193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1259 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0490  elongation factor P (EF-P)  50.14 
 
 
720 aa  696    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.65475  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1336  protein CysQ  50.75 
 
 
728 aa  727    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0235  putative periplasmic protein  49.38 
 
 
744 aa  738    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.919677  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1259  putative periplasmic protein  100 
 
 
718 aa  1462    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1268  organic solvent tolerance protein, putative  42.7 
 
 
675 aa  550  1e-155  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.279939  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1389  organic solvent tolerance protein, putative  42.55 
 
 
682 aa  547  1e-154  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0473  putative organic solvent tolerance protein  42.41 
 
 
675 aa  545  1e-153  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.242427  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0599  Organic solvent tolerance protein  42.28 
 
 
710 aa  536  1e-151  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.784934  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0506  conserved hypothetical protein, putative organic solvent tolerance protein  40.59 
 
 
677 aa  523  1e-147  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0426  organic solvent tolerance protein, putative  32.61 
 
 
738 aa  351  2e-95  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.695489  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4523  organic solvent tolerance protein  20.94 
 
 
771 aa  108  4e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1159  organic solvent tolerance protein  23.24 
 
 
686 aa  104  6e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001662  Imp required for envelope biogenesis/organic solvent tolerance protein precursor  26.39 
 
 
781 aa  104  6e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03411  organic solvent tolerance protein  28.06 
 
 
750 aa  102  3e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.473581  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00811  organic solvent tolerance protein  26.39 
 
 
781 aa  99.8  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1574  Organic solvent tolerance protein  23.94 
 
 
841 aa  95.5  3e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1235  Organic solvent tolerance protein  23.17 
 
 
705 aa  95.1  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0268  Organic solvent tolerance protein  24.14 
 
 
765 aa  95.1  4e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0865  organic solvent tolerance protein  28.57 
 
 
774 aa  93.6  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000634249  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2864  organic solvent tolerance protein  26.69 
 
 
787 aa  92.8  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000318031  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0437  Organic solvent tolerance protein  26.79 
 
 
680 aa  91.3  6e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0882  organic solvent tolerance protein  25.34 
 
 
773 aa  90.5  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000270887  normal  0.785369 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3276  organic solvent tolerance protein  21.86 
 
 
710 aa  89.4  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.112373  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0396  organic solvent tolerance protein  27.73 
 
 
788 aa  88.6  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441976  normal  0.0999186 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0967  organic solvent tolerance protein  24.43 
 
 
774 aa  88.2  5e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000267662  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1454  Organic solvent tolerance protein  26.21 
 
 
836 aa  87.4  9e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591855  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3418  organic solvent tolerance protein  20.95 
 
 
735 aa  86.7  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000112563  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0566  organic solvent tolerance protein  23.82 
 
 
807 aa  85.5  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0203405  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1017  organic solvent tolerance protein  24.24 
 
 
773 aa  85.9  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000878563  hitchhiker  0.00955351 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2885  organic solvent tolerance protein  24.75 
 
 
766 aa  85.1  0.000000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000379496  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2076  organic solvent tolerance protein  25.38 
 
 
870 aa  85.1  0.000000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0583626  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0898  Organic solvent tolerance protein  22.7 
 
 
684 aa  84  0.000000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.33463e-30 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3076  organic solvent tolerance protein  25.49 
 
 
766 aa  84  0.000000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2367  organic solvent tolerance protein, putative  22.28 
 
 
628 aa  84  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.147572  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0371  organic solvent tolerance protein  27.11 
 
 
784 aa  83.6  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3347  Organic solvent tolerance protein  22.96 
 
 
684 aa  82.8  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0106  organic solvent tolerance protein  33.6 
 
 
870 aa  82.8  0.00000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.307862  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2528  organic solvent tolerance protein  27.08 
 
 
816 aa  82.4  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.150977  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2816  organic solvent tolerance protein  25.81 
 
 
764 aa  82.4  0.00000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0189474  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1870  organic solvent tolerance protein  26.11 
 
 
816 aa  82.4  0.00000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0675  Organic solvent tolerance protein  24.1 
 
 
788 aa  81.6  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2328  organic solvent tolerance protein  19.5 
 
 
762 aa  81.6  0.00000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000704394  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4024  putative organic solvent tolerance protein  24.1 
 
 
789 aa  81.3  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.560503  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2474  organic solvent tolerance protein, putative  19.89 
 
 
697 aa  80.9  0.00000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1088  Organic solvent tolerance protein  24.27 
 
 
784 aa  80.9  0.00000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.567172  normal  0.030432 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3636  organic solvent tolerance protein  24.27 
 
 
765 aa  80.5  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2902  putative organic solvent tolerance protein  25.21 
 
 
714 aa  80.1  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1274  Organic solvent tolerance protein  27.49 
 
 
778 aa  80.1  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.436193  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0058  Organic solvent tolerance protein  27.93 
 
 
671 aa  80.5  0.0000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1670  organic solvent tolerance protein  22.96 
 
 
756 aa  80.5  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0107497  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1546  organic solvent tolerance protein  25.21 
 
 
714 aa  80.1  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2629  organic solvent tolerance protein  24.36 
 
 
786 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.355062  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4010  organic solvent tolerance protein  27.73 
 
 
938 aa  80.1  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1519  organic solvent tolerance protein  25.52 
 
 
912 aa  79.3  0.0000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.136547 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2311  organic solvent tolerance protein  28.5 
 
 
842 aa  79.7  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0908  organic solvent tolerance protein  24.27 
 
 
765 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000625202  normal  0.177324 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3112  organic solvent tolerance protein  24.27 
 
 
765 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000136701  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1050  organic solvent tolerance protein  26.79 
 
 
790 aa  79.3  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3208  organic solvent tolerance protein  25.08 
 
 
799 aa  79.3  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2763  organic solvent tolerance protein  23.93 
 
 
786 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1977  Organic solvent tolerance protein  22.69 
 
 
751 aa  78.6  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0575  organic solvent tolerance protein, putative  25.64 
 
 
787 aa  78.6  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04642  organic solvent tolerance protein  33.61 
 
 
813 aa  78.2  0.0000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0686354  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3206  organic solvent tolerance protein  23.85 
 
 
765 aa  78.2  0.0000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000004691  normal  0.810097 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0497  organic solvent tolerance protein  27.52 
 
 
810 aa  77.8  0.0000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1698  putative organic solvent tolerance protein  25.94 
 
 
997 aa  77.8  0.0000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.999611  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0980  organic solvent tolerance protein  23.86 
 
 
765 aa  77.4  0.0000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000900172  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1936  organic solvent tolerance protein  27.11 
 
 
792 aa  76.6  0.000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1679  organic solvent tolerance protein  26.58 
 
 
829 aa  76.6  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.495698 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3482  organic solvent tolerance protein  22.43 
 
 
776 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.151246 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2738  organic solvent tolerance protein  25.35 
 
 
786 aa  77  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2099  organic solvent tolerance protein  25.35 
 
 
786 aa  77  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07770  organic solvent tolerance protein OstA precursor  23.43 
 
 
924 aa  76.6  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0241314 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2711  organic solvent tolerance protein  25.35 
 
 
786 aa  77  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3309  Organic solvent tolerance protein  23.86 
 
 
765 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000208036  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3829  organic solvent tolerance protein  34.21 
 
 
801 aa  75.9  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2012  organic solvent tolerance protein  27.88 
 
 
792 aa  76.3  0.000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2342  organic solvent tolerance protein  26.64 
 
 
831 aa  75.9  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3632  organic solvent tolerance protein  34.21 
 
 
799 aa  76.6  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000841674  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3510  organic solvent tolerance protein  28.12 
 
 
794 aa  76.3  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0671  organic solvent tolerance protein  33.61 
 
 
826 aa  75.9  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0438  organic solvent tolerance protein  24.51 
 
 
935 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.373211  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3473  Organic solvent tolerance protein  27.62 
 
 
837 aa  75.5  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0739  organic solvent tolerance protein OstA precursor  23.75 
 
 
922 aa  75.5  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1082  organic solvent tolerance protein  23.35 
 
 
765 aa  75.5  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000021692  normal  0.94876 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1049  organic solvent tolerance protein  23.35 
 
 
765 aa  75.5  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000815644  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0605  organic solvent tolerance protein  32.76 
 
 
799 aa  75.1  0.000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0272025  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6038  organic solvent tolerance protein  26.48 
 
 
786 aa  75.1  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2968  organic solvent tolerance protein  26.76 
 
 
833 aa  74.7  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.61435 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0435  organic solvent tolerance protein  24.51 
 
 
932 aa  74.7  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00337227  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3829  putative organic solvent tolerance protein OstA (ImpA)  26.64 
 
 
861 aa  75.1  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.216689  normal  0.0687208 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1020  organic solvent tolerance protein  22.62 
 
 
794 aa  74.7  0.000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2421  putative organic solvent tolerance protein  25.64 
 
 
761 aa  74.3  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.644424  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1754  organic solvent tolerance protein  22.38 
 
 
1131 aa  74.7  0.000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0989736  hitchhiker  0.000198385 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0208  organic solvent tolerance protein, putative  25.64 
 
 
787 aa  73.9  0.000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.357539  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0871  organic solvent tolerance protein, putative  25.64 
 
 
787 aa  73.9  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2737  putative organic solvent tolerance protein  25.64 
 
 
787 aa  73.9  0.000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2341  putative organic solvent tolerance protein  25.64 
 
 
787 aa  73.9  0.000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.651905  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0692  organic solvent tolerance protein  25.64 
 
 
787 aa  73.9  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0706  organic solvent tolerance protein  25.64 
 
 
787 aa  73.9  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>