
 		 727 aa  88.6  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.301946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3034  organic solvent tolerance protein, putative  23.3 
 
 		 701 aa  88.2  5e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1050  organic solvent tolerance protein  20.85 
 
 		 790 aa  87.8  7e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3911  organic solvent tolerance protein  25.41 
 
 		 863 aa  87.4  9e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3632  organic solvent tolerance protein  22.36 
 
 		 799 aa  85.9  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000841674  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2864  organic solvent tolerance protein  21.54 
 
 		 787 aa  85.1  0.000000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000318031  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3206  organic solvent tolerance protein  23.03 
 
 		 765 aa  84.3  0.000000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000004691  normal  0.810097 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4112  organic solvent tolerance protein  22.89 
 
 		 783 aa  81.3  0.00000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0202  putative organic solvent tolerance transmembrane protein  25.05 
 
 		 819 aa  80.9  0.00000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.829458 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00811  organic solvent tolerance protein  20.83 
 
 		 781 aa  80.5  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1259  putative periplasmic protein  25.21 
 
 		 718 aa  80.1  0.0000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0882  organic solvent tolerance protein  22.24 
 
 		 773 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000270887  normal  0.785369 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3470  Organic solvent tolerance protein  22.89 
 
 		 791 aa  79.7  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.917858  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04642  organic solvent tolerance protein  26.21 
 
 		 813 aa  78.6  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0686354  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3636  organic solvent tolerance protein  23.94 
 
 		 765 aa  78.6  0.0000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0992  organic solvent tolerance protein  22.04 
 
 		 765 aa  78.2  0.0000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0210027  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6035  organic solvent tolerance protein  26.15 
 
 		 774 aa  77.4  0.0000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0898  Organic solvent tolerance protein  28 
 
 		 684 aa  75.9  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.33463e-30 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4076  organic solvent tolerance protein  24.04 
 
 		 814 aa  76.3  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.258262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4024  putative organic solvent tolerance protein  25.87 
 
 		 789 aa  74.7  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.560503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6038  organic solvent tolerance protein  26.27 
 
 		 786 aa  74.3  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0727  organic solvent tolerance protein  25.84 
 
 		 787 aa  74.3  0.000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000065541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2099  organic solvent tolerance protein  26.67 
 
 		 786 aa  74.3  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2711  organic solvent tolerance protein  26.67 
 
 		 786 aa  74.3  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0675  Organic solvent tolerance protein  24.4 
 
 		 788 aa  74.3  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2738  organic solvent tolerance protein  26.67 
 
 		 786 aa  74.3  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4523  organic solvent tolerance protein  20.64 
 
 		 771 aa  73.9  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0575  organic solvent tolerance protein, putative  27.1 
 
 		 787 aa  73.9  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0199  organic solvent tolerance protein  24.58 
 
 		 757 aa  73.9  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0836973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3076  organic solvent tolerance protein  26.41 
 
 		 766 aa  73.9  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0396  organic solvent tolerance protein  26.32 
 
 		 788 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441976  normal  0.0999186 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1049  organic solvent tolerance protein  21.44 
 
 		 765 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000815644  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4863  organic solvent tolerance protein  23.7 
 
 		 822 aa  72.8  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.102386 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1082  organic solvent tolerance protein  21.3 
 
 		 765 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000021692  normal  0.94876 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1017  organic solvent tolerance protein  21.55 
 
 		 773 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000878563  hitchhiker  0.00955351 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0980  organic solvent tolerance protein  21.61 
 
 		 765 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000900172  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0603  organic solvent tolerance protein  20.24 
 
 		 781 aa  73.2  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000490445  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0605  organic solvent tolerance protein  32.67 
 
 		 799 aa  72  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0272025  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3309  Organic solvent tolerance protein  21.3 
 
 		 765 aa  72.4  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000208036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001662  Imp required for envelope biogenesis/organic solvent tolerance protein precursor  20 
 
 		 781 aa  72  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3659  organic solvent tolerance protein  25.27 
 
 		 849 aa  71.2  0.00000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.880911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0104  organic solvent tolerance protein  19.94 
 
 		 784 aa  71.2  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00372289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3829  organic solvent tolerance protein  32.93 
 
 		 801 aa  71.2  0.00000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0268  Organic solvent tolerance protein  24.23 
 
 		 765 aa  70.1  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0588  organic solvent tolerance protein  25.98 
 
 		 786 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.649611  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0566  organic solvent tolerance protein  32.82 
 
 		 807 aa  70.5  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0203405  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03411  organic solvent tolerance protein  21.72 
 
 		 750 aa  70.5  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.473581  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0917  organic solvent tolerance protein  27.72 
 
 		 821 aa  70.1  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3208  organic solvent tolerance protein  24.91 
 
 		 799 aa  70.5  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0208  organic solvent tolerance protein, putative  26.13 
 
 		 787 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.357539  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0871  organic solvent tolerance protein, putative  26.13 
 
 		 787 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3418  organic solvent tolerance protein  21.67 
 
 		 735 aa  69.3  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000112563  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2763  organic solvent tolerance protein  26.62 
 
 		 786 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0706  organic solvent tolerance protein  26.13 
 
 		 787 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2421  putative organic solvent tolerance protein  24.6 
 
 		 761 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.644424  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2629  organic solvent tolerance protein  26.62 
 
 		 786 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.355062  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>