168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3044 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_3044  Organic solvent tolerance protein  100 
 
 
784 aa  1624    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.328846 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2626  organic solvent tolerance protein  37.76 
 
 
746 aa  501  1e-140  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3340  organic solvent tolerance protein  30.26 
 
 
743 aa  336  7.999999999999999e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.491125 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2603  organic solvent tolerance protein  27.75 
 
 
786 aa  281  4e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3941  Organic solvent tolerance protein  27.53 
 
 
876 aa  263  8e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.911669 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2311  organic solvent tolerance protein  27.57 
 
 
842 aa  262  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3648  organic solvent tolerance protein  27.53 
 
 
876 aa  263  1e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.326034  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0685  organic solvent tolerance, putative  27 
 
 
792 aa  262  2e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3473  Organic solvent tolerance protein  27.52 
 
 
837 aa  261  4e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3931  Organic solvent tolerance protein  26.79 
 
 
862 aa  257  6e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.748868  normal  0.188644 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3829  putative organic solvent tolerance protein OstA (ImpA)  27.66 
 
 
861 aa  257  7e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.216689  normal  0.0687208 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2342  organic solvent tolerance protein  28.55 
 
 
831 aa  256  8e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0411  organic solvent tolerance protein  27.23 
 
 
748 aa  256  1.0000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.693712  normal  0.0669812 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2478  organic solvent tolerance protein  27.47 
 
 
833 aa  254  6e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0677  putative organic solvent tolerance  27.18 
 
 
792 aa  253  6e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5100  organic solvent tolerance protein  26.91 
 
 
886 aa  253  9.000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0299865 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2968  organic solvent tolerance protein  27.14 
 
 
833 aa  252  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.61435 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1759  organic solvent tolerance protein  25.79 
 
 
786 aa  251  5e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.179124  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1679  organic solvent tolerance protein  28.24 
 
 
829 aa  249  1e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.495698 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5838  Organic solvent tolerance protein  26.6 
 
 
886 aa  246  9.999999999999999e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0554  organic solvent tolerance protein  27.28 
 
 
859 aa  243  1e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.952449  normal  0.0626467 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2836  organic solvent tolerance protein  26.58 
 
 
842 aa  243  1e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.324598  normal  0.142407 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0506  organic solvent tolerance protein  27.07 
 
 
791 aa  242  2e-62  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0434  organic solvent tolerance protein OstA-like  27.65 
 
 
886 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.435152  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0889  organic solvent tolerance protein  25.96 
 
 
756 aa  239  1e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.111396  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1762  organic solvent tolerance protein  26.73 
 
 
767 aa  236  2.0000000000000002e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.868226  normal  0.32659 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1210  Organic solvent tolerance protein  25.41 
 
 
776 aa  231  6e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.44229  hitchhiker  0.00000306995 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0652  organic solvent tolerance protein  26.52 
 
 
892 aa  225  3e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1066  Organic solvent tolerance protein  25.41 
 
 
780 aa  224  4e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000331071 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1541  organic solvent tolerance protein  25.89 
 
 
777 aa  219  2e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2223  Organic solvent tolerance protein  25.89 
 
 
889 aa  205  3e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.653366 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0763  organic solvent tolerance protein  28.24 
 
 
781 aa  203  8e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.169469 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2528  organic solvent tolerance protein  24.55 
 
 
816 aa  203  9e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.150977  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0900  organic solvent tolerance protein  26.9 
 
 
804 aa  191  4e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.403582 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1812  organic solvent tolerance protein, putative  26.45 
 
 
715 aa  190  1e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0780027  normal  0.530576 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1188  organic solvent tolerance protein  25.92 
 
 
716 aa  181  5.999999999999999e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0274723  normal  0.555926 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1224  organic solvent tolerance protein  24.76 
 
 
724 aa  176  1.9999999999999998e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0104539  normal  0.332289 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2902  putative organic solvent tolerance protein  23.64 
 
 
714 aa  172  2e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1546  organic solvent tolerance protein  23.64 
 
 
714 aa  172  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0947  organic solvent tolerance protein  24.16 
 
 
731 aa  159  1e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0025554  normal  0.755835 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1119  organic solvent tolerance protein  27.71 
 
 
712 aa  128  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.223918 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2328  organic solvent tolerance protein  21.86 
 
 
762 aa  89  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000704394  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3034  organic solvent tolerance protein, putative  30.13 
 
 
701 aa  88.2  5e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2643  Organic solvent tolerance protein  30.13 
 
 
727 aa  88.2  6e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.301946  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0098  organic solvent tolerance protein  24.17 
 
 
799 aa  86.3  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0199  organic solvent tolerance protein  23.1 
 
 
757 aa  84.3  0.000000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0836973  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1977  Organic solvent tolerance protein  23.05 
 
 
751 aa  83.6  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001662  Imp required for envelope biogenesis/organic solvent tolerance protein precursor  25 
 
 
781 aa  79.7  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3276  organic solvent tolerance protein  24.38 
 
 
710 aa  79.7  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.112373  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1724  organic solvent tolerance protein  22.24 
 
 
738 aa  79.3  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2714  Organic solvent tolerance protein  24.47 
 
 
753 aa  77.8  0.0000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2474  organic solvent tolerance protein, putative  24.57 
 
 
697 aa  77  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0740  organic solvent tolerance protein, putative  24.48 
 
 
860 aa  76.6  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0739  organic solvent tolerance protein OstA  23.33 
 
 
701 aa  75.1  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.71512e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1274  Organic solvent tolerance protein  24.42 
 
 
778 aa  73.9  0.00000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.436193  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0898  Organic solvent tolerance protein  25 
 
 
684 aa  72.8  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.33463e-30 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00811  organic solvent tolerance protein  22.92 
 
 
781 aa  73.2  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1235  Organic solvent tolerance protein  23.01 
 
 
705 aa  72.4  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4812  organic solvent tolerance protein  25.65 
 
 
856 aa  72  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.685199  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1336  protein CysQ  23.24 
 
 
728 aa  71.6  0.00000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3347  Organic solvent tolerance protein  25.82 
 
 
684 aa  71.2  0.00000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0575  organic solvent tolerance protein, putative  27.73 
 
 
787 aa  70.9  0.00000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0371  organic solvent tolerance protein  24.23 
 
 
784 aa  70.5  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3208  organic solvent tolerance protein  25.32 
 
 
799 aa  69.7  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0490  elongation factor P (EF-P)  22.92 
 
 
720 aa  69.3  0.0000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.65475  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4863  organic solvent tolerance protein  23.93 
 
 
822 aa  68.9  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.102386 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0391  Organic solvent tolerance protein  27.57 
 
 
813 aa  68.6  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.298665  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0601  organic solvent tolerance protein, putative  22.28 
 
 
1091 aa  67.4  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0375  hypothetical protein  24.3 
 
 
839 aa  67.4  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0406  Organic solvent tolerance protein  27.1 
 
 
813 aa  66.2  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0396  organic solvent tolerance protein  25.42 
 
 
788 aa  65.9  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441976  normal  0.0999186 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2421  putative organic solvent tolerance protein  26.05 
 
 
761 aa  65.9  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.644424  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0208  organic solvent tolerance protein, putative  26.05 
 
 
787 aa  65.5  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.357539  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0871  organic solvent tolerance protein, putative  26.05 
 
 
787 aa  65.5  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2763  organic solvent tolerance protein  25.5 
 
 
786 aa  65.5  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2737  putative organic solvent tolerance protein  26.05 
 
 
787 aa  65.5  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2341  putative organic solvent tolerance protein  26.05 
 
 
787 aa  65.5  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.651905  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0692  organic solvent tolerance protein  26.05 
 
 
787 aa  65.5  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0706  organic solvent tolerance protein  26.05 
 
 
787 aa  65.5  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0588  organic solvent tolerance protein  25.3 
 
 
786 aa  65.1  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.649611  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0521  organic solvent tolerance protein  22.26 
 
 
929 aa  64.7  0.000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2629  organic solvent tolerance protein  25.5 
 
 
786 aa  64.7  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.355062  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0350  hypothetical protein  24.23 
 
 
839 aa  64.7  0.000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0202  putative organic solvent tolerance transmembrane protein  24.13 
 
 
819 aa  64.3  0.000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.829458 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1088  Organic solvent tolerance protein  24.47 
 
 
784 aa  63.5  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.567172  normal  0.030432 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4764  organic solvent tolerance protein  23.25 
 
 
820 aa  63.9  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2337  organic solvent tolerance transmembrane protein  23.36 
 
 
728 aa  62.8  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.503681  normal  0.440955 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1574  Organic solvent tolerance protein  23.47 
 
 
841 aa  63.2  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1259  putative periplasmic protein  22.81 
 
 
718 aa  62.8  0.00000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1348  Organic solvent tolerance protein  23.7 
 
 
781 aa  62.8  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2864  organic solvent tolerance protein  23.67 
 
 
787 aa  63.2  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000318031  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1754  organic solvent tolerance protein  23.19 
 
 
1131 aa  63.5  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0989736  hitchhiker  0.000198385 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0515  organic solvent tolerance transmembrane protein  26.92 
 
 
811 aa  62.4  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.877133  normal  0.048519 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0497  organic solvent tolerance protein  26.53 
 
 
810 aa  62.8  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1454  Organic solvent tolerance protein  23.54 
 
 
836 aa  62.4  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591855  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0436  organic solvent tolerance protein  24.58 
 
 
824 aa  62  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.524466 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3470  Organic solvent tolerance protein  27.02 
 
 
791 aa  61.2  0.00000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.917858  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2099  organic solvent tolerance protein  24.11 
 
 
786 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2711  organic solvent tolerance protein  24.11 
 
 
786 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2738  organic solvent tolerance protein  24.11 
 
 
786 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>